Candidatus Pantoea carbekii US: BMSBPS_0617
Help
Entry
BMSBPS_0617 CDS
T03853
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V gamma chain RecC
KO
K03583
exodeoxyribonuclease V gamma subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
pck
Candidatus Pantoea carbekii US
Pathway
pck03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pck00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
BMSBPS_0617
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
pck03400
]
BMSBPS_0617
Enzymes [BR:
pck01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
BMSBPS_0617
DNA repair and recombination proteins [BR:
pck03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
BMSBPS_0617
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Exonuc_V_gamma
RecC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKC32401
LinkDB
All DBs
Position
862866..866258
Genome browser
AA seq
1130 aa
AA seq
DB search
MLRIYHSNQLDLLKDLLIKLITIESFSDPFYADQILVHNTSMAHWLQIELAKHFSISANI
NFLFPETFIWNMFLKVLPEIPEEYAFTKTQMTWKLMHCLPNLLNKKNFYSIKQYLYADDD
KRKLHQLSMRIATLFDQYLIYRPDWLNIWENGQLIDGLGKTQQWQAELWCHLVYMTKKKG
QPAWHYANLYTRFIQILEEVPISLLNLPRRVFIFGISALPPMYLQVLEALGRHISIHLFF
INPCRYYWGDIQDYSFLAKMQGRQRRRLYCLPISNIVPVSFNRLSEQQLTNPLLASWGKL
GRDNLYLINQMECSANDIHAFVDIQKDSLLHSVQRDILNLDDNTIIGLNAAELTDSTKKI
TLNPTDRSIIVQVCHSIQREVEVLQNYLLTIMEKNPELKTRDIVVMVSDINSYSPFIQAT
FSRVHDQCYLPFTILDRNKIQIHPVMVALLNLLQLPFSRFCLEEVLALLEVSALAQRFSI
DESNLRLLRRWVVESGIRWGLDDTNVEALSLPTTGQHTWRFGLQRMLLGYALESSHGDWE
GILPYDESRGLIAEIVGHLAKLLSCLEVWHIRLSKARTLSEWKPLCRELIDVFFIDDSES
HLALLFIEIQWKEIIEQGIQAKYDKPISITLLYDNLRTRLEQHNINQHFSSGPINFCTLR
TIRSIPFKVICLLGMNDGMYPRSLLPLNFDLMQQQIRKGDRSSRDDDHYFFLEALIACQN
QFYISYIGRTIQDNSKLYPSIMVKELMDYISNSFCLAGDEQCVPDVSACRVRNHLQILHS
RMPFSPENFRSSENRQSFASEWLNAANNSGVVPSNFFTKPLRIQRINSLSIKQLLAFWRH
PIRTWFQQSLGVNFSTQSNTELPDSEPFFLNKLECYKLNTQLLNALINNQNVDQLYKYHR
TAGNLPYGAFGEIFWKTQVEEMKKIVSNFSTQSQEIENWEVNLQLDNIQLTGWLNQIQVN
NGLLRFRPSILSISDGLLLWLEHLVYCAMGGSGTSRIYGCKKSRWCFNALEKNKALLILK
NYVNGYQMGLTQPLMLTNQSSSAWLNISFDTESRQLINNQKTQTEAMNKLIQKWQGDSKI
RGESHDPYFHRLTRTLHNNIVQQMIVDTARKWYLLVYVSHDHTEYNNNGF
NT seq
3393 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttcgaatttatcattctaatcagctcgatcttttaaaagatttgttaataaaatta
ataacaatcgaatcattttctgatccattttatgctgatcaaatcctggtacataataca
agtatggctcattggcttcaaatagaactagcaaaacattttagtatttcagctaatata
aattttttatttccagaaacttttatttggaatatgtttttgaaggtattacctgaaatt
ccagaagaatatgcttttactaaaacgcaaatgacttggaaattaatgcattgtcttcct
aatttattgaacaaaaaaaatttttattcaataaaacaatatctctatgccgatgatgat
aaacgaaagttacatcaactcagcatgcgaattgctactttatttgatcaatatcttata
tatcgtcctgattggttaaatatttgggaaaatggtcagttgatagatggattaggaaaa
acacagcagtggcaagctgaattatggtgccatttagtttatatgactaaaaaaaaagga
caaccagcatggcattatgctaatctttatactcgttttattcagatattagaagaagtt
ccaatatctctgctaaatttgccaaggcgtgtatttatcttcggtatttcagcattacct
cccatgtatctacaagttttagaagcgcttggacgacatattagtattcatttgtttttt
attaatccttgtcgttactattggggtgatattcaagattactcttttttagcaaagatg
caaggtcgtcaacggcgtcgcctgtattgtttacctatatcaaatatagtaccagtatca
tttaatagactaagtgaacaacaattaactaatccgctattagcttcatggggaaaatta
ggtcgtgataatctttatcttattaaccaaatggaatgttcagctaatgatatccatgcg
ttcgttgatatacaaaaagatagtttattacatagtgtccagagggatattcttaattta
gatgataatacaattattggattgaatgctgctgaacttactgatagtactaaaaagatt
acacttaatcctacagatcgctctattattgttcaagtttgtcatagtatacaacgtgaa
gtagaagtcttacaaaattatttgctaacaataatggaaaaaaatcctgaactgaaaaca
cgcgacattgttgtaatggtatcggatattaatagttattctccttttattcaagcaact
tttagcagagtgcatgatcaatgttatttgccatttactattttagatcgtaataaaatt
caaatacatccagtaatggtagcattgctcaatttactacaattaccattcagtcgcttt
tgtttagaagaagtattagcattgctagaggtatctgcattagcacaacgtttttcaata
gacgaaagtaacttacgtttgctacgtcgttgggtagttgaatctggtatccgttgggga
ttagatgatactaatgtagaagctttatcactacctactactgggcaacatacttggcgt
tttggcttgcagcggatgttgctaggctatgcattagaaagctctcatggtgattgggag
gggattcttccatacgatgaatctagaggtttaatagctgaaatagtcggtcatcttgca
aagttactatcttgtcttgaggtatggcacattcgcctatcaaaggccagaacacttagt
gaatggaaaccattatgccgtgagttaattgatgtgtttttcatcgatgattctgaaagt
cacttggcattactatttatagaaatacaatggaaggaaattattgaacagggtattcaa
gctaaatatgataaacctatttctattacgttattatatgataatcttcgcacacgctta
gaacaacataatattaatcaacatttttctagtgggccaattaatttttgtaccttaaga
acaatacgttcaatcccttttaaggtcatttgtttattagggatgaatgatggtatgtat
cctcgttcattactacccttgaattttgatctgatgcaacaacaaatacgtaaaggtgat
cgcagttctcgcgatgatgaccattatttttttcttgaagcattaattgcatgtcaaaat
caattctatattagctatattggtcgtaccatacaagataatagtaagctttatccatca
attatggtaaaagaattaatggattatatttctaacagtttttgtttagctggcgacgag
cagtgtgtaccagatgttagtgcgtgccgtgtacgcaatcatcttcagatattgcatagt
cgtatgcctttttctccagaaaattttcgttctagtgaaaacagacaaagctttgcaagc
gaatggttgaatgcagcaaataacagcggtgtggtaccatcaaacttttttactaaacca
ttgcggatacagcgtattaacagtctttcaataaaacaattattagctttttggcgtcat
ccaatacgaacttggtttcaacaatccctaggtgttaatttttcaactcaaagtaacact
gaattgccagatagcgaacctttttttcttaataaattagaatgttataaacttaataca
caattacttaatgcattaataaataatcagaatgttgatcaactctataagtatcatcgc
actgccggtaatttaccttatggtgcatttggagaaattttttggaaaactcaagttgaa
gaaatgaagaaaatagtttctaattttagtactcaatctcaagaaatagaaaattgggaa
gtgaatctacaattagataatatccaattaactgggtggttaaatcagattcaagttaat
aatggcttattacgattccgtcccagtatattgagtataagtgatggtttactattatgg
ttagagcatttagtatattgcgcaatgggcggtagcgggacaagtcgtatatatggatgc
aaaaaaagtcgttggtgttttaacgcactagaaaaaaacaaagctttattaattttaaag
aattatgtcaatggttatcaaatgggactaacacaacccttaatgctgactaatcaatct
agcagtgcgtggttaaatattagttttgatactgaatcgcgacaattaattaacaatcaa
aaaacacagacggaggcaatgaataaattaattcaaaaatggcaaggtgattctaaaatt
agaggggaaagccatgatccttattttcatcgtcttacacgaacgttacacaataatatt
gtacaacagatgattgtcgatactgcacgaaaatggtatttactagtatatgtatcgcat
gatcatacggaatacaataacaatggtttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
