Plasmodium chabaudi: PCHAS_1124000
Help
Entry
PCHAS_1124000 CDS
T01108
Name
(RefSeq) poly(A) polymerase PAP, putative
KO
K14376
poly(A) polymerase [EC:
2.7.7.19
]
Organism
pcb
Plasmodium chabaudi
Pathway
pcb03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcb00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
PCHAS_1124000
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pcb03019
]
PCHAS_1124000
Enzymes [BR:
pcb01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.19 polynucleotide adenylyltransferase
PCHAS_1124000
Messenger RNA biogenesis [BR:
pcb03019
]
Eukaryotic type
mRNA processing factors
3' end processing
Poly(A) addition factors
PCHAS_1124000
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAP_NTPase
PAP_central
PAP_RNA-bind
NTP_transf_2
MTPAP-like_central
DUF4269
Nrap_D2
Polbeta
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3485794
NCBI-ProteinID:
XP_732847
UniProt:
A0A077TLL5
LinkDB
All DBs
Position
11:<845120..>846961
Genome browser
AA seq
613 aa
AA seq
DB search
MHTVYKSESLIECSNFLLCSKEEIEEFLELNEIKHDNEETYINYNIECALNKNVHDKKDE
ISNRRNIITNDNVTENKKHEYGVSDPVSLDYPTEEDLKKGNDVVELLKSYNLFETEQALK
KREKVLGMINKLFHEFVIELSISQGINEEEAKEIYGNLYTFGSYRLGVITPNSDIDCIFL
APQNVTREIFFNEFYLKLQQDRNVKKLQALPETYTPIIQFMYDDVDIDLLLATLPYRTLK
DCRYTLDNDYILKNLDEVTVRSLNGIRVADLILGSVPNKDNFRNTLRFIKLWAKRRGIYS
NILGFLGGISWALLTAKICQIYPNYNISQLICKFFRVYSIWNWKYPVLIQNIKKYNVEGL
KNFTIWDPEKNVKDKLHIMPIITPAFPCMNSTHNVTYCTRSILIEEFKRAHSIISYMELN
PDADIGQVMEHVNNLMSHGNAININNVAKSGDIENVNIHSSSSSIWSCIIEPFDLFKTYK
HFLHIQIMGTNELIYNLWKGWIESKIRLLFKKLETINELKIRPFPKFYTYKKDKFYYCSS
FFIALIFFFKNPYDNTFNLSYAIRDFIDIVLNWPQKNKYANSFKINISYQKVSQVLDFLS
SVSNDSKENNGDS
NT seq
1842 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcatacggtttacaaaagcgagagtttgattgaatgtagcaattttttattgtgcagt
aaagaagagatcgaggaatttctggaattgaatgagataaaacatgataatgaagagaca
tatataaattataatatagagtgtgcattgaataaaaatgtgcatgataaaaaggatgag
ataagtaaccgaagaaatataataacaaatgataatgtaactgaaaataaaaaacacgaa
tatggtgtatcagatcctgtatctttagattatccaacagaagaagatttaaaaaaaggt
aatgatgttgtagaattattaaaaagttataatttatttgaaactgaacaagcattaaaa
aaaagagaaaaagtattaggtatgataaataaattatttcatgagtttgtaattgagtta
tctataagtcaaggaataaatgaagaggaggcaaaagaaatatatggaaatttatataca
tttggttcatatagattaggagtaataacaccaaatagtgatattgattgtatattttta
gcaccacaaaatgtaacaagagaaatattttttaatgagttttatttaaaattacaacaa
gatagaaatgtaaaaaaattacaagcattgccagaaacatatacacctattattcaattt
atgtatgatgatgtagatatagatttattattagcgacattgccatataggactttaaaa
gattgccgttatacattagataatgattatatacttaaaaatttagatgaagtaacagtt
cgatctttaaatggtatacgggttgctgatttaattttaggttcggtaccaaataaagat
aattttcgaaacactcttagatttataaaattatgggcaaaaagaagaggaatctatagt
aatattttaggttttttaggaggtatttcatgggcattattgacagctaagatttgtcaa
atatatccaaattataatattagtcaattaatttgtaaattttttagagtttattctata
tggaattggaaatatcctgttcttatacaaaatattaaaaaatataatgttgaaggatta
aaaaattttactatatgggatccagaaaaaaatgttaaagacaaattacatatcatgcca
attattacccccgcttttccttgtatgaattcaacacacaatgttacatattgcactaga
agtattttaatcgaagaatttaaacgtgcccactccattattagttatatggaattaaat
ccagatgcagatattggacaagttatggaacatgtcaataatttgatgagtcatggaaat
gctattaatattaataatgtagcaaaatctggtgatattgaaaatgttaatattcatagt
agcagtagtagtatatggtcatgtattattgagccttttgatttatttaaaacatataaa
cattttttacacattcaaattatgggaactaatgagcttatatataatttatggaaaggt
tggatagaaagtaaaattaggttactctttaaaaagttagaaactattaatgaactaaaa
attcgaccattccctaaattttatacttacaaaaaagacaaattttattattgctcttct
ttttttattgcccttatatttttttttaaaaacccttatgacaatacttttaacttatca
tacgcaatcagagattttatagacattgtcctaaattggccacaaaaaaataaatatgca
aactcatttaaaattaacatcagctaccaaaaagtatctcaggtcttggacttcttgtca
agcgtttcaaatgattcaaaggaaaataatggagatagttaa
DBGET
integrated database retrieval system