Pedobacter cryoconitis: AY601_0100
Help
Entry
AY601_0100 CDS
T04341
Name
(GenBank) Cytochrome C biogenesis protein
KO
K02198
cytochrome c-type biogenesis protein CcmF
Organism
pcm
Pedobacter cryoconitis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pcm02000
]
AY601_0100
Transporters [BR:
pcm02000
]
Other transporters
Others
AY601_0100
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cytochrom_C_asm
CcmF_C
HpiC1-like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMP97071
UniProt:
A0A127V6Y1
LinkDB
All DBs
Position
112361..114829
Genome browser
AA seq
822 aa
AA seq
DB search
MDIQFTGETLLPGKVGQFFIVLAFAAALLSTISYFFATRNKDLADKSWQRLGRIAFLTNL
FSVIGIGVTLFYLILNHYNEYYYVYSHSSKTLPVYYIVSAFWEGQEGSFWLWAFWQAILG
TILIWKARTWENGVMTVVAFSQVFLTSMLLGVQIFGERIGSSPFILLRDAVNLKDMAPVV
FADAENYKNYLKFITDGRGLNPLLQNYWMVIHPPTLFLGFASMIVPFAYVITGLWQKRYK
EWVKPAMPWALFAVMVLGTGIIMGSFWAYEALNFGGFWAWDPVENASLIPWLTLIGAVHV
MIAFKNTGHAFFTSIALVLVSFILVLYASFLTRSGILGETSVHSFTDLGMFGHLILYNVV
FLAIPVILIILRWKELPITNKDEETYSREFWMFIGALVVTVACIQVIFSTSVPVFNKAFG
TNFAPPIDAIKYYNQWQAPFAILITMISGFSQFLKYKRTDTRKFYSSLVATLIIAIVVTA
GFVYITNVYNNLIYILLSFSCMFAILSNARVLTQGFSGKGKLVGAAVAHIGFALLLVGAL
VAAATSKPVSINATNFIPVKDFEKVEKPGENMVLYKNEPKKMGRFTVTYTNDTTIAPNTY
YTLNFKVIDEKTGKLKEDFNLNPRVQINEKMGLIASPDTKHYLTYDVYTHITSAPDKKDA
HADSDAQSDEQNYKKPRVVTVSTGDTLHTSSGIITVKDLNFKPTAKSLALAQGDIAVGLP
LEINLNGKIYKTEPIFLVKGNNTFDFARNIPELGLRLRFTKILPDQKKVELQVFEKPQQS
KDWVVFKSIEFPYINLYWVGLIVMVIGFVISIIRRQKEIKSV
NT seq
2469 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacatacaattcacaggagaaaccctcctccccggcaaagttgggcagttttttatt
gttttagcgtttgccgctgcactactttcaacgatttcttatttctttgcgacccgcaat
aaagaccttgcagataaatcctggcaacgtttgggaagaatagcatttttaactaatctc
tttagtgtaattggaattggggtaacactgttttatctgatcctgaatcattataacgaa
tactattacgtttattcgcactcttcaaaaacacttcctgtatattatatcgtttccgca
ttctgggaaggacaagaaggtagtttctggctttgggcattctggcaagctattttagga
acaatactgatctggaaagcaaggacctgggaaaatggagtgatgactgttgttgccttc
tcacaggtatttttaacttctatgctattaggcgttcagatctttggtgaacgcattgga
agttctccttttatcctgttaagagatgcagtaaacctgaaagacatggcaccggtagta
tttgccgatgctgaaaattataaaaactatcttaagttcattactgatggaagaggctta
aacccacttcttcagaattactggatggtgattcacccgccaaccttattccttgggttt
gcgagtatgattgttccgtttgcctacgtaattactggcttatggcaaaaaagatataaa
gagtgggtaaaacctgctatgccatgggcactgtttgctgtgatggttttaggtacagga
attatcatgggttctttctgggcttatgaagcactgaatttcggtggtttctgggcatgg
gacccggttgaaaatgcgtcattaattccatggttaaccttaattggtgcagtccatgtc
atgattgctttcaaaaataccggtcatgctttctttacttctatcgcactcgtgttagtg
agttttatcctggtattatatgcttctttcttaaccagaagcggtattcttggagaaaca
tcagtacactccttcacagacctggggatgtttggtcacctgatcctttacaacgtagta
ttcctggctattccggtaatcctgattatcttacgctggaaagaattaccgattaccaat
aaagacgaagaaacctattcaagagaattctggatgttcattggtgcacttgtggtaaca
gttgcttgtatccaggttattttctctacctcagttccggtattcaataaagctttcgga
actaattttgcacccccgattgatgcgatcaagtattacaatcaatggcaggctccgttt
gctatcctgattactatgatatctggtttttctcaattcttaaaatacaaacgtaccgat
acccgtaaattctatagcagtctggtggctacactgatcattgcaattgtagttacagca
gggtttgtttatataaccaacgtctataacaacctgatttatattttactttcattcagt
tgtatgttcgctattttatctaatgcgcgtgtgcttacccaaggattcagtggcaaaggt
aaattagtaggagcagcagttgcgcatatcggtttcgccttgctattagtaggtgccctg
gtcgctgcggcaacaagtaaaccggtatctatcaatgcaacgaactttattccggtaaaa
gacttcgaaaaagtagaaaaaccaggtgagaacatggtgctgtacaaaaacgaacctaaa
aaaatgggccgttttacagtaacctatacaaacgacactacgatagcccctaatacttat
tatacactgaactttaaagtgattgatgagaaaacaggcaaacttaaagaagactttaac
ttgaacccacgtgttcagatcaatgagaaaatgggtctgattgcatctccggataccaaa
cattacctgacttatgatgtatacacgcacattaccagcgctcctgataaaaaggatgca
catgcagatagtgatgcacagagtgatgagcagaattataaaaaaccaagggtagttact
gtaagtactggggatactttacataccagcagtggtattatcactgtgaaggatcttaac
ttcaaaccaacagctaagagcctggctttagcacaaggtgatattgcagtagggcttcca
ctggaaatcaacctgaacggtaagatttataaaactgaaccaatcttcctggttaaagga
aataatacattcgattttgcacgtaatattcctgaattaggtttaagactgagatttacc
aaaatactccctgatcagaaaaaagtggaattacaagtatttgaaaaaccacaacaatct
aaagattgggtcgtatttaaatctatcgagttcccttatatcaatttatattgggttggt
ttaattgtaatggtgattggatttgtaatttctatcatcagaagacaaaaagagatcaaa
tcagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system