KEGG   Plasmodium chabaudi: PCHAS_0508200
Entry
PCHAS_0508200     CDS       T01108                                 
Name
(RefSeq) SNF2 helicase, putative
  KO
K11367  chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1 [EC:5.6.2.-]
Organism
pcb  Plasmodium chabaudi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pcb00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:pcb03021]
    PCHAS_0508200
   03036 Chromosome and associated proteins [BR:pcb03036]
    PCHAS_0508200
Transcription machinery [BR:pcb03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   Coactivators
    SAGA/TFTC/STAGA complex
     PCHAS_0508200
Chromosome and associated proteins [BR:pcb03036]
 Eukaryotic type
  Histone modification proteins
   HAT complexes
    SAGA complex
     PCHAS_0508200
    SLIK complex
     PCHAS_0508200
SSDB
Motif
Pfam: SNF2-rel_dom Helicase_C Chromo ResIII DEAD HTH_CHD1_Hrp3 Myb_DNA-binding CDH1_2_SANT_HL1
Other DBs
NCBI-GeneID: 3497837
NCBI-ProteinID: XP_744718
UniProt: A0A4V0K4Y9
LinkDB
Position
5:complement(<338658..>346349)
AA seq 2563 aa
MTMMNNNNIVNNDNGTISITSSLLSNNDKNINIKSKLGINKNGNVGGGLHESYQKSMLSS
YNMNNVPMPSMNYHGSNNVMNRYNPMNYPLQEMNPNMQMNNNMKQNSMQGNDMLIKQNSK
DQNYMYYQRNNSNNFNNMHGNFYPYMNNGFYGMSSANCYKPNSTNVANNNNTNNFNQMNG
SFPYDNTIRSGVGSSTAPGGANNTISSNSNNNNPNFVKTLNSVNYGENINCNSMNNILNK
DSENLDKSSQMKSLSNNMNVNNLNMGHHANNTATTSGTNNNSNNIPPYRLNSDSQLDKQN
SIDDMNNNTRYHPMNMYNRMEYGYDNFKDENGLDKDKANIDKSSNSNNSNLLGDNKTNSS
ISNIRKGNNKDGTIADNNSNNDSDSYKKYKSETDANHNKMKDGKDSKLNDSANSNANNSY
AMFPNYNLKYPMNMNMFNNMNNFNMNNKTGINNMGGVSNMNVEGGNYQNYNLMNNMSKMP
NVNNYNMMNMYGDNRYNNNTSMNAGVNNNMINMNNYNNMNYMNNRNYANDMNMRLLNGRN
IPNNMNNGDLSTNYMTDAMGNRIVNHDLNNMNDGSLNNGNKYVRKTAIGKQYVTNTVASS
SMKKKIEAQKDKKKKRKKKNENSLAESDDEDDNDLYINSYVKKSAPKSSSSKSWLQYDSV
EDKYTEKMKRHEKNDIFISPNIGAVGGRTNLRERKRVYNYAQIDNYYETDEEDKKVDEEK
NLLKQEKQSMGGIDRVIHHRRIKDWDIINSIKNNPFLFINRKKPEVSENGDDKKNETLVG
STEASSDSLNTTEAGGTEGAPDVSCHKILGGVENIEDPALDDFYEEEDIVDINEVEFLVK
WIGKSHIHNFFCTYEYLRYFNGVKKVDNYIKKIRLSFQKRKYMTADEIEQEKIYSEIKKQ
IEMDSIHAERIVTHRKCEITNEQLFLVKWTSCAYDQCTEETRQTLLDHNFGKLIEEYFDR
ESKIYGAKALSSIWNRGPLTATKFDPYNETPSYLQGKKLRAYQLTGLNWMVSRMKRNLSV
LLADEMGLGKTVQTIAVVGHMLYKEKLIGPYLVLVPQSTVDNWLNEFKNWLPQANVVCYH
GNAVSRELIRTYELKKVYVPNRGYRYKFDVCITTPSILNSVSDVELLKRIPWQLMVVDEA
HQLKNRQSKRFIELKQFMAESKLLLSGTPLHNNLEELWTLLHFLNPQQYTYYEAFQKKYN
EIENTSLIGEAKQKQLMQLQHELHEVILRRVKKDVEKSLPNKVERILRVELSPIQIEYYK
NILTKNYEQLAKASGGAKNSLQNICMELKKVCNHPFLCCEPIDKDEYRERLVYSSGKICL
LEKLLIRLKERGNRVLIFSQMVKMLNILSEYLTLRGFKHQRLDGTMTKEMRKKAMNHFNS
KNSDDFVFLLSTKAGGLGINLTSADTVIIYDSDWNPQNDLQAGARAHRIGQTKTVQIYRL
VTKDSIEQTILERAKVKMVLDTLVVQGLNKKQNDNVNFIGGEGSNSSNGFTREELSKILK
FGSQKLWEKNSSKYSPQDGEDGKNIIKGVDVDLDKILEEAEANENTNNANKDINSELNSL
QNGAGSSFFNSNSNLFGGGAGVAGVNNIGGGGIADDLLSSYNNITEFKYEPPENLKSNIL
YNDSTKQGEIDIEENDKDFWDKTIPLEERLKLKKMKEEELLVHGPRKTRTRDARYNQGLY
YDGGANNNNSDGDDSDEFTIKYTDKYNKNLNKKKRKRRTSTQITEKDKFRLYRSILKFGN
PTLRIDDIQFDSKLMKVDRNVILTELNIIVDTCKEIVERVSKDGNNNGQGALANPNVKMD
NDEQNEYNEDGEPSVNVKNNDMSIEVKGEKDQQSEEANDENDKSTRGKRSTRGTTVSSTG
ENGEAADDSKKEENNTGGGFFSKFMKFTKGSTEPKREDEIEGKGIKTKTEDDTVKDELDD
DMIKDELNDESDNNNKTKGERGRKIDAYTFYIGTNKANALDLCHRLQLFKSLHDFIKEQN
NDNEYSFRLPLIPLNGANGDVGVIETAGGNSKSSAKNDKTKGKKDDPEAAATTANTEGEE
GKTSNGYEGAESSMLVGGNPSDDYLKLKLPNYIFDHLRDLSTKDVKAWTKENDENLIKGV
YIYGFGSFNEICADVNLNLEHMKNIKWDKIKMRCIKILKMIEEYTSSNKEGTTGKKRRRA
RGKNKNNDEIKDEYGNNTSIKSEENGGTSKGNNASGRHGNSNYGRRSSERVKAIYSQEDK
ETGGVLKKRALSSRKGERDNKNGSSKLENVYDINSKGDNTLLSSSTADKRRRRGVSSKSS
NVTLKNEKTNSKCIIESSECSSSNEQKSNGSDEDDDDESNVNIVKRSGRSGSNRSSSRMN
SYENYKLTRRRSTRTRRGGNDSIVGSECINSIDPDGDDEYYNDPNDRKKLKKKKKKKDKK
KKLTDEEIIEIIKNTNLREMDQHSINKLTKKPLKKYKKLLKIVKKVLSSIELGEVEEDES
EEIRKKTDELIFYIGNYIGEFFDHCADSECKDILNNSGWEYISNFMNETSDDLRSKYEQL
KSSNLKDSNNADITEENIISFFYSKKGSGSLYPEDDPDDGMDE
NT seq 7692 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaccatgatgaataataataatattgttaataatgataatgggacaataagtataaca
agcagtttattaagtaacaatgataaaaatattaatataaaatctaaattgggaataaat
aaaaatggcaacgttggtggtgggctgcatgaatcttatcagaagtcaatgttatcttcc
tataatatgaacaatgttcccatgccatcaatgaattaccatggtagcaataatgtgatg
aataggtataatcctatgaattatccattacaagaaatgaatccaaatatgcaaatgaat
aataatatgaaacaaaattctatgcaaggtaatgatatgttaataaaacaaaatagtaaa
gatcaaaattatatgtattatcaaaggaataattcaaataattttaataatatgcatggg
aatttttatccatatatgaataatggattttatggaatgtcatcagcaaactgctataag
cccaattctacaaatgtagcaaataataataatacaaataattttaatcaaatgaatgga
tcttttccatatgataatacaataagaagtggtgttggctccagtacagctcctggtggt
gctaacaatactatttcaagtaacagtaataataataaccctaattttgtgaagacttta
aactcagtaaattatggtgaaaatataaattgtaattcaatgaataatatattaaataaa
gattctgagaatttggataaatcatctcaaatgaaatctttatcaaataacatgaatgtt
aataatttaaatatgggtcatcatgctaataatactgctactacaagcggtacaaataac
aacagtaataatattcctccatatagattaaacagtgattcacaattagataaacaaaat
tctatagatgatatgaataataatacacgatatcatcctatgaatatgtataataggatg
gaatatggttatgacaattttaaagatgagaatgggttagataaggataaagctaatata
gataaatctagcaacagtaataactctaatttattaggtgataataaaacaaattcttct
atttctaatattagaaaggggaataataaagatggtacgatagcagataataatagtaat
aatgattctgattcttataaaaaatataaaagtgagacagatgcaaatcataataaaatg
aaggatgggaaagattctaaattaaatgattcggctaatagcaatgctaataattcatat
gctatgtttccaaattataatttaaaatacccaatgaatatgaatatgtttaataatatg
aataattttaatatgaataataaaactggtataaataatatgggaggtgtatctaatatg
aatgtagaaggtggcaattatcaaaattataacttaatgaataatatgagtaaaatgcca
aatgtgaataattataatatgatgaatatgtatggtgataatcgatataataataatact
agcatgaatgctggtgttaataataatatgataaatatgaacaattataataatatgaat
tatatgaataatagaaattatgctaatgatatgaatatgagattattaaatggtcgaaat
attccaaacaatatgaataatggtgatttaagtacaaattatatgaccgatgcaatgggc
aatcgaattgttaaccatgatctaaacaatatgaatgatggaagcttaaacaatggtaat
aaatatgtgagaaaaactgctattggaaagcagtatgtgactaatactgttgcttctagc
tctatgaagaaaaagattgaagcacaaaaagataagaagaaaaaacgaaaaaagaaaaat
gaaaatagcttagccgaatcagatgatgaagacgataatgatttgtatataaattcatat
gttaagaaatcggcacctaaaagtagtagtagtaagagttggttacaatacgatagtgtt
gaagataaatatactgaaaaaatgaaacgccatgaaaaaaatgatatttttatttcccca
aatattggcgcagtaggaggtagaacaaatttaagagaaagaaaaagagtttataattat
gcccaaatagataattattatgaaacagatgaagaagataaaaaagtagatgaagaaaaa
aatttacttaaacaagaaaagcaaagtatgggaggtattgatcgtgttattcatcatagg
agaataaaagattgggatattattaatagtattaaaaataatccgtttttatttataaat
agaaagaaacctgaagtgtctgaaaatggggatgataaaaagaatgaaaccttagtagga
tcaacagaagcatcatcggattcattaaatactaccgaagcgggtggaacagaaggtgct
ccagatgttagttgtcacaaaatattaggaggtgttgaaaatattgaggatccagcatta
gatgatttttatgaagaagaagatattgtagatataaatgaagttgaatttttagtaaaa
tggataggcaaatctcatattcataattttttttgtacttatgaatatttaagatatttt
aatggtgtaaagaaagtcgataattatattaaaaagattcgattatcatttcaaaaaaga
aaatatatgacagcagatgaaattgaacaagaaaaaatatattctgaaataaaaaaacaa
atagaaatggattcaatacatgccgaaagaatagtaactcataggaaatgtgaaataaca
aatgaacaattatttttagtaaagtggacaagctgtgcatatgatcaatgtacagaagaa
acaagacaaaccttgttagatcataattttggaaaattaatagaagaatattttgataga
gaaagtaaaatatatggtgctaaagcattatcaagtatatggaatagaggcccattaact
gcaacaaaatttgatccatataatgagacaccaagttatttacaaggaaaaaaattaaga
gcctatcaattaacaggtttaaattggatggttagtagaatgaaaagaaatttaagtgtt
ttattagcagatgaaatgggtttaggtaaaacagttcaaacaattgcagtagttggtcat
atgttatacaaagaaaaattgatagggccttatttagtgctagtacctcaatcaactgta
gataattggttaaacgaatttaaaaactggttacctcaagcgaatgtagtatgttaccat
ggtaatgcagtaagtagagaattgataagaacctatgaattaaaaaaagtatatgtacca
aatagaggatatcgatataaatttgatgtatgtataacaactccatctatacttaatagt
gtaagtgatgttgaacttttgaaaagaataccatggcaattaatggttgttgatgaagca
catcaattaaaaaatcgtcaatcaaaaagatttatagaattgaaacaatttatggcagaa
tcgaagcttttgcttagtggtacgccattacataataatttagaagaattatggaccttg
ttacatttcttaaatccacaacaatatacatattatgaagcatttcaaaaaaaatataat
gaaattgagaatactagtttaattggggaagctaaacaaaagcaattgatgcaattacaa
catgaattacatgaagtaattttaagaagagtaaaaaaagatgttgaaaaatctcttcca
aataaagtggaaagaattttacgagttgaattatcacctatacaaatagaatattataaa
aacattttaacaaaaaattatgaacaactagctaaagcatcaggtggtgcaaaaaattca
ttacaaaatatatgtatggaattaaaaaaagtatgtaatcatccatttttatgttgtgag
ccaattgataaagatgaatatagagagcgattagtatattcaagtggaaaaatatgttta
ttagaaaagttattaattagattaaaagaacgagggaatcgtgttttaattttttcacaa
atggtgaaaatgttgaatatattaagtgaatatttaacgttaagaggttttaaacatcaa
agattagatggtacaatgacaaaagaaatgagaaaaaaagctatgaatcattttaatagt
aagaattctgatgattttgtatttttattatctacaaaagctggaggattaggaattaat
ttaacatctgccgatacagttattatatatgattctgattggaatccacaaaatgattta
caagccggtgctagagcacatcgtataggacaaacaaagacggtgcagatatatcgttta
gtaacaaaagattccattgagcaaaccattttagaaagggcaaaggtgaaaatggtttta
gatacattagttgttcaaggattaaataaaaaacaaaatgataatgtaaattttattgga
ggagaaggtagtaattcttctaatggttttacaagagaagaattatcaaaaattcttaaa
tttggttctcaaaaattatgggaaaagaatagctcgaaatattctccacaagatggagag
gatggaaaaaatattataaaaggtgttgatgtcgatttagataagattttggaagaagcc
gaagctaatgagaacactaataatgcgaataaagatataaattctgaattaaatagttta
caaaatggtgccggtagtagcttttttaatagtaatagcaatttatttggtgggggtgct
ggtgttgctggtgtaaataatattggtggtggaggaattgctgacgatttattaagttcc
tataataatattacggagtttaaatatgagcctcctgagaatttaaaaagcaatatatta
tataatgattcaacaaaacaaggtgaaatagatatagaggagaatgacaaagatttttgg
gacaagacaatacctttagaagaacgattgaaattaaaaaaaatgaaagaagaagaatta
ttagtacatggtcctagaaaaacccgaacccgagatgctagatataaccaaggattatat
tatgatggtggagcaaataataataatagtgatggagatgatagtgatgaatttacaatt
aaatatactgataaatataataaaaatttaaataaaaagaaacgaaaaagaagaacatct
acacaaattactgaaaaagataagttccgtttgtataggtctatattaaaatttggtaat
ccaacattacgtattgatgatatacaatttgattcgaaattaatgaaggtcgataggaat
gtaattttaactgagttaaatattattgtagatacatgtaaagagatagtggaaagagtg
tcaaaggatggtaataataatggtcaaggtgctttagctaacccgaatgtaaaaatggat
aacgatgagcaaaatgaatataatgaagatggtgagccttcagtaaatgtaaagaataat
gatatgagtatagaggtgaaaggagagaaagatcaacaatctgaagaggctaatgatgaa
aatgataaaagtacaagaggaaaaagaagtactagaggcactaccgtttcatctactggt
gaaaatggcgaagcagctgatgattctaagaaggaagaaaataatacaggtggtggattc
ttttcaaaatttatgaaattcacaaaaggtagcactgaacctaagagagaagatgaaata
gaaggaaagggaataaaaacaaagacagaagatgatacggttaaagatgaattagatgat
gatatgataaaagatgaattaaatgatgaaagtgataataataataaaacaaaaggtgaa
agaggaagaaaaatagatgcatatacattttatattggtactaataaagctaatgcttta
gatttatgtcatagattacagctatttaagagtttacatgattttataaaggaacaaaat
aatgataatgaatatagttttagattaccgttaatacctttaaatggtgcgaatggtgat
gttggtgtgattgaaactgcgggaggtaatagtaaaagcagtgcaaagaatgataaaaca
aaaggtaaaaaagacgaccctgaagcagctgctactactgcaaatacggaaggagaagaa
ggaaaaacttctaatggatatgaaggtgcagaatcatctatgcttgtcggtggtaatcct
tctgatgattatttaaaattaaaattaccaaattatatatttgatcatttgagagattta
tctacaaaagatgtaaaagcatggactaaagaaaatgatgagaatttaataaagggagta
tatatatatggttttggttcatttaatgaaatatgtgcagatgtgaatttaaatttagaa
catatgaaaaatataaaatgggataagataaaaatgcgatgtataaaaatattgaaaatg
atagaagagtacacttctagtaataaggaaggaacaactggtaagaaacgacgacgagct
cgaggaaaaaataaaaataatgatgaaataaaagatgagtatggtaataatacatcaatt
aaatcggaggaaaatggtggaacaagtaagggtaataatgcaagtggtcgacatggtaat
agtaattacggtcgaagaagtagtgaacgagttaaagctatatattcacaagaagataaa
gaaactggaggtgtattgaaaaaaagggcactatcttctagaaagggagaaagagataat
aaaaacggatcatctaaattagaaaatgtatatgatattaatagcaaaggggacaataca
ttattatcatcatcaacagctgataaaagaaggagaagaggtgtttcatctaaatcttca
aatgtaacattaaaaaatgaaaaaaccaatagtaaatgtattattgaatcttctgaatgt
tcctcttcaaacgaacaaaaaagtaatggaagtgatgaggatgacgatgacgagagtaat
gttaatattgtaaaaagatcgggtcgtagtggtagtaacagaagtagtagtagaatgaat
tcctatgaaaattataaattaacaagacgtagaagtactagaacccgtagagggggtaat
gattccattgtgggaagtgaatgtataaattcaattgatcccgatggagatgatgaatat
tataatgatccaaatgatcgaaaaaaattaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagataaaaaa
aaaaaattaactgatgaagaaattatagaaataattaaaaatacaaatttaagagaaatg
gatcaacatagtataaataaattaacaaaaaaacctttgaaaaaatataaaaaattatta
aaaatagttaaaaaggtattatcttcaattgaattgggagaagttgaggaagatgaatct
gaagaaattcgtaaaaaaacggatgaacttattttctatattgggaactatattggtgaa
ttctttgatcactgtgcagatagtgaatgcaaagatatattaaataattctggttgggaa
tatatatcgaattttatgaatgaaacaagtgacgatttaagatcaaaatatgaacaactc
aaatcgtcaaacttaaaagatagtaataatgctgatataacagaagaaaatattatttca
tttttttattctaaaaaaggttcgggttcactatatcctgaagatgatccagatgatgga
atggatgaataa

DBGET integrated database retrieval system