Pediococcus claussenii: PECL_1797
Help
Entry
PECL_1797 CDS
T01713
Name
(GenBank) LPXTG-motif cell wall anchor domain protein
Organism
pce
Pediococcus claussenii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SpaA
Cna_B
Big_8
Collagen_bind
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEV96009
UniProt:
G8PBV1
LinkDB
All DBs
Position
1750246..1753173
Genome browser
AA seq
975 aa
AA seq
DB search
MDITLPKKANWLFTVLTVLLASFIALFIFSGTASADTSTTANSQTTVVNSNVGTNSTTTS
SSVQSTSTNPSSSTSQATVDKKATSSSDNSNKSEVSDVTEPATSNANQQVSSSSATSSET
KPSNNTAVTTTSQGAAMNSSSNSNVKSTATSTPQPKLSMAKALVSTQSNSVSVSGLDANS
AVIKDDQGNVVSNSSTLSAYNSYVVNYNWSIPDGSNIKSGDTTTVTLPSNVKFNTDTSFP
VTNSVGDTIGTFTASQDAQSGLLTFSNYFENNTINRSGTLSFNVSGTQTSTGDNNRDWLS
NKIGWWTNSNMVDGHPASATWNIAFNPNNQTLSKVVLVDTIGANQTFNNDIVANTGSYDD
NGKFNSNGTITPVVSINGQVVTMTFTNVTQAVNLTYTTTITGINSGNIYTNGVSYSGTGT
NGEGNAEVNTSNNTAKLTFGGTGNGDGTIGSVTLTKENADGSVKLAGAVFKLVDANGSLV
ESNLVTDANGNITVNNLGAGSYQFIETSAPTGYILNNNPINFTISNSNVNATVSAVNTAI
AKTNIKVVKTWDGVPTNVKTPAITVVLNANGQPTGQSLTLDSSNNYQASFTGLDQTDSNG
NPINYTVTENIPAGYTSSTAGAQSPNNGTVNLVNNYIPVPGSVTLTKEDSKTATKLAGAT
FKLVAANGEVVKDNLITDANGTIEVADLNQGTYQFIETAAPNGYVLNSSPINFTIDGTGT
NVNVSAINTAIAKTNIKVIKTWDGVPTNVKTPAITVVLNANGQPTGQSLTLDSSNNYQAS
FTGLDQTDSNGNPINYTVTENMPAGYTSSTAGAQMPNVNGIVNLVNTYIPATPGKPVTPG
KPVTPSKPVTPSKPVTPSKPVTPSKPVTPSKPVTPSKPVTPSKPVTPSKPVTPSKPVTPS
KPNVPTKTVVPDKPVVPDKSTEPAKANSKKVTYSNKAKILPQTGETENSLLILLGLLLMG
FVVLIVFTRVRKNNY
NT seq
2928 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatattactttacccaaaaaagccaactggttatttactgttttaactgttttactt
gctagttttattgcactgttcatttttagtggaactgcttccgctgacacatcgaccact
gcaaatagccaaactactgttgtaaattcaaatgttggtaccaacagcactactacctct
agtagtgttcaatcaacaagtaccaatcctagcagtagtactagccaagctacagtagat
aaaaaagctactagttcctcagataactcaaataaatccgaagtatctgacgtaacagaa
cctgctacttcaaatgctaaccaacaggttagttcatcgtcagctactagttctgaaaca
aaaccttctaacaacacggccgttactactacctctcagggggcagctatgaatagctca
agtaatagcaatgtaaaatctactgcaacaagcacgccacaaccgaaattatccatggca
aaggcactcgtttcaacgcaatctaactctgtttcagtttctggattagatgcaaatagt
gctgttatcaaggacgatcaaggcaacgttgttagtaattcttcaacgttaagtgcctat
aacagttacgtcgttaactataattggtctattcccgacggaagtaacatcaagtctggt
gacactacaacagtcactttaccaagtaacgttaagttcaatacagataccagttttcct
gtcactaatagtgtaggagatacgattggtacatttactgccagccaagatgcacagtcc
ggattactaacattcagtaattattttgaaaataatactattaaccgttccggaactttg
agttttaacgtttctggcacacaaacttcaacgggtgataataatcgggactggctttca
aataagatcggctggtggactaattcaaacatggtagatgggcatccagcttccgcaact
tggaacattgcctttaacccaaacaaccaaacgctaagcaaggttgttcttgttgatact
attggcgctaaccaaacctttaacaacgacattgtcgctaatactggctcttacgatgat
aatggcaagtttaattcaaatggtaccattacacccgttgtaagtattaatgggcaagtt
gtaaccatgacctttacaaacgtcacacaagccgtcaacttaacatacaccactacaatc
actggtatcaatagtggaaatatctacacgaatggcgttagttattctggaactggcaca
aacggcgaaggtaatgctgaagttaacaccagcaacaataccgcaaaattaacctttggg
ggaactggtaacggtgatgggacaattggttctgttacacttaccaaagaaaacgctgat
ggctcagtaaagttagccggtgcagtattcaaattagttgatgctaatggttctttagtt
gaaagtaacctagttacagacgccaacggaaacattactgtcaataatttaggagctggg
tcttaccaatttatagaaacttcagcacctactggatatattttaaataataatccaatc
aactttacaattagtaacagtaatgttaatgcgactgtttctgctgtcaatacggctatt
gctaaaaccaatattaaagttgttaagacttgggatggtgttcctacgaacgtaaagacc
cctgctatcaccgttgttttaaatgccaatggtcaaccaactggtcaatcattgacttta
gacagctcaaacaattaccaagcttcatttactggattagatcaaactgattcaaatggt
aatccaattaattacacagtaactgagaacattcccgcaggttatactagttctacagct
ggtgcacagtcaccaaacaatggaacagttaacttggttaataattacatcccagttcct
ggatccgttactttaactaaagaagattctaaaactgctacaaagttggctggtgcaaca
tttaaattagttgcagctaacggagaagttgtaaaagataatttaattacagatgctaac
ggtacaattgaagttgcagatttaaaccagggaacttatcaatttattgaaacagcagca
ccaaatggttacgttttaaacagttcaccaattaactttacaatagatggaaccggaact
aacgtaaatgtttcagctatcaacacagctattgctaaaactaatattaaagttatcaaa
acttgggatggtgttcctacgaacgtaaagacccctgctatcaccgttgttttaaatgcc
aatggtcaaccaactggtcaatcattgactttagacagctcaaacaattaccaagcttca
tttactggattagatcaaactgattcaaatggtaatccaattaattacacagtaactgag
aatatgcctgcaggttacactagttctacagctggtgcacagatgccaaatgttaatgga
attgtaaacttagtaaatacgtatattccagcgacacctggtaaaccagttacacccggt
aaaccagttacacctagcaagccagtcacacctagcaagccagttacgcctagcaaacca
gttacacctagcaagccagttacgcctagcaaaccagttacacctagcaaaccagttaca
cctagcaaaccagttacgcctagcaagccagttacacctagcaagccagttacacctagc
aagccaaatgttcctactaaaacagtggttcctgacaagccagttgttccagacaaatca
acagaacctgctaaagctaactcgaaaaaggtcacatacagtaataaggcaaagatcttg
ccccaaactggtgaaactgaaaatagtttactaattttgttaggattattattaatggga
tttgttgtattaattgttttcacaagagtacgtaagaacaattattaa
DBGET
integrated database retrieval system
