Pediococcus claussenii: PECL_344
Help
Entry
PECL_344 CDS
T01713
Name
(GenBank) Transcriptional regulator
Organism
pce
Pediococcus claussenii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sigma54_activat
PRD
EIIA-man
Sigma54_activ_2
AAA
AAA_5
Mg_chelatase
AAA_2
AAA_14
AAA_22
AAA_16
NACHT
RuvB_N
AAA_7
MarR_2
ResIII
T2SSE
AAA_29
TrmB
FtsK_SpoIIIE
DEAD
HTH_Crp_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEV94655
UniProt:
G8PB26
LinkDB
All DBs
Position
356188..359109
Genome browser
AA seq
973 aa
AA seq
DB search
MTRQERIYQYMVENTMAVQSVDAMGNDGLTTAAVASSLQIARPNVSKELNDLVRQGKLLK
SAGRPVQYCVALVDMLSDTLDETRNTQEHESGFAQTNKHTDEEIKNEPQQTTILQYSDDL
LTHMIGGNSSMHNQIEQAKAAMLYPPRGLNTLIIGPTGSGKTFFANAMFEYTKSQKLMPG
AKGLITFNCADYAHNPELLMSHLFGYTKGSFTGANDDQEGLIQEADGGMLFLDEVHRLPP
EGQEMIFYFMDHGTYSRLGETAKTHHANVRLVCATTEDPESSLLQTFVRRIPITIQLPSF
NKRSPQERIELLRSLLTIEANRTNKQITLTEDVVQALLGSVTYGNVGQLKSNVQLVCAQG
FLNNIDNEDEIVITSDKLPSNIKDGLLHLASDRRELGEISKLLQPYMTIKPDSKRSLPVN
HNDSYELPYNLYEIIGDKATMLREEGLDQEHINNFITTDINLHLKSFYKEDAITQSTENK
LAEIVDSDIIEFSKEIQPQIESKLNYQFRDNFIYAMSLHISSFIKRIQSGKPMRLMGNDL
VAMVKDYPDELEVANTIKEQLEERYNMPIPESESYYLAILIISLKMAPSKGNVGIVVAAH
GSSTASSMVQVVSQLLSDNSVESYDMPLDVDPQVAYRGIVEKVRDANQGNGVLLLVDMGS
LSTFAPKITEETQIPVQVIDMVTTAMVLEATRKASFIESDLNGIYSELREFHGYSRVASS
KKEIEDDDADVKRLLPNKPKAVIAICSTGEGTAQRIKNLLDQLLVQNLIEDVKIIPISIV
NMKERITEINKQYTVIAATGVMDPEIGVPFMALQSLLQGGGEQFVRQLVERSEVAWVTNI
GNTEVSKEVCRKYLSDYFMFINPDKFTSILWNYVGYLEEQRHVKFNDPFKISLIMHLGGA
VERALTNTAIPATEDEIREIQGQEWLKLVQNANHEYLDKVQITLTSSEEFYIYKLLETWQ
EKNDTMTSDTLVQ
NT seq
2922 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaagacaagagcgtatatatcaatatatggttgagaataccatggcagtacaaagt
gtggacgcaatgggcaatgatgggctaacaacggctgcggtggctagttcattacagatt
gctcgaccaaacgttagtaaggagcttaacgatctagttcgtcaaggcaagttgttaaag
tctgcggggcgtccagttcaatattgtgtggcgttggttgatatgttatctgacacactc
gacgaaactaggaatacacaagaacatgaatcagggtttgctcaaacaaataaacataca
gatgaagaaataaaaaatgaaccacaacagacaacgattcttcagtattcagatgatttg
ctaacccacatgattggtggcaattccagcatgcataatcaaatcgagcaagcaaaggcc
gccatgctgtatcctccacgaggattgaacactttaattatcggtccaaccggttctggt
aaaacgttttttgctaatgcaatgtttgaatataccaaaagtcagaagttaatgcctgga
gcaaagggattaataacttttaactgcgcagactatgctcataatccagagttattgatg
tcgcatctttttggttatacaaaaggctcatttaccggagctaacgatgaccaagagggt
ctcattcaagaggcagatggtggcatgcttttccttgatgaagttcatcgacttccacca
gagggtcaggaaatgattttctactttatggatcatggaacatatagtcgattgggggaa
acagctaaaacacatcatgcaaatgtgcgtttggtatgtgctacaacggaagaccccgaa
agttcattattgcaaacctttgtacgacgaattccaataacaattcaacttccttcgttt
aacaaacgtagtccacaagaacgaattgaattacttcgttcactattaacaatcgaagct
aatcggaccaataagcaaatcactttaactgaagatgttgttcaagcactactgggtagt
gtaacttacgggaatgttggacaattaaaatcaaacgttcagttagtttgtgcacaggga
tttttgaacaatattgataatgaagatgagattgttattacgtctgacaagttaccaagc
aatattaaagatggattattacatcttgcatcggatcgacgagagcttggcgagatttca
aagttgctacaaccctatatgacaattaaacctgattccaaacgttcacttcccgttaat
cacaatgatagttatgaactcccgtataatttatatgaaattatcggcgataaagctacc
atgttgagggaggaaggtttagatcaggaacacattaataatttcataacaacggatatt
aatttacatttaaaatctttctataaagaagatgctattacacagtccactgaaaataaa
ttagcagagattgtggactcagacattatcgagttttcaaaggaaattcaacctcaaatc
gaaagtaagctgaattaccagttccgagataactttatttatgcaatgagtttacacatt
agttcgtttatcaagcgaattcaatctgggaagccaatgcgtttaatgggcaatgattta
gttgcaatggttaaggattatccggacgaattagaagtagcgaataccattaaggaacaa
ttggaagaacggtataatatgccaattcctgaatctgagagctattatcttgcaatattg
ataatttcactcaagatggcgccttcgaagggaaatgtgggaatagttgttgcagcacat
ggtagtagtaccgctagttcaatggttcaagtagtttcacaattattatcagataattca
gtagagtcctatgatatgccgttggacgttgatccgcaggttgcttaccgcggaattgtt
gaaaaagtacgcgatgctaaccaaggtaacggtgtgttgttattagtggacatgggatcg
ttaagtacttttgctcctaagattactgaggaaactcaaatcccggttcaagtaattgac
atggttaccacggcaatggttttggaagcgacgcgaaaggcctcatttattgaaagtgat
ctgaacggaatttactctgagttacgtgagtttcatggttattcaagggttgctagttca
aaaaaagaaattgaagatgatgacgcggatgttaaacgtcttttgccaaataaaccgaag
gccgttattgctatttgttcaaccggtgaagggactgcccagcggattaagaacttattg
gatcaattgttagttcaaaatttaattgaagatgtcaagatcattccaatttcaattgtt
aatatgaaggaaagaattactgagattaataaacagtacacggttatagcagcaactggt
gttatggatccggagattggggttccgttcatggcattacaatccttacttcaaggaggc
ggcgagcagtttgtgcgtcaactggttgaacgaagtgaagtggcttgggtaacaaacatt
ggtaatacagaagtttctaaagaagtatgtcgcaagtatttgtctgattattttatgttt
attaacccagataaattcacttcaattttgtggaattatgtgggttatcttgaagaacaa
cgacatgttaagttcaatgatccatttaagattagtttgatcatgcatttaggtggtgca
gttgaacgggcgttgactaatactgcaattccagcgacagaagatgagattcgtgaaatt
caagggcaggaatggcttaagttagttcaaaatgctaaccatgaataccttgataaagtg
caaataacactaactagtagtgaggagttttatatttataaattgcttgaaacttggcaa
gaaaaaaatgatacaatgacttcagatactttagttcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system