Paenibacillus chitinolyticus: PC41400_09085
Help
Entry
PC41400_09085 CDS
T06610
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
pchi
Paenibacillus chitinolyticus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
Ntox44
DUF6531
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QAV17807
UniProt:
A0A410WU59
LinkDB
All DBs
Position
1983918..1989146
Genome browser
AA seq
1742 aa
AA seq
DB search
MKKKINYLVLFCLMVQMLAPLYVIHANEQSASNPQQISQPLLTVESLSKTYGVPETDLLS
ELNKGYSLLEIQSALQTRQDPSQPLGEVLNQMNPTIEEQLKKEDYSAERFAEKQSQPGPT
APTVSEQTYGTYVESSGDSIIPDPSLLYPSGVTDATYGRVSLLSSSNYPTSYDELAVKRL
DIKADRAPWAFPISEDVSTLNGSLQIQTTDMTLPGRNGLSFELKRKYDSSDALYYEKDVL
NDSVYTTQYYPELTTRLYFKYSNEMVTEDGGATDFTFGPGYRSVIRFKNDYTYWYLPFEI
PYVEEFNNEQYDSFKKAWPYVDPENPNTQPFIQKEDIRLDGLEFIAKAYTTGNVRKEGKP
QYIRTGYANKTKPIKNENRYPIGKGWSWDLPYIERKDNNKTYIRLFGGATYELDDRTLKG
YPWKDLTMYYDSSVRVNNLLSTFRLDSLDGKKQYFAHNGELIQITDAYQNTIQFEYQDVT
PYGQVLTKIKDAIGNEISIAYTEKEVTLTSGERTVKYDKIKDPQGNKELLSQVTDPAGRK
TQYVYNVEAAPFDLVRDPKMKDNYVALLKQVYYPTKARTDYTYEKFNRSLGYFGQETVHR
VKAREDVVTFADGTESRSNPVDYTYSGDSGSVQNKNTSYTTIVNNGRTQTSYSYDRVYID
DNTPEVFYNTQIKQDDGTTQSITMMEYNRTNRWPSPTKTTTKKVQGSSSSTEQVSQRTYD
EYGNVLTETDPANTVSTYQYDATTHLLSSVTAPATSGLNSYMELERYPGTNGIKEVRVKE
NNSAGALKAQSSYTYDAHGNPISITIKDDAQDIVVNNGYGTQYHSAFPAEQSVQVTDAAK
QNMTVTQRFEYNPSTGAMTKFTDGKGLMTKYEYDVLGRATKVIQPDSSTYTYTYNDAANE
VTTVDPTGVTQITKWNPLGWKIKSGISGKASQEFGYDVYGRQTWSQDGAGNRTSYEYDKW
DRLIATTYPGAEQAKATVSYDDINRKVISKDGENNRTEETYDLLGRATQRDISSATGALI
GSVKFTYDAAGKVLTKSDGAGSNSGDVQTTQYSYDAMGRLASVTDAEANTTRYTYSKASN
LIQIEYPDHNKKLKSYDQMGRVIQETDPLGQIETYFYDTNSNLTKSIDRKGNIHTFTYNA
VNLLTASETTDEKISFSYDAAGRRLSMQDGIGTTGYTYEPSTGWLTQVKYPDQRTLQYAY
DQQGKRTKMTDPFGVVTNYEYDTQNRITAVGTEPAEWDATYQYKKNGLLAATQAKNGVHA
AFTYEGVNLTALTQAKSGAAVQSFSYGYDLHANQTSKVENGVTQSFSYDALNRIATSSDY
NENYSYDNRGNRLTLQSDKPINPVDTSYTYDNRNRLNAVQLDESSHVNYKYNGDNLLTER
TENGITTRYYYDGDQMIAEGTVTNGVAAHKASYLRGNQLVARVDANGSKAYYVHNGHGDV
VELRDANGNVINQYAYDLWGNPTTVLKGVDNPFLYSGEYWDESVELQYLRARWYDPSMGR
FINEDTYEGQLDNPLSLNLYTYVENNPLTHVDPSGHCGIKSGGGLYNCNEVDTKLISLKQ
TAESPMITKSGKAAVASEAWRLRNSAGSYDEKNNPSGYTVRYDKDLDYYMIYDVTDKLNN
LMISYEKKYKDFSDNNSTKDVYLKFYNTVRGTAELDLKNQPDWQHSHFIYSGEYVDKDVP
GNISYGYFGKVMKIPDFMLLEAAGLAQMFAGTWKVEDYKSYFDDPRDQARIWQGIDLYKS
WH
NT seq
5229 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaagaaaattaattatttggttttattttgcttaatggttcaaatgctcgctccc
ttatatgtaattcatgcgaatgagcaatccgcaagcaatccgcagcaaatatcccagccg
ttattaacggtagaaagcctgagcaaaacttacggagtaccggaaacggacctattgtcc
gaacttaacaaaggatactcactgttggagattcaatccgccttgcaaacaaggcaggac
ccttcccaaccgcttggagaagtgttaaatcaaatgaatccaacgattgaagaacagttg
aaaaaggaagactactcggctgaacgattcgcagagaagcagtctcagcccggtccgacg
gctcctactgtttccgagcaaacttatggaacctatgtggagtcgtccggagattcgatt
atacctgacccctcattgctttatccatccggtgtaacggatgctacttacggaagagtg
tccctactttcatcttccaactatcctaccagttatgatgagctagcggtaaaacgcctt
gatattaaagcggatcgggctccttgggctttcccaattagtgaagatgtatctacgttg
aacggttctctgcaaatacaaacgacagatatgaccctaccggggagaaacggactttct
tttgaattaaagcgcaagtatgacagttcggacgccttatattatgaaaaagatgttcta
aatgattctgtttatacgacccaatattatccggagctcaccacccgactatattttaaa
tactccaacgagatggtcacggaagatggaggcgctacggacttcaccttcgggcctggg
tatcgttctgttattcgatttaaaaatgactatacctattggtatttacccttcgaaatt
ccctacgtagaagagtttaacaatgagcaatatgactcttttaaaaaggcctggccttac
gtggatcctgaaaatcccaatacgcagccgtttattcagaaagaggatattcggcttgat
gggttggaatttattgcgaaagcttacacgacgggtaacgttcgcaaggagggtaagccg
caatacataagaaccggctatgccaataaaaccaaaccgatcaaaaacgaaaaccgttat
ccgatcggaaaaggatggagctgggatcttccttacattgaaagaaaggacaataataaa
acctacatccggctttttggcggggcaacatacgagctggatgacagaactctgaaaggg
tacccttggaaagacctaacaatgtattatgattcaagtgttagagtgaataatttactg
tctaccttcaggctggattcactggatggaaaaaagcagtattttgctcataacggagaa
cttattcaaataacggatgcttatcaaaacacaattcagtttgaatatcaggacgttact
ccttacggacaagttcttacaaagatcaaggatgccataggaaatgaaatttccattgct
tatacggaaaaggaagtgacgctgacctctggtgagcgcaccgttaaatatgacaagata
aaggatccgcaaggtaataaagagctactttctcaggttaccgatccggcgggacgtaaa
acacaatatgtatacaacgttgaagcggctccgtttgatttggtacgtgatccaaaaatg
aaagacaattatgttgctttgttgaaacaagtttattatcccactaaagctagaactgac
tatacttatgaaaagtttaatcggagcttgggttattttggtcaggaaaccgttcaccga
gtaaaagccagggaagatgtcgtgacttttgcagatggcaccgagagccggtctaatcct
gtagattacacctattcaggagatagcggatcggttcagaataaaaacacttcttataca
accatagttaataacggacggactcaaacttcctacagctacgacagagtgtatattgac
gataatacacctgaagttttttataacacgcaaattaagcaagacgacggtaccacacaa
agtattacgatgatggaatacaacaggacaaaccgttggccgtctccaacgaaaaccacc
acgaaaaaggtgcagggttcttccagctcgacggaacaagtgagccagcgtacgtatgat
gaatacggcaatgtgttaacagagactgatcctgccaacacggtgagcacgtatcagtat
gatgcaaccactcatttgctcagcagtgtaacagcaccggctacgagtgggctaaacagc
tacatggaactggagcgttacccagggacgaatggaattaaggaagtgcgggtgaaggag
aacaattcggcaggagccctgaaagcccaatcaagttatacgtatgatgctcacgggaat
ccgataagcattactattaaagacgacgcgcaagatattgttgtgaacaatgggtacggc
actcaataccactccgcgtttccggctgaacaatccgtacaagttacggatgcagccaag
caaaacatgacggtgactcagcggtttgagtataacccgtcaactggtgctatgacgaag
tttacagacggcaaaggccttatgactaagtacgaatatgatgtattaggccgagccacc
aaggttatccagcctgattcaagtacgtatacgtatacctataacgatgcggcaaatgaa
gtcaccaccgtagatccaacaggagtcacacagattacgaaatggaatccgctcggatgg
aaaatcaagtccggcattagcggaaaagcctcacaagagtttggctacgatgtgtatggc
cgtcagacttggagccaggatggggcaggtaaccgtacgtcttatgagtatgacaaatgg
gatcggcttattgcgaccacatatcctggagcagaacaggctaaagcgaccgtctcttat
gacgatattaaccgtaaggtgataagcaaagatggcgagaacaatagaaccgaagagacc
tatgatttgcttggacgagccactcaacgggatatttctagtgccaccggagctttgatc
ggttctgtcaagtttacttatgacgctgcaggcaaagttctcacaaagagtgatggggca
ggaagtaattcaggggatgtacaaaccacacagtacagctatgatgctatgggcaggctg
gcatctgtaacggatgcggaagccaatacgacacgctacacgtatagtaaagcgagcaat
ttgatccaaattgagtatcccgatcataataaaaagttgaagagctatgaccagatggga
agagttattcaagaaacagatccactgggtcagattgaaacttacttctatgatacaaac
agtaatttaacgaaaagtatcgataggaagggtaatattcataccttcacgtacaatgca
gtcaatttgctcacggcaagtgagacaacggatgaaaaaatatccttcagttatgatgct
gcaggccgccgcttgtctatgcaggatggaatcggtacaacggggtatacctacgaacct
tcaacaggttggttgacgcaggtcaaatatccggatcagcggacactgcaatatgcctat
gaccagcaaggaaaacgcacgaagatgacagacccgttcggtgtcgttacaaattatgaa
tacgatacacagaaccggataaccgcagtcggtacggaaccggccgagtgggatgctact
tatcaatacaagaagaatggattgctggctgcaactcaagcgaagaacggggtccatgct
gcatttacctatgaaggtgtaaacctgactgcgctaactcaagctaaatcaggagcagcg
gttcagtccttctcttatggctatgaccttcatgctaaccaaacaagtaaagtggagaat
ggagttacccaatccttttcgtatgatgctttaaaccggattgctacttcgtcggactac
aacgaaaattacagctatgataatcggggcaatagacttaccttgcaaagcgacaagcct
ataaatcccgtagataccagctatacgtatgacaatcggaacaggctgaatgccgtacaa
ctggatgaatcaagtcatgtaaattacaagtacaatggggataacctgcttacagaacgg
acagagaacggaatcacgacccgttattattatgacggcgatcagatgattgccgaaggt
acagtcacaaatggggtggccgctcataaagccagttatctgcgtggtaatcaattggta
gcacgtgttgatgcaaatggcagtaaagcgtactatgtccataatggacatggagatgtt
gtggagctgagggatgcaaatggtaacgtaatcaatcagtacgcttatgacctatggggt
aatccaacaacagtactcaaaggggtagacaatccattcttgtatagcggggagtactgg
gatgaaagcgtggaactccagtacctacgcgcccgctggtacgatccgagcatgggacgg
tttattaacgaggatacgtatgaaggacagttggataatccgctgagtttgaatttgtat
acgtatgtggagaataatcctctgacgcatgttgatccgagtgggcattgtggtattaaa
tctggtggagggttatacaactgtaatgaggtagacacaaaactaattagtcttaaacaa
acagcagaaagtcccatgataacaaaaagtggaaaagctgctgtagctagtgaagcatgg
aggttgagaaattccgcaggttcttatgatgagaaaaataatcccagcggatacactgtc
aggtatgataaggatctagattattatatgatttatgatgtaacagataaattaaataat
ttaatgatttcatacgaaaaaaagtacaaagatttttcagacaataattctacaaaagat
gtatatttgaaattttataatacagtgagaggaactgctgaacttgacttaaaaaatcaa
cctgattggcaacattcacattttatctatagcggggagtatgttgacaaagatgttccc
ggtaatatttcatatggttattttggtaaggtgatgaaaataccagattttatgctttta
gaagcagcaggattagctcaaatgtttgccggtacttggaaagttgaagattacaaaagt
tattttgatgatccaagggatcaagcaaggatttggcagggaattgatttgtataagtcg
tggcattga
DBGET
integrated database retrieval system
