KEGG   Plasmodium chabaudi: PCHAS_1130400
Entry
PCHAS_1130400     CDS       T01108                                 
Name
(RefSeq) large subunit rRNA methyltransferase, putative
  KO
K14857  AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 [EC:2.1.1.-]
Organism
pcb  Plasmodium chabaudi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pcb00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:pcb03009]
    PCHAS_1130400
Ribosome biogenesis [BR:pcb03009]
 Eukaryotic type
  Pre-60S particles
   Other pre-60S particles
    PCHAS_1130400
SSDB
Motif
Pfam: FtsJ Spb1_C DUF3381
Other DBs
NCBI-GeneID: 3495260
NCBI-ProteinID: XP_016654032
UniProt: A0A4V0K9Q3
LinkDB
Position
11:complement(1096311..1099437)
AA seq 995 aa
MGKKKKVGKERIDKYYKLAKSAGYRARSAFKLIQIAKKYNIFKNANILIDLCAAPGGWLQ
VAYKNMSKSSTIIGVDLMPIRKIDNNVITIKSDITSVECIRKIKDIIKYEKADVILNDGA
PNVGTTYSYDSFNQNILVLSSIKLAYKFLTRGGIFITKVFRNEEYVSLIWVLEKLFTEVK
HIKPRSSREISSEIYLIGLNFLGNKIDKKYFDYTYIFSSQFRKDENKLPNSHSKGKGNDE
SENDSSENDSDSNTAKQKAKKKKGLSSILKEKKKKNRQGYEEGDDYRITNITDFINNDNY
VDLLIKSNKFIFDKNYENSPSLLIKKTYEAIYTNKSTNNEIFNLCKDLKVLGKSDLFHLI
KWRYKIKKSVTKLLMDSKEKTKQDVNDEEENTNTTFAISKEESPISAEKINTKSTVCDDK
SDELSNSSDEESGNESINEFSKYIDKKEKKLKKKKEKKLKKELEKKKINKPLKIDYDEND
IHFSKDMLNLLNKQKFTDHLNILNSSKSNNKLDINEENFSASDEENDEDQIYDEIDEDDE
LGRLEYLVDLDYKQQKIKENKKNDENKDEKLTRRKRAMDFKNEELMKIQKIMELKNEELM
MKKKLNEYLSEDEDDSDISSDEDEMEENDNDSLETNQDTQTDKYEDAINQNEHIKKIVDK
ILMIRKNLKEKEPEDESPTSTNRFFDQKIFSNIFNQLNNDENGEDAEHAENSEEGDEEDA
EEEEESSDEIKEVSAKNLPKIPLPAKLAKKEKNKKLREKYGNNETKIKNASFSIVKTDTN
NSEHVNKYFSNLIKDDDELAFIKYVGEKLIHKKSRMDLIDDSFNRHSYLEDEDTLPEWFV
EEEKKYRRPVIPIDKTVLDQYKSKINRITKMPIKKVIEAKMRNKKREITKMKKLEAKIGR
IEKDEDDPFLKQRAIANVLKKNKSEKKREKSYVVCTGKGSKMAKKNKKGGKTMVKFVDKR
LKKDKKAKKRIEKKKKNMTRVKYSKSRPFKFKKFF
NT seq 2988 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggggaaaaagaaaaaggtcggaaaagagagaatagataaatattataagctagccaaa
tcagcaggatatagagctaggtcagcatttaagttaattcaaatagcaaaaaaatataat
atatttaaaaatgcaaatatattaatagatttatgtgcagcaccaggaggatggttacaa
gtggcttataaaaatatgagtaagagcagtacaattataggagttgatttaatgcctatt
cgtaaaattgataataatgtaattactataaaaagtgatataacttcagttgaatgtata
agaaaaattaaagatataataaaatatgaaaaagcagatgttatattaaatgatggggca
cctaatgttggtactacatattcctatgacagttttaatcaaaatattctagtgcttagt
agtatcaaattagcttataaatttttaacaagaggaggaatattcattacaaaagtattt
agaaatgaagaatatgtatctttaatttgggttttagaaaaattatttacagaagttaaa
catataaaaccaagaagtagtagagaaatatcttctgaaatttatttaattgggctcaac
tttttaggaaataaaattgataaaaagtattttgattatacttacatatttagtagccag
tttaggaaagatgaaaataaattacctaactctcattcaaaaggtaaaggaaatgatgaa
tcggaaaatgatagtagcgaaaatgatagtgatagtaatactgctaagcaaaaagcaaag
aaaaaaaaaggattaagtagtattttaaaagaaaaaaaaaaaaaaaacagacaaggttat
gaagaaggtgatgattatagaataacaaatataactgattttataaataatgataattat
gttgatttattaattaaaagtaataaatttatttttgataaaaattatgaaaattcgcca
agcttattaataaaaaagacttatgaagctatctatacaaataaatcaacaaataatgaa
attttcaacctctgtaaagatcttaaagttttgggaaaatcagatcttttccatttgatc
aaatggagatacaaaattaaaaaatctgtcacaaaattgttaatggatagtaaagaaaaa
acaaaacaagacgtaaacgatgaagaagaaaatacgaatactacttttgcaattagtaaa
gaagaaagcccaataagtgcagaaaaaattaatacaaaatcgacagtttgtgatgataaa
tcagatgaattgagtaattcctctgatgaagaatcaggaaatgaaagtataaatgaattt
tcaaaatatattgacaaaaaagaaaaaaaattaaaaaaaaaaaaagaaaaaaaattaaaa
aaagaacttgaaaaaaaaaaaataaataaaccacttaaaatagattatgatgaaaatgat
atacattttagtaaagatatgttaaacctattgaacaaacaaaaatttacagatcattta
aatatattaaacagtagcaaaagtaataataaacttgatatcaatgaagaaaacttttca
gctagcgatgaagaaaatgacgaagatcaaatttatgacgaaatcgatgaagatgatgaa
ttaggtagattagaatatctagttgatttagattataaacaacaaaaaattaaagaaaat
aaaaaaaacgatgaaaataaagatgaaaaactaacaagaagaaaaagggcaatggatttt
aaaaacgaagagttaatgaaaattcaaaaaattatggaacttaaaaatgaagaattaatg
atgaaaaaaaaattaaatgaatatcttagtgaggatgaagatgattcagatatctcatct
gatgaagatgaaatggaagagaatgataacgacagtttagaaaccaatcaagatactcaa
actgataaatatgaagatgcaataaatcaaaatgaacatattaaaaaaatagttgataaa
attttaatgatacgaaaaaatctaaaggaaaaagaaccagaagatgaatctccaacaagt
acaaacagattctttgatcaaaaaatattctctaacatatttaaccagttgaataatgat
gaaaatggtgaagacgctgagcatgctgaaaattctgaggaaggggatgaggaagatgct
gaagaagaagaagagagcagtgacgagataaaagaagtgagcgcaaagaaccttcccaaa
ataccgctacctgcaaaactagccaaaaaagagaaaaataaaaaattaagggaaaaatac
ggaaacaacgaaactaagataaaaaatgcatctttttctatagtaaaaacagatacaaat
aattctgaacatgttaataaatatttttcaaatttaattaaagatgatgatgaattagca
tttataaaatatgtaggagaaaaattaattcataaaaaaagtagaatggatttaattgat
gattcttttaatagacattcatatcttgaagacgaagatacattacctgaatggtttgtc
gaagaagaaaaaaaatatagaaggccagtcataccaatagataaaactgtactagaccaa
tataaaagtaaaattaatagaataacaaaaatgcctattaaaaaggttattgaagctaaa
atgagaaataaaaagagagaaattacaaaaatgaaaaaattagaagcaaaaattggaaga
atcgaaaaagatgaagatgacccattcttaaaacaaagagctatagcaaatgtattgaaa
aagaacaaatcagaaaaaaaacgagaaaagtcatatgttgtgtgcactggaaaaggatct
aagatggccaagaaaaacaaaaagggaggaaaaacgatggttaagtttgttgataagaga
cttaaaaaggataagaaagctaaaaagcgtatcgaaaaaaagaaaaaaaatatgacaaga
gttaaatattcaaaatcaagaccatttaaatttaaaaagtttttttaa

DBGET integrated database retrieval system