Plasmodium chabaudi: PCHAS_1218800
Help
Entry
PCHAS_1218800 CDS
T01108
Name
(RefSeq) oocyst capsule protein Cap380, putative
Organism
pcb
Plasmodium chabaudi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Presenilin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3496426
NCBI-ProteinID:
XP_743324
UniProt:
A0A4V0K931
LinkDB
All DBs
Position
12:667806..677636
Genome browser
AA seq
3276 aa
AA seq
DB search
MYVINVIYVLIVCLFGIVLSSPHWADPLLNDFGNEDLSTNKKKRLHSTKAKRYALDISSF
GNTCVAKYSDICGHSNYEIRVNNGISGYTIKAMLIQKETSDIVSVHHAVSSFSTDGSALL
KFDDIPSLHYNIILEVTDLIYNKDYTIGNKCLCNVCNDTKIEINLSNLENNIIHATRGHK
QIKLPFPQSSFVNGKLLFSNFSLYHSQINLKSIENYEEIYKNQYELVRPCSGIIMVHSEK
YKIHYDIKSVHCYHVYIIDKIMKKITSNDQRSINFKNNMFLMFDENKTNEDDMISVVKNY
SIQLPLKYDNGFYYPQSTVNGLLVTINVNVLLNNIKNIYINNIDKKMEYIQIFRIIIRLM
HQYNEITYDNLLQYTTNLTLEKSKSPSSLINTNIYNVYAEELTVLLNSLSLEFNPDIIGL
DKNVVLMEEKEFISQHGVDTNARIYKNQLILKESSDVCLVLLQDIAREISSYVNNKLDHK
YTGVCKNLRKKNSYANMSVMHYTYEIDCNISIFYKEYNTNEGLMITNVISNKSLFEDVYI
QLHYYDIYEYGILVHIQVDQNLVRYMKSLAKNYINNDSVIVMNIIGRKTDKLPEDIDQTL
KIITFPIDCITNCSNAESIIIHDNYDYISIENICIKNTNGSEICFPKYNYSYIFDTRLLL
VHMININPYPEITLHAIIHQRIVEGNYCILSRHPLLISHEYTPRIYKDNVCKEYINRCEL
LSTNVVVKSINIPSSILQLKNKFKLSFTTDFDEKHEEMFQVNYLADNDIVNISQKKHLLT
HYNNSFYINQHDNLINESKRQKEDFNPIVSIDESSHNYIKGNGELYNEENAYKNIDNIQE
MKYDINIFNMERMYTHEQTSKNNDSSLYPFGGLSINYSHVKKNIYMKFLNDYIYFYESDS
QKSDYNTVSALSEDKFSHFTNVSVYNYECLGAYAYLMNKFNILVNDSLNCEAIHMIIEVL
LKGKLGKYFIYNKNKIFLNFIKKEQYSDDIYDVFDLIDVEIYEQDNLHTPKSKHRLNVSI
DENNLNLLYSHKNVLYRNKYFSNIYILMFKIAYLSNEYDFYTFFYDLTGIRLIDETVLIN
MDKLSMEDQTYIQYILLHLENNYNIKIEEHTNKFEELINEISLLAAYIVELTSSYKIDLN
TTSVESENELKSFANIKYFVYINEFKYHGKNVSINQLVHTMSQFDTLIIKKKVLCCSNFV
DEVEASLKYYLMYKYVHTGTDLVNENDDIMPPTAYNIIQTLLERPIPKSDIYDKMTKSNI
DNIATHIMKESGFIHKNNITTEYKDLECIHLDSINHYDNIITHFETKYDNHGSLVSMTIL
KGLLKDKSIDIQEDMDYSVYFSFRNLSVPFIGKTHREETLDFKRILLLKAFPKAINESVV
FYTYIDQLDGNSLFMLEKIIFVSKGNKLVKEINVEYQTFFVHPHNMILTNNMDSNTHINT
YSTYFNELTRCYHYNNGIQACNYPEYGYNGFTPYYVFYTENNQRKEILFKDNEEIANLIN
NKPLTLTKRYNIELGGEKMDVEIYNSVEVIINEIAFSIGLKNFNEKNCSKLTLNNGLMHI
PNDPNSLISSIYYETLYCLDKSAIYKKILTICNFDKEELIKLFSASDSNILPYNLEETFA
KSLTHNEIINLITYFISAPYQINMMIRRTDDTDNKDVNNDIKPLILNIMEFNSTENSESK
IVFIENEDIIKINKQFLQKEVDNSSLLEFNKSLYFELLKYMPDSFINEHKILIDMKDINN
YLKSYINKENICNNDSYFKNNGIMLVPGETSTYNQPSFTYINNDNIYIKKKPEDSYIFNN
IFLFEGKNNLDKKFLNAIVVLSPIHITEVHDISYVELIANAFDNKHQFSMKCYPHKKYDN
SYFEKEFNLAPNSIYFVCMNVYTMYLKSGLYEFNKYLIKFNTTNSNTYHVYQNMPVRPVY
TVKNNNIIVPDMNKIDLKLHRIKDDDMNSVLIKYLIYVDGSITLHTNPYVVVNPIFTEDS
YYYNTNIRQTDDYVSFMYSRKLKLFEFLELPTTQMLFKENTMTITTEQFVHYQEETHNIY
LLTLVKTLNLTKVIIRDIYNNEFEITIDLVTDEKPVAPTNVHTETPLPTPPISTTTDIIE
EKEEEKVEEKEEEKEEEKVEEKEEEKEEEKIEEKEEEKVEEKEEEKVEEKEEEKVEEKEE
EKIEEKEEEKVEEKEEEKVEEKEEEKSNVACKCCLIKITNNTGSNGNCISVTQYLFLVQS
LTSISEGKISLHVSENGYELIGNDDNLPINRTLNLLCTKLNGEVKLTNGDYNIQISNYRY
TMPKSTIKISNGYFNILRINEDGTRYIAPPNVFINGEKPFTVDLNIPKITSIENTEKVSE
SLVPEEKNKSQVIDVIPIPSVEEKKQSKPSFSNYGWLTNQRTISLNNAHYYRRNVTCSIY
IKSIELYDDKDKMGVYENKYDINTNSLHYGVYEIHVNNGKSYGSCKNGHCLLDYWFLNYI
IHSNQLKNGVYMLHIKNYINIHRIDQHESNPNHVTEYSKATVTESLPVASKSVFCASENL
NTLESFDANKKIKIIREVETNSNMNAGIYIVHINYNNYEVYAEKENHKILDTGIFESCIK
HDFDIKDDMQYIYKVQILNGETKDIRHKENESIFIDKNNNKFKEYYAFISSIENNDNRSA
YGYNNITRFYGPHHIVKSKYIINGQNLHNIKRINQNGYYENIDEKDEEIVMELFNSLFES
IPHDKLYFIEIFDEDFDYSLITDFESKIGLEMDSNNSGSENASRTNEILTDTQNNIFMVQ
IAEYRGMDHQNRKWGYNDYDEFMLQGDFIKPGHYDIVFSNGKYTINYYSSDEKKIKASDI
ENIIMSSGKILKNSYYKIHIVKWENSEESMLINDLFHTKVDAAKSKDNKYAATEVKDSDN
TASSSVVPSKKEGGGFYRSYISLKLKYDESDKYGIKKVVDGIFDSKIVDSKYSVKMLNNN
SYRINILNNSNVHSKSIIDLIKSVWNCNMNGNNCIYDIEIYAYNTVERGNNGMDSNNDDY
YYIIIEPIKNEEEEVGNSDKVASKKDTEYIKIIGKNLPIGHFNVVVENDTFNGTDANKMK
VDKNLIKTIMFLSFEKPLDGKYNVTIVKNNDSILTNCSEYNTEMKEKISPTHKGIHQHIT
IRGFNEENHLATIFQKDIHFQKGNGIKDGQYSMQPHLNGTYSIRSRNYKLSTNENTLLQD
ILLGTSFKGYSFLNITTIDDGPSELLQYDLFSSKNCISLQNDNTNSIGIRSNILPSIENS
ESSTIKYKYVKSKITNAITHCSSSNEMNCLNVLRRA
NT seq
9831 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacgttatcaacgtaatttatgttctaatagtatgcctttttggcattgttctttcg
tcccctcactgggccgatccattattaaatgattttggtaacgaggacctaagcactaat
aaaaaaaaaagattacattccactaaagcgaaaagatatgctttagatatttcttcattt
gggaatacatgtgttgcaaagtactcagatatttgtggacattccaattatgaaatacga
gtaaataatggaataagtggatatacaataaaagctatgctaattcagaaagaaactagt
gatattgtttctgttcatcatgcagtaagttcattttctacagatggtagtgcactatta
aaatttgatgatattccatctttacattataacattatattagaagtaactgatttaatt
tataataaagattatactattggaaataagtgcctatgtaatgtatgtaatgatacaaaa
atagaaatcaatttaagcaatctcgagaataatataatacacgcaacaagagggcacaaa
caaattaagttaccatttccacaaagctcctttgtaaatggtaagttattgtttagtaat
tttagtttgtatcattctcaaataaatttaaagtctattgaaaattatgaagaaatatat
aagaatcaatatgaattagtacgcccatgttctggtattattatggtacattcagagaaa
tataaaattcattatgacataaaaagtgtacattgttaccatgtatatattatcgataaa
attatgaaaaaaataacgtctaatgatcaaagaagcataaactttaagaataatatgttc
ctaatgtttgatgaaaacaaaactaatgaagatgatatgatatctgttgtaaaaaattat
tcaattcagcttcctttaaaatatgataatggattttattatccacaaagcacagtaaat
ggacttttagttacaattaatgtgaatgtattattgaacaatataaaaaatatatatata
aataacatagataaaaaaatggaatatattcaaatatttagaataattattagattaatg
catcaatataacgaaattacatatgacaatttgttacaatataccacaaatttgacatta
gaaaaatctaaatcaccatcttcattaataaatactaatatatataatgtatatgccgaa
gagttaactgttttattaaattctttatctttagagtttaatccagatataattggactt
gataaaaatgttgtacttatggaggaaaaggaatttatttcacaacatggagtcgatact
aatgcacgtatatataaaaatcaactaatacttaaagaatcatcagatgtatgtttagtt
cttttacaagatatagctagagaaatcagtagttatgttaataacaaattagatcataaa
tatactggtgtatgcaaaaatttaagaaaaaaaaacagttatgccaatatgtcagtaatg
cattatacctatgaaatagattgtaacatttcaattttttacaaagaatataatacgaat
gaaggtttaatgataacaaatgttatatcaaataaaagtctatttgaagatgtttatatt
caattacattattacgatatatatgaatatggcatattagttcacatacaggttgatcaa
aatttagttagatatatgaaatcattagccaaaaattacataaataatgattcagtaatt
gtgatgaacataattgggcgaaaaactgataaactacctgaagatattgatcaaacactt
aaaataatcacatttccaattgattgcataacgaattgttcaaatgcagaatcaataatt
atacatgacaactatgattatatatctatagagaatatatgtattaaaaatacaaatgga
tctgaaatttgcttcccaaaatataattattcttacatatttgacactaggttattactt
gtacatatgataaatattaacccctatcccgaaatcacattacatgctattatacatcaa
agaatagtcgagggaaactattgcatcttatcaagacatcctcttttaatatcacatgaa
tacactccaagaatatataaagataatgtatgtaaagaatatattaatagatgtgaactt
ttgtcaacaaatgtagttgttaaaagtataaacattccttcatctatactacaactaaaa
aataaatttaaactatcatttacaacggattttgatgaaaaacatgaagaaatgttccaa
gttaattatttggcagataatgatattgttaatatttcccaaaaaaaacatttattaaca
cattacaataatagtttttatataaatcaacacgataacttaattaatgaatctaaacgc
caaaaagaagattttaatcctattgtatccattgatgaatcatcacataattatataaaa
ggaaatggagaattatataatgaggaaaatgcttataaaaatattgataatatccaggaa
atgaaatatgatattaatatatttaatatggaaaggatgtatactcatgagcaaacatca
aagaataacgattcttctttatatcctttcggtggtttaagcattaattattcacatgta
aagaaaaatatatatatgaaatttttaaacgattatatttatttttatgaaagcgattca
caaaaatcggattataacacagtttcagctttatcagaagacaaattttcccatttcacg
aatgtctctgtatataattatgaatgtttaggagcttatgcttatttgatgaacaagttt
aacattttagtaaatgattcactaaattgtgaggctatacatatgattatagaagtctta
ttaaaaggaaaattgggaaaatatttcatatacaataagaataaaatatttttaaacttt
ataaaaaaagaacaatatagtgatgatatatatgatgtgtttgacttaatcgatgtcgaa
atatatgaacaagacaacttacatacacctaaatcgaagcatcgacttaatgtaagtatt
gacgaaaataatttaaatttattatattctcataaaaacgttttatatagaaataaatat
ttttcgaacatatacatactaatgttcaaaatagcatatttatcaaatgaatatgacttt
tatacatttttttacgacttaactggaattagattaattgatgaaactgtattaataaat
atggataaattatcaatggaagatcaaacatatatacaatatatattattacatcttgaa
aataattataatataaaaattgaggaacatactaacaaatttgaagaattaataaatgaa
atatcattattagcagcctatattgtagagttaacatcatcatataaaatagatttgaat
acaactagtgtagaatcagaaaatgagttaaaatcatttgcaaatattaaatactttgtt
tatatcaatgagttcaaataccacggaaaaaatgtttcaataaatcaattggttcataca
atgtcacaattcgacacattaataattaaaaaaaaagtattatgttgttcaaattttgta
gatgaagtagaagcatcattaaaatattatttaatgtataaatatgtacatactggaact
gatttagtaaatgaaaatgacgacattatgcctccaacagcatataatataatacaaaca
cttttggagcgacctattccaaaaagcgatatatatgataaaatgactaaatcaaacata
gataatatagcaacacatataatgaaggaatcaggattcatacataaaaataatataact
acagaatacaaagatttggaatgtattcatttagactcaataaaccattatgataatatt
ataacacattttgaaacaaaatatgataaccatggatcattggtttctatgacaatttta
aaaggtttattaaaagacaaaagtattgatatccaagaagatatggattattcagtatac
ttttcatttagaaacttatctgttccattcattgggaaaacacatagagaagaaacatta
gactttaaaagaatattattattaaaagctttccctaaagccattaatgaatcagtagta
ttttatacatatatagatcaattagatggaaattcattatttatgttggaaaaaataatc
tttgtatcaaagggaaataaattagtaaaggaaataaatgtagaatatcagacatttttt
gttcacccacataacatgatattaactaataatatggattcaaatacgcatattaatact
tattcaacatattttaatgaactaactagatgttatcattataacaatggtatccaagca
tgtaattaccctgaatatggatataatggatttactccatattatgttttttacactgaa
aataaccaaagaaaggaaatattattcaaggataatgaagaaatagcaaatttaattaat
aacaagcctttaacattaactaagagatacaatattgaattaggaggagaaaaaatggac
gtagaaatttacaattcggttgaagtgataataaacgaaatagccttttctattggactt
aaaaattttaatgaaaaaaattgttcaaaattaactttaaataacggattaatgcatata
cctaatgatccaaattcccttatatctagtatttattatgaaacattatattgtttagac
aaaagtgctatttataaaaaaatattaactatttgtaattttgataaagaagaacttata
aaattatttagtgcttcagatagtaacatattaccatataatttggaagaaacttttgca
aagtcgttaacacataacgaaataataaatttaataacatactttatttcagccccatat
caaataaatatgatgataagaagaacagatgatactgataacaaagacgtaaataatgat
ataaaacctttaatcttaaacattatggaattcaatagtacagaaaatagcgaatccaaa
atagtttttatagaaaacgaagacataattaagataaataaacaatttttacaaaaagaa
gtggataattcgtctttattagaatttaacaaatcattatattttgaacttttaaaatat
atgcctgatagttttattaatgaacataaaatactaatagatatgaaggatataaataac
tatctaaaaagttatataaataaagagaatatatgtaataatgattcatattttaaaaat
aatggaataatgttagtaccaggtgaaacttccacatataaccaacccagttttacatat
ataaataatgataatatatatattaagaaaaaaccagaagacagttatatatttaacaat
atatttttatttgaaggaaaaaataatttagataagaaatttttaaatgctattgtagtt
ttatcaccaatacatataactgaggtacatgatatatcatatgttgaactaatagcaaat
gcatttgataataagcatcagttttctatgaaatgctacccccataaaaaatatgacaat
tcatattttgaaaaggaatttaatttagcccctaattcaatttattttgtttgtatgaat
gtatatacaatgtatttaaagagcggattatatgaatttaataaatatttaattaaattt
aatactacaaatagtaatacataccatgtatatcaaaatatgccagtaagacctgtttat
actgtcaagaataataatataatagtcccagatatgaataaaatcgatttaaaattacac
cgtataaaagatgatgatatgaactcagtattaataaaatatcttatatatgtagatggt
tcaattaccttacatactaatccatatgtagtagttaatccaatatttacagaagattca
tactattataatactaatataaggcaaacagatgattacgtatcttttatgtattcccgt
aaacttaaactttttgagtttttagaattaccaactactcaaatgttatttaaagaaaat
acgatgactataacaacagagcaatttgtacattatcaagaagaaacccataatatatat
ttattaactcttgtaaaaacccttaatttaacaaaagttataataagagacatatataat
aatgaatttgaaataactatcgatctagttacggatgaaaaacctgttgcacctaccaat
gtccatacagaaaccccattacccaccccaccaatttctacaactactgacataatagaa
gaaaaagaagaagaaaaggtagaagaaaaagaagaagaaaaagaagaagaaaaagtagaa
gaaaaagaagaagaaaaagaagaagaaaaaatagaagaaaaagaagaagaaaaggtagaa
gaaaaagaagaagaaaaggtagaagaaaaagaagaagaaaaggtagaagaaaaagaagaa
gaaaaaatagaagaaaaagaagaagaaaaggtagaagaaaaagaagaagaaaaagtagaa
gaaaaagaagaagaaaaaagtaacgtagcatgcaagtgttgcctaattaaaataacaaat
aatacgggttcaaatggtaattgcatatctgtaacacaataccttttccttgtacaaagt
ttaacttcgatttctgaaggaaaaatatcattgcatgtttctgaaaatggttacgaatta
attggaaatgatgacaatttgccgataaatagaacacttaatttattatgtaccaaatta
aatggtgaagtaaaattaacaaatggggattataatatccaaatatcaaactatcgatat
actatgcctaaatcaacaattaaaatttccaatgggtattttaatatactgagaataaat
gaagatggaacaagatatattgctcctcctaatgtgtttataaatggggaaaagcctttt
acagtggatttaaatataccaaagattactagcattgaaaatacagagaaagtttcagaa
tcgttggtacctgaggaaaaaaataaatctcaagtaattgatgttatacctataccatct
gttgaagaaaaaaaacaatcaaaaccatccttttcgaactacggttggttaacaaatcaa
agaacaataagcttaaataatgcgcattattatagaagaaatgttacgtgcagcatctat
ataaaaagcatagaattatatgacgataaagataaaatgggtgtttatgaaaacaaatat
gatataaacacaaattcattacattatggtgtatatgaaatacatgttaataatggtaaa
tcctatggatcatgtaaaaatggccattgtcttttagattactggtttcttaattatata
atacatagcaatcaattaaaaaatggagtttatatgttacatattaaaaattatatcaat
atacatagaattgatcaacatgaaagcaaccctaatcatgtgactgaatattctaaagcc
actgtaacagaatcattaccagtcgcatctaaatcagtgttttgcgcgtccgaaaattta
aacacattggaaagttttgatgcaaataaaaaaataaaaattattagagaggttgaaaca
aactcgaatatgaatgcagggatatatatagtacatattaattacaacaattatgaagta
tatgcagaaaaggaaaatcataaaatattagatacaggtatatttgagtcttgtattaaa
cacgattttgatataaaagatgacatgcaatatatatataaagtgcaaatattaaatggt
gaaactaaagatataagacataaagaaaatgaaagtatatttatagataaaaataataat
aaatttaaagaatattatgcatttataagtagcatagaaaataatgataatagatcagca
tatggatataataatattacacgattttatgggccccaccacatagtaaaatcaaaatat
attataaatggacaaaatttacataatataaaaaggataaatcaaaatggttattatgaa
aatattgatgaaaaagacgaagagattgtaatggaattgtttaattcattgtttgaatca
attccgcatgataaattatattttatagaaatattcgatgaggattttgactattcgctt
atcacagattttgaatcaaaaataggtcttgaaatggatagcaacaatagcgggagtgaa
aacgcatctagaactaatgaaattttaactgatacccaaaataacatttttatggtacaa
atagctgaatatagaggcatggaccatcaaaacaggaaatggggttataacgattatgat
gaatttatgttgcaaggcgattttataaaaccaggacattatgatatagtattttccaac
ggtaaatacacaattaattattatagtagtgatgaaaaaaagataaaggcaagtgatatt
gaaaatataattatgtcatctggaaaaatattaaaaaattcctattataagatacatatt
gtaaaatgggaaaattcagaagaaagcatgttgataaatgatttatttcatacaaaagtc
gatgctgcaaaatccaaagataataaatatgcagcaactgaagtaaaagacagtgataat
actgcatcatcttcggtggtaccaagcaaaaaagaaggaggaggattttatagatcttat
atatctttgaaattgaaatacgatgaaagcgataaatatggaataaaaaaagttgtcgac
ggtatttttgatagtaaaattgtagacagtaaatattcagtaaaaatgttaaataataat
tcttacagaataaatattctaaataattcaaatgtccactcaaaaagtataatcgattta
ataaaaagtgtatggaattgtaatatgaatggcaataattgtatatatgatattgaaata
tatgcatacaataccgtagaaagaggaaataatggaatggactcaaataatgatgactac
tattatattattatagaacctattaaaaatgaagaggaagaagtaggaaatagtgataaa
gttgcaagtaaaaaagatactgaatatataaaaattataggaaagaatttaccaattggt
cactttaatgtagttgtcgaaaatgacacttttaatggaactgatgcaaataaaatgaaa
gtggataaaaatttaataaaaacaattatgttcttatcatttgaaaaaccgttagatgga
aaatacaatgtaacaattgttaaaaacaacgatagtattttaacaaactgttcagaatat
aatacagaaatgaaagaaaaaatatctcctacccataaaggaatacatcaacatattaca
atacgtggttttaatgaagaaaatcacttagcaacaatttttcagaaagatattcatttt
caaaaaggaaatggtataaaagatggtcaatactcgatgcaaccccatctaaatggaaca
tatagtattagaagtcgaaattataaattaagtacaaacgaaaatacattattacaggat
atattactaggaacatcatttaaggggtattctttcttaaatataacaacaatagacgat
ggtccaagtgaactgttacaatatgatctattttcatcaaaaaattgtatttcattacaa
aatgacaataccaatagtataggaattcgtagtaatatactaccttcaattgagaattcc
gaaagttcgacgataaagtacaaatatgtgaaatctaaaataactaatgcaattacacat
tgttcatcttctaatgaaatgaactgcttgaatgtattgcgaagagcataa
DBGET
integrated database retrieval system