Polaribacter cellanae: J3359_10995
Help
Entry
J3359_10995 CDS
T08224
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase family protein
Organism
pcea
Polaribacter cellanae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
SWIM
PRORP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTE21355
UniProt:
A0A975CLD0
LinkDB
All DBs
Position
2441486..2445148
Genome browser
AA seq
1220 aa
AA seq
DB search
MIKEIKKYITNCSTKAIRNRANSIQVNLKFKTKEKYVFYYKGSGNKPYEIIVFFKEKNIK
TSCNCPYDYAGLCKHEVAGLNFIIDEEMLEKIQKDLFGNEIIEVKNDELFLENHLITDVL
LDSICKKNNIYYLQEYSIEILAITKNFIKTTYNSWPSKNQEFNYNSTNNILKVFCTCRES
KKNICVHILSALSRLIEDFGEDFFTPNYIDNQKELFLKNYGLTLADNYKDFFDFSFGING
IEVVEKVKNIVPSLEMASSNLIPKLDKKQEDAFLISSENKSQELEYGIGFCFDLYRQNKI
DFFSFLPFKAKFKKHSKEFASTFKEIDRYNFVEQLRTISVLEKNALLQAIEFREIYERFL
NNFSIDMYRSSFIQFNNLLKETSEYSYFTKKKKDTFVKKNIVPVNFSSENPILSFTFTEK
EALYTLKPKITIEGNSYQINSSKIKIFPFFCLYNNTIYCFKTPQEFLHINRLQQRSEINF
IKNDENKLYEEFLKPISKHFDITTKVYKVSKKKIAEEQLQKQVYLSDYEGEYILFKLGVQ
YNKEVMLLHTKEQLFDAKKQRIIPRNYTFENEFLEEFKEFHPDFKEQDGVFFLTPYQLVE
DGWLLKFSEKMPQKNIAIFGAKELKSFKFNLNKPTISMSVKSETDWFDLNIEIKYGNQKV
SLRDIKKAVLKKSKYVVLGDGTFGILPKEWLQKFSRYFKSGEVKNNAIKISNYQFNSIDE
LYEDLENTPEFLLKLQRKKQQLLNLKDVANITIPKQLKATLRPYQKEGLNWLAFLEENEL
GGCLADDMGLGKTLQVIAFLAYLKIVKKEKLSHLVVVPTSLIFNWESEIQKFCPSLKVLV
YTGLNRKEKIKSFAKANIILTTYGSILNDIETLKEIKFGYVILDESQAIKNPNSKRYKAV
RMLQSKNRLALTGTPIENNTFDLYAQMNFLNPGLLGTISHFKKEFSEAIDKFKNEEASKL
LSKMIHPFLLRRTKKQVATELPEKTENILYCEMGMEQRKVYNLFKDKYRDYLLNKIDENG
IGKSQMYVLEGLTKLRQICNSPELLSDEEDYGKSSVKLDILIENIISKTTNHKVLVFSQF
TTMLQLIKDRLDNENIAYEYLDGKTQKRQDKVANFQETENLRVFLISLKAGGVGLNLTAA
DYVFLVDPWWNPAVENQAIDRSYRIGQTKHVMAYKMICKDTIEEKIVDLQKNKRKVSDSL
IQVDVAKKSFNKKEIKALFS
NT seq
3663 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaagaaataaaaaaatacataactaattgctcgactaaagccattcgtaacaga
gccaattctatccaagtaaatctaaaatttaaaacaaaggaaaaatacgttttttattat
aaaggttcaggaaataaaccttacgaaataatagtattttttaaggaaaaaaatattaaa
accagctgtaattgcccttatgattatgctggtttatgtaaacacgaagtagcagggtta
aactttattatagacgaagaaatgctagaaaaaattcaaaaagatttatttggaaatgag
attatagaagtaaaaaatgatgaactatttttagaaaaccatttaattacagatgtttta
ttagatagtatttgtaaaaaaaataacatttattatctacaagaatatagtattgaaata
ctagcaataactaaaaattttattaaaactacgtataatagttggccttccaaaaaccaa
gaatttaactacaattctactaataatatattaaaagttttttgtacttgtagagaatct
aaaaaaaatatatgtgtgcatatattatctgctttaagtagattaatagaagattttgga
gaagatttttttactcctaattatatagataatcaaaaagaactatttttaaaaaattac
ggtttaacactagcagataattataaagatttttttgatttttcttttggaataaatgga
attgaagttgtagaaaaggtaaaaaatattgtaccctcattagaaatggcttcatcaaat
ttaattccgaaattagataaaaaacaagaagatgcttttttaatttcatcagaaaataaa
agccaagaattagaatatggtattggtttttgttttgatttatacaggcaaaataagata
gatttttttagttttcttccatttaaagcaaaatttaaaaagcattccaaagaatttgct
tctacttttaaagaaatagataggtataattttgtagaacaattaagaacgatttctgtc
ttagaaaagaatgctttattacaagcaatagaatttagagaaatttacgaacgttttctt
aataatttttctattgatatgtatcgtagttcatttattcagtttaacaatttattaaaa
gagacttctgagtattcttattttacaaaaaaaaagaaagatacttttgttaaaaaaaat
attgttcctgttaatttttcatcagaaaaccctattttatcttttacatttacagaaaaa
gaagcactttatacgctaaaacctaaaataactatcgaagggaatagttatcaaataaac
tcatcaaaaataaaaatttttccatttttttgtttgtataataatacaatttattgcttt
aaaacaccacaagaatttttacatatcaatcgacttcaacaacgaagtgaaataaatttt
ataaaaaacgacgagaataaattgtatgaagaatttttaaaacctatctctaaacatttc
gatattacaactaaagtatataaagtttctaagaaaaaaatagcagaagaacagcttcaa
aaacaagtgtatctatctgattatgaaggtgagtatattctttttaaactaggtgtacaa
tacaataaagaggtaatgcttttacataccaaagaacaattatttgatgcaaaaaaacaa
agaataattcctcgaaactacacgtttgaaaacgaatttttagaagaatttaaagaattt
catccagattttaaagaacaagatggcgttttttttcttacaccatatcaattagtagaa
gatggttggcttcttaaattctcagaaaaaatgcctcaaaaaaacattgctatttttgga
gcaaaggagttaaaatcattcaaatttaatttaaataaaccaaccatttctatgagtgta
aaatcggaaacggattggttcgatttaaatatagaaataaaatatggcaaccaaaaagta
agtttaagagacattaaaaaagcggtacttaaaaaaagtaagtatgtagttttaggcgat
ggaacttttggaatcttacccaaagaatggcttcaaaaattttcgagatattttaaatcg
ggcgaagtaaaaaataatgctattaaaatttctaactatcaatttaatagtattgatgaa
ttgtatgaagacttagaaaacacgccagaatttttattaaaactacaacgcaaaaaacaa
caattactcaatttaaaagacgttgcaaatattaccattccaaaacaattaaaagccact
ttaagaccataccaaaaagaaggattaaattggttggcttttttagaagaaaacgaatta
ggtgggtgtttggcagacgatatgggattgggaaaaacattacaagtaattgcattttta
gcatatttaaaaatagtaaaaaaagaaaaattgagtcatttagtagtggtgccaacttct
ttaatttttaattgggagagcgaaatacaaaagttttgcccatctttaaaagtattggtt
tacacaggcttaaatagaaaagaaaagattaagtcttttgcaaaagcaaatataatttta
acaacttacggctctattttaaacgatatagaaacgttaaaagaaataaaatttggatac
gtaattttagatgaaagtcaggcaataaaaaacccaaattctaagcgatacaaagctgta
agaatgcttcaaagcaaaaataggttagcacttacaggtacacctatagaaaataataca
ttcgatttatacgcacaaatgaactttttaaatccaggtcttttaggtactataagtcat
tttaaaaaagaattttctgaagctatagataaatttaaaaacgaagaagcttctaaatta
ttaagtaaaatgattcatccttttttgttaagaagaacaaaaaaacaagttgctaccgaa
cttccagagaaaacagaaaatattttgtattgtgaaatgggaatggagcaacgaaaggta
tataacttatttaaagataaatacagagattatttattaaataaaattgatgagaatggt
attggaaaatcgcaaatgtatgtgcttgaagggctaacaaaattacgtcaaatttgtaac
tcgccagaattattaagcgatgaggaagattatggaaaatcgtccgtaaaattagatatt
ttaattgaaaatattatctcaaaaacaacgaaccataaagtgttagttttttcgcaattt
actaccatgttacaattgataaaagacaggctagataacgaaaacatagcatacgaatat
ttagatggaaaaacccaaaaaagacaagacaaagttgcaaattttcaagaaacagaaaat
ttacgggtgtttttaataagtttaaaagcgggtggagttgggcttaatttaacagcggct
gattatgtgtttttagtagatccatggtggaacccagcagttgaaaaccaggcaatagac
cgttcttatagaataggacaaacaaaacatgtaatggcttataaaatgatttgtaaagat
accattgaagaaaaaattgtagacttacaaaaaaacaaaagaaaagtttctgactcttta
attcaagtagacgttgcaaaaaaatcatttaataaaaaagaaattaaagcactttttagt
tag
DBGET
integrated database retrieval system