Plasmodium chabaudi: PCHAS_1130400
Help
Entry
PCHAS_1130400 CDS
T01108
Name
(RefSeq) large subunit rRNA methyltransferase, putative
KO
K14857
AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 [EC:2.1.1.-]
Organism
pcb
Plasmodium chabaudi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcb00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
pcb03009
]
PCHAS_1130400
Ribosome biogenesis [BR:
pcb03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
Other pre-60S particles
PCHAS_1130400
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsJ
Spb1_C
DUF3381
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3495260
NCBI-ProteinID:
XP_016654032
UniProt:
A0A4V0K9Q3
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(1096311..1099437)
Genome browser
AA seq
995 aa
AA seq
DB search
MGKKKKVGKERIDKYYKLAKSAGYRARSAFKLIQIAKKYNIFKNANILIDLCAAPGGWLQ
VAYKNMSKSSTIIGVDLMPIRKIDNNVITIKSDITSVECIRKIKDIIKYEKADVILNDGA
PNVGTTYSYDSFNQNILVLSSIKLAYKFLTRGGIFITKVFRNEEYVSLIWVLEKLFTEVK
HIKPRSSREISSEIYLIGLNFLGNKIDKKYFDYTYIFSSQFRKDENKLPNSHSKGKGNDE
SENDSSENDSDSNTAKQKAKKKKGLSSILKEKKKKNRQGYEEGDDYRITNITDFINNDNY
VDLLIKSNKFIFDKNYENSPSLLIKKTYEAIYTNKSTNNEIFNLCKDLKVLGKSDLFHLI
KWRYKIKKSVTKLLMDSKEKTKQDVNDEEENTNTTFAISKEESPISAEKINTKSTVCDDK
SDELSNSSDEESGNESINEFSKYIDKKEKKLKKKKEKKLKKELEKKKINKPLKIDYDEND
IHFSKDMLNLLNKQKFTDHLNILNSSKSNNKLDINEENFSASDEENDEDQIYDEIDEDDE
LGRLEYLVDLDYKQQKIKENKKNDENKDEKLTRRKRAMDFKNEELMKIQKIMELKNEELM
MKKKLNEYLSEDEDDSDISSDEDEMEENDNDSLETNQDTQTDKYEDAINQNEHIKKIVDK
ILMIRKNLKEKEPEDESPTSTNRFFDQKIFSNIFNQLNNDENGEDAEHAENSEEGDEEDA
EEEEESSDEIKEVSAKNLPKIPLPAKLAKKEKNKKLREKYGNNETKIKNASFSIVKTDTN
NSEHVNKYFSNLIKDDDELAFIKYVGEKLIHKKSRMDLIDDSFNRHSYLEDEDTLPEWFV
EEEKKYRRPVIPIDKTVLDQYKSKINRITKMPIKKVIEAKMRNKKREITKMKKLEAKIGR
IEKDEDDPFLKQRAIANVLKKNKSEKKREKSYVVCTGKGSKMAKKNKKGGKTMVKFVDKR
LKKDKKAKKRIEKKKKNMTRVKYSKSRPFKFKKFF
NT seq
2988 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggaaaaagaaaaaggtcggaaaagagagaatagataaatattataagctagccaaa
tcagcaggatatagagctaggtcagcatttaagttaattcaaatagcaaaaaaatataat
atatttaaaaatgcaaatatattaatagatttatgtgcagcaccaggaggatggttacaa
gtggcttataaaaatatgagtaagagcagtacaattataggagttgatttaatgcctatt
cgtaaaattgataataatgtaattactataaaaagtgatataacttcagttgaatgtata
agaaaaattaaagatataataaaatatgaaaaagcagatgttatattaaatgatggggca
cctaatgttggtactacatattcctatgacagttttaatcaaaatattctagtgcttagt
agtatcaaattagcttataaatttttaacaagaggaggaatattcattacaaaagtattt
agaaatgaagaatatgtatctttaatttgggttttagaaaaattatttacagaagttaaa
catataaaaccaagaagtagtagagaaatatcttctgaaatttatttaattgggctcaac
tttttaggaaataaaattgataaaaagtattttgattatacttacatatttagtagccag
tttaggaaagatgaaaataaattacctaactctcattcaaaaggtaaaggaaatgatgaa
tcggaaaatgatagtagcgaaaatgatagtgatagtaatactgctaagcaaaaagcaaag
aaaaaaaaaggattaagtagtattttaaaagaaaaaaaaaaaaaaaacagacaaggttat
gaagaaggtgatgattatagaataacaaatataactgattttataaataatgataattat
gttgatttattaattaaaagtaataaatttatttttgataaaaattatgaaaattcgcca
agcttattaataaaaaagacttatgaagctatctatacaaataaatcaacaaataatgaa
attttcaacctctgtaaagatcttaaagttttgggaaaatcagatcttttccatttgatc
aaatggagatacaaaattaaaaaatctgtcacaaaattgttaatggatagtaaagaaaaa
acaaaacaagacgtaaacgatgaagaagaaaatacgaatactacttttgcaattagtaaa
gaagaaagcccaataagtgcagaaaaaattaatacaaaatcgacagtttgtgatgataaa
tcagatgaattgagtaattcctctgatgaagaatcaggaaatgaaagtataaatgaattt
tcaaaatatattgacaaaaaagaaaaaaaattaaaaaaaaaaaaagaaaaaaaattaaaa
aaagaacttgaaaaaaaaaaaataaataaaccacttaaaatagattatgatgaaaatgat
atacattttagtaaagatatgttaaacctattgaacaaacaaaaatttacagatcattta
aatatattaaacagtagcaaaagtaataataaacttgatatcaatgaagaaaacttttca
gctagcgatgaagaaaatgacgaagatcaaatttatgacgaaatcgatgaagatgatgaa
ttaggtagattagaatatctagttgatttagattataaacaacaaaaaattaaagaaaat
aaaaaaaacgatgaaaataaagatgaaaaactaacaagaagaaaaagggcaatggatttt
aaaaacgaagagttaatgaaaattcaaaaaattatggaacttaaaaatgaagaattaatg
atgaaaaaaaaattaaatgaatatcttagtgaggatgaagatgattcagatatctcatct
gatgaagatgaaatggaagagaatgataacgacagtttagaaaccaatcaagatactcaa
actgataaatatgaagatgcaataaatcaaaatgaacatattaaaaaaatagttgataaa
attttaatgatacgaaaaaatctaaaggaaaaagaaccagaagatgaatctccaacaagt
acaaacagattctttgatcaaaaaatattctctaacatatttaaccagttgaataatgat
gaaaatggtgaagacgctgagcatgctgaaaattctgaggaaggggatgaggaagatgct
gaagaagaagaagagagcagtgacgagataaaagaagtgagcgcaaagaaccttcccaaa
ataccgctacctgcaaaactagccaaaaaagagaaaaataaaaaattaagggaaaaatac
ggaaacaacgaaactaagataaaaaatgcatctttttctatagtaaaaacagatacaaat
aattctgaacatgttaataaatatttttcaaatttaattaaagatgatgatgaattagca
tttataaaatatgtaggagaaaaattaattcataaaaaaagtagaatggatttaattgat
gattcttttaatagacattcatatcttgaagacgaagatacattacctgaatggtttgtc
gaagaagaaaaaaaatatagaaggccagtcataccaatagataaaactgtactagaccaa
tataaaagtaaaattaatagaataacaaaaatgcctattaaaaaggttattgaagctaaa
atgagaaataaaaagagagaaattacaaaaatgaaaaaattagaagcaaaaattggaaga
atcgaaaaagatgaagatgacccattcttaaaacaaagagctatagcaaatgtattgaaa
aagaacaaatcagaaaaaaaacgagaaaagtcatatgttgtgtgcactggaaaaggatct
aagatggccaagaaaaacaaaaagggaggaaaaacgatggttaagtttgttgataagaga
cttaaaaaggataagaaagctaaaaagcgtatcgaaaaaaagaaaaaaaatatgacaaga
gttaaatattcaaaatcaagaccatttaaatttaaaaagtttttttaa
DBGET
integrated database retrieval system