Plasmodium chabaudi: PCHAS_1113400
Help
Entry
PCHAS_1113400 CDS
T01108
Name
(RefSeq) ATP-dependent DNA helicase UvrD, putative
KO
K03657
ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA [EC:
5.6.2.4
]
Organism
pcb
Plasmodium chabaudi
Pathway
pcb03420
Nucleotide excision repair
pcb03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcb00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
PCHAS_1113400
03430 Mismatch repair
PCHAS_1113400
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
pcb03400
]
PCHAS_1113400
Enzymes [BR:
pcb01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
PCHAS_1113400
DNA repair and recombination proteins [BR:
pcb03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
PCHAS_1113400
MMR (mismatch excision repair)
Other MMR factors
PCHAS_1113400
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
DEAD
AAA_22
AAA_30
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3497599
NCBI-ProteinID:
XP_016653956
UniProt:
A0A4V0K9B1
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(476180..479383)
Genome browser
AA seq
1067 aa
AA seq
DB search
MALENEGNSCNDSISVDEDDTDKINDDIINQILFRNLSEEQMKIVQVPLDYNLCIIACPG
SGKTSTLTARIIKSIIERKKSIVCITFTNYSAKDLKEKIIKKINCLIDLCTGKDIQNKLF
NRNKNIGGTKIRNKKYDINKTMYKNKFKVLDTTIFIGTIHSFCRYILLKYKGEFKILTES
INSNVIKMAFNNFCNSTMYKNCLVQGDGKTPNDPSIINKSDSTFNLSHFINCMKNNISKN
EEKKLEDEAIQSEGEDEEEDEYFFNYLYNFNSSMDKGNLEQLGEVKCILKKKEILFLKKK
IKLLKYVELYNMTNIEVNDIEKKFYENYKKIFEAEKYIYYDFDDLLIETYKLMKDNIPIR
NKILEEWNYMFCDEFQDINTTQFNILQFFANIQYDVKPTMDNEFGDDDMNIFVENDPSKF
IKKRSKNSKLQNNKRNKTKTSITVIGDDDQSIYAFRGAHASVFKKIIKECNCLLFKLSTN
FRSTKEIVRISNNLILNNGSCRINKKIYTNNIPGQKATFEIFKTNDDQISYVLAQIIFLK
KIYNLKFSDFAILSRTNKTLKETLINMNKYEIKKKSLKMFREFCKNLENKNIPSDTHENS
SKNEKQYESTTGNMTNVKSQEDSVSSKKEVPSDKMKEEWSEVNIGTFNIPIKELNKKKSF
FGSKEIIQLITLLRFLINVNDDVVFLKSFKIIKNSKLIKIIIHKLANNHIGQTHNAKDNN
NRNNHRNKSSKENMPLFEKVKTISQLYILSKRKELSTDQLAILNIFTENEIRVILDFFFV
VNHFLNICSKHNSVYTLVMDILKKTNFIKKIMKKIEESAENAANTMNDEQSDLVNDNNNS
SHMENATNCKSENDISTVSHKSGIENNSKEKESAHIKNGVNTVDYQNAHGKKRTFEECND
NAEIINNNNKENPNIINELEIKNNLKALFNINEEDYNHSQIQNIFIFLEITREYKPNLME
QTCYDCLICFLNDFKNNMHEKLLIEKVTLTTIHKSKGLEWKVVFIINVIEGEIPHVSANN
NEIIEERKIFYVGITRAKYILYLLCYVQNTHMSEKNTISRFIYQMKI
NT seq
3204 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctttagaaaacgagggtaacagttgtaacgactccataagtgttgatgaagatgat
acagacaaaataaatgatgatataattaatcagattttgtttagaaatttatcggaagaa
caaatgaaaattgtacaggtacctttggattataatttatgtattattgcatgtccaggg
tcaggaaaaacatccactttaacagctcgtattattaagagtataatagaaaggaaaaaa
tcaattgtctgtataacattcacaaattattctgctaaagatttaaaagaaaaaataata
aaaaaaataaattgcttgatagatttatgtacaggcaaggatatccaaaacaaacttttc
aacagaaataaaaacattgggggtaccaaaattcgaaataaaaaatatgatattaataaa
acaatgtataaaaataaattcaaagttttagacacaacaatatttataggaactattcat
tcattctgtagatatatacttttaaaatataaaggagagtttaaaatattaaccgaatca
ataaatagtaatgtaataaaaatggcttttaataacttttgtaattcaaccatgtataaa
aattgtttagttcaaggggatggtaaaaccccaaatgatccctctataattaataagagt
gatagcacatttaatctttcccattttatcaattgtatgaagaataatataagtaagaac
gaagaaaagaaattagaggacgaagcgatacaatcggagggcgaagatgaagaagaagat
gaatatttttttaattatttatacaattttaatagttctatggataagggtaacttagaa
caattgggtgaagttaaatgtatattaaaaaaaaaagaaatactttttttaaaaaaaaaa
ataaaattattaaaatatgttgaattgtataatatgacaaatattgaagtaaatgatatt
gaaaagaaattttatgaaaattataaaaaaattttcgaagcagaaaaatatatttattac
gattttgatgacttattaatagaaacatataaattgatgaaagacaatataccaatacga
aataaaatattggaagaatggaattacatgttctgtgatgaatttcaggatataaataca
acacaatttaatattcttcaattctttgctaacatacaatatgatgttaaacctactatg
gataacgagtttggtgatgatgatatgaatatttttgttgagaatgatccaagtaaattc
ataaaaaagcgttctaaaaatagtaaactacaaaataataaacgaaataagacaaagaca
agtattactgtcataggggatgatgatcaatcaatttatgcctttagaggagcacatgct
agtgtttttaaaaaaattataaaagaatgtaattgcctactatttaaactaagtacaaac
tttcgaagtacaaaagaaatagtaagaatatcaaataatttaatattaaataatggaagt
tgtagaataaataaaaaaatatatacaaataatataccaggacaaaaagcaacttttgaa
attttcaaaacaaatgatgatcaaatatcatatgtgttagctcaaattatttttttaaaa
aaaatatataatttaaaatttagcgattttgctatattatctcgtactaataaaacttta
aaagaaactcttataaatatgaacaagtatgaaattaaaaaaaagtctttaaaaatgttt
cgagagttttgtaaaaatttagaaaataaaaatatacccagtgatactcatgaaaatagt
tcgaaaaatgaaaaacaatatgagtctacaactggaaacatgacaaatgtaaaaagtcag
gaggatagtgtctcttcaaaaaaggaagttccctctgataaaatgaaagaagagtggagc
gaagtaaatattggcacttttaatataccaataaaagaattaaataaaaaaaaatcattt
tttggatcgaaagaaattattcaattgataacattacttcgttttttaataaacgtaaat
gatgatgtagtttttttaaaatcttttaaaattataaaaaatagtaaattgataaaaata
attattcacaagctagctaataatcatattggacaaactcataatgctaaagacaataat
aataggaacaatcatagaaacaaatcaagtaaagaaaatatgcctctctttgaaaaagtt
aaaactatttcacagttgtatattttgtctaagagaaaagaacttagcaccgatcagcta
gccattttaaatatatttacagaaaatgaaataagagttattcttgactttttttttgta
gtaaaccattttcttaacatttgttcgaagcataattcagtttacactttggtaatggat
atattaaaaaaaacaaactttataaaaaaaataatgaaaaaaatagaagagagtgcagaa
aatgctgctaacacaatgaatgatgaacagtctgatttggtgaacgataataataattca
tcccatatggaaaatgcaacaaactgtaaaagtgaaaatgatatatccacagtaagccat
aaatcaggtattgaaaataatagtaaagaaaaagaaagtgcacatataaagaatggcgtt
aatacagtggattatcaaaatgcgcatggaaaaaaacggacgtttgaggaatgtaatgac
aatgcagaaataatcaataataataataaggaaaaccctaacataataaacgagttagaa
attaaaaataatttaaaggcgctcttcaacataaatgaagaagactataatcatagtcaa
atacaaaatatatttatatttttagaaataacaagagaatataaacccaatttaatggaa
caaacatgctatgattgtttaatatgttttttgaatgattttaaaaataatatgcatgaa
aaattgttaattgaaaaagttacattaacaactatacacaaatcaaaaggattagaatgg
aaggttgtatttattataaatgttatagagggtgaaatacctcatgtttctgcaaataat
aatgaaatcattgaagaaagaaaaattttctatgtaggtataacaagagcaaaatatata
ttatacttattatgttatgtacaaaatactcatatgtctgaaaaaaacactatatcacga
tttatatatcaaatgaagatttaa
DBGET
integrated database retrieval system