Prosopis cineraria: 129303296
Help
Entry
129303296 CDS
T09047
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
pcin
Prosopis cineraria
Pathway
pcin03015
mRNA surveillance pathway
pcin03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcin00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
129303296
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
129303296
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
pcin03041
]
129303296
Spliceosome [BR:
pcin03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
129303296
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
RRM_MARF1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129303296
NCBI-ProteinID:
XP_054798491
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
488 aa
AA seq
DB search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NT seq
1467 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggaacgtatgatcaaggtggcggtggcggtactgcgcttccaccttacggagct
ggtggtggatatcaaggaggtagctatggtggtgaaggtggctatggaggcggaggctat
ggaggaggcaacgttgctggcggctatggcggtaatgacggtgggggctatgggggtaag
gggaggggcggcggctttggcggtaatgatgctggagggtacggaggcaggggaagcggt
ggttatggtgggagaggcagcagcggaggtcatgggggtcgaggaggagcaggaggttat
ggtggtcgagggggaggaggaggaggttttggtggtcgaggtggtggatatcaaggagga
gaccgtggtggacgaggaggtggccgtggtggaggtgggagagacggagattggcgttgc
ccaaaccctagctgtggaaacctgaattttgcgagaaggactgaatgtaacaaatgcggt
gcaccgtcccccgctggtgctggtgatcgtggtggcagtggtggtgcaggtggttacaat
agaggaggaagggacgggggatatggcaataatcgagggggtagatctggtaactatgag
ggaggaagaggtaatgactataataggggcagtggtgattacaatgatggaaggagggga
ggcaacagggaccattctttcagtggtagagaagatggtggctatggtcaagtgcctcct
cctacagcccaatcttatgaaggtgcgggtggaaactatgcaccaactttcaattcatat
gatgggaatgtaaattatggctcagaagcagtacctccacctccaacctatactgttgga
cccacttcataccctccatcctacggtggtaacatgggtggttatggtggtgacaattca
gttgatgcacggagtggtggtcggactgggccaccagctggatatgatggtagttataat
gctggtaatcgaggcggatatggtggacctcctgccgagctcacatctaaggtgaagcag
tgtgatgagaattgcggggagtcctgtgacaattctagaatctatatatcaaacttacca
ctggatgtgacaattgaagagctgagagatctttttggaggcataggacaagttgctagg
ataaagcagaagaggggctataaagatcagtggccctggaacataaaaatatacacggat
gagcaaggcaataataagggtgatgctgttctttcctatgaagatccatctgctgcacac
tctgctggtggtttctacaataattatgatttgaggggtcacaaaatcagtgtggccatg
gcagagaaatccgcaccaaaggctccacctgcatatgggggcaacaggggtggatatggt
ggacgcagagataactacagagatggcggaggttctgggcctgataggcgtgacaacttt
ggcgggagccgatcgcgtccatactga
DBGET
integrated database retrieval system
