Polistes canadensis: 106790984
Help
Entry
106790984 CDS
T05611
Name
(RefSeq) vacuolar protein sorting-associated protein 13A isoform X1
KO
K19525
vacuolar protein sorting-associated protein 13A/C
Organism
pcf
Polistes canadensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
pcf04131
]
106790984
Membrane trafficking [BR:
pcf04131
]
Endosome - Golgi transport
Rab GTPases and associated proteins
Rab associated proteins
106790984
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
VPS13_N
VPS13_M
VPS13_VAB
VPS13_C
T2SSM
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106790984
NCBI-ProteinID:
XP_014611766
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
3308 aa
AA seq
DB search
MVFESVIAELLNKVLGEYIQNLDYTQLKLSLWGGDVVLTDLLIKETALDVLDLPIRLEYG
RLGKLILKIPYKDIWNAQVDAIVEELFILIVPSSQVSYDSEKETRQQLETKRAELARIEK
NKQLAETKPQEKLNDSMVEKLIARMIKNIHIEIKRIHVRYEDHVTFKDHPFSVGFTLNTF
VIESCTDTWSTTGNMKDMYAIPQIYKLCTLDGLAVYLNTGVEQFSKNSQSMYSKLFCDGI
ATIDYTPIGYLYLLGPINVNAKLKLNPKPETDSSNYTIPKIWLNLEMLKLRIALTKHQYQ
TLVQLGEGLDQAQKAAPYRRYRPNLTSYRGHYKEWWLFAYTCILEETVRRYRRNWDWNHM
KTHRDMCREYAQVYQTKLTTKKVTQDIEERLKTYEKKLDLFNLVIIRQQIEMEVERLAEK
EKNLKAKRGWFGFLWGSPQTEETQELNSAAAIMRKFEEAMTPQEKEKLYRAIDYQENTAP
AHYPETYEMIDTNFFLHGLQLLLLDTDKEHPSILDLQLNSVQAGFKSRPSANAISITTSI
SDMKLFGVKQNDYIPSLFNSEHESADNVLLSIAYEKNPLDKLCGDRIIIKSKSVDIVYDA
QTIIELVKLFKVPNSSALNQIQAAAAEQLEGLKEKSALGLEYAIEKHSILDIQVDMQASQ
LIIPLGGLYDNTKSLFIINLGSLKMHSLEKPKSDKSKATVKQLASMGKSEEDILLHLREH
SYDKFALNIVNFQILVSLGNENWREALMKNGSMTLLCPTTLEIQFHKCLITDDPLLPKMR
LVGQLPSLAINITDIRLLEALSIVQSIPFPEEETSAQLTKSSLSKSVSQLSLFKELTTIS
SPNGKKKQEDKPLKQTTDLEMKFEMKEFTLSISKQEDETVVPFVRFEILQLEVEMLQRSY
DQEIILKLGGTQMKQYHNNGEIFMINTPMSTGKNEYLIIVQYVNVNKRSPEFITRHGSVV
KLLQLEFTTLDVLLHQEALINLLKFVTDIQDKIQSMSAALKEKLQEDIVPSRPTHLPLIQ
EETSVFIKDQIQKQRIKPSISRRKRGVMEFIDLKVKAKVGTISMKMISDVRDISAFFIEG
IIAGLIMKASYSQANINLTSINIQDLNTTSIYKNIISVDGEESLKIEAVIYNIEPQEFDK
NNMSIKIIMGCHRIIFLNAFVTNIVNFLNNFQVAQQAIKEASAAAAEAAKTNIKDVQESA
TRVELNVNIKAPIIYVPRNSKSEHCLMLDMGNLTVCNIFKKLETETESGEYPIVDEMKIE
LQNLKLSRIRLNKIEFTIENEVLLLEPVSFTLLMKRNLSTAWFTSIPDIDMYGRLNKINM
LLSQEDYATVMKVLEENLGESVEEPKSTQIPEHFDKKTLLDHQNKQRAIEPIKVDINTEK
ETTNLQEQKHVHTFIKFEFIMDSLVINLFTGGSKMLQTQTSPLHLPESGLAKFSLTHFGV
KGRIFADGLLATSILLMNCTLDDIRPNRESTLTRLMERTTALSTVHDTEKDTKPVRSMLD
VTVRQGTNDMFVDVRVFSFSIIVSLDYLMKIKDFFNIESSTTSRNLQQSSQKGYSDAVTK
KKSVHTSGNVTQMLTVNLHVEKPDIILLEDMDDINSNCILLNTELLLKMRIMGEHQVITG
SIKDLSLLTGIYNPAKRADWIYQVLRPCSVSVAGSTPEEKGLHIDVCCTDIHISVSPGVI
EILNKVIHTVTKAEVEDSEVVKHEPNYEGLWLITPYEEQNYWFLKTEIAVEALEDFTYPD
YDNDAVYKPELAIISAPTILLTLEAGVGNKTLPMLLMHIGFQSNVNDWSTKSMSVECTIS
LIMAYYNSRLALWEPLIEPKEGIQTGKRTSTPWELKTKVQFNDLAVNSRGASAVSPSVES
EPEDLHQVAKMSIDVTSSENLEITVTKTCLDVLKQLGNAFSSAMVVGGKTATQKFAPYVL
KNETGLPMILDLELSHFKIFDSGSRSSNNADSYTEVILESGASIELAPKFIKIETQLLEQ
LKANSVKDRGDNKFVVSFKGIYDRLTIPVLRADKRFFSLKYRKDNSEEWGIVSDVVVDEG
STIVTLRSILQVHNHFTEPISVYYMTKRGNEVECVGTVAPNDRLNLPLDAVYTPTNIYWL
FFSVNGYMVSIEPFVWKDLQKNVSMTKLLKCEARSKQEIIEPFYVQMFFMMIVVGSILYN
NNTISLLLNTIDWQYKLCHFIDHVKRFCLNCFNSEHPKYVETPIQVVGEIEQVYFENTSR
HTMASTIYNVHLYPSVYLKNFLPIDIIICLPGIIEEKLLEASATLQIPTIDYTKSNIIIK
LPNYLEKNWSCKGEIVANPPEFSVWSFESFDSAQKVVMDLGMHTSYKHGSSIMALYCPFW
MLNKTGLMLSYRSGEDYLNILYHPEHFKGPILFSFRSKAFFGKKKAMIRVEDGEWSEKFS
IDVAGSEGVVACKYNGMIYQIGVHNQLTYNSLTKQITFTPYYVLINNSDFLIECQESDRP
ADPFIVVSPGECSAFWPRSEHEVKTLKAKAAGYPEKTAAFIYTDSHTTLLKLDNKYGGIN
VDIQINEGGIYISMSGYSPGNAPALIINHTHHSINFWEKGSINIRFIQSFNRMFYTWENP
AGPRKLMWKDSNKKEIEDDLRKDTLGAFQIPDTEEEIYYVSFLNGTQRVLLFTTNLKIAE
DCQLVGDLEPIEQEITLNIHGVGFSLVNNITKSELLYMCIASSGIIWETCKSIGSRWRFL
NAREVNIIEEGYQKYIRELQIEKDPPYRVLLEPKLEVDYLNMEMLRPHRRYIRRSFQTGL
WLQYKTSAHQVQLHAKINRLQIDNQLSDCVFPVILAPVPLPKSITQSTVPKPFAELSMVK
RLLEHSTVQQFRYFKVLIQEFHIKVDIVLINVIMAFFEANVANDAEESELFRTDMKLVHE
PLMYHVSLITTAEQKNFFDLLHFSPLKIHISFSMTGTGSGPSAVPQVLNVLLQGIGVTLT
DINDIVFKLAYFERDYTFMTHKQLISEATTHYVGQAIKQAYVLVLGLDVIGNPYGLVVGT
MKGIEDLFYEPFQGAIQGPGEFAEGLYLGVRSMLGHTVGGMAGAVSKITGAMGKGIAALT
FDKDYQRKRQEQLNKQPANLHEGLVRSGKGLVMGVVDGVTGVVMKPISGAKEEGIEGFFK
GFGKGVVGLVTRPTAGVVDFASGSFGAVRRAAELSEEAKRVRPPRFLQPDSLVRPYIRDE
AEGNKILAELEKGKYANTDIYFYHIYINKDVLLLTDKRIAYLEYSDLFGGWKVDWTHTWQ
EFGELPKIVDKGVQICIKDSSKRKKLGNLFGSPEQSKIILVPDCNIKQLLYSKIREQMNQ
YGITNELT
NT seq
9927 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtttttgagtcggttatagcagagcttttaaataaagttttaggagagtatatacaa
aatttggattatacgcaattaaaacttagtttatggggaggtgatgtagtattgacagat
ttattaataaaagaaacagcgttagatgtactggatttacctataagattagaatatgga
cgattaggtaaattaatattaaaaattccatataaagacatatggaatgctcaagtagat
gcaatagtcgaggaattatttatacttattgtaccttcaagccaagtttcttatgattct
gaaaaagaaacaagacaacaattagagaccaaaagagctgagcttgcaagaatagagaaa
aacaaacaattggcagaaactaaaccacaagaaaagctaaatgattcaatggttgaaaag
ttaattgctcgtatgataaaaaatatacacattgaaataaagcgaattcatgttcgttat
gaagatcatgttacatttaaagatcatccattttcggttggattcacattaaatacattt
gtcatagaaagttgtacagatacttggagtacaactggtaacatgaaagatatgtatgca
attcctcaaatttataagttgtgtacattagatggcctagctgtatatcttaatactggt
gttgaacaatttagtaaaaattcacaatctatgtattccaaattattctgtgatggtatt
gcaacgatagattatacgcctattggttatttatatttattgggtccaataaatgtaaat
gcaaaattaaagcttaatccaaagcctgaaacagatagtagtaattataccattccaaaa
atatggctcaatttggaaatgcttaaattacggatagcattgacaaaacatcaataccaa
actttagtgcaattaggagaaggtctggatcaagctcaaaaagctgctccatacagaaga
tatagaccaaatttaacgtcatatagaggccattacaaagaatggtggttatttgcatat
acttgtatattggaagaaactgtaagaagatatcgtagaaattgggattggaatcatatg
aaaacacatagagatatgtgtcgcgaatatgcacaagtatatcaaactaaattaacaact
aagaaagtaacgcaagatatagaagaacgtcttaagacttatgagaaaaagttagatcta
ttcaatttagttattatcagacaacaaattgaaatggaagtcgaaagattagcagagaaa
gaaaagaatcttaaagcaaaaagaggatggtttggatttttatggggctctcctcaaaca
gaagaaactcaagagttgaattctgctgcagctattatgcgtaaattcgaggaagccatg
acaccacaagagaaggaaaaattgtatcgtgcaattgattatcaagagaacactgcacca
gctcattatcctgaaacatatgaaatgattgatactaatttcttcttacacggacttcaa
ttacttcttttagatacagataaagaacatccaagtatcttggatttacaattaaatagt
gttcaggctggttttaagtcacgaccttctgccaatgctatttcaataacgacatcaata
agtgatatgaaacttttcggagtaaaacaaaatgattatattccttcgctttttaattct
gaacatgaaagcgcggataatgttttattatctattgcttacgaaaaaaatcctcttgat
aaattatgtggagatcgtattattataaagtcaaagtcggttgatattgtatacgatgct
caaacaataatagaattagttaaattatttaaagttccaaattcttcagctttaaatcaa
attcaagcagctgctgcagaacaattagaaggcttaaaagaaaagtctgccttaggttta
gagtatgctatcgaaaagcattcaatattagatattcaggtagacatgcaggcatcccaa
ttaattataccacttggtggattatacgataataccaaatcattatttataataaattta
ggtagtttgaagatgcattctcttgaaaagcccaaaagtgataaatccaaagcaactgtt
aaacagcttgctagtatgggtaaaagtgaagaagatattttgttacacttaagggaacat
agttatgataaatttgctctgaatatagttaattttcagattcttgtttcattaggaaat
gaaaattggcgagaagctttaatgaaaaacggttcaatgacattactgtgtccaactaca
ttagaaattcaatttcataaatgtttaataacagatgaccctttattacccaaaatgaga
ttagtaggacaattaccatctcttgctattaatataacagatatacgtttgctagaagct
ctcagcattgttcaaagcattccattccccgaggaagaaacttcagcacaacttacaaag
tcatcacttagcaaatccgtttcccaattgtctttattcaaggaattgactacaatttct
tctcccaacggtaaaaaaaaacaggaagataaacctcttaaacaaacaactgatttagaa
atgaagtttgaaatgaaagaattcactttatcaatctctaaacaagaagatgaaacagtc
gtgccatttgtaagatttgaaattttacaattagaagttgaaatgttgcaacgttcttat
gatcaggaaataatattaaaattaggcggtactcaaatgaagcaataccataataatgga
gaaatttttatgataaatactcccatgtcaactggaaagaatgagtatcttattatagtg
caatatgttaatgtgaataaacggtcaccagagtttattactcgacatggatcagttgta
aaattgttacaactagaatttactacattagatgtattacttcatcaggaagcgcttata
aatcttttaaaatttgtgacagatatacaagacaagatacaatccatgtctgcagcttta
aaagaaaaattgcaagaagatatagtaccatctcggcctactcatttacctctcatacaa
gaagaaacttctgtatttatcaaagatcaaattcaaaagcagagaattaaaccttccatt
tcacgacgtaaaagaggggtgatggagtttatagatttaaaagtaaaagccaaagttggt
accattagcatgaaaatgattagtgacgtgagagacattagtgcgttttttatcgaaggc
attattgctggtcttataatgaaggcttcttactcgcaagcaaatattaatcttacttcc
attaatatccaagatctcaatactacatcaatttataaaaatattatatcagtagacggc
gaagaatccttaaagattgaagcagtaatatataatattgaaccacaagagtttgataaa
aacaatatgtctattaaaattattatgggctgtcatcgcattatatttttaaatgccttt
gttacaaatattgtgaattttctcaataatttccaagtagctcaacaagcaattaaagaa
gcatctgcagctgctgcagaagcagcgaaaactaatattaaagatgtgcaagaaagtgca
acgcgagtggagttaaatgttaacattaaggctcctattatatatgtacctagaaattca
aaaagcgagcattgtttaatgttagatatgggtaaccttacagtttgtaacattttcaaa
aaattagagactgaaactgaatctggagaatatcctatagttgatgaaatgaagatcgaa
ttacaaaatttaaaactttcaaggataagactgaacaaaattgaatttacgattgaaaat
gaagttctattgctagaaccagttagttttacattattaatgaaacgcaatttgtcaact
gcatggtttacttctataccagatattgatatgtacggccgattgaacaaaattaatatg
ctattaagtcaggaagactatgcaactgtaatgaaagttttagaagaaaatttaggagaa
tcagtggaagaacctaaatctacacaaatcccagaacattttgataaaaagactttatta
gatcatcagaataagcaaagagcaatagaaccaattaaagtggatattaatacagaaaaa
gaaactacaaatttgcaagagcaaaagcatgtacacacgtttattaaatttgaatttatt
atggatagccttgtcattaatttgttcacaggcggctccaaaatgttacagactcaaacg
tcacctctacatcttccggaaagtggtttggcaaagttttccttaacacattttggagtt
aaaggacgaatattcgctgatggtttattagcaacctctatacttcttatgaattgtact
ttggacgatattcggcctaatagagaaagtactttaacaagacttatggaaagaacaaca
gccttatcgactgtacatgatacagaaaaagatacaaaacctgtgagaagtatgttggat
gtaacagttaggcaaggcactaatgacatgtttgttgatgtcagagtgttctcattcagc
attatcgtatcacttgattatttaatgaaaataaaagatttctttaacattgaatcttct
acaacaagtagaaatctacaacaatcttcacaaaagggttatagtgatgcagtaactaag
aaaaagtcagttcatacttcaggaaatgttactcaaatgttaactgtgaatttacacgtt
gaaaagccagatatcattcttcttgaagatatggatgatataaattcaaattgcatatta
ttaaatactgaactacttttaaaaatgcgcattatgggtgaacatcaagtaataacaggt
tctattaaagatctttctcttttaactggtatatataatcctgctaaaagggctgattgg
atatatcaagttttaagaccatgtagtgttagtgtagcaggctctacacctgaagaaaaa
ggtttgcacatagatgtatgctgtacagacattcacatttctgtttcgccaggtgtaatt
gaaattttgaacaaggtcattcatactgttactaaagcagaagtggaagatagcgaagtg
gtaaagcatgaacctaattacgaaggactttggctaattacaccatatgaagaacaaaat
tattggtttttgaaaacagaaattgcagtagaggcattagaagattttacttatcctgat
tacgacaatgatgcggtttataaacctgaattagcaataatttctgcaccaacaattttg
ttaacattagaagcaggcgttggtaataaaacattaccaatgcttttgatgcatattgga
tttcagagcaatgtcaatgattggagtactaaatccatgtccgtggaatgtacaatttca
cttataatggcatactataatagtcgtttggctttatgggaaccattaatagaaccaaag
gaaggaattcaaactggaaaacgtacttcaactccttgggaattgaaaacgaaagtacaa
tttaatgatttagcagtgaactctagaggagctagtgctgttagtccaagtgtagaaagt
gaaccagaagatttacatcaagttgctaaaatgtctattgacgtaacatcttctgaaaat
ttagagattacagtgaccaaaacatgtctcgatgtattaaaacaattaggtaatgcattc
tcttctgctatggtagttggcggaaaaacggctacccaaaaattcgcaccatatgtattg
aaaaatgaaacaggcttgccaatgatacttgatttagaacttagtcattttaagatattt
gatagtggttcaagatcaagtaataatgcagattcatatactgaagtaattctcgaatct
ggagcgtccatagaactcgcaccaaaatttatcaaaatagaaacgcagcttcttgaacaa
ttaaaagctaactctgttaaagacagaggagacaataaatttgtcgtttcgttcaaagga
atttatgatagattaacaataccagttcttcgagcagataaaagattcttttcattgaaa
tatcgtaaggataattcagaagaatggggcattgtttctgatgttgttgttgatgaagga
agtactattgttacgcttagaagtatccttcaggtacataatcatttcaccgaacctata
tcagtatattatatgacgaaacgaggaaacgaagttgaatgtgtaggcacagtagctcct
aatgatcgattgaaccttccattggatgctgtatatacaccaacaaatatttattggtta
ttctttagcgttaacggctatatggtttcaatagaaccatttgtatggaaagatcttcaa
aagaatgtttccatgacaaaactgttaaaatgtgaagcaagatcaaaacaagaaataata
gaaccgttttacgtacagatgtttttcatgatgattgtggttggtagtattctctataat
aacaacacaattagtttactcttaaataccattgactggcaatacaaattgtgtcatttt
attgatcacgtgaaacgtttctgcttgaattgttttaattcagagcacccaaaatatgtg
gaaacacctattcaggttgtaggagagatagagcaagtttattttgaaaatactagtcgc
catacaatggcaagcactatttataatgttcatttatatccgtctgtatatctaaaaaac
tttttgccaatcgacattattatttgtcttcctgggattattgaagaaaaacttttggaa
gctagtgctactttacaaattccaacaattgattacacaaaatcaaatattattattaag
ctaccaaattatttagaaaaaaattggtcatgtaaaggtgaaatagtagcaaatccaccg
gagttttcagtctggtcttttgaatcttttgatagtgcacaaaaagttgttatggattta
ggaatgcatacatcatataaacatggttccagtataatggctctctactgtcctttttgg
atgttgaataaaactggattaatgttatcttataggagtggagaagattatttaaatatt
ttatatcatccagaacactttaaaggaccaatattattttcattccgttcaaaagccttt
tttggtaaaaagaaagcaatgattagagtggaagatggagaatggtctgaaaagttttca
attgatgttgcgggaagtgagggagtagttgcgtgcaaatacaatggaatgatatatcag
attggtgtacataatcaattgacatataattctttaacaaagcaaattacatttacacct
tattatgttctaattaataacagtgattttctaattgaatgtcaagaaagtgatagacct
gctgatccatttatcgtagtttcacccggagagtgttctgctttttggcctcgttcagaa
cacgaagtgaaaactttgaaggcaaaggctgcaggatatcctgaaaaaacagcagctttc
atttatactgatagtcataccacattgttaaaactagataataagtacggcggtattaat
gttgatatacaaatcaatgaaggcggaatatatatttcaatgtcaggttacagtcctggc
aatgctccagctcttattataaatcatactcatcattcaatcaatttctgggaaaaagga
tctataaatataaggtttattcaatcatttaacagaatgttttatacttgggaaaatcct
gctggtccaagaaaattaatgtggaaagatagtaacaaaaaagaaatagaagatgatcta
agaaaggatactttaggtgcttttcaaatacctgacacagaagaagaaatatattatgta
tcatttctaaatggtacacaaagagtacttctatttactacaaatttgaaaatagctgaa
gattgtcaattagtaggtgatcttgagcctatcgaacaagagataactcttaatatccat
ggagtaggattttcccttgtaaataatattactaaatcagagcttttatacatgtgcata
gctagctctggtataatatgggaaacgtgtaaatctattggaagtagatggcgttttctt
aatgcaagagaagttaatattattgaagagggataccaaaaatatatacgcgagttacaa
attgaaaaggatccgccttatagagtattacttgaacctaaattggaggtggattactta
aatatggaaatgttaagacctcatcgtcgttatataagacgttcattccaaactggttta
tggctacagtataaaacatcagcacatcaagtacaattacatgctaaaattaatagattg
cagatagataatcaactttcagactgtgtttttccagttattctagcaccagttcctcta
cctaagagtatcacgcaaagtacagtaccaaaaccgtttgccgagcttagtatggtaaaa
cgcctcttagaacatagcactgttcaacaattccgttatttcaaagtacttattcaagaa
ttccacattaaagtggatatagtacttataaatgtcataatggccttttttgaagcaaat
gtagcgaatgatgcagaagaaagtgaactttttcgcacagacatgaaattagtgcatgaa
ccactcatgtatcatgttagtttgatcacaacagctgaacaaaaaaatttttttgattta
ttgcacttttcacctctcaagatacatattagtttttcaatgactggtactggaagtgga
ccttctgcagtacctcaagtactaaatgtactattacaaggcattggagttacgctaact
gatattaacgatatcgtattcaaattagcatacttcgaacgagattacactttcatgaca
cataagcaattaatctcagaagcaactacgcattatgtaggacaagctattaagcaagct
tatgttcttgtgttaggtcttgatgtaattggtaatccatatggtcttgtagttggtacg
atgaaaggtatcgaagatttattttatgagccttttcaaggtgccatacaaggcccagga
gaatttgctgaaggtttatatcttggtgttagaagtatgctaggtcatactgttggtgga
atggcaggagctgtatcgaaaattacaggagctatgggtaaaggaatagctgctttaact
ttcgacaaagattatcaaagaaaaagacaagaacaattgaataaacagccagcaaatttg
catgaaggactagtcagaagtggaaaaggtttggtcatgggcgttgtggatggtgtaact
ggtgttgtaatgaaacctatatccggtgctaaagaagaaggtattgaaggattcttcaaa
ggttttggaaagggagttgttggacttgtaactagaccaactgcaggagttgtcgatttt
gctagtggatctttcggtgctgtcaggcgtgctgctgaattaagtgaagaagctaaaaga
gttcgtccacccagattcctacaaccagatagtcttgttcgaccttacataagagatgaa
gcagagggtaataaaatactagctgaacttgaaaaaggcaaatatgcaaacacagatatt
tatttctatcatatatatatcaataaagatgtcctattgctgactgataaacgtatagcg
tatcttgaatatagcgatttattcggtggttggaaggttgattggacccatacgtggcaa
gaatttggtgaattaccaaaaatagtagacaaaggagtacagatttgtattaaagattcc
tcaaaaagaaagaaactaggaaatttatttggtagcccagaacaatccaaaataatctta
gtaccagattgcaatataaaacagttactatatagtaaaataagggaacagatgaatcaa
tatggaataacaaatgaacttacataa
DBGET
integrated database retrieval system
