Proteus terrae subsp. cibarius: F9282_02945
Help
Entry
F9282_02945 CDS
T06330
Name
(GenBank) LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein
KO
K13735
adhesin/invasin
Organism
pcib
Proteus terrae subsp. cibarius
Pathway
pcib05100
Bacterial invasion of epithelial cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcib00001
]
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05100 Bacterial invasion of epithelial cells
F9282_02945
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_1
IAT_beta
Invasin_D3
Glyco_hydro2_C5
bMG3
LysM
CarboxypepD_reg
Serglycin
LysM3_LYK4_5
TetR_C_9
PTHB1_GAE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGW02004
LinkDB
All DBs
Position
complement(623673..630749)
Genome browser
AA seq
2358 aa
AA seq
DB search
MTKFKSGLTPQLSSITKKVAWFNIFIQLAFPISATLPANVFAKENSQEKQTINLVQKRNT
YQVKKDDTPESIAKKFNIKLFRLIEANPDYVSLVGKLKIKEGITLNIPNEPLPTKKWLNS
HQDSSIPTTNEQELAQIIVTNSSLLNKDTDATQYAISQISSKANQQIEQWLKQFGHAQVS
LSTDKKFTLEGSSAELLIPLYDSEKNLVFSQTSYHRKDSRSQLNQGIGYRHFTDKFMVGL
NAFYDYDLSRYHSRFGVGAEIWRDYFKFSVNHYHRLSNWRTSDDVMDYNARPANGWDIRT
EGYLPAYPQLGAKLIFEQYYGKEVGLFGKDNRQENPHAYTAGLTYTPVPLITFGAERRFS
LNDNSDNKFDVNIQYRLGESLSSQLNPDNVRATRLMSGNRYDFVNRNNDIVLEYQKKTLV
FLSITPAINGYAKEEKDLGVQIRSKYPVKQIEWSASRLIANGGKIQHNNNLNHSIILPRH
IVGSSEKNSYTVSAVAIDEQGNRSDPVQSKITVDQSAINTQNSQFTPKTTKLPADNHSAQ
NLTLSILDNDKLPVDIDVKELSLDVQSDASAGNSWVSSFSRIDTGKYQVTITAGSTPEIV
TLTPKFRDNTFNQAKITFVADTHSAIIAKGGLTVIKNHAPADGKSQNKIQVIVTDINANR
IPNYPVSFTADNGATIIAQANTDTEGKIIVPITNMHIGKSIINVSVKDITYSTNVDFIAD
INSARINTFTINPNSSFANGIDEKTIAFNIIDKNNNPVPNAKIQLSADNQSQLKETELLT
DNQGNASTTMTSKMAGTVTVIAQVNNISTQKTTHFTADLSNGKIISVTPSTPPYIADGKT
AVTFTAVVEDKNHNILPNAKVIWSTNRDPHIVSINEISTTDKQGVAQTTVTSTQALEVIV
TASISNGSFDALPITFIANNQQGLITLTSNKTQLIANDKEQAIITAIVKDKFGNKLPNVT
VEWQSNASTTLDKQKSVTDNQGQTTNQIRTTKAGATEIIATLSNKEKAQVTLTAIADPNS
ANIALTTVNNKTEAIADNNDTITLMAHVTDAKNNPLIKQSVFWHSTHNVLSENIAKTDNN
GDVQVVIKGIEAQPTTVTATLENSQSATQNLRFLAGKVNTPQSTFLIEPQSIVANGTSFA
TGTITLKDKFGNPVPRQDKFIALSGDNNTIKFSVLKEIDTGVYQTTINGKQEGISLIHVQ
YVNNGNNVKLTQPLGFIADKQNAMINAVNVIAPFDVTANGTDKVIIRAKVVDKQGNPSME
GIAVGWLTSLGKLSLPISKTDKNGIAEITLSSTQAGVAQVTAMLDSQQSLDADHLINFNT
DVISADKSQLSLIPNTIISETDRSQITLTLKDKYDNLLTGLKDKISVNYSTDLTATTTAF
NEISMGVYQAQVSALKAGQTTISTKINSVTLKQTALLTVLPNNQTAKVDKFVISNTQPHA
GDTITYHAYLSDKNDNPLNSGVSVTWTTDKDSLLAKPLTFTDSKGIAEVELTRNPAGIAK
VNAVLISGRYPAPDINFVADDVDENSSEINLVPATIIANGTDKTLLTLTIKDKGGNILPD
QQVEGIANNSTIQFSPAKQTSPGHYEIEATGTKSGTAQLSVKVNGVDFKKQKTLQLRADA
TTWQVKSVNVDRASMIAGDKGVNYQATIVDANDNILPNVIVSWKLQGLADDYDFSTYTDT
HGIARTKVTSSVAGILKMSAYLDLNNHKPIQDVTVKPADIDANKSTFSSSRQSIGGDNKD
SALLTVHLMDKYSNTIDGKTVSIKTTRGKPNFSDNPLTSLGKGKYQTNLTSNVKTDIILT
AEAEGLTIAKPLTIKVTIPKPDIIFDKQIQQETYASAPINALGYTGLPKNINLMWSSSDP
AIASIDTTSGNISMKKAGTVIITLQTAGNAQYQPAQSSYPLVIEKADVGLVAKESHLSSI
WNDNITQQVMLLYTNKDATNNPPPKQFVNYKQAIITVDEQGKITPIKPGDTNITVLSQAT
EQFKSSSTVINYTQDKGTINYHFKNSDETLIVDALSSGVLTAQAPIPPLPTGINAIWSSS
NPSAVEVTSKGAITHLGIGKATLTLSIKDDVYYHDNHNSYNITVKPAPYITIDSLKFKSA
GREMIASNTNYLSWQPVYISDNKITVNWSSSETPHAINFELYDEKNNLIQLEERQNYSPK
NNISTPVIFSPGESYINKPQNLKLKVITFDLNNKSYPKEYNIAVKSISAQTAANLFLIHL
NSQFLYTDSGSSASSCQDAMGTSAIHFTVIPRVEFKGDTKNLLYPIRLTAKIDSITLNSS
NLSQGIINQNVVYPDDFTLNKTSLNNYEFKATSSQYAIDKECKITDSGDGVFKLTIDVYG
NKQEITNKFNWNGFNGAH
NT seq
7077 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaaatttaaaagtggactaacgccacaactttcttctattacaaagaaagttgct
tggtttaatatctttattcaattagcatttcctatctcggcaacactccctgccaacgtt
ttcgcaaaagagaatagccaagaaaaacaaactattaatttggtacaaaaaagaaatact
tatcaggttaaaaaagatgacacgcctgaatcaattgcgaaaaaatttaatataaaatta
tttaggcttattgaggctaatcctgattatgtttctttagtcggtaaattaaaaataaaa
gaaggtattactcttaatatacctaatgagcctttgccaacaaaaaaatggctaaatagc
catcaagacagctctattccaaccacaaacgagcaagagcttgcacaaattattgttact
aactcatctttgttaaataaagatactgatgcaacacaatatgcaataagccaaatatca
agcaaagccaatcaacaaatagaacaatggttaaaacaatttggtcatgctcaagtttca
ctttcaacagataaaaaattcaccttagaaggaagctctgctgagcttcttatcccactc
tatgatagtgaaaagaatttagttttttctcaaaccagttatcaccgtaaagattctcgt
agccaattaaaccaaggtattggttaccggcattttactgataagtttatggtgggtctt
aatgctttttatgattacgatttaagtcgatatcatagtcgctttggggttggtgctgaa
atatggagagactattttaaattcagtgtaaaccactatcaccgtctatctaactggcgt
acttctgacgatgtcatggattataatgcgcgtccagctaatggttgggatatcagaaca
gaaggctacctgcccgcttatccacaattaggcgcaaagcttatttttgaacaatattac
ggaaaagaagtcggtttatttggcaaagataatcgccaagaaaatcctcacgcttatacc
gcaggactcacttatacgccagtgcctttaattaccttcggtgctgaacgtcgttttagt
ttaaatgataatagtgataataagtttgatgtaaatatccaatatcgccttggagagtcc
ctctcttcacaacttaatccagataatgtccgtgcaacgcgtttaatgtcaggaaatcgc
tatgatttcgtaaataggaacaacgatattgttcttgaatatcagaagaaaaccttagta
ttcctgtctatcacaccggcaattaatggctacgcaaaagaagaaaaagatttaggtgtg
caaattcgctctaaatatcccgttaagcaaattgaatggtctgcgagtcgcttaatcgct
aatggcggtaagatccaacataataataatcttaaccactcaatcattcttcctcgccat
attgtgggttcatctgaaaaaaacagctacacagtaagcgccgttgcgattgatgaacaa
ggtaatcgttctgatccagtacagagtaaaatcaccgtcgatcagtctgcaattaataca
caaaatagccaatttacgccaaaaacaacaaaactacctgccgataatcattctgcacaa
aatttgactttatcaattcttgataatgataagcttccagttgatatcgatgtaaaagaa
ctttcattagatgttcaatctgatgcttctgctggtaatagttgggtttcaagttttagt
cgaattgatacaggaaaatatcaagtcaccatcacggctggaagtacacctgaaattgtg
acattaacgccaaaattcagagataacacctttaatcaggcaaaaatcacttttgtggct
gatacgcattccgccattattgctaaaggtggattaaccgtaattaaaaatcacgcacca
gccgatggtaaaagccaaaataaaattcaagttatcgtaacagacattaatgctaataga
attcctaactatcccgtttcttttactgctgataacggtgcaacgattattgcacaagcg
aacacagacactgaaggtaaaattattgttccaatcaccaatatgcatattggtaaaagc
atcataaatgtcagtgttaaagatattacctattcaactaatgttgattttattgccgat
attaactcagcaagaataaatactttcaccattaatcccaatagttcatttgctaatgga
atagatgaaaaaacaattgctttcaatatcattgataaaaataataatcctgttcccaat
gctaaaattcaattatccgcagataatcaatctcaacttaaagaaacagaattattaacg
gataatcaaggtaatgcatcaaccaccatgaccagcaaaatggcaggcaccgtcactgtg
atcgcgcaggtcaataatatttcgacacaaaagaccacgcattttacggccgacctatcc
aacggtaaaattatttccgtaacaccatccacaccaccttatattgctgatggtaaaaca
gccgtaacatttaccgccgtcgttgaagataaaaatcacaatatattaccgaatgcaaaa
gtgatttggtctactaatcgtgatccacacattgtttctattaatgaaatttcaacaaca
gataagcaaggtgttgcacaaacaaccgtgactagcactcaagccttagaggttattgtt
actgcaagtatcagtaatggatcattcgacgcattacccattacttttattgccaataat
caacagggcttaattaccttaacgtccaataaaacccaattgattgcaaatgataaagag
caagcgataataaccgcgatagtaaaagataaatttggtaataaattacctaacgtcacc
gttgaatggcaatctaatgcctcaaccacactcgataaacaaaagagtgtgaccgataat
caagggcagacaaccaatcagattcgaaccacaaaagcgggtgcaacagaaattattgcc
acgctttcaaataaagagaaagcgcaagttacactcaccgctattgccgatccgaatagt
gccaatattgccttaacgaccgtcaataacaaaacagaagccattgcagataataatgat
acgattaccttaatggcacatgtcacagatgctaaaaataatccgttaataaaacaatct
gtattctggcattcaactcataatgtattgagtgagaatatagcaaaaaccgataataat
ggtgatgtacaagttgtaatcaaagggattgaagcacaacctacaacggtcacagctaca
ctggaaaatagccaaagtgccacacaaaaccttcgttttcttgcgggtaaagtgaatact
ccacaaagtacatttttgattgaacctcaatctatcgtggcaaatggcacttccttcgca
acagggacaattactctaaaagataaatttggtaatcctgttccaagacaggataaattt
attgcactttctggtgataacaacaccattaaatttagcgtactcaaagaaatcgatact
ggcgtttatcaaacaaccatcaatggtaaacaggaaggtattagtcttattcatgttcaa
tatgtgaataatggtaacaacgttaagctaactcagccccttggttttattgctgacaag
caaaatgccatgatcaatgcggttaatgttatcgccccttttgatgtcaccgccaatggt
actgataaagtcattattcgcgcaaaagttgttgataaacaaggcaatccaagcatggaa
ggcattgctgtgggttggttaacctcattaggcaaactttcgttacctatcagcaaaaca
gataaaaatgggattgcagaaattaccttaagtagtacacaagcgggcgtagcacaagtt
acagcgatgctagatagtcaacaatcccttgatgctgaccatctgataaactttaacact
gatgtaatttctgccgataagtctcagctatcacttatccctaacaccattatttctgaa
acggaccgttctcaaattactttaacgctaaaagataaatacgataatttattaacaggg
ttaaaggacaaaatcagcgttaactacagtactgatttaaccgcaactacaacggcattt
aatgaaatttcaatgggggtttatcaagctcaagttagtgcgttgaaagcaggtcaaaca
acaatcagtaccaaaataaattcagtgacacttaaacaaactgcactattgacggttcta
cctaataaccagacagccaaagtcgataagtttgtgataagtaacacacaacctcatgca
ggtgacaccattacttatcatgcttatcttagcgataaaaatgacaatccgcttaatagt
ggtgttagcgtgacatggacaaccgataaagatagcttacttgctaaaccactgacattt
acagacagtaaaggtattgctgaagttgaattaacacgtaatcctgcaggtattgctaaa
gttaatgccgtattaatttcaggtcgttatcctgctcctgacatcaattttgtggctgat
gatgttgatgagaacagttcagaaatcaatttagtacctgcaacaatcattgctaatggc
acagataaaacattactcactttaacgattaaagataaaggcggtaatattttgccagat
cagcaagttgaagggatcgctaataactcaactattcagtttagtcctgctaaacaaact
tctccgggccattatgaaattgaagcaacaggtacaaaatcaggtacggcacaattaagt
gttaaagttaatggtgttgatttcaaaaaacaaaaaaccttacaactgcgtgctgatgca
acaacctggcaagtaaaatctgtcaatgtcgatagagcaagcatgattgctggtgataaa
ggcgttaattatcaagcaactattgttgatgccaatgacaatatactgcctaacgttatt
gtgtcatggaagttgcaaggcttagctgatgactatgactttagtacctatacagatact
cacggtatcgcaagaaccaaagtcaccagctctgttgcgggtatattaaaaatgagtgcg
tatcttgatttaaataatcataagccaattcaagatgtcaccgtaaaaccagcagatatt
gatgccaataaatcaacctttagtagtagccgtcaatcaatcggtggtgataataaagat
agtgccctactcactgtgcatttaatggataaatacagtaatactattgatggtaaaact
gtttcgataaaaacaacccgtggtaagcctaattttagtgataatccgctaacttcatta
ggcaaaggtaaatatcaaaccaatcttacttctaatgttaaaacagatattattttaacg
gctgaagcagaaggattaaccattgcaaaaccactgactattaaagtaaccatccctaaa
ccagatattatttttgataaacaaatccagcaagagacctacgcttcagcacctatcaac
gcactaggttatacgggattaccaaagaacattaatctgatgtggtctagttccgatccc
gctattgcctctattgatacaactagtggtaatatttcgatgaaaaaagcaggtacggtc
attattacactacaaacagcaggtaatgctcaatatcagccggctcaaagtagttatcct
ttggtgattgagaaagcggatgtcggactagtcgccaaagaatctcatttaagctcaatt
tggaatgataatattacacaacaagtgatgcttttatataccaataaagacgctacaaac
aacccaccacctaaacaatttgtcaattataaacaagctataataacagtcgatgaacaa
ggaaaaattacaccaataaaaccaggtgatacaaacattaccgtattatctcaagcaaca
gaacaatttaaatcatcaagtacagtcattaattacacacaagataaaggtacaataaat
tatcattttaaaaattcagatgaaacattaattgttgatgcattgtcaagtggcgtattg
actgctcaggcacctattcctccactgcctactggtattaatgctatttggagtagtagt
aatccaagtgctgtagaagtgacttcgaaaggtgcgatcacccacttaggtatcggaaaa
gccacactcacattatcaattaaagatgatgtttattatcatgataaccataatagttat
aatattacggtaaaacctgcaccttatattacgattgattcactaaaatttaagtctgcc
ggtagagagatgattgcttcaaatactaactatttatcttggcaacctgtttacatctca
gataataaaattactgttaattggagttcatcagaaacacctcacgctattaactttgag
ctgtatgatgaaaaaaataatttgattcaattagaggaaagacaaaattatagccctaaa
aacaatatatctactcctgttattttctctccaggtgaatcttatattaataagccacaa
aatttgaaattaaaagtgatcacatttgatttaaataataaatcttatcctaaagaatat
aacattgcggttaaatctatttctgcacaaacggctgcaaatttatttttaattcatctt
aattctcaatttttatatacagatagtggtagttcagcatcatcttgccaagatgcgatg
ggaacaagcgcgatacactttacagtaatacctagagttgaatttaaaggtgatactaaa
aatttactttatccaatcaggttaactgcgaaaatagatagtataacgttaaattcatcg
aatctatcacaaggaataattaatcaaaacgtagtttatccagatgattttaccttgaat
aaaacatcgttgaataattatgaatttaaggcaacatcatcacaatatgctattgataaa
gaatgtaagattacagactcaggtgatggtgtatttaaactgactatagatgtatatgga
aacaaacaagaaataactaataaatttaactggaatggctttaacggcgcccattaa
DBGET
integrated database retrieval system
