KEGG   Pediococcus claussenii: PECL_329
Entry
PECL_329          CDS       T01713                                 
Name
(GenBank) S1 RNA binding domain protein
  KO
K06959  protein Tex
Organism
pce  Pediococcus claussenii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pce00001]
 09190 Not Included in Pathway or Brite
  09192 Unclassified: genetic information processing
   99973 Transcription
    PECL_329
SSDB
Motif
Pfam: Tex_YqgF Tex_central_region HHH_3 Tex_N HHH_9 S1 HHH_7 YqgF HHH_5 T2SSK S1_RRP5 ATP-synt_ab_C Baculo_p24
Other DBs
NCBI-ProteinID: AEV94641
UniProt: G8PAT2
LinkDB
Position
342307..344484
AA seq 725 aa
MEENVLNIVEKELNQYRPIQINATLDMLEDGNTVPFIARYRKERTHSLDEVQIREIQATY
HQVETLEKRKADVIKNIEEQGKLTSELRRSITKATALQTVEDLYLPYKQKRRTKATIAKE
AGLEPFASWLLTFPTNEINKKAEQFLNSDQDINTVDDVLAGVHEILAEAFGDNADFRDWI
RTYTKKNGLLTSVLKSKGEEHDENEVYKLYYDFSEQFNKVVSHQMLAINRGEKEKVLRAK
IDVNEDGIERFLRFRIIGDKTGEALPIIEDAYRDAYKRFIGPAIERELRAELTESASQQA
IKVFGDNLYHLLMQAPLKGKVVLGFDPAYRTGCKLAVMDENGKFLDKLVIYPHKPASASK
RAEAGKLFKDFLNKYQVEMIAIGNGTASRESEEFVAQKLKEIDRKIYYVIVNEAGASVYS
ASPEARKAFPELQVEERSAISIGRRLQDPLAELIKIDPQAVGVGQYQHDLPQKELTEQLD
GVVETAVNQVGVNLNTASPELLTHISGLTKTTAQNIVNFRDENGRYDARNQLKKVPRLGP
KAFEQAVGFLRIVDGKDVLDNTDVHPESYKAAKQLLKDLGIGMDSLGQDETIQKLKNANI
QQLSNQLKIGSETLTDIIEALQKPGRDLRDAMPAPLLRADVLTMEDLKPGMELQGTVRNV
IDFGAFVDIGVKQDGLVHISKLTKQFVKKPSDIVSVGDIVTVWVESVDLNRHRIQLTMIQ
DENKK
NT seq 2178 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttggaagaaaacgtacttaatatagtagaaaaagaattaaatcaatatcgaccgattcaa
ataaatgcaacacttgatatgcttgaagacggtaatacggttccgtttattgcacgatat
agaaaagaacgaactcatagtttggacgaagttcagatacgagagattcaagcgacgtac
catcaagttgaaacacttgagaaacgtaaagcagatgttattaagaacattgaggagcaa
ggaaagttaacttctgaactcagaagatcaatcacaaaagcaactgcattgcagacggtt
gaagacttgtatttaccatataaacaaaaacgtcgcactaaggcaactattgcaaaagag
gctgggcttgaaccgtttgcttcatggttattaacatttccaactaatgaaattaataaa
aaagccgagcaatttttaaattctgatcaagacattaatacagttgacgatgttttggca
ggcgttcatgagatcttggcggaagcctttggagataatgctgactttcgtgattggata
agaacttatactaagaaaaatggacttttaacatctgttcttaagtcaaaaggcgaagaa
catgatgaaaatgaagtgtacaaactttattatgatttttcagaacaatttaataaagtt
gtatcacaccaaatgctagcaattaatcgtggtgaaaaagaaaaagttcttagagccaag
attgacgttaatgaagatgggattgaacgctttttgcggtttagaattattggagataag
actggagaagctcttccaattattgaagatgcatatcgagatgcttataagcgttttatc
ggaccggcaattgagcgtgaattaagggcggaattaaccgaaagtgcaagtcaacaagca
attaaggtgtttggagataacctatatcatttgttgatgcaagcacccttaaagggaaag
gtagttctcggatttgatcctgcatatcgtacaggatgtaaattagctgtgatggatgaa
aacgggaaatttttggataaattggtaatttatccacataaaccagcatcggcatcaaaa
agggctgaggcaggaaaactcttcaaagattttctgaataagtatcaggttgaaatgatt
gcaattggaaatgggacagccagtcgtgagtcggaagagtttgttgcgcagaaattaaaa
gaaattgatcgaaagatttactatgtcattgtgaatgaggctggggcatccgtttattcg
gcaagcccagaagcacgtaaagcatttcctgaattacaggttgaagaacgaagtgccatc
agtatcgggcgtcgtttgcaagatccactagcagagttaataaaaattgatccacaagca
gttggcgtaggtcaatatcagcatgatttgccacaaaaagagttgaccgaacagcttgat
ggagttgtggaaactgcggttaatcaagttggggttaatcttaatacagctagcccagaa
ttattaacacatatttctggtttaactaaaacaacggctcaaaacattgttaattttcgt
gatgaaaacggacgttatgatgcgcgtaatcagcttaaaaaggtaccacgtttaggaccg
aaggcttttgaacaagcggtcggattcttgcgaattgttgatggcaaagatgtgctagac
aatactgatgttcatccagaaagctataaagctgctaaacagttattgaaagacttagga
attggaatggattctttggggcaggatgaaactattcagaagcttaagaatgcaaatatt
cagcagttatccaaccaacttaagatagggagtgaaaccctgaccgacatcatagaagct
ttacaaaaaccaggtcgtgatttacgtgatgctatgccggcaccgttacttagagcggat
gttttgactatggaagaccttaaacctggaatggagctacaaggtacggttcgtaacgtg
attgattttggcgcttttgttgatattggggtcaagcaagacggcttggtacacatttcc
aagctaaccaaacagtttgttaagaaaccaagcgatattgtgtcagtgggcgacatcgtc
acagtatgggtggaaagcgttgatttaaatcgacatcgtattcagttaacaatgatacag
gatgagaataaaaaataa

DBGET integrated database retrieval system