Procambarus clarkii (red swamp crayfish): 138366072
Help
Entry
138366072 CDS
T07930
Name
(RefSeq) collagen, type I, alpha 1a-like
Organism
pcla
Procambarus clarkii (red swamp crayfish)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
138366072
NCBI-ProteinID:
XP_069182906
LinkDB
All DBs
Position
2:27252204..27270714
Genome browser
AA seq
643 aa
AA seq
DB search
MTFTPCRCYMNSSTSSNGADSSDGAFGVDGADGADGADSDDGAFGADGADGSDGVDGANG
ADCADSDDGADGADGADGADGADGVDGVDGVDGADSADGVDGVDGADGADGVDGADSVDG
VDGVDGADGADGVDGVDRVDGVDGAHCVDGADGADGADGVDGVDRVDGVDGADGADGVDG
ADGVDGADGVDGVDRVDGVDGADGADGVDGVDGVDGVDGADGPDGVDGSVGADGADVADG
ADGSVGADGSVGADGADCVTWEGADGADGAYGADGSHGADGADGAHGADGAHGADGSDGS
IGADGADVADGVDGANGSDGSDGADVADGVDGADDSDGADGADVSNGADGSDGSDGVGGA
DVFDGVNSADGFDGADGADGSAGSDGADGADGSDGVDGADGSNGVDGTDGADLFDGADSS
DDADGADGSDGSIGADGADFDGVDGADGSDGSDGANGSNGVDGTDGSDGANGANVSDGVD
GANVSDGSDGTVGFDGADVADGVDGADGSNGANGANGVDGTDGADGSDLANGANVSDGVD
GANVSDGSDGTVGFDGADGVDGADGVDVIDCVDGADGSDGSNGANCADGSDGAIGFVGAD
GSNGADGAIVCCHSRPWHSPDCSIYCWISVIKLCLMFTQLCKQ
NT seq
1932 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccttcacaccctgccgctgttacatgaacagcagtactagttccaatggtgccgat
agttctgatggtgcctttggtgttgatggtgccgatggtgctgatggtgctgatagtgac
gatggtgcctttggtgctgatggtgccgatggttctgatggtgtcgatggtgctaatggt
gccgattgtgctgatagtgacgatggtgccgatggtgccgatggtgctgatggtgctgat
ggtgccgatggtgttgatggtgttgatggtgttgatggtgccgatagtgccgatggtgtt
gatggtgttgatggtgccgatggtgccgatggtgttgatggtgccgatagtgttgatggt
gttgatggtgttgatggtgccgatggtgccgatggtgttgatggtgttgatagagttgat
ggtgttgatggtgcccattgtgttgatggtgccgatggtgccgatggtgccgatggtgtt
gatggtgttgatagagttgatggtgttgatggtgccgatggtgccgatggtgttgatgga
gccgatggtgttgatggtgccgatggtgttgatggtgttgatagagttgatggtgttgat
ggtgctgatggtgccgatggtgttgatggtgtcgatggtgttgatggagttgatggtgcc
gatggtcctgatggtgtcgatggttccgttggtgccgatggtgctgatgttgccgatggt
gccgatggttccgttggtgccgatggttccgttggtgccgatggtgctgattgtgtaaca
tgggagggtgccgatggtgccgatggtgcgtatggtgctgatggttcccatggtgcggac
ggtgctgatggtgcccatggtgctgatggtgcccatggtgctgatggctctgatggttcc
attggggctgatggtgccgatgttgccgatggtgtcgatggtgccaatggttccgatggt
tctgatggtgccgatgttgccgatggtgttgatggtgccgatgattctgatggtgccgat
ggtgctgatgtttccaatggtgccgatggttccgatggttctgatggtgtcggtggtgcc
gatgttttcgatggtgtcaatagtgcagatggttttgatggtgccgatggtgctgatggt
tccgctggctctgatggtgccgatggtgctgatggttctgatggtgtcgatggtgctgat
ggttccaatggtgtcgatggtaccgatggtgccgatcttttcgatggtgccgatagttct
gatgatgccgatggtgctgatggctctgatggttccattggggctgatggtgccgatttc
gatggtgtcgatggggctgatggctccgatggttctgatggtgccaatggttccaatggt
gtcgatggtaccgatggttctgatggtgccaatggtgccaatgtttccgatggtgtcgat
ggggccaatgtttctgatggttccgatggtactgttggttttgatggtgccgatgttgct
gatggtgtcgatggtgccgatggttctaatggtgccaatggtgccaatggtgtcgatggt
accgatggtgccgatggttctgatcttgccaatggtgccaatgtttccgatggtgtcgat
ggggccaatgtttctgatggttccgatggtactgttggttttgatggtgccgatggtgtc
gatggtgccgatggtgtcgatgttatcgattgtgtcgatggtgctgatggttccgatggt
tccaatggtgccaattgtgctgatggttccgatggtgccattggttttgttggtgccgat
ggttccaatggtgccgatggtgccattgtttgctgtcatagtcgcccttggcactcacca
gactgttccatctactgttggatatcagtaattaagttatgtttaatgttcacacaactg
tgtaaacaataa
DBGET
integrated database retrieval system
