Prosopis cineraria: 129308290
Help
Entry
129308290 CDS
T09047
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
pcin
Prosopis cineraria
Pathway
pcin03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcin00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
129308290
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pcin03019
]
129308290
Messenger RNA biogenesis [BR:
pcin03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
129308290
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129308290
NCBI-ProteinID:
XP_054805335
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
474 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWDTTEDKLKDHFSNYGDVLHTSVMREKNTGKPRGFGFVVFADPSIL
DRVLEEEHKIDGRTVDAKKAFSREDQQISATSRAGNPNSYRNSGNGGNIRTKKIFVGGLP
PTLTEEKFRQYFEGYGHVTDVVVMYDQNTGRPRGFGFISFDSEDAVDRVLHKPFHDLNGK
QVEVKRALPKDANPGASGRTMGGVGGGGGGYQGYGASGGNQNAYDGRMDSGRYVQPPSTG
GGFPPYGSSGYSAPGYSYGPANNGIGYGGYGSYGGASTGYGGPAGATYGNPNIPNAAYAG
GPPGAPRSSWPAQAPSGYGSMGYGNAAAWGAPGGGAGSGGGGPGAAPASQSPSGAAGYGN
QGYGYGGYGGYGGSDSSYGNPGVYGAVGGRSGSAPNSYASGPGGNEPQGSGGNYNGSGYG
DANGSSGYGNAAWRSEPAQPSGNYGTPQVNGPHGGQVGYGSSYGSAQSRQAQQQ
NT seq
1425 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaagggaagctttttattggtgggatatcgtgggatacgacggaggac
aagctgaaagatcatttcagcaactacggtgatgtcttgcacacttccgttatgagagag
aagaacactgggaagcccagaggctttgggtttgttgtgttcgcagatccttcgattctc
gatagggttctcgaggaagagcacaaaatcgatggcagaacggtggatgctaagaaggcc
ttctccagagaggatcaacaaatttctgccacttccagggcaggaaatcccaactcttat
agaaattcaggaaatggtggaaatatcaggaccaaaaaaatatttgttggagggttgcct
cctacattgactgaagaaaagttccgtcagtattttgagggttatggtcatgttactgat
gtagtggtcatgtatgaccagaatactggacggccacgtggatttgggtttatttcattt
gactctgaagatgcagttgacagggttttgcataaaccatttcatgatttaaatggtaag
caagtagaagtgaagcgtgcacttccaaaggatgctaatcctggtgctagtggccgtact
atgggtggtgtaggaggaggtggcggcggctatcaggggtatggggcatctggtggcaac
caaaatgcatatgatggtcggatggattctggtaggtatgtgcagcctccaagcactgga
ggtggatttccaccttatgggtcttcaggatatagtgctcctgggtacagttatggtcct
gctaataatggcattggttatggcggatatggaagttatggtggtgcaagcactgggtat
gggggacctgctggtgcaacttatgggaatcccaacatccctaacgctgcttatgctggt
ggtccacccggtgccccaaggagttcatggcctgctcaagctccctctggttatggttct
atgggctatgggaatgctgctgcttggggtgctccaggtggtggtgctggatctggtggt
ggcggtcctggtgcagcccctgcaagtcaatcacccagtggggctgctggttatgggaat
caagggtatggttatggtggttatggtgggtatggtggaagtgatagttcttatgggaac
cctggcgtatatggtgctgttggtgggcgttctgggagtgccccaaatagctatgccagt
ggtccaggaggaaatgaaccacaaggaagtggtggcaactacaatggaagtggctatggt
gatgcaaatggaagttcaggatatggaaatgctgcatggagatctgaacctgcgcagcca
tctggaaattatgggactcctcaggtaaatggtccccatggtgggcaagttggttatggc
agcagctatggcagtgcacaatcacggcaggcccaacagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
