Candidatus Pantoea carbekii US: BMSBPS_0660
Help
Entry
BMSBPS_0660 CDS
T03853
Name
(GenBank) chaperone ClpB
KO
K03695
ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB
Organism
pck
Candidatus Pantoea carbekii US
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pck00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03110 Chaperones and folding catalysts [BR:
pck03110
]
BMSBPS_0660
Chaperones and folding catalysts [BR:
pck03110
]
Heat shock proteins
HSP100
BMSBPS_0660
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_2
AAA_lid_9
Clp_N
AAA
ClpB_D2-small
AAA_5
AAA_22
AAA_16
NBD_SMAX1
Sigma54_activat
AAA_14
nSTAND3
ATPase_2
TniB
bpMoxR
AAA_18
AAA_7
IstB_IS21
AAA_24
DUF815
NACHT
AAA_19
Torsin
T2SSE
ATP_bind_1
SRP54
DNA_pol3_delta2
CLP1_P
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKC32441
UniProt:
U3U754
LinkDB
All DBs
Position
926972..929542
Genome browser
AA seq
856 aa
AA seq
DB search
MRLDRFTNKFQLVLDEAQSLALRHENQFIEPIHVMNILLKEENESVHILLKTAGIDVSNL
SINLEKSLNQLPKVEGTAGDIHSSSDLLNTLNLCYQLAQKNGDKFISCEWFILAALDSRG
LLAHLLKTAGASHKILYDSINQLRRGEKVHDQNFEERREALKKYTIDLTTYAEQGKLDPV
IGRDDEIRRTIQVLQRRTKNNPVLIGEPGVGKTAIVEGLAQRVINGEVPEGLKGRRVLSL
DMGSLIAGAKYRGEFEERLKNLLNELIKQEGNVILFIDELHAMVGAGKAEGVIDAGNMLK
PALARGELHCIGATTLDEYRKYLEKDAALERRFQKVFVAEPTVENTIAILRGLKERYELH
HHVQITDPAIVAAATLSNRYITDRQLPDKAIDLIDEAASSIRLQIDSKPELLDRLERRII
QLKLEQEAMKKELDEASIKRLEILKSELDQKECKYIELEKIWKAEKASLSDVQNIKWKIE
QARFSLEQARRIGDLGLMSKLQYGKIPELEKQLESIQSEHKPMKLLRNRVTDEEISDVLA
RWTGIPVARMMESERNKLLRMEQSLHRQVIGQHEAIEAVSNAIRRSRAGLSDPDRPIGSF
LFLGPTGVGKTELCKSLANFLFDKNDAMVRIDMSEFMEKHSVSRLVGAPPGYIGYEEGGY
LTEAVRRRPYSVILLDEIEKAHPDIFNILLQVLDDGRLTDSQGHTVDFRNTVVIMTSNLA
SDLIQEKCSLLDYMGMKQIVMSVVRQHFRPEFINRIDEVVVFHPLQENHIASIAKVQIQH
LYERLAEQGYHLNISESTFKFLGKNGYDPIYGARPLKRVIQDKIETPIAHKILSGDLITD
KIITIDVNNDKIIVCQ
NT seq
2571 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgtctggatcgttttactaataaatttcagttagtacttgatgaggctcaatctctt
gctttaagacatgaaaatcaatttatagaacccattcatgtcatgaatatattacttaaa
gaggaaaatgagtcggtacatatattgttaaaaactgcaggtattgatgtttcgaacctt
agtattaatcttgaaaaatctcttaatcaacttccaaaagtagaaggaactgctggtgat
atacattcatcatctgatttgcttaacacactaaatttatgttatcaattagcacaaaaa
aatggtgataaatttatatcatgcgaatggtttattttagcagcacttgattcgcgaggt
ttattagcacatttacttaaaactgctggtgcttcgcataaaatattatatgatagtatt
aatcaattacgaaggggagagaaagtgcatgatcaaaattttgaagagcggcgtgaagct
ttaaaaaaatataccatcgacctcacaacttatgccgaacagggaaaacttgatccagtc
attggccgtgacgatgagattcgccgtaccattcaagtattacaacgtcgcactaaaaat
aatcctgtattaataggtgaacctggcgtaggtaaaactgctattgttgaaggtttagcg
caacgtgtcattaacggtgaggtaccagaaggtctcaaaggtcgtcgtgtactaagttta
gatatgggttctttaatagctggtgctaaatatcgtggtgaatttgaagagcggttaaaa
aatttattgaatgagcttattaaacaagaaggtaatgttattctttttattgatgagcta
catgctatggttggagctggtaaagcagaaggtgtaatagatgctggtaacatgcttaaa
ccagcattagctcgaggggaattacattgtataggtgcaactacgttagatgaatatcga
aaatatcttgagaaagacgctgctctagaacgtcgttttcaaaaagtatttgttgcagaa
ccaacagttgaaaatactattgctattttacgtggacttaaagaacgttatgaactacat
catcatgtacaaattaccgacccagcaattgtagctgctgcaactctatcaaatcgttat
attacagatcgtcaactgcctgataaagcaattgatttaatcgatgaagctgcatctagt
attcgtctacaaattgattctaaaccagaattattggatcgacttgaacgtcgtattatt
cagttaaaattagaacaggaggcaatgaaaaaagagttggatgaagccagcattaaaaga
cttgaaattctcaaatcagaactcgaccaaaaagagtgcaaatacattgaattagaaaaa
atatggaaggcggaaaaagcatctttatctgatgttcaaaacatcaaatggaaaattgaa
caagctcgtttttcattggaacaagctcgtcgtataggtgatctaggattaatgtctaaa
ttacaatacggcaagataccagaacttgaaaaacagttagaatccatacaatccgaacat
aagcctatgaaacttttgcgtaatcgtgtaacagatgaagaaatttccgacgttttagca
cgttggactggtattccagttgcacgcatgatggaaagtgagcgaaataaattgttacgt
atggaacaatcattacatagacaagttattggtcaacatgaagctattgaagcagtatca
aatgccattcgtcgtagccgtgctggtttgtctgatcctgatcgtccgataggttcattt
ttatttttaggacctactggtgttggcaaaactgaattatgtaaatccttagctaatttt
ttatttgataaaaatgatgcaatggtccgcatagacatgtctgaatttatggaaaaacat
tctgtgtcgcgtttggttggtgcaccaccaggttatatcggttatgaagaaggaggatac
ttaacagaagcagtccgtcgtcgtccttattcagtgattctattagatgagatagaaaaa
gcacatcctgatatatttaatattttattgcaggttttagatgatggtcgtctaaccgat
agtcaaggacatacagtagattttcgtaatactgtagttattatgacttctaatcttgct
tctgatttaatacaagagaaatgtagcttattggattatatgggaatgaaacaaatagtg
atgtcagttgttaggcaacattttcgtccagaatttattaatcgtatcgatgaagtggtc
gtttttcaccctttacaagaaaatcacattgcttctattgccaaggttcaaatacagcat
ttatatgaacgtttagcagaacaaggctatcatttaaatatttctgagtcaacttttaaa
tttcttggtaaaaatggttatgatccaatttatggtgcacgtcctttaaaacgagtaatt
caggataaaattgaaacgccaatagcgcataaaattctttcaggtgatttaattacagat
aaaatcattaccatagatgtaaacaatgataaaataattgtttgtcagtag
DBGET
integrated database retrieval system
