Pediococcus claussenii: PECL_626
Help
Entry
PECL_626 CDS
T01713
Name
(GenBank) putative cell-wall-anchored protein (LPXTG motif)
Organism
pce
Pediococcus claussenii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MBG
KxYKxGKxW_sig
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEV94921
UniProt:
G8PCD6
LinkDB
All DBs
Position
633514..638970
Genome browser
AA seq
1818 aa
AA seq
DB search
MSFWRKNHKSTNLNTKNHYKMYKAGKQWLFAGITTIAGLGGQSIAGAKADSLSATSTATK
DVQDQDVLATGDSAIIPAESSVASSSVATASATSATLSSASSAVSSSNSSNTSSASASSA
DTSSSSSSVASGSNTTSSSVSSTSSSSATSSANASSNNSNSSSATSSTVNSSSNSAATSS
TAESSSPVSSSSSVASITSNALSSATSGTQSLVSSGVTNTTSSSATTSSTATSSSAVASL
SMSNSMSLSESQSLISLASLNIGSSVAASSAASSAKKVAMKAMVMAATVAPTVAVNVGSL
SYNMGTQIAYYALRSWKDSGLNIVSLTPSWLLANFTAISALLTYYQANGTVLRADGTMDP
SLIAALSGIYAAPSWSGQTGIKVSGSTAASSGYTQNGSGWNNTDYTNDYYLIGTVKNPFS
ATDYYAGIASILNVYAQEVTNYFDQVATKVQDTSGGVGNSLSDQLASYFTYNPNIAQNQS
GALGLLANVTALVSPLLSAQGSNDSLTGQIPGIFGFHVTTSDPLIISDLTQNASNAYNTG
SLQSLDNLISVVMSSLQPAIEKQLFNDIRTLGINQSGSLSIPSDLYTAVYTLTPGLAQVI
SYFNFSSLLNLPLLNQIYLSVVNGIRTAIVNDAIVGVNAAFKNILDPKDNPDPDYSTVAG
YNRTSASGAANTVQTTQNTTLLAQSVGYSWAQQVVPTILRAASADALNKATPQNLNEILN
TLLNAGVITSAQVTQLTVAGTQNTSYTNYVADPTGAQNLITSLYTAEYNAVQQAVTDFNN
GTPKGANPTWTDPSTVQTDGTNSGIETLTDYGNVYDYLVKVRHDAMVDADAKSHSEKDGK
VAALTSVSGSTNANFNTTAGLTNYVTNAVSASGILSSTSDISALAAISQTDYVSEYNAEA
ALTNTAFAQGAAAAQVQIRLHPNGHLASPASVDYNGYSGSSDKTAQYAVTTDTLQTGQAF
TDGYLASVDTVTEIAAPSAPTSSWTTAQLTAFNTAIKNAFPNATQQSNGNWVIGTDYVAP
GATNVLYTAPTTVTGFGSTNQTLTTAGAAGNTSDTVTFTFTAGVNLISNYGIDGASSTGL
GQDTSFTPTGTALTIPGLLTGLNGELQTWHNASKILFDFNNTTFSTTSNGVTGSSLSIYL
LAYYAQLGYATATDLQTAISNEFASGSDKLALQVLALIQGGLATTSAASSGTVTMNYAFK
NTNVNSTVATVGSIVDQRGNKLQPDTTNSLVVGNNLVFQTPTIPTGRTINFDNSYVQMSL
DGSEPVKYTLTQLTQILGITLTGNSQADLTSIINAFNEANGNVTITTGNLLDNLQALTYI
QLNPQASTASVSGSQSVTYTGSVPALTTGDYTVTLADGSTYTLQAGDIDIINSSKNAGTY
QVELTAQGLANINAASADHIYTIDNSTLGTLVINKANATINVDGTQHVYTGDTYNATATA
TGAVNGETLNYTVSGSQTEIGSSPVAVNFDPADPINANYNITVTGAAVITVVRNATSDSN
STSASESMSDLGSVSASDITSVSQSNSIAGSISISNSNNFSASNSIVESASTSASKQSSI
ETNDKVSELMSDSASLSEEASAGGSQSLQNSQSLSNSMSTNGDNSISNVNSLSESNSLSA
QNSLSIAQGNSLNNELSDAESGVASGDTSQSNSVNDAGSQSLVNSVSESNSIIDRGSDGS
NDSISNSNSYSVANSNSVQNSISASNSLSLDDSNNVNSDTSESVSLSISNSQNIVNSVST
STSGSTSFSMSGNESVSGSTSISESESLSSVDSVSGSVSNSNNVSNTTSASLSLSNSNSE
STVESLSVSNSLSGFAKC
NT seq
5457 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctttttggagaaaaaatcacaagagtacgaatctgaatacaaaaaatcattacaag
atgtacaaagcaggtaagcagtggctttttgcgggtatcacaacgattgctggccttggg
ggtcagtcaattgccggtgcgaaggcggattctttaagtgcaacttcaactgcaacaaag
gacgtccaagatcaggatgtgctagcgacaggggatagtgccattattccagctgagtcg
agtgtagcaagtagttcagtggctacagcatctgcaacgagcgcaacgctttcatctgcg
agtagcgcggtaagcagttcaaattcatcaaatacaagtagtgccagtgcatcaagtgct
gacacttcttcgagttcaagcagtgttgcctctggctcaaatacgacatcatcttccgtt
agttcaacatcaagtagcagtgctacttcgtcagcaaatgcaagtagtaataatagcaat
agttcaagtgctacatcttcaactgttaatagtagttccaattctgctgcgacatcatca
acagcagaatcatccagcccagttagcagttctagttcagtggcatcgatcacttcaaat
gcactttcttctgcaacttcgggaactcaaagtttagtaagttcaggagtaaccaacaca
acgagctcaagtgctacgacaagttctacagcaacaagtagtagtgcagtagcctcttta
agcatgtcaaatagtatgagcttaagtgagagtcaatctttaattagcttagcttcattg
aatattggcagttcagtagcggcatctagtgctgcaagcagcgcaaagaaagttgctatg
aaggctatggtaatggcagctacggttgctcccacggttgcagttaatgtgggtagtttg
tcgtacaacatgggtacacagattgcatattatgcacttagaagttggaaggatagtggg
ctgaatatcgtttcacttactccatcttggttactagcaaactttacagcaataagtgct
cttttgacgtattaccaagcaaatggaacggttttaagagcagatggtactatggatcca
tccttaattgctgcactcagcggaatatatgccgctcctagttggtcaggacaaaccggg
attaaagtttccgggagtaccgcggctagcagtggttatactcaaaatggtagtgggtgg
aataatactgattataccaacgactattatctaataggtacggttaaaaacccattttca
gcaacggattattatgctggaattgcatctattctgaatgtttatgcacaagaggttact
aactacttcgaccaggtagctacaaaagtgcaagatacttctggtggagtcggaaactca
ttgtcagatcaattagctagttacttcacttataatcctaatattgcacagaatcaatct
ggagctttgggcctgttggcaaacgttactgccttggtttcgcctttattgagtgcgcaa
ggatcgaatgactctttaacgggtcaaatacctggaatttttggatttcatgtgacaact
agtgatccattgattatttctgatttaacacaaaacgcttctaatgcctataacacaggt
tcattgcagtcattagataatcttattagcgttgtgatgagttcattacaacctgcgatt
gaaaaacagttgttcaatgatattagaactttgggtattaatcagagcggctcactaagc
attcctagtgatctatataccgcagtttatacactaacaccggggcttgcacaggttatt
tcatatttcaacttttcttctttgttgaacctgcctctgttaaatcaaatatacttatcg
gtagtgaatggtattagaacggccattgtaaatgatgcgatcgtaggtgttaatgcagcc
tttaaaaatatccttgatccaaaggataaccccgatcctgattatagtacagttgccggt
tacaatagaacaagcgcaagtggagcggcaaacactgttcaaacaactcaaaatacaaca
cttcttgcacaatctgttggttattcttgggcacaacaagtcgttcctactattttgcgg
gctgcttctgccgacgccttaaacaaggcaacaccacaaaatttaaacgaaattttaaat
actttattaaatgctggcgttataacatcagcacaagtaacacaattaacagttgcagga
actcaaaatacaagttatacaaattatgttgctgatccaacaggagcacaaaatttaata
acgagtttgtatactgctgagtacaacgctgttcaacaagcagtgacagattttaacaac
gggactcctaagggtgctaatcctacttggactgatccttcaacagtccagactgacgga
actaatagtggtattgagacactcacagattatgggaatgtctacgattaccttgttaag
gtgcgccatgatgcaatggttgatgctgatgctaaatcccatagtgagaaagacggtaaa
gttgcggcactgactagtgtttctggatcgactaatgctaattttaatacaaccgctgga
ttgacgaattatgtaacgaatgcagtttcggcctctgggattcttagctcaactagcgat
atatctgcgttggcagcaatcagtcagactgattatgtttctgagtacaacgcagaagca
gctttaacaaataccgcatttgcccaaggagctgcagcggctcaagtccaaattagatta
catcctaatgggcatttagctagtccagctagtgttgattacaatggctacagtggaagt
agtgataaaacagcacaatacgcagtaactacggataccctccaaaccgggcaagccttt
actgacggttatttggcaagcgttgatactgttaccgagatcgcggcaccatcagcgcca
actagttcttggacgacagcacagcttactgcatttaatacggctattaagaatgcattt
cctaatgcaacacagcagtcaaatggtaattgggtaattggaacggactatgtagcacct
ggtgctacgaatgttctctatactgcacctacaacagtgactggttttggatctaccaat
caaactttgacaactgctggcgctgcggggaacacatccgatacagttacatttacgttc
acggctggcgttaatttgattagtaactatggaattgacggtgcatcaagtaccggtctt
ggacaagatacttcatttacgccaactggaacagctttaacaattcccggattacttaca
gggctgaatggagaattacagacttggcacaatgctagcaagatcttgtttgattttaat
aatacgactttttcaacgacctccaatggcgtaactggaagctcgttgagtatatatttg
ctcgcatattatgctcagttgggttatgccactgccactgatttacagactgcaatttct
aatgagtttgctagtggcagtgataagcttgccttacaagtattagctttaatccaaggc
gggttagcgacaacaagtgctgcatctagtggcacagttaccatgaactatgcttttaag
aacactaacgttaactcaaccgttgcaaccgttggctcgatagttgatcagaggggtaac
aaacttcaacccgatacaacaaatagcttagttgttggcaataatttagttttccaaact
ccaacaattccaactgggcggacgattaattttgataacagttatgttcagatgtcgtta
gatggatcagaaccagttaagtatactttgactcagctgactcaaatccttggtatcact
ttaaccggtaattcacaagcagatttgactagtatcatcaatgcctttaacgaggccaat
ggtaatgtaacgattacaaccggtaacttgttggataacttgcaggctttaacttatatt
caattgaacccacaagcatcaacagcttctgtttctggaagtcagtcagttacgtatacc
ggctcagtaccagctttaactacaggtgactataccgttacacttgctgatggaagtact
tatacattgcaggctggcgatattgacatcattaatagtagtaaaaatgccggaacttac
caagttgagcttacagcacaaggtttagctaatattaatgccgcttcagctgatcacatt
tatacgattgataatagtacgctcggaactcttgtaattaataaggccaatgcaactatt
aacgtagatgggacacagcatgtttacactggggatacgtacaacgccacagctacggca
actggtgctgtaaatggcgaaacccttaattacacagttagtggtagccagactgaaatt
ggtagtagcccagtagcagtcaacttcgatcccgctgacccaattaatgccaactacaac
attacagttactggtgcagcagttattacagttgttagaaatgctacaagtgatagtaac
agtacttcagcatctgaaagcatgtcagatcttggtagtgttagtgcttctgatataaca
agtgtttcacagagtaattcaatagcgggttcaattagtatttctaattcaaacaatttt
tctgcttcaaattccattgttgagagtgcttccacgtcggcttcgaaacagtcctcgatt
gaaacaaatgataaagtttcagagctgatgtccgattcggcaagtctatcagaggaagct
agtgctggcggatcccagagtttgcaaaatagtcaaagcctaagcaactcgatgagtact
aatggcgataattctattagtaatgttaattcacttagtgaatcgaattcactaagtgct
cagaatagtttgagcattgcgcaaggtaatagtttgaataacgaacttagtgacgcggaa
tcaggggttgcatcaggggatactagtcagtctaatagtgtgaatgatgcaggttcacaa
tcacttgttaattcggttagtgagtcaaatagtattattgatcgaggctccgatggtagt
aacgattcaatctcaaattcaaacagttactctgtggctaattcaaatagcgtacaaaat
tcaattagtgcatcgaacagtctgagcttagatgattcgaacaatgttaattcagataca
agtgaatcagtttcattgagtatttcaaatagtcaaaatattgttaattcagtaagcacc
tctactagtggttctacttcatttagcatgagtggtaatgaatcagtttcaggctcgact
tctataagcgagagtgaaagcttgagtagtgttgactctgtcagtggaagtgtaagtaat
agtaataacgtatcaaatacgacaagtgcgtcgctttcacttagcaactcgaatagtgaa
agtacggtggaatcactaagtgtttctaattccttgagtggtttcgcaaagtgttag
DBGET
integrated database retrieval system
