Paenibacillus cellulosilyticus: HUB94_17030
Help
Entry
HUB94_17030 CDS
T07813
Name
(GenBank) collagen-like repeat preface domain-containing protein
Organism
pcel
Paenibacillus cellulosilyticus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
BclA_C
PA14
C1q
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKS45958
LinkDB
All DBs
Position
3324024..3327146
Genome browser
AA seq
1040 aa
AA seq
DB search
MDNEIPITTAQLNALKKLLNDLVALLPSVLGSPSPSNIAQLNALLRELRRLVLAINFEVM
EQAALLALLENYITLAEVFPFTPLGAAVITEELLTMLGAVTLRFAVDPPDKDELISLIRS
NQQRLATGFVQLGSQTGTAGPPGPPGAPGAPGPIGPIGPVGPQGIPGPQGPAGAPGEEGP
AGAPGPLGPQGIQGPAGAAGTAGNPGAAGATGPTGATGAGLQGVTVFNPANAPSYPDNQL
VVYEGSLYITTTASPTGKPGSSPDFLLLVTRGETGIGVTGATGATGSTGGTGATGLQGAT
GPTGSGAGPTGATGATGATGVTGDTGATGSGATGATGATGADGATGATGADGATGADGAT
GATGTDGAPGAAGATGATGADGAPGPAGATGATGADGAPGADGATGAAGATGATGADGAP
GAAGATGATGADGAPGAAGATGATGADGAPGAAGATGATGADGAPGATGATGAEGATGAA
GATGATGADGTPGAAGATGATGADGAPGVAGATGATGADGAPGADGATGATGADGAPGAD
GATGATGADGAPGAAGATGATGADGAPGAAGATGADGAPGAAGATGATGADGAPGAAGAT
GATGADGAPGAAGATGATGADGATGAAGATGATGADGAPGVAGATGATGADGAPGATGAD
GAPGAAGATGATGADGAPGATGATGAEGATGAAGATGATGADGAPGVAGATGATGADGAP
GAAGATGATGADGATGAAGATGATGADGAPGADGATGATGADGATGADGATGATGADGAP
GAAGATGATGADGAPGAAGATGATGADGAPGVAGATGATGADGAPGAAGATGASGADGAP
GAAGATGATGADGAPGAAGATGATGADGAPGTAGATGATGTTGVTGATGTTGVTGTTGAT
GATGSAFTDVHAFAANTSGSAISVVLGGTNVPLPNAQVFNGGFTINGANDTITVPTTGTY
MISFQINTTASLLVSARLLVNGTAVPAGTISNAVSVTQFNNVVVLNLTAGNTVTIQLFGL
LGTATLITGAGAAVTIVLLS
NT seq
3123 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataatgaaattccgataacgaccgctcagctgaacgcattgaagaagctgctcaat
gatcttgttgcgctgctcccctctgttcttggctcaccgagcccaagcaatatcgcccaa
ttgaacgccctgcttcgcgagctgcgccgtttagtgcttgccattaattttgaagtgatg
gaacaagccgcactacttgcacttctcgaaaattacatcacattagccgaagtattccct
ttcacgccacttggcgctgccgttattaccgaggaactgctaacgatgcttggtgcggta
acgctccgtttcgctgttgatccaccagataaagatgagctcatcagccttattcgttcg
aatcaacagcggctggctaccggcttcgttcaacttggttcgcaaactggaacagctgga
ccaccgggaccgccaggagctccaggtgctcctggacctatcggaccgattggacccgtt
ggtccgcagggaattccgggtccacaaggaccagctggagctcctggtgaagaagggccc
gccggtgctccaggacctctagggccgcaaggcattcaaggacctgctggcgctgccgga
actgctggcaatccaggggcagcaggagctacaggaccaactggcgctacgggagctgga
ctccaaggagtaaccgtctttaacccagcaaatgccccaagttatccagacaatcagcta
gttgtctatgaaggcagcttatatattacgacgactgcatctccaaccgggaagccaggg
tcttcaccagattttttgctccttgtgacaagaggtgaaaccggcatcggggtgacgggt
gcgactggcgcaacaggatcaactggtggcacgggagccaccggtcttcaaggtgcaact
ggaccaacagggtcgggcgctggtccaacgggggctaccggggctaccggggctaccggc
gtaactggtgatacaggtgcgactggtagcggtgcaactggcgcgaccggggctacgggg
gctgatggcgcgacgggcgcgaccggggccgacggcgctacgggggctgatggcgcgacg
ggcgcgaccggcaccgatggggcgccgggggctgccggagctacgggcgcgacgggcgct
gatggggcgccggggcctgctggagctacgggcgcgactggcgctgatggcgctccgggg
gctgatggtgcgacgggagctgccggcgctacgggcgcgacgggcgctgatggtgcgccg
ggagctgctggagccacgggcgcgacgggcgctgatggggcgccgggagctgccggagcg
actggggccactggcgctgatggggcgccgggggctgctggagcgactggggccactggc
gctgatggggcaccgggagctacgggtgcgaccggcgctgaaggtgcgacaggagctgcc
ggagcgactggggccactggcgctgatggtacgccgggagctgccggagcgactggggcc
actggcgccgatggtgcgccgggagttgctggagctacgggcgcgactggcgccgatggt
gcaccgggagctgatggtgcgactggcgccactggcgctgatggtgcgccgggggctgat
ggtgctacgggcgcgactggcgccgatggtgcaccgggagctgccggagctacgggcgcg
accggagccgatggtgcgccgggagctgctggagcgaccggtgctgatggggcgccgggg
gctgccggggcgaccggggccactggcgctgatggtgcgccgggggctgctggagcgact
ggggccactggcgctgatggtgctccgggggctgccggagctacgggcgcgaccggcgct
gatggtgcgacaggagctgccggagctacgggcgcgactggcgctgatggcgcgccgggg
gttgctggagctacgggcgcgaccggcgctgatggggcgccgggagcgacgggcgctgat
ggtgcgccgggagctgctggagcgactggggccactggcgctgatggggcaccgggagct
acgggtgcgaccggcgctgaaggtgcgacaggagctgccggagcgactggggccactggc
gctgatggggcgccgggggttgccggagctacgggcgcgaccggtgctgatggggcgccg
ggggctgctggagcgacgggcgcgactggcgctgatggggcgacaggagctgccggagct
accggggccactggcgctgatggggcgccgggggctgatggggcgacgggcgcgaccggc
gctgatggcgctacgggggctgatggggcgacgggcgcgaccggcgctgatggtgcgccg
ggggctgctggagcgacgggcgcgaccggcgctgatggtgcgccgggggctgctggagcg
acgggcgcgaccggcgctgatggcgcgccgggggttgctggagcgacgggcgcgaccggc
gctgatggtgcgccgggagctgctggagcgactggggccagtggcgcagatggtgcgccg
ggggctgccggagcgactggagccactggcgctgatggtgcgccgggggctgctggagct
acgggcgcgactggcgctgatggtgcgccgggtacggctggagcgactggcgcaacaggt
accacgggtgtgactggtgctacaggcaccacaggtgtaaccggcacaacgggggcgacc
ggagctacaggcagcgctttcaccgatgtgcatgcctttgccgctaatacatctggctct
gcgatctccgtcgtgcttggcggtacaaatgtacctcttccgaatgcacaggttttcaat
ggcggtttcacaatcaatggtgctaatgatacgattacggttccaaccactggcacctat
atgatttcattccagattaatacgacagcttcgctattggtttccgcacgcttactcgtc
aacggaactgcagttcctgctggcacgatatcgaatgccgtgtcggtcactcagttcaac
aacgtcgtcgtcctcaatttgaccgcaggcaataccgtcacgattcagctattcggttta
cttggaactgcaacactcattacaggagcaggcgcggcagtcactatcgtcttgttgtct
taa
DBGET
integrated database retrieval system
