Plasmodium chabaudi: PCHAS_0826900
Help
Entry
PCHAS_0826900 CDS
T01108
Name
(RefSeq) armadillo repeat protein, putative
KO
K14327
regulator of nonsense transcripts 2
Organism
pcb
Plasmodium chabaudi
Pathway
pcb03013
Nucleocytoplasmic transport
pcb03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcb00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
PCHAS_0826900
03015 mRNA surveillance pathway
PCHAS_0826900
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pcb03019
]
PCHAS_0826900
Messenger RNA biogenesis [BR:
pcb03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Surveillance factors
Surveillance complex
PCHAS_0826900
mRNA cycle factors
P-body specific factors
PCHAS_0826900
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Katanin_con80
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3497219
NCBI-ProteinID:
XP_016653827
UniProt:
A0A4V6Z8K8
LinkDB
All DBs
Position
8:1040667..1044701
Genome browser
AA seq
1344 aa
AA seq
DB search
MDSDIKNSEEDIGCPSNETENDILRNKIANRIDKQNNDENNEKSGEDIKKQMSIIQIHKF
INRLKNANIKSLEKNDIIKLEDDIKTLNISKYLSEIISYILNLSIHINKYSDIFILLNIL
KYICLNYNNVDYLIEKLIFIKFFKLDEKDSNYFFIIFHDIYNNVDNHSYSNSSEGHNSSS
DSKVFEKNLFDEKHGSQTEDSGNTKCDNPGLSTLGVEENYNNKAESVNKLNKIKSEIFKK
MTSYFYKENNENIENIENQTFLFQNNFNDKRMEYVSLPIWTNSSNEINSKDKIGSKNNSE
KKLYIQEMIKNCNVVKNVEKQNRLRKILLCLYFELVLLKICNNKDMLIYMFINITFYSSL
NMDVNSLGKETEKGFKGGSSKLGTHSYNIEKKNNDKLSEIDPLNMVKKCLCVNTIVVYDY
FFTNTMSLFSDSARCNPILNHVKDVKNYIIEFFNNFYKFSMYRILTYLYAEHVDNEYRNG
NKKVASNEDHYFFKIYNKSKNFCLLFTHLNKFNLNQIQIEGIQLLGVDKNSYNYIINSDR
LKKQNDEQRQKSKAQSLLELSTNSLLTQNNNNCVDNEQEEICYEWKNIEEQNFYTVFPEY
SNININLNDEENDEEDIILERIENGGENVLKKKKNKHDEFGNYTNKIINMNNEKDLENMV
MIFLLNYNTKKKRKIIATKLIYLNKIILNLIPFYCRYIAILNKYTKDICLIIIDELKRII
EKDVKNKLPCQSKKTKCIKYICELVKFKLLDMSYVLDILNLLIENFTQDHLELCFYILEN
SSILLVSNSKTHIRFLYILEKLKKIKNTKNIPSSLENVFEECCIKVNNYLVEKTKRNNLF
SNDNTHLDLNKINYKGNNISNQLSNQDKKKKKFFLKKLLLQDMNNMEDENAYDISKYIRK
YNWNETFITHFLNKYIYKYLKYMTIYQINKIASLLYYIAIYKPQFVIHIIDELNEKIIKS
FEDNDFKTFPYLIQYAHLFSGLYIYKTISSSNVFDLLYFLLSFSDTSMSNASNIFEIYKL
FSQNVKFVKMVKDKVLAKRLLLPNGENEKMGTQSVCDSLGEAGQVNGGQGKAGQANQIRD
GQGKGNHVSSGPFHYDADIESCSKFLFINNKNPILNNMLKDEDSSSFINIRMACIIIENC
FKYFTNIPLLKFKLNIYFLFFIRFLLIFESLPIYIKTITDNILKQGSLNMTYFKTIRDVD
KILFAILNYEYKIFQNEIKEDEQSSDELPFFDSDLNFKLDNVENGEEGKILKNEGGKNLA
STPSTKHIKDAKQNRIDNKSSLNENDTSTNLTKYDEMDNEINQIIKESIDENRLTKNNKT
QTSANFKKKFYLQPFIKKGSVKLC
NT seq
4035 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatagtgatataaaaaattcagaggaagatattgggtgtccaagtaatgaaacagaa
aatgatatattacgtaataaaattgcaaacagaatagacaagcaaaataatgatgaaaat
aatgagaaaagtggtgaagatataaaaaaacaaatgagcattattcaaatacataaattt
attaatagattaaaaaatgcaaatataaaaagtttggaaaaaaatgatattataaaatta
gaagatgatataaaaacattaaatataagtaaatatttaagtgaaataattagttacatt
ttaaatttaagtatacatataaataaatattctgatatatttattttgttaaatatttta
aaatatatttgcctaaattataataatgtagattatttaattgaaaagttaatatttatt
aaattttttaagcttgacgaaaaagattccaactatttttttattatttttcatgatata
tataacaatgtagacaaccatagttactccaattcttctgaagggcataactcttcaagt
gattctaaagtttttgaaaaaaatttatttgatgaaaaacatggttctcaaaccgaagat
agtggtaatacaaaatgtgacaaccctggtctttccactttaggggtagaagaaaattac
aataataaagctgagagtgtaaataaattaaacaaaattaagagtgaaatatttaaaaaa
atgacatcatatttttataaagaaaataatgaaaatattgaaaatattgagaatcaaact
tttttatttcaaaacaattttaacgataaaaggatggaatatgtttctttgcctatttgg
acaaactcatcaaatgaaataaatagtaaagacaaaataggttcaaaaaataattcagaa
aaaaaattatatattcaagaaatgatcaaaaattgtaatgttgttaaaaatgtagaaaaa
caaaataggttgagaaaaatattattatgtttatactttgaattggtattacttaaaatt
tgtaataataaagatatgttaatatatatgtttataaatataacattttattcatctcta
aatatggatgtaaatagcttagggaaagaaacagaaaagggattcaaaggtggatcatca
aaattagggacacactcttataatatcgaaaaaaaaaataatgacaaattatctgaaata
gatccattaaatatggttaaaaagtgcttgtgtgttaatacgatagttgtctatgattat
ttttttacaaacacgatgagtctatttagtgattcagctcgttgtaatcccatattgaat
catgtgaaagacgtaaaaaattatataatcgaattttttaataatttttataagttctct
atgtacagaatattgacatatttgtatgccgaacatgtagataacgaatacagaaatggt
aataaaaaagttgcatcaaatgaggatcactatttttttaaaatatataacaaaagtaaa
aatttttgtcttttgtttacgcatttaaataagtttaatttaaatcagattcaaatagag
ggtatacaattattgggtgttgataaaaatagttataattatataataaattcagaccgt
ctaaaaaagcaaaatgatgagcaaagacaaaaaagtaaagcacaatcgttgcttgaattg
tctaccaactccttacttacacaaaacaacaacaattgtgtagacaatgaacaagaggaa
atatgctatgaatggaaaaatattgaagaacaaaatttttacactgtttttccagaatat
tcaaatattaatataaatctaaatgatgaagaaaatgatgaagaggatataattttggaa
aggattgagaatggaggagaaaatgttttaaagaaaaaaaaaaataaacatgatgagttt
ggtaattatacaaataaaataattaatatgaataatgaaaaggatcttgaaaatatggtt
atgatttttttattaaattataatacaaagaaaaaaagaaaaataattgcaacaaaactt
atatacttaaataaaattattcttaatttgattccattttattgtagatatatagctatt
ttaaataaatatacgaaagacatttgcttaataataatagatgaattaaaacgaattatt
gaaaaagatgtaaaaaataaattaccgtgtcaaagtaaaaaaacaaaatgtataaaatat
atttgtgaattagttaaattcaaattattagatatgtcttatgtattagatattttaaat
ttattaattgaaaattttacacaagatcatttagaattatgtttttatattttagagaac
tcgtctatattattagtaagcaattcaaagacacatatacgttttttatatatattagaa
aaattgaaaaaaataaaaaatacaaaaaatataccatcatcgttagaaaatgtgtttgaa
gaatgttgtattaaagtaaataattatttagtagagaaaacaaaaagaaataatttattt
tcaaatgataatacacatttagatttaaacaaaattaattataaagggaataacatttct
aatcaattgtctaaccaagataaaaaaaaaaaaaaattttttttaaaaaagttgttactt
caagatatgaataatatggaagatgaaaatgcatatgacatatctaaatatataaggaaa
tacaattggaatgaaacctttataacacattttttaaataaatatatttataaatattta
aaatatatgactatttatcaaataaataaaatagcatccttattatattatatagcgatt
tataaacctcagtttgtaatacatattattgatgaactaaatgaaaaaattataaaaagt
tttgaagacaatgattttaaaacatttccatatcttatacaatatgcacatttattttca
ggattatatatttataaaacaataagttcatctaatgtttttgatttattatattttcta
ctttccttttcggatactagtatgtcaaatgcttcgaacatttttgagatctacaaactg
ttttctcaaaatgtgaaatttgtgaaaatggttaaagataaagtgctagcaaaaaggctt
ttactgccgaatggagagaacgaaaaaatgggcacccaatctgtttgcgattcgttgggt
gaagcaggtcaagtcaatggtgggcagggtaaagcaggtcaagcaaaccaaattcgtgat
ggtcaaggtaaagggaaccacgttagtagcggaccgtttcattacgatgctgatatagaa
agctgttccaagtttctgttcataaataataagaacccgattttaaataacatgttgaaa
gatgaagacagtagtagttttattaatattaggatggcatgtataattatagagaactgt
tttaaatattttactaacattcctttgttaaaatttaagttaaatatatattttttattt
tttattcgctttttattaatatttgaatcattaccaatatatattaagacaatcacagat
aacatactaaagcaagggagtctaaatatgacctactttaaaacaataagagatgtcgat
aaaattttgtttgcaattttaaattatgaatataaaatatttcaaaatgaaataaaagag
gatgaacaaagtagtgatgaactgcccttctttgattcggatctcaactttaaacttgat
aatgttgaaaatggagaggagggcaaaattttgaaaaatgaaggtggcaaaaatttagct
agcaccccttcgactaagcatataaaagatgcaaaacaaaataggattgataataaatcg
agtttaaatgagaacgatacaagtaccaatttgacaaaatatgatgaaatggataatgaa
attaatcaaatcataaaggagtctatagatgaaaataggctaacaaaaaataataagaca
caaacatcagcaaattttaaaaaaaaattttatttacagccttttattaagaaaggatct
gttaagttgtgttga
DBGET
integrated database retrieval system