Polistes canadensis: 106788805
Help
Entry
106788805 CDS
T05611
Name
(RefSeq) nucleolar protein 6
KO
K14544
U3 small nucleolar RNA-associated protein 22
Organism
pcf
Polistes canadensis
Pathway
pcf03008
Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcf00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
106788805
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
pcf03009
]
106788805
Ribosome biogenesis [BR:
pcf03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
106788805
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Nrap_D4
Nrap_D5
Nrap_D3
Nrap
Nrap_D2
Nrap_D6
DUF6161
Spy1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106788805
NCBI-ProteinID:
XP_014607882
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1183 aa
AA seq
DB search
MKIKDSRKVGKRKELKKKTVINNSHTDSESEFNFDNDNNQDSELDNEFNFMREFDEDNES
DPQLNDINNSIFTTTRKRSVTEELDSVPKKKKKLKNDLYKQPTVEELNQLRETETLFHSN
LFRLQIEELLAEVKLKNKYKNLFDAWFIKFKANIESLQETDELKFSDENIYKKLHLNIPI
LNVPEDARGTFKFLKPLSIVIIGSYSFDCTVGTNTAIDIMIQMPGNLFQKHDYQNYRYLR
KKAIYLTYITANIEDDLVDKKLFLGSNLKPILKIVPPGILGKKLSIHIHISAHENTFKLN
RFLPEKNCIRPNWFFKEEVENAPLTPTPHYNSIILHDLTMLETNSHNIELIKKYPNIRDG
IILLKIWLSQRQLMKSHDGFSSHIITMYVLYLLKIKKLNTFMSSYQIVRNVWCTLVQNGW
YENGISMYQGDDSQKHISVYHKYYDCIFLDPSGYHNLAAFVSRDTFCWVQREAEISLQHL
DNVNVNSFPSIFMQKIPFYNAFDNILCIEDDEIIEKIVDSNSSKDDKLDYGIDKRNQAIS
IFMKVLKQGLGNRVCRICVLPEELRQWECEKEMSNNIGKISIGIDLNPDFCFNIVEKGPE
ANLPEAASFREFWCNKSELRRFQDGSIREAVVWDKGKTLHGKRMICKKIIKFLLKHKFNL
APNQYLYLANQMEDILQLNKIKITHFVYGTGEEATLRVIKAFNSLEKDLMSLVDIPLSIT
GVQGSSAAFRYTEVFPPLATTYRPYHKIIEEGEDYLMLKAKNINKVPRYVHPLDISLQLS
TSGKWPEELEAIRKTKTAFHIQIAECLRKQHNLNAQGHVTHIDVFKDGFVFRLRVAHQKE
IALLKHQVDEDGVVKYRDNEESIELEKKLFLLPKLSSTLHGIHSQHPSFGAACCLTKRWL
SAHLLDDFHMPTIAVELIIASMYLMPEPYKHTHMPQVAFLRVLEIFAREYWNTDPVIVNF
NDEMSKEEIIEVETLFGTSRDSLPPLFISTPYDQKESLWTKKAPSVLILNRICLLARESL
KLFEQQFNTRTMLDCKALFRSPISEYDCLIHLKPLLNPRRLQGVDLDEKYPVIEWHPYKP
HSLQKIPIIDFDPIQCFLKELRDGYSKFALFFHDTYGGMVIGVLLKPTALEEKDFKVSNM
NCRKLNNDGKLVLNSSTMIQDFYVLGKDLVRGIEVTSNKLFLT
NT seq
3552 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaattaaagactctcgtaaggtagggaaaagaaaggagttgaaaaaaaaaactgtt
attaataattcacatacggattctgaaagtgaatttaattttgataatgataataatcag
gacagtgagcttgataacgagtttaactttatgagagaatttgacgaagataatgaatct
gatccacaattgaatgatattaataattctatttttacaacaaccagaaaaagaagtgtt
acagaagaactcgatagtgtacctaaaaaaaagaagaaattgaagaatgatttatataag
caaccaacagttgaagaattaaatcaacttagagaaacggaaactctatttcattcaaat
ttatttagacttcaaattgaagaattattagctgaagttaaactcaaaaataaatataaa
aatctattcgatgcttggttcattaaatttaaagctaacattgaatcattgcaagaaact
gatgaattaaagttttcagatgaaaatatatataaaaaattacatttgaatattcctata
ttgaatgtaccagaagatgcaagaggtacatttaaatttttaaaaccattatctattgtt
attattggttcatattctttcgattgtacagtgggtacaaatactgctatagatataatg
attcaaatgccagggaatttattccaaaaacatgattatcaaaattacagatatttaaga
aaaaaggctatatatttaacatatataactgctaatatagaagatgatcttgttgataaa
aaattatttcttggcagtaatttaaaacctatattaaaaatagtgccacctggaatttta
ggaaaaaaattaagtatacatatacatatatctgcacatgaaaatactttcaaactaaac
agatttttaccagaaaaaaattgtataagacctaattggtttttcaaggaagaagttgaa
aatgcacctttaacaccaacacctcattataactccataatcttacatgatctaacaatg
ctagaaacaaattctcacaacattgaactgataaagaaatacccgaatatcagagatggt
attattttactaaagatatggttaagtcaacgacaattaatgaaaagtcatgacggcttt
agcagtcatataataacaatgtatgttttatatttgctaaaaataaaaaaactcaacaca
tttatgagtagttatcaaatagtaagaaatgtatggtgtactttagtacaaaatggttgg
tatgaaaatgggatatcgatgtaccaaggagatgatagtcaaaagcatatttcggtttat
cataaatattatgattgtatttttttggatccaagtggatatcataatttagctgccttc
gtatcaagagatactttttgttgggtacaaagagaagcagagatttctttgcaacatttg
gataatgttaatgttaatagttttccatctatttttatgcaaaagattccattttacaat
gcatttgataatatattatgtattgaagatgatgaaatcatagaaaaaattgtggacagt
aactcatctaaagatgataaattagattatggtattgataaacgcaatcaagctattagt
atatttatgaaagtattaaaacaaggcttaggaaatagggtttgtagaatatgtgtgtta
cctgaggaactaaggcaatgggagtgtgaaaaagaaatgtcaaataatattggaaaaata
tccattggtatagatttaaatccagacttttgttttaatattgttgagaaaggtcctgaa
gctaacttaccagaagcagcttcgttccgagaattttggtgtaataaatcagaattacgt
cgttttcaagatggatctatacgtgaagctgtagtttgggataaagggaaaaccttgcat
ggaaagagaatgatttgtaaaaaaattataaaatttttattgaaacataaatttaattta
gcaccgaatcaatatttatatcttgctaatcaaatggaagatattttacaattaaacaaa
ataaaaattacacattttgtatatggtactggtgaagaagcaactttacgcgtgataaaa
gcatttaattctttagaaaaagatttaatgtctcttgttgatatacctctttcaataact
ggtgtacaaggatctagcgcagcttttcgttatacagaagttttcccacccttagcaact
acttatcgaccttatcataaaataattgaagagggtgaagattacttaatgcttaaagca
aaaaatattaataaggtacccagatatgttcatccacttgacattagtttacaattatcg
actagtggaaaatggcctgaagaattagaagctattagaaaaacaaagactgcttttcat
attcaaattgctgaatgccttaggaaacagcacaatcttaatgcacaaggacatgttact
catatagatgtatttaaggatggatttgtctttcgattgagagtagcacatcaaaaagaa
atagctttgttgaaacaccaagtcgatgaagatggtgtagttaagtatagagataatgaa
gaatctattgaattagaaaagaaattatttctattacccaaattaagcagcacgttacat
gggatacactctcaacatccttcatttggagctgcttgttgcctaacaaaacgttggtta
tctgctcatttgttggatgattttcatatgccaactatagcggttgaattaattatagca
tcgatgtatttaatgccagaaccatataagcatacacatatgccacaggtagcatttcta
agagttttagaaatttttgcaagggaatattggaatacagatcctgttattgtaaatttt
aatgatgaaatgtcaaaagaagaaattattgaagtagaaacgcttttcggaacgtcacgt
gattctttaccacctttgtttatttctacaccttatgaccaaaaagaatctttatggacc
aaaaaagcaccatccgttttaattttaaatcgtatatgtcttctagcccgagaatcctta
aaattgtttgagcaacaattcaacactagaacgatgctagattgtaaagctctttttaga
tcacctatctcagaatatgattgtttgatacatttgaaaccacttcttaatcctagaaga
ttgcaaggagttgatctggatgaaaaatacccagttattgagtggcatccatataaacca
cattcattacaaaaaattcctatcatagactttgatcctattcaatgttttttaaaagag
ttaagggatggttatagtaaatttgctttattttttcacgatacatacggtggtatggta
ataggagttttattgaaacctactgctctagaagaaaaggattttaaagtatcgaacatg
aattgccgaaaattaaataacgatggcaaacttgtattaaattcatccacgatgatacaa
gatttttatgttcttggaaaagatcttgtaaggggtattgaagttacctctaataaatta
tttcttacgtga
DBGET
integrated database retrieval system