Plasmodium chabaudi: PCHAS_1017900
Help
Entry
PCHAS_1017900 CDS
T01108
Name
(RefSeq) DNA mismatch repair protein MSH2, putative
KO
K08735
DNA mismatch repair protein MSH2
Organism
pcb
Plasmodium chabaudi
Pathway
pcb03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcb00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
PCHAS_1017900
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
pcb03400
]
PCHAS_1017900
DNA repair and recombination proteins [BR:
pcb03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
Mismatch and loop recognition factors
PCHAS_1017900
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
MutS_III
MutS_II
DUF7309
MutS_IV
DUF6447
AAA_27
Tocopherol_cycl
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3486934
NCBI-ProteinID:
XP_733962
UniProt:
A0A077YFY5
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(707964..710399)
Genome browser
AA seq
811 aa
AA seq
DB search
MENNETVEVNNDEILCLFIDTKKYQKTIGVCFYNYLKCEFLMTEFIDNGYFTALESLFIQ
KRPCKCFFNSTTDLVDDEKVLNLFKMCNIEPILTDKKKYDITNLKEELKSIIPQNDDIRN
YDKHLELENASKCLMVLINYLKFKEDEDINYQCSINIYNMNLYMRLDKAAITALNILPNK
KNTHSYNNNTSLLKFLDKCNTSIGSKKLVSWLTQPLTNALEINQRLNIVETFINEDDIRN
SVFCNYLKRIPELDKLNHYLKEINKNNDIRVNSKYNEEMILKDIVKLYYAILDFKQIYFL
LVSINGKHKETLNEILIKPLHDILNKFSRFLDMIEMTIDLKEIEENKVYLISKHFDSELE
EIYNEKSALMKKIKNHKEDVEKDLFSDKHDRRNKKAMREDIRLIECNTNGFLFRVCKKDC
PLVQQQKKKYLPIRMNKNEFLFTTNTLKNLCREYEHCLSIYNTLQSEIVKKTICAVSTYT
PVIEKFIDVVSTLDVLVSFSVVCYNSPFTYVRPALVKNGENVIMKKSRHPLLELQHNISN
FIPNDIHMNKNKSRLIIVTGPNMGGKSTYIRQIAIICILAQIGMFVPCDFCEIPIFTQIM
CRVGASDFQLKGISTFLSEMIEASAIIKNADNNSLIIVDELGRGTSTYEGLGISWSIGKY
ILDNIKCFCLFATHFHEMSNIAYQCEGVINRHIETIIDQKNKKICFLYEIKDGASNKSYG
VNVAEIAKLPKDVIQKAYEKVEELESAENKYYLKEKLNIDTSSSTNETYKNNISNYVKIK
DEINYIFSSTDESEFIKRFMSKKAYLKELTI
NT seq
2436 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaataacgaaacagtcgaggtaaacaatgatgaaatattatgtttattcatagat
acgaagaagtatcagaaaacgataggtgtttgtttttataattatttaaaatgtgaattt
ttaatgactgaatttattgacaatggatattttactgccttagaatcattgtttatacag
aaaagaccatgcaagtgtttttttaatagtaccacagatttagttgatgatgagaaagtt
ttgaatctatttaagatgtgtaatatagaacccattttaacggataaaaaaaaatatgat
ataacaaatttaaaagaagaattaaaatcaataataccacaaaacgatgatattcgaaat
tatgataagcatttagagttagagaatgcaagtaaatgtttaatggtgttaataaattat
ttaaaatttaaagaagatgaagatataaattatcaatgcagtattaatatatataatatg
aatttatatatgagattagataaggctgctattactgcattaaatatacttccaaataaa
aaaaatactcatagttataataataatacaagcttattaaaatttttagataaatgtaac
acttctattgggtctaaaaaattagtttcttggttaacacagccattaacaaatgcttta
gaaattaatcaaagactaaatattgttgaaacatttataaatgaagatgatatacgtaat
agcgttttttgtaactatttaaaaaggatacctgaattagataaattaaaccattaccta
aaagaaataaataaaaataatgatattagagtaaattcgaaatataatgaagaaatgata
ttaaaagacattgtaaaattatattatgcaattttagattttaaacaaatatatttttta
ttagtatctattaatggaaaacataaagaaacattaaatgaaattcttattaaaccttta
catgatatattaaataaattttcaagattcttagatatgattgaaatgactattgattta
aaagaaattgaagaaaataaagtttatttaatttcaaaacatttcgattcggaactagaa
gaaatatataatgaaaaaagtgcattaatgaaaaaaattaaaaatcacaaagaagatgtc
gaaaaagatttattttctgataaacatgatagacgtaataaaaaagcaatgagagaagat
attagattaatagaatgtaatactaatggatttttatttagagtgtgtaaaaaagattgt
cccttagttcaacaacaaaaaaaaaaatatttaccaatacgtatgaataaaaacgaattt
ttatttacgacaaatactttaaaaaatttatgtagagaatatgaacattgtttaagtatt
tataatacactgcaatcagaaattgtaaaaaaaacaatatgtgctgtatctacatatacc
ccagtaattgaaaaatttatagatgtagtatctacattagatgtgttagtatcattttct
gttgtttgttataattcaccttttacatatgttagaccagcattagttaaaaatggagaa
aatgttattatgaaaaaatcaagacatccattattagaattacaacataatataagtaat
tttatacccaatgatatacatatgaataaaaacaaaagtagattaataatagttacagga
ccaaatatgggaggaaaaagtacatatattagacaaatagctataatctgtatattagca
caaataggaatgtttgttccatgtgatttttgtgaaatacctatttttactcagattatg
tgtcgagtaggtgcatctgattttcaattaaaaggaatttcaactttcttatcagaaatg
atagaagcatcagcaattataaaaaatgctgataataattcattaattattgttgacgaa
ttaggtagaggaacatctacatatgaagggttaggaataagttggtctattggaaaatat
attttagataatataaaatgtttttgtttatttgctactcattttcatgaaatgtcaaac
atagcttatcaatgtgaaggtgttattaacagacatatcgaaacaataattgatcaaaaa
aacaaaaaaatatgctttctatacgaaattaaagatggtgcatccaataaaagttatggt
gtaaatgtagctgaaatagctaaacttcctaaagatgttatacaaaaggcatatgaaaaa
gtagaagaactagaatctgctgaaaataaatattatttaaaagaaaaattaaatattgat
acttcctctagcactaatgaaacatataaaaataatatttccaattacgtaaaaattaaa
gatgaaattaattatattttctcttcaacagatgaaagtgagttcatcaaacgatttatg
tccaaaaaggcgtatctcaaggagctcaccatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
