Polaribacter cellanae: J3359_06065
Help
Entry
J3359_06065 CDS
T08224
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16089
outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins
Organism
pcea
Polaribacter cellanae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcea00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pcea02000
]
J3359_06065
Transporters [BR:
pcea02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
J3359_06065
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTE23830
UniProt:
A0A975CR53
LinkDB
All DBs
Position
1340797..1342845
Genome browser
AA seq
682 aa
AA seq
DB search
MFLNRLFCILFLSTTTFMFTQEKVVKKDSLKINTLNEVIVTATRTVRQLSSLPMPVTLIS
KKQIRKSGATRLKDILLEQTGINFVTNHSGFTGVQVQGLSAEYTMIMIDGVPLVGRRSGN
LDLNRISVNNIKQIEIVKGPSSSLYGSEALGGVINIITEKPKKNTLKGNVSYFVRSGSQD
ELDINTNFLYRKEKFGVVAGINLNSSDGFDLTPETTYKTTKAYQNYTGNLKLTYDFSDQL
KFLISQRYFYEEQAKNNVQSDWNSNVELHHQLNDTWNINYSFYATKFKTESKFNGKVSEF
KQTLMRPEIRVTAKFSNSSLISGIGVNLDALDRTFFAKKETFNAKYIFAQYDFHPTERIN
TIVGTRFDSHNKYKSALSPKISSSYKINDWLKAKGSVGYGFKAPDFRQLFFNFNNNAGGY
VVLGIKTLHELYGNVPSVQAISKDLKPENSIGYNFGFEIKPISNLKISINGFRNDIKDLI
NTVALKGGLPSLNPGTSVFYYENRDQVFTQGIELDLNYKISNNFRFIGGYQYLEAKDKED
ISKIKSGNIFFRRTPSSPSEILKLSDYFGLSNRSKHTVNAKLFYQNLAHNFSANIRAIFR
SKYALFDTNNSQGIVDVYDDFVAGNTQINVAVEKTFFNLMNVQFGIDNLFDEKGLINKET
FKNNDAVLLLGRNFYTRIRFNL
NT seq
2049 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttctaaatagacttttttgtattctttttttaagtacaactacttttatgtttact
caagaaaaagtggtaaaaaaagattctcttaaaataaatactttaaatgaagtaattgta
actgcaacaagaacagttaggcaattatcttctttaccaatgccagttactttaatttct
aaaaaacagattcgaaaatctggtgcaacaagattaaaagatatattattagagcaaaca
ggtattaattttgtaacaaaccatagtggctttacaggagtacaagtgcaaggtttatct
gcagaatacactatgattatgattgatggagttccacttgtaggtagaagatctggaaac
ttagacctaaatagaattagtgtaaataacataaaacaaatagagattgtaaagggacca
tcttcttctttatatggttctgaagcgttaggtggtgttataaatattatcacagaaaag
ccaaaaaagaatactttaaaaggtaatgttagctattttgtaagatctggttcacaagac
gaattagatataaacaccaactttttatatagaaaagagaagtttggagttgttgctggc
atcaacttaaattcgagtgatggttttgatttgaccccagaaaccacctataaaacaaca
aaagcttaccaaaattatactggaaacttaaaactgacgtatgatttttctgatcaatta
aaatttttgatttctcaaagatatttttacgaagaacaggctaaaaataacgtacaaagt
gattggaattcgaatgtagaattacatcaccaattaaatgatacttggaatattaattat
tctttttatgcaactaaatttaaaacggaaagcaaatttaatggaaaagtgtctgaattt
aagcaaactttaatgcgtccagaaattagagtaaccgcgaagtttagcaacagttcttta
atcagtggaattggagttaatcttgatgctttagacagaacttttttcgctaaaaaggaa
acttttaacgccaaatatatttttgctcaatacgattttcatccaacagaaagaataaat
acgattgttggtacacgtttcgacagccataataaatacaaatctgctttaagtcctaaa
atttcatctagctataaaattaacgattggttaaaagcaaaaggttctgtgggttatggc
tttaaagcgccagattttagacaactttttttcaattttaataataacgctggtggttat
gtagttttaggaataaaaaccttgcacgaattatatggaaatgtacccagtgtacaagct
atttctaaagatttaaagccagaaaattcgattggttacaattttggttttgaaataaaa
ccaatttctaacttaaaaatatctataaacggatttagaaatgatattaaagatttaata
aatacggttgctttaaaaggaggtttaccaagtttaaatccaggcacttctgttttttat
tacgaaaacagagaccaagtttttacacaaggaattgagttggatttgaactataaaatt
tcaaataattttagatttattggtggttatcaatatttagaagccaaagacaaagaagac
attagtaaaattaaatctggcaatattttctttcgaagaaccccttcatctccttccgaa
attttaaaattgtcagattattttggcttatctaaccgatctaaacatactgtaaatgca
aaacttttttatcaaaatttagcacacaatttttctgcaaacataagagccatttttaga
agtaaatacgcgctttttgacaccaataatagtcaaggtattgtggatgtttatgatgat
tttgttgcaggaaatacacaaataaatgtagccgtagaaaaaactttttttaatttaatg
aatgtacaatttggtatagataatttatttgatgaaaaaggtttaataaacaaagaaact
tttaaaaataatgatgcagtcttattattaggaagaaatttttacacacgcatacgattc
aatttgtag
DBGET
integrated database retrieval system
