Pediococcus claussenii: PECL_264
Help
Entry
PECL_264 CDS
T01713
Name
(GenBank) alpha amylase, catalytic domain protein
Organism
pce
Pediococcus claussenii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEV94587
UniProt:
G8PAM8
LinkDB
All DBs
Position
264218..266020
Genome browser
AA seq
600 aa
AA seq
DB search
MNPVIEYDSFQTKNKKPFGAVLHGTEIQFAISIHNLDVVQISLQVDQDGHWDTEKSVQMT
PSGDDQNRFVGAFRPNISGLYFYYFKIQTDTATLYYGCVNGGFGGPGTVYQNRAQVQMYQ
ITCLAEVETIPEWYQNAVFYHIFVDRFSNGNPDDQVNQPKANSFIYGRKTDLPVYIRNSQ
NDILRWDFYGGNLKGIEQKLPYLADLGVTALYLSPIFEARSNHRYDTGDYFKIDGILGTL
ADFDHLLSKIHQMGMHVVLDGVFNHVGADSKYFNLWKSYENDGAVQSVNSPYYSWFDFLK
YPTDYKSWWGIKDLPTINKDEVSYQNYIYGNDDSVLNYWTSRGVDGWRLDVADELPDSFI
GGIRKAVSQYPERVVIGEVWEDASHKVAYNQRRHYLEGGMLQATMNYPLRELIINTLNRK
IKPRGWWRRLGTLQENYPQTAFNNALNNIGTHDTERILTAVGNDKTLLLNAMWLLFSLPG
TPCLYYADETGMLGGTDPENRAFYPWGHEDQEILSEVKKAIIWRKHHNWINKAQFTPFYI
EDTVIGLRYQSEDNQLSVLLNVTESDQDVELADVIGIDGSTIIRDGKSVISFKKRQMLMF
NT seq
1803 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacccagtaattgaatatgattcattccaaactaagaacaaaaaaccgtttggagca
gttttgcatgggacagagattcaatttgcaatctcaattcataatttggatgtggttcag
attagtttgcaggttgaccaagatggacactgggacactgaaaagtcagttcaaatgacg
ccaagcggcgatgaccaaaatcgctttgtaggtgcctttcgtccgaatatttcagggctt
tatttctattactttaagattcaaacagataccgcaaccttatattatgggtgtgtaaat
ggtggctttggtggaccgggtactgtgtatcaaaatagagcgcaggttcaaatgtatcag
ataacttgtctggctgaagttgaaacgattcctgagtggtatcaaaatgccgtcttttat
catatttttgtggatcgctttagtaacggtaaccctgatgatcaagtcaatcaaccaaag
gcaaacagttttatttatgggcgaaaaacggacttacctgtctacattcgtaatagtcaa
aatgacatattacggtgggatttttatggtggtaatttaaaaggtattgagcaaaagctc
ccatatttggccgatttaggggtcacagctttatatttaagtccaatttttgaagcgcga
agcaatcatcgctatgatacgggtgattactttaaaattgatggaatattagggacgtta
gctgattttgatcacttgctaagtaaaattcaccaaatgggaatgcatgtagttcttgat
ggagtttttaatcacgttggagcagattctaaatactttaatttatggaaatcatatgaa
aacgacggagcggttcagtcggtaaacagtccttattatagctggtttgatttcctgaaa
tatccaacagattataaaagctggtggggaattaaagatttaccgactattaataaagac
gaagtatcctaccaaaattatatttatggtaatgatgattcagttttaaattactggact
agtcgtggcgtagatggctggcgtttggatgttgcagatgaattgcctgacagttttatt
ggtggaattagaaaagcagtttcacaatatcccgaaagggtggttataggtgaagtctgg
gaagatgcgtcgcataaagttgcatacaatcaacgtagacattatttagagggtggcatg
cttcaagcaacaatgaactatccgcttcgagaattaatcattaatacgttgaatagaaag
ataaagccacgtggttggtggcgtcgattaggaacattgcaggagaattatccccaaact
gcttttaataatgcgctcaataatattggaacgcatgatacagaacgtatactaacggcg
gttggaaatgacaaaacgttgttactgaatgcaatgtggttattgtttagcttgccgggg
acaccatgtttgtattatgcagatgaaacaggaatgttggggggaacagatccagaaaat
agggcattttatccatggggacatgaggatcaggaaatattatctgaggtgaaaaaagcg
attatttggagaaagcatcacaattggattaacaaagctcaatttacaccgttttacatt
gaggatacggtgattggattgcgataccagtcagaagataatcagttatctgttttgctg
aatgtaacggaaagcgatcaagacgtagagctggcggatgtgattggcattgatgggagt
acgattattagagatggtaagagtgtgatcagttttaaaaaaagacaaatgctgatgttt
taa
DBGET
integrated database retrieval system
