Candidatus Pantoea carbekii US: BMSBPS_0742
Help
Entry
BMSBPS_0742 CDS
T03853
Name
(GenBank) MscS mechanosensitive ion channel YjeP
KO
K22051
miniconductance mechanosensitive channel
Organism
pck
Candidatus Pantoea carbekii US
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pck00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pck02000
]
BMSBPS_0742
Transporters [BR:
pck02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
BMSBPS_0742
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MscS_TM
MscS_porin
MS_channel_2nd
MS_channel_3rd
MS_channel_1st
COMM_HN
DUF4435
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKC32513
LinkDB
All DBs
Position
complement(1019113..1022457)
Genome browser
AA seq
1114 aa
AA seq
DB search
MYAFLCLLLFFMFSTSAAYENVPSISQLEQELSIAKSAKNTLFQNEQIQSIESALKFLSE
RDESIELTKQYQQVIDDFPKLISELRQQIINLNGKTKIVHDNMNHAELDQEMLQVSSQLL
EESRQAQQEQDRAREISNSLSQLPQQQTEARRAMVDSEHRIKKGLISLNTPLAQAKIYAH
QAENAANKAHLDALELAQLSANNRQELARMRSEVHQKKMVQLDNYLQKLRNQLNNQRQHE
AELALERTEQLAENTKNLPHLIGDQFRVNRELSSDLNQQAERMDLVSSRQRLATNQILQV
LQVLSTLREQSQFLSASNLLGEALRAQVSRLPEVPKSQQIDNEMGELRVQRLRYENLIDR
QHVLQKEKQDHGRFFTKEQKKLLKAQLKIQHELLNSLISGCDTLILEITKLKVSNTQLQD
ALSEVKEATHRYLFWTADVRSIGFDYPVQVVQDLRRLLSLDTLDQVGKSLVMMFTRKETV
LPIIGASLLVGISISSRRHYNDFIARAANRVGKVTQDHFGLTLRTVFWSILVALPLPVLW
ATLGYGLQHAWPYPFAMAIGEGITATLPLLWAFMISASFARHDGLFLVHFRWPQMSVVRA
TRYYSLTVGLIVPLIMLLITFAHLDDAQFSASLGRLCFMLICGALSIVTVSLKRSGIPLY
LDEEGNGDNLVNRILWNIMIGIPLLAALASGIGYLTTAQALLARLETSVGIWFFLLIVYY
IIRRWMLIQRRRIAFDRARQRRAEILANRARSEEAKEQQMQNNSDTIEIEEPVIDLDEIS
AQSLRLVRSILTLIAFVSVIALWSEIHSAFSFLDNIELWDASTTIQGVKSLQPITLGAVI
IAILVLIITTQLVRNMPALLELVLLQHINLSPGTGYAITTLTKYLLMLLGSLIGFSMIGI
EWSKLQWLVAALGLGLGFGLQEIFANFISGLIILFEKPIRINDTVTIRDLTGNITRINTR
ATTITDWDRKEIIVPNKAFITEQFVNWSLSDSVTRVVLTIPAPANINSNKITKLLKEAAA
HCTYVLNTPMPDVFLVDLQQGIQLFELRVYAAEMGHRMPLRHELHQLILHGFEKNNIEMP
FPPFQIRIENIEQKAGVANNSISSTNQVFKSGSL
NT seq
3345 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgtatgcttttttatgtttactattattttttatgtttagcacatctgctgcttacgaa
aatgttccgagtataagtcaacttgaacaggagttaagcatagccaaatctgctaaaaat
actctttttcaaaatgagcaaattcaatctatagaatcagctctcaagtttctttctgaa
agagatgaatccattgaacttactaaacagtatcaacaagtcattgatgattttcctaaa
ttaataagtgaattacgacaacagattattaatttaaatggcaaaactaaaatagtgcat
gataacatgaatcatgcagaactagatcaggagatgctgcaagtaagcagtcaactcttg
gaagaaagtcgccaagcacagcaagaacaagatcgcgcacgtgagattagtaattcatta
tcgcaattaccacagcaacaaactgaagcacgacgggctatggtagatagcgaacaccgt
ataaaaaaaggcttaatatctttaaatacaccattagctcaggcaaaaatatacgcacat
caagcagaaaatgccgctaataaagcacatttagatgcattggaattagcccaattgtca
gcaaataatcgacaagaactagctcgcatgcgttctgaagtacatcaaaaaaaaatggtc
cagttagacaactatttacagaaactacgtaatcaacttaataatcaacgtcaacatgaa
gctgaattagcactcgaacgtactgaacaactagctgagaatactaagaatttaccgcat
ttaatcggcgatcaatttcgtgttaatcgtgagttatcttctgatcttaatcagcaagca
gaacgtatggatttagtttcctctcgacagcgcttagccacaaatcaaattttacaggta
ttacaggtattaagtacactacgtgaacaatcgcagtttttaagtgcatctaatctatta
ggtgaagcattacgtgcacaggtatctcgcttacccgaagtccccaagtcacaacaaatc
gataacgagatgggtgaactccgcgttcaaagactacgttatgaaaatttgattgatcgt
caacatgtattgcaaaaagagaagcaggatcatggtagattttttaccaaagaacaaaaa
aagcttcttaaagctcaacttaaaattcagcatgaattattaaattcattgatttctggt
tgtgatacattaattttagaaatcactaagctgaaagtatcaaatacgcaattacaagat
gcattaagtgaagttaaagaagcaacgcatcgttatcttttttggacagcagatgtcaga
tcaataggatttgattatcctgttcaagttgttcaggatttaaggcgtttattatcgcta
gataccttagatcaagttggtaaatctttagtaatgatgtttactagaaaagaaacagtg
cttccaattattggtgcgagtttattggttggtataagtattagttcgcgccgacattat
aatgattttattgcacgtgccgctaaccgagtgggaaaagttacacaggatcatttcggt
ctgacattacgtactgtattttggtcgattttggttgctttgccattacctgttctttgg
gcaacactaggctatgggttacaacatgcctggccttatccgtttgctatggctattgga
gagggaattactgctaccctgccattgctctgggcatttatgattagtgcttcctttgct
cgtcatgatggattatttttggtgcatttccgttggcctcaaatgagtgtagttcgtgct
acacgttactattcacttacggttggcttgattgtaccattaattatgctattaattact
tttgctcatttagacgatgcacaattttctgcatcgcttggtcgtctgtgttttatgcta
atttgtggtgcacttagtattgttactgttagtttgaaacgttctggtataccactctat
ctcgatgaagaaggaaatggcgataatcttgttaaccgtattttatggaatataatgata
ggtattccacttcttgcagcacttgcctctggaattggatatttaacaacagcacaagca
ttgttagcgcgtttggaaacctctgttggaatttggttttttctattaattgtctattat
attattcgtcgatggatgttaattcaacgacgtcgaattgcttttgaccgtgctcgtcaa
cgacgtgctgagatcttagcaaatcgtgcacgcagtgaagaagcaaaagaacagcaaatg
caaaataattctgatactattgaaattgaagagccggttatcgatcttgatgagattagt
gctcaatcgttacgtcttgtgcgttcgatcctcacactgatagcttttgtatccgtaatt
gcattatggtcagaaatccattctgcctttagttttttggataatattgagctatgggat
gctagtactaccattcaaggtgtaaaaagtttgcaacctattacactaggtgctgtcata
atagctattttagtactgatcattaccactcaattggtacgtaatatgcctgcattattg
gaattagttctgttacaacatattaatttatcaccaggcacaggttatgctattacaacg
ttgactaaatatctattaatgttacttggtagtttaattgggttttcaatgattggtatt
gaatggtcaaagttgcaatggcttgtagcagctttaggattaggattaggttttggttta
caagaaatttttgctaattttatctctggtttaattattttatttgaaaaaccgattcgt
attaatgatacggtaacaattcgcgatctcacaggaaatattacacgtatcaatacacgt
gctaccacgattactgactgggatcgaaaagaaattattgttcctaataaggcatttatt
acagaacaatttgttaattggtcactttcggactcggtcacacgagtagtgcttactatt
ccagcaccggcgaatataaatagtaataaaataacaaaactgcttaaagaagcagccgct
cattgtacatatgtgctgaatacgcctatgcccgatgtgtttcttgttgatttacaacaa
gggattcaattatttgaattacgtgtatatgcagctgaaatgggacatagaatgccatta
cgtcatgaattacatcaattaattttgcacggttttgaaaaaaataatattgaaatgcca
tttccaccatttcaaatacgtattgaaaatatcgaacaaaaagcaggagttgctaataat
agcatatcttctacaaatcaagtttttaaatctggtagtttatga
DBGET
integrated database retrieval system
