Plasmodium chabaudi: PCHAS_0418900
Help
Entry
PCHAS_0418900 CDS
T01108
Name
(RefSeq) ATP-dependent RNA helicase DDX60, putative
KO
K20103
ATP-dependent RNA helicase DDX60 [EC:
5.6.2.7
]
Organism
pcb
Plasmodium chabaudi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcb00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pcb03019
]
PCHAS_0418900
Enzymes [BR:
pcb01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
PCHAS_0418900
Messenger RNA biogenesis [BR:
pcb03019
]
Eukaryotic type
mRNA degradation factors
3'-5' decay
Exosome cofactors
PCHAS_0418900
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
ResIII
AAA_22
Helicase_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3490876
NCBI-ProteinID:
XP_016653342
UniProt:
A0A4V0K364
LinkDB
All DBs
Position
4:710287..717672
Genome browser
AA seq
2405 aa
AA seq
DB search
MILANNVYKVPKLKDLKNLRIAENDSTNRYSFINKFEENELEDIENIINNKDISVDNKIE
LFYSKLNSSIHDIFRIIADYTSLYIINGEGLLIHVCMLLSKFYSFQNEEDQNILSFNNSL
NISSIIYYIEKVLRDFALCNSNFHIIFFNVFNLFFEKETKLFENYNILRNAFIIHCKKNL
IPYYIFDNWYNDNNYNIYIIKYKPLFMFVEDSSSFLYLFNKFYVSEVNEENELDNNAAIS
KKSEADEKTNNNSDSILDVEKNRKEYLKKKKIYDYYNEEIREISLCFYFLLINNILRDIK
SVLFFNVEIEKNTVNAFSINYKMINFKTVEKLNEESASLFEKNVYQSIGIRESIDYEKAN
SDYTQINISQNIKDYDLIYNDEKNYSKEELELLELFSANAKTDNINLKNIVLNVFYSKIK
ETIMKDDEKKNFTFLTVKLIFMHNYLIEKLNMKNLNCMHDIEKTDTDYSSYNFIKSQVEG
YILSYLNIYNLILKSLQGYMYCDILQNIRNTDILHFFNSSIIHNLISFICYKIRENNYII
NYEDFSFEDSDFFEKSFKNVVGNDGMSFFPINFEFLLNCTNLLPKNETNVVEGNDNKIDE
NTMKDGNQCKSEISNNNKIINVNLINIKNEFIENFFHIDNKSNEAERNTNDIINENNKGH
EIKYKVNYVDKYIEYDSEFFELCGLLHITQREEVYDIYRRYIKMSKNSRISKVRKEDERN
ILRGQQKEERRNAIIAKYFYISSLHHPIIISENHPWLKYYIYNIDKLYNYLKNEENKKVI
NMRMKRIFEETFLKESTPSICDAKSKKIKKQQNYVKMFEVLDDISGDDSNIDNDGQNNKG
KKGQKEKEEKKHIKGGNSNQLTRKDEILKRKELSNEKKLYEVDLERYNVLEAKINKLSSN
NNYSEMNTWSLDIISGFNRLVDVYNFNNVSNLIKNPTIQLKVSMKVLSNMFDIIMHTKLK
NVKTNKQKSDAIRSVMLIYKLVNEIFNKFKEVLTEKDIVQLQTVLLSLGFRNSSYNLFEE
YIKIKMKQIEEENNNDAEEDKTGKNKKNVKGKEKTKLKGGAKGGKNKEEEKVGLDKIKKK
GREESNSEIGIKGSDRKEIKELYKHKIESVKTYSELKIDEDKEHEFQLYYMYYLLDRTTG
NIKDKRVLFTLDTWQYNILNLVDRRKSILVSCPTSSGKTFICYYVMDKVLRLNNDSVVVY
VAPNDTLALQVFHEVNGRFSTKSYSKYGESKLCSYLTDKYAQDKALEAQIVIILPSVLEN
ILLSYYSMSENTGLETKVSKFISRIEYIIFDEIHCIGDKEFYGPQIENIIHLTTCPFLAL
SATIGNIKYFYDWLKNVMIKKGKDEKDLHLIKFYERFSDLVLYVYTNKNLHHLNPLACYN
YRDILYKGINKDFYCNPREIYEIIMLLFELAKQKKFYDLVEFLEPSFYFKYTRCINKKQF
IYYMHSVKEMIIYLIQNKYITSSDYDMFIHMLLSNYLKNTDVSRGEKKEEEKRNKEKEVE
KRETAKDVDSSSDSDEGNKKIKSMQSITKHLYKRKVKDDVPKEKLFQELYKNVVLDEKYY
LNKSNDLVKYTETVNVDQEYLDSGNLIELLKHLEDVNFLPCIVFNFERKELEDMTINLIN
ELMRRQHDKYYGTDERAFNTKMENKLRQERYENLLKQREMLLKIKTVSRNQRLEQNLDKD
YLDMLNEDEIPEPPIDISEEYDGDFYFCNRKVYHNYVFEIEDLIKDAERAIEGRKNKDIL
IEGLKRGIGLHYEVLPYKFTIIVESLFRLGYIKIIFSNKNLSLGINIPCKSIIFTGHTYE
LNSLMFKQTSGRAGRRGFDLYGNIIIWNINFKNLKRLITCPLQTLSGTYCVNFTNICRSM
LLYNCLKKYREMEEIAHRNKAIVNKPSKKKKKEETMSVAEKEEIFEKNRFININYFSRVN
GILSLFYNTLYYINAFHDENNKALENIESNKNVEHVKGGDKTSHNTNNYDVICESDYLNF
RKEEFLEYKEKDISSDFINRKYEYNELICEIIENKKKNKYMSIFENQKNLKELSFMIKIH
FLIYINILVEMEALDDDGNVINLTELSILLKKECDNNFLLTHLFRKRIIHNLIGDDVFLS
YSNSEVSLQKIIDCITFEKNYSRNAIVDDASRGKFILLFILSHFINKIKENKIALTNILI
NYNNKSRNRLELFSHKYFPLLHTLPKSVQNHVNNLEKLILNNLINYSIIIISKLKLWNRK
NTYLLPYTQLYIFEEHPSSNLVDIFNNTNSEFINYYKGKVDDYNIRSPFLAPLYKNDKFD
NLCELLYTSLIDLDMKKNMIPDIMEDYVYFYKFENGSIKEEKTCLKNSYMIDYFLHGKYY
VLRNKNKLGQYTWYIIDRFIDSLKNIENYLYEIKREKDFSNDIFYTCLSSMKDILQKHFK
SINSE
NT seq
7218 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattttagctaataatgtttataaagttcctaaactaaaagacctgaaaaacttgagg
atagcagaaaatgatagtacaaatagatattcgttcattaacaaatttgaggaaaatgaa
ttagaagatatagagaacataataaataataaggatataagtgtagataataaaatagaa
ttattttattccaaattaaacagtagtatacatgatatatttaggataatagcagattat
actagtttatatattataaatggggaaggtttattaattcatgtatgtatgttattatct
aagttttattcatttcaaaatgaagaagaccaaaacattcttagttttaacaatagtttg
aatattagtagtataatatattatattgaaaaggtgttaagggattttgctttatgtaat
tcaaatttccatataatattttttaatgtttttaatttgttttttgaaaaagaaacaaaa
ttattcgaaaattataatatcttaagaaatgcatttataattcattgtaaaaaaaatttg
attccttattatatttttgataattggtataatgataataattataatatatacattata
aaatataaacctttatttatgtttgttgaagacagttcttcttttttatatttgtttaat
aaattttatgtaagcgaagttaatgaagaaaatgaattagataataatgcagcaatatca
aagaaaagcgaagctgacgaaaaaacaaataacaacagtgatagcattttagatgtcgaa
aaaaaccgtaaggaatatttgaaaaaaaaaaaaatatatgattactacaatgaagaaatt
agagaaatatcgctttgcttttattttcttttaattaataatatattaagagatataaaa
tctgtgctttttttcaatgtggaaattgagaagaatactgtaaatgccttttctataaat
tataagatgataaattttaaaacagttgagaaattaaatgaagaatcagcatctctattt
gaaaaaaatgtgtatcaaagtattggtattagagaaagtatagactatgagaaagctaat
agtgattacacacagataaatatatcacaaaatataaaggattatgatttgatatataat
gatgaaaaaaattatagcaaagaagaattagaattacttgaattgttttcagcaaatgcg
aaaacagataacattaatttgaaaaatattgtattaaatgtgttttattccaaaattaaa
gaaacaattatgaaggatgatgagaaaaagaattttacatttttaactgtgaaacttata
tttatgcataattatttaatagaaaaattaaatatgaaaaatttaaattgtatgcatgat
atagaaaaaacggatacagattatagtagttacaattttataaaatcacaagtagaagga
tatatattatcttatttaaatatttataatttaatattgaaaagtttacaaggatatatg
tattgtgatattttgcaaaatattagaaacacagatatattgcacttttttaactcttca
ataattcataatttaataagctttatatgctataaaataagagaaaataattatataatt
aattatgaagatttttcatttgaagattcagacttttttgaaaaatcatttaaaaatgta
gtaggaaatgatggcatgtcattttttccaattaattttgaatttttactaaattgcact
aatttattacctaaaaatgaaacaaacgttgtagaaggaaatgataacaaaatagacgaa
aatacgatgaaagatggaaaccaatgtaaaagtgaaatatcaaataataataaaataatc
aacgttaacctgataaacattaaaaatgagtttatagagaatttttttcatattgataat
aagtcaaatgaagccgaaagaaatactaacgatataataaatgaaaataataaagggcat
gaaattaagtataaagtaaattatgtagataagtatatagaatatgatagcgaatttttt
gagttatgtggattgttgcacattacacagagagaagaagtatatgatatttataggcgt
tatataaaaatgtctaaaaattcgagaatatcaaaggtaagaaaagaagatgaaagaaat
atattacgaggacaacaaaaagaagaaagaagaaatgctataattgcaaaatatttttat
attagctcattacatcatccaattattatatcagaaaatcatccatggttgaaatattat
atatataatattgataaattatataattatttaaaaaatgaagaaaataaaaaagtaatt
aatatgagaatgaaaagaatatttgaagagacatttttgaaagagagtaccccaagtatt
tgtgatgcaaaaagtaaaaaaattaaaaaacagcaaaattacgttaaaatgtttgaagtt
ttagatgacataagtggtgatgatagtaacatcgataatgatgggcaaaataataaaggg
aaaaaaggacaaaaagaaaaggaagaaaaaaaacatattaaaggaggaaattcaaatcaa
ttaactcgaaaagatgaaattttaaaaagaaaagaattgtcaaatgaaaaaaaattatat
gaagtagatttagaaagatataatgtattagaagcaaaaataaataaactgagtagcaat
aataattattctgaaatgaatacatggtcattagatataatatcaggttttaatagatta
gtagatgtatataattttaataatgttagtaatttaataaaaaatccaactattcaactt
aaggttagtatgaaagttttaagtaatatgtttgatattattatgcatacaaaattaaaa
aatgttaaaactaataaacagaaatcagacgcaattagaagtgtaatgttaatttataaa
ttggttaatgaaatttttaacaaatttaaagaggttctaactgaaaaagatattgttcag
ttgcaaactgttttgctatcacttgggtttagaaatagtagttataatttatttgaagag
tatattaagataaagatgaaacaaatagaagaagaaaataataatgatgcagaagaagat
aaaacgggtaaaaataaaaaaaatgtaaaaggaaaagaaaaaacaaaattgaaaggtgga
gctaaaggtggaaaaaacaaggaagaagagaaagtgggtctagataagataaaaaaaaaa
ggaagagaagaaagcaattcagaaattggaataaaaggatcggataggaaagaaataaaa
gaactttataaacataaaatcgaatccgtaaaaacatacagtgaattaaaaatagatgaa
gataaagaacatgaatttcaattatattatatgtactatttattagatagaacaacagga
aacataaaagataagcgtgttttatttactttagatacttggcaatataatatattaaat
ttagtagatcgaagaaaaagtatattagtttcttgtccaactagtagtggtaagacattt
atttgttattatgttatggataaggtattaagattaaataatgatagtgtagttgtatat
gttgcccctaatgatacattagccttacaagtatttcatgaagtaaatggaagatttagc
acaaaaagttattcaaaatatggggaaagtaaattatgctcatatttaacagataaatat
gcacaagataaggcattagaggctcaaatagttataatattacctagtgttttagaaaat
attttattatcttattattcgatgagtgaaaatacgggtttagaaacaaaagtatctaaa
tttattagtagaattgaatatataatttttgatgaaattcattgtattggagataaagaa
ttttatggacctcaaattgaaaacattattcatttaacaacttgcccatttttagcatta
tctgctactattggtaatataaaatatttttatgattggctaaaaaatgttatgataaaa
aagggaaaagatgaaaaagatttgcatttaattaaattttatgaaagattttcagatttg
gttttatatgtatatactaataaaaatttgcatcatttaaaccctttggcgtgctataat
tatagagatatattatataagggtattaataaagatttttattgcaatcctcgagaaata
tatgaaattataatgttattatttgaattagctaaacaaaaaaaattttatgatttggta
gaatttttagaaccttcattttatttcaaatatacacgatgtataaataagaaacagttt
atatattacatgcacagtgtaaaagaaatgataatatatttaatacaaaataagtacatt
actagttcagactatgacatgttcatacatatgttgttatcaaattatttgaagaatact
gatgtatctcgaggagaaaagaaagaagaggaaaaacgtaataaagaaaaagaggtagag
aagagggaaacagccaaagatgttgatagtagcagtgatagtgatgaagggaataagaaa
ataaaaagtatgcaaagcataacaaaacatttatacaagcgaaaagtgaaagatgatgta
ccaaaagagaaactatttcaggagttgtataaaaatgttgtattggatgaaaaatattac
ttaaataaatcaaacgatttagtaaaatatactgaaactgtaaatgttgaccaagaatat
ttagacagtggtaatttaatagaattattaaaacacttagaagatgtgaactttttacct
tgcattgtttttaattttgaaagaaaagaattagaagatatgactatcaatttgattaat
gaacttatgagaagacaacatgataaatattatggaactgatgaaagggcatttaatacg
aagatggaaaataagctaaggcaagaaagatatgaaaatttattaaagcaaagagaaatg
ctattgaaaataaaaactgtatctaggaaccaaagattagaacaaaatttagataaagat
tatttagatatgttaaatgaagatgagataccagaacctcctatagatatttcagaagaa
tatgatggtgatttttatttttgcaatagaaaagtatatcacaattatgtttttgaaata
gaggatttgataaaggatgcagaaagagcaatagaaggacgaaaaaataaggatatatta
attgaaggtttaaaaagaggtatcggtttacactatgaagttttaccttacaaatttaca
attatagttgaatctttatttagattgggatacattaagataatatttagtaataaaaac
ttgtccttaggaataaatattccttgtaaatctattatatttactggacatacttatgaa
ttaaattctcttatgtttaaacaaacttcgggaagagctggtcgtcgtgggtttgattta
tatggtaacataatcatatggaatattaattttaagaatttaaaaagattaattacatgc
cctttgcaaaccctttccggtacttattgtgttaattttacaaacatatgtagaagtatg
ctattatataattgcttgaagaaatatagagaaatggaagaaattgcacatagaaataaa
gctatagtaaataaaccaagtaaaaagaagaaaaaagaagaaactatgagtgtggctgaa
aaggaagaaatttttgaaaaaaacagatttatcaatattaactattttagtagagttaat
ggtatattaagtttgttttacaatactttgtattatataaatgcattccatgatgaaaat
aataaagcattagagaatatagaaagcaataaaaatgttgaacatgtaaaagggggtgat
aagacatcacacaatacgaataattacgatgtaatttgtgaaagtgattatttaaatttt
cgaaaagaagaatttttagaatataaagaaaaggatatatcatccgattttatcaataga
aaatatgaatataatgagttaatttgcgaaattattgaaaataagaagaaaaacaaatat
atgtcaatttttgaaaaccagaaaaatttaaaagaattatcttttatgataaaaattcat
tttcttatatatataaatattcttgttgaaatggaagcattagatgatgatggcaatgta
attaatctaactgaattatctatattattgaaaaaggaatgtgataataacttcttatta
acgcatttatttagaaaacgaattatacataaccttataggagatgatgtatttttatca
tactcaaatagtgaagtatctttacaaaaaataattgattgcataaccttcgaaaaaaat
tattctcgaaatgcaatagtagatgacgcatcaagaggaaaatttatcctattgtttatt
ctttctcattttattaacaaaattaaagaaaataaaatagctctaaccaatatattaatc
aattataataataaaagtagaaatcgattggaattatttagccataaatatttccctctt
ttacacacgcttccaaaatctgtacaaaatcatgttaataatctagaaaaacttatatta
aataatttaataaattattcgatcataattataagcaagttaaaattgtggaataggaaa
aacacatatttgcttccatatactcaattatacatatttgaagaacacccctcttcgaat
ttggttgacattttcaataacacaaattcagagttcataaattattataaaggaaaggtt
gatgattacaatataagatccccattcttggctcctctttataaaaacgataaattcgat
aatttatgtgaattactttacacatctctaattgatttggatatgaaaaaaaatatgatt
ccagatataatggaagactatgtttatttttataagtttgaaaatggatcaataaaagag
gaaaaaacatgcttaaaaaattcttatatgatagattatttcttacacggaaagtattac
gttttaagaaacaaaaacaaactagggcaatatacttggtatattatagatagatttatt
gactctttaaaaaatattgaaaattatttatacgaaattaagagagaaaaggatttctca
aatgacattttttacacatgcctaagttcaatgaaagatattttacaaaaacattttaaa
tctattaactcagaataa
DBGET
integrated database retrieval system