Prosopis cineraria: 129287198
Help
Entry
129287198 CDS
T09047
Name
(RefSeq) ABC transporter C family member 2-like isoform X1
Organism
pcin
Prosopis cineraria
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
MMR_HSR1
DUF87
TrwB_AAD_bind
AAA_16
AAA_23
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129287198
NCBI-ProteinID:
XP_054779361
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1640 aa
AA seq
DB search
MQDPHVDVLFLNISAKVLTNMAFEPLDWFCQPVANGLWTKVVQNAFGAYTPCAVDSLVII
ISHLILFGLCFYRIWLINKNFNVKRYCLRSKLYNYVLGLLAGYCTAEPLFRLVVGLSVLN
LDGQTRLAPFEMVSLIVEALAWCSMLVLILVETRVYVYEFRWFVRFGVVYTVVGDAVMFN
LVFSAKEFYTRSMLYLYISELAIQALFGILLLVYIPNLDPYPGYAPIRSELVTDIAYEEL
PGGEQICPERHSNLFSKITFAWMNPIMKLGYQRPLTDKDVWKLDTWDRTETLNNKFQRCW
NEESRKSRPWLLRALNSSLGGRFWCGGFWKIGYDVSQFLGPLILNMLLQSMQRGDQASIG
YVYGFSIFVGVVFGVLCEAQYFQNVMRIGFQLRSTLVAAVFRKSLRLTHEARKQFASGKI
TNLMTTDAEALQQICQSLHTLWSAPFRIIVALVLLYQQLGVASILGALMLVLMFPVQTFI
ISRMQKWSKEGLQRTDKRIGLMNEILASMDTVKCYAWESSFQSKVQVVRNDELSWFKKAL
LLGACNGFILNSIPVFVTVISFGVFTLLGGDLTPSRAFTSLSLFAVLRFPLFMLPNVITQ
VVNANVSLKRLEELLLAEERILMPNPPLEPGLPAISVKNGNFSWDAKAGRSTLSNVNLDV
PVGCVVAIVGSTGEGKTSLISAMLGELPPTADATVVIRGTVAYVPQISWIFNATVRDNIL
FGSPFDPVRYEKAIDVTELQHDLELLPGGDLTEIGERGVNISGGQKQRVSMARAVYSDSD
VYIFDDPLSALDAHVARQVFDKCIKGELRGKTRVLVTNQLHFLSQVDRIILVHDGMVKEE
GTFEDLSNHGPLFQKLMENAGKMEEYAEENTDSESMQKSSSKSVPNGMPNDMAKSEIKSK
EAKSVLIKQEERETGVVSWKVLQRYKNALGGFWVVLVLFACYILTEVLRVSSSTWLSHWT
DQSASEGYSPGYYNLIYASLSFCQILVTLTNSYWLIISSLYAARRLHNAMLHSILRAPMA
FFHTNPLGRIINRFAKDLGDIDRNVAPFVNMFLGQVSQLLSTFILIGIVSTMSLWAIMPL
LVLFYGAYLYYQSTAREVKRLDSISRSPVYAQFGEALNGLSTIRAYKAYDRMADINGKAM
DNNIRFTLVNMSGNRWLAIRLETLGGLMIWFTASFAVLQNGRAENQQAFASTMGLLLSYA
LNITSLLTAVLRLASLAENSLNAVERVGSYIDLPSEAPSIIESNRPPPGWPSSGSIRFED
VVLRYRPELPPVLHGLSFTIFPSDKVGIVGRTGAGKTSMFNALFRLVELERGKILIDDCE
IAKFGLTDLRKVLGIIPQSPVLFSGSVRFNLDPFNEHNDADLWEALERAHLKDVIRRNSL
GLEAEVSEGGENFSVGQRQLLSLARALLRRSKILVLDEATAAVDVRTDALIQKTIREEFK
SCTMLIIAHRLNTIIDCDRILLLDGGQLREYGTPEELLSDNDSAFSKMVLSTGAANAQYL
RSLVLNGDGGNKPVQEGKHLDGQRRWLASSRWAAAAQFALAVSLTSSQNDLRQLEIEDDN
SILKTAKDAVITLQGILDGKHDKEIEESLDQHQISPNRWWSSLFKMIEGLAMLSRLARNR
LHQSDYNFEDTSINFDHVDM
NT seq
4923 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaggatcctcatgttgatgttctttttttaaatatctctgctaaagtgctgacaaat
atggcatttgagccattggattggttttgtcagccagtggcaaatgggttatggacaaaa
gtggttcagaatgcctttggtgcttatactccttgtgctgttgattctcttgtgatcatc
atttcgcatttgatcctttttggcttgtgcttctatcgaatatggttgattaacaagaat
ttcaacgtcaagagatattgtttgaggtcaaagctttataattatgttttggggttgtta
gctggctattgcactgcagagccattattcagattggttgtgggcctatcagttttaaat
ttagatgggcagactcgtcttgctccatttgagatggtttcactaattgttgaggctctt
gcttggtgctctatgctggttctgattcttgttgaaactagagtctatgtctatgaattc
cgatggtttgtcagatttggtgtggtttatactgtagtgggggatgctgtcatgttcaat
cttgtattttcagcaaaggaattctacacgagatcaatgttatatttatacataagcgag
cttgccatacaggctttgtttggaatactgttgcttgtgtatattcctaatttagatcct
tatcctggttatgctcccatccgaagtgaattggtcactgatattgcatatgaagaactc
ccaggaggagagcaaatatgtcctgagaggcatagcaacttattttcaaaaataactttt
gcttggatgaatcctataatgaagctaggatatcaaagaccacttactgataaagatgta
tggaaattggatacatgggatcggactgagactttgaacaacaagttccaaaggtgttgg
aatgaggaatctcggaagtctagaccatggctattaagagcattaaatagtagcctagga
ggaaggttttggtgtggaggcttttggaagattggctatgatgtttcccaatttctaggg
cctcttatattgaacatgctactgcagtctatgcaaagaggtgaccaggcgtcaattggc
tatgtgtatggcttctcaatatttgttggagtggtttttggagttttatgtgaagctcaa
tattttcagaatgtcatgcgcattggttttcagcttagatcaactttggtggcagctgtg
tttcgcaaatctttaagacttactcatgaagcccgaaagcaatttgcatctggaaaaata
accaatttgatgactactgatgctgaggcactacagcaaatatgtcagtcacttcatact
ctgtggtcagctccatttcgtatcattgttgcgctggttcttctataccaacaacttggt
gttgcttccattcttggcgctttaatgcttgttctaatgtttccagtacagacttttatt
attagtagaatgcaaaagtggtccaaggaagggttgcagcgtacagacaagagaattggt
ctcatgaatgaaattttggcttctatggacactgtaaaatgttatgcatgggagagtagt
ttccaatctaaagtacaagttgtcagaaatgatgaattatcatggttcaagaaggcatta
ttacttggcgcgtgtaatggatttatactaaacagcatcccagtttttgtaactgttatt
tcatttggagtgttcaccttgcttggaggggatttaacaccttcgagagcatttacatcc
ctttctttgttcgctgtgttacggtttcccctcttcatgcttcctaatgttattactcag
gttgttaatgcaaatgtatccttgaagcgtctggaagagttgctcttagcagaagaacgg
attcttatgcctaatccccctctagagccaggattaccagccatctcagtgaagaatgga
aatttttcatgggatgcaaaggctgggaggtctacattgtctaatgtcaatttggatgta
cctgttggttgcgttgttgcaatagttggcagtactggagaaggaaagacatcgctcata
tctgctatgcttggggagcttccacctactgcagatgcaactgttgttataagagggaca
gttgcttatgtaccacaaatttcatggatctttaacgcaactgtgcgggataacatttta
tttggttctccttttgaccctgtgagatatgagaaggcaatagatgtgactgaactgcag
catgacctcgagttgcttcctggtggtgaccttactgaaattggtgaaagaggggtgaat
atcagtggtggtcaaaaacaaagggtatccatggctagagctgtctactccgattcagac
gtgtacatatttgatgatcctttaagtgccctggatgcgcatgttgcaagacaggtgttt
gataaatgcatcaaaggggaattgagaggaaaaactcgagttcttgttacaaatcagcta
catttcctttcacaggtcgatagaattatactggtccatgatggtatggtaaaagaagag
ggaacatttgaggatctctctaaccatggaccactgttccaaaagcttatggaaaatgct
ggaaagatggaggagtatgcagaagaaaacacagacagtgaaagtatgcaaaagtcttct
tcaaaatcagttcccaacggaatgcctaatgatatggcaaaaagtgaaattaaatcaaaa
gaagccaaatctgttcttattaaacaagaagaacgagaaacaggtgttgtcagttggaaa
gttctacagaggtacaagaatgcattgggaggattttgggtggtgctagtactctttgca
tgctatatcttaactgaagtgttgcgagtttccagtagcacatggttaagccattggact
gatcagagtgcatcagagggttatagtcctggttactacaatctgatatatgcaagcctg
tcattttgtcagattttggtgactttaacaaattcttattggctaatcatatcaagtctt
tatgctgctagaaggttgcacaatgccatgctccactctattttacgggctcctatggct
ttttttcataccaatcctcttgggaggatcatcaataggtttgcaaaggatctaggtgat
atagaccggaatgttgctccttttgtgaatatgtttttgggccaggtttcccagcttctt
tcaacattcatcttgatagggattgttagcacaatgtccttgtgggcaataatgccatta
ttggtgttgttttatggagcctatctatattatcagagcacagcccgtgaagtgaagcgc
ttagattctatcagcagatcacctgtatatgctcaatttggagaagcacttaatggtcta
tcaactatccgtgcttacaaagcttatgatcgaatggctgacattaatggaaaagccatg
gacaataatatacgattcactcttgtgaacatgagtggtaaccgatggcttgcaattcgt
ctggaaactttgggtggccttatgatatggtttactgcatcttttgctgtattgcaaaat
gggagggctgagaaccagcaggcatttgcttccacaatggggctactgcttagttatgct
ttaaatattactagtttgctcactgcggtgctcagacttgcaagtctggctgagaatagt
ttaaatgcagttgagcgtgtgggttcttatattgatttgccttcagaggctccatctatc
attgagagtaatcgtcctcctcctggttggccatcatctggatcaattagattcgaagat
gttgttcttcgatataggccagaacttccacctgtcttacatggattgtctttcacaatt
tttccaagtgacaaggttggcattgtcgggaggacaggagcaggaaaaactagcatgttt
aatgctttatttcgactcgtagagttagaaagaggaaaaatcttaattgatgactgtgaa
attgctaagtttggactgactgatttacgtaaagttcttggaattatcccacagtcacct
gttctcttttcaggaagtgtgagatttaatcttgatccttttaatgagcataatgatgct
gacctttgggaggctctggagagagcacatttgaaggatgtgattcggaggaattcattg
gggcttgaagctgaggtatctgagggaggagaaaatttcagcgttggacagaggcaacta
ttgagtcttgctcgtgcattattgcggagatcaaagatattggtacttgatgaggcaact
gcagcggttgatgtcagaactgatgcactgatacagaaaacaattcgagaagagtttaaa
tcctgtaccatgctcattatagctcatcgacttaataccattattgactgcgatcggatc
cttctacttgatggtgggcagctccgtgaatatgggacccctgaggagctactgtcagac
aacgatagtgctttctcaaagatggtactaagtactggagctgccaatgctcaatattta
cgcagcttagtgctcaatggggatggtggaaacaagccagtgcaagaggggaagcacctc
gatggacagcgaagatggctagcttcctctcgctgggcagctgcagcgcaatttgccctt
gctgtcagcctgacctcatcccagaatgaccttcgccaattggaaattgaagatgacaac
agtattctcaagacagccaaggatgccgttataacgttgcagggaattttggatggaaag
catgataaagaaattgaggaatctttagatcaacaccagatatcacctaacagatggtgg
tcatcccttttcaagatgattgagggtctggctatgttgagcagattagcccggaatagg
ctgcaccaatctgactacaattttgaagacacgtcaataaattttgaccatgttgatatg
tag
DBGET
integrated database retrieval system
