Pedobacter cryoconitis: AY601_0440
Help
Entry
AY601_0440 CDS
T04341
Name
(GenBank) Mtultidrug ABC transporter permease/ATPase
KO
K06147
ATP-binding cassette, subfamily B, bacterial
Organism
pcm
Pedobacter cryoconitis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pcm02000
]
AY601_0440
Transporters [BR:
pcm02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
AY601_0440
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
Peptidase_C39
ABC_membrane
SMC_N
ABC_ATPase
AAA_22
Guanylate_cyc_2
AAA_21
AAA_29
AAA_23
SRP54
nSTAND3
Zeta_toxin
AAA_30
RsgA_GTPase
SbcC_Walker_B
DUF87
Peptidase_C39_2
MobB
AAA_16
DUF5906
ATPase
AAA_14
NACHT
AAA_24
Pex24p
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMP97396
UniProt:
A0A127V7X7
LinkDB
All DBs
Position
497179..499386
Genome browser
AA seq
735 aa
AA seq
DB search
MFSKRNKFKFFHQLESIDCGPACLAMVASYHKKHFTLKELKKLCSITRMGVSVQDIITGA
QKIGFEAEALKITIEDLEKIPLPSILYWKQDHFILLHEIRNKKSGKNYFLADPGYGEIKL
DQETIIKEWLGTSDKGVAIVLQVAETNELNSSKLEKMRFKDNPLVKPIVAFVKENKLLYS
FTTLLLVLGLLANWAMPLVFRKIIDEGIINKSLQMVWILLLAQFGLFLGNFFSDSISHLI
LTKINFKLSLLLKNKLLNKLMRLPISYFDTRLNTDTLQRLSDQGKIQAFITWKGLELILN
FLNIIVFSTMLFFMNKIIFVIYIVLSILSFVWVSFFLKLRAILEYSMFLRQSENNNSSYE
FIMHMPEIKINGAQQNMIDKLLTIQEKLNKIELRSLFLNLYQVVGVSFISKLKEFVTIAF
CAFLIINGKMTLGSLLSITYILGELSRPIQNFINYVRDAQDADIAQKRVNDIYTEKDENE
SHHLALKDKIKSLRLDNVSFKYPGSFNPFVINQLSFDIPVNQITAIVGQSGSGKTTLLKL
LLSYYVPTGGSVLLNGTDLSSFNAEQWRERCGVVMQDGHIFSGTIAENIAFADPEIMPEK
VKEAARIACVDSFIELLPLGYNTKIGNVGIQLSGGQKQRILIARAVYKNPGFILLDEATS
SLDANNEKNIMDNLNEFFIGRTVVVIAHRLSTVKNANQIIVMNQGQIVEIGAHDELVSGK
KHYYELIKNQLELGN
NT seq
2208 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttttctaaaagaaataagtttaaattttttcatcagctcgaaagcattgattgtggg
ccggcatgtctggctatggtagctagttatcataaaaaacatttcactttaaaagaatta
aaaaaattgtgttctattaccagaatgggggtttccgttcaggatattattacgggtgca
caaaagataggctttgaagcagaggctttaaaaattacaatagaggatttggagaaaata
ccgctaccatcaattctgtactggaaacaagaccactttatattactccatgaaataaga
aataaaaagtcagggaaaaactattttcttgctgatccggggtacggggaaattaaacta
gatcaggaaaccatcataaaggaatggttagggacaagcgataaaggagtagctatagta
ttacaagtagctgaaactaatgaactcaattcttcaaagttggagaagatgcggtttaag
gataatccgctggtaaagcccattgttgcttttgtaaaagaaaacaaattattatactct
ttcacaacactgctactcgtattggggttattggcaaactgggccatgccattggttttt
cgcaagattattgatgaagggattatcaataaatctctgcagatggtatggattcttttg
ctggcccaatttggtttgttcctgggtaactttttctctgattcaataagtcatctgatt
ttaacgaagattaattttaagctaagtcttctgcttaaaaataagttgttaaataagctc
atgagacttcctattagttattttgatacgcgattgaatacggacacgctccaaaggtta
tctgatcagggcaagattcaggcatttataacctggaaaggattggaactaattttaaac
ttcctgaatataattgtctttagtacaatgttgttttttatgaataaaatcatatttgtc
atatacattgtacttagtattttatcatttgtctgggtcagtttctttctgaaactaagg
gcgatcctggaatattctatgtttttgaggcaatctgaaaataacaacagttcttacgaa
tttattatgcatatgcccgaaataaaaatcaacggtgcccagcaaaatatgatagataaa
ttgttgactattcaggaaaaactaaataaaatagaactcaggtcgctctttctgaatctg
tatcaggttgttggtgtaagttttatttctaagctgaaagagtttgttactattgcgttc
tgtgcttttttgatcattaatggcaaaatgactttaggctctttattgagcatcacttac
atactgggggaactttccagacctattcaaaactttattaactatgtcagggacgcgcaa
gatgctgatattgcacaaaaaagagtaaatgatatctataccgaaaaagatgaaaacgag
tcccatcatttggctttaaaagataaaataaaaagcctgagactggacaacgtatccttt
aaataccctggtagctttaacccatttgttatcaatcagctttcatttgatattcctgta
aatcagataactgcaatcgtaggccagagtggcagcggtaaaacgactttattgaaactg
ttattgtcttattatgtcccaactggtggatctgttttattaaatggaacagatttgtct
tcgtttaatgctgaacagtggagggaacgttgtggcgtagtgatgcaggatggccacatt
tttagtggtacaatagctgagaatattgcctttgctgatcctgaaattatgcctgaaaaa
gttaaagaggccgccaggattgcttgtgttgattctttcattgaactattgccattggga
tataatacgaaaatagggaatgttggtattcagttaagtggtgggcagaagcaacgtata
ctaatagcccgtgcagtgtataaaaatccaggttttatacttttagacgaagcaaccagt
tcactggatgctaacaatgagaaaaatataatggacaatttgaatgaattctttattggc
aggactgtggtagttatagcacacagattaagcactgtgaaaaatgctaatcaaattata
gtaatgaaccagggtcaaatagtggaaattggggctcatgatgagctggtatccggcaaa
aaacactactacgaattaataaaaaatcagttagaattgggcaattag
DBGET
integrated database retrieval system