Pedobacter cryoconitis: AY601_1887 Help Entry AY601_1887        CDS       T04341                                  Name (GenBank) TonB-dependent receptor   KO K02014   iron complex outermembrane recepter protein Organism pcm  Pedobacter cryoconitis Brite KEGG Orthology (KO) [BR:pcm00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02000 Transporters [BR:pcm02000]     AY601_1887 Transporters [BR:pcm02000]  Other transporters   Pores ion channels [TC:1]    AY601_1887 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  TonB_dep_Rec_b-barrel Plug CarbopepD_reg_2 CarboxypepD_reg Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AMP98795 UniProt:  A0A127VBY5 LinkDB All DBs Position 2171767..2174346 Genome browser AA seq 859 aa AA seqDB search MKKHLLIILSLLLTANFVFAQSAITGVIKSSNGVPVPHATLLIRGTKNSATADADGKFSI DSKQELPFYLRVSSVGYKSQDFQILKLQDTPFELVLIESALLDEIVVTSRRRSEVLQDVP IAITVIGGQAAENAGAFNVNRLKELVPSVQLYASNARNTTLNIRGLGSTFGLTNDGIDPG VGFYVDGVYQARPAATSTDFLDIEQIEILRGPQGTLFGKNTTAGAFNITTAKPSQTPSGK VELSFGNYNFMQAKTSVTGGVGKNLAARLSISGTQRDGTIFNTKEERRYSGQNNLGFKGQ FYYTPSDKLQILFSGDASIQHPAGYPLVIAGVTATERSPYRQYAKIVSDLGYQQPVADPK SRTINTNTPWKHDQSIGGLSVNVDYKIGNGTLTSTTAWRFWNWNPTNDRDFSELSALTKS QGTSRHDQYSQEVRYAGNLSEKVSGVIGVYFLGQNLKGLGQTEEVGKDQWRFVQTSNTGA QALYSTPGLLDGYGIKTNSTIKSLSAAVFAQVDWEIVNHLHVLPGLRYTYDKKDVDYDRT TYGGLQTSDPALLALKTAVYANQRFNTNVDNNNLSGNITVSYRPTTKLNAYGTFSTAYKP VGVNVGGLPTTATGEADLSVAVVKPEYVQHYELGLKTKPVKGAIVNVSAFNTDIKDYQTN VQSPQLGVNRGYLANAEKVRVKGLEVDGIYQIGRFLTLNAALAYLDGKYVKFTNAPLPLE ETGHTELVNGVATQAAFKDASGGKLPGISKWNVSGGAEFSNPGKLATTTGRYFIAADASY RSEYSSNPTPSRVLNVEGYSLLNGRLGFKSDKFSAFIWARNIANKNYYEQLQAAAGNSGL YAGVLGDPRTYGVTLRYNL NT seq 2580 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaagaaacatttactcatcatcctttcactcttgctaacggcaaattttgtctttgcc caaagtgcgataacgggcgttataaaaagtagtaacggcgttccagtaccacatgctaca ctattgatcagagggaccaagaattctgcaactgctgatgcagatggcaagttcagtatt gattcaaagcaagaacttccattttacttgcgtgtgagctcagttggttacaaatctcag gattttcagattttaaagcttcaggatacacctttcgaattagtgctgattgaaagcgca ttattggatgaaatcgttgttacctcaagaagacgttcagaggtgctacaggatgtgcct attgccattactgttatcggaggtcaagctgcagaaaatgcaggagcttttaacgttaac cgtttgaaagagctggttccttcagtacaattatatgcttcaaatgcaagaaatacgaca cttaatatcagggggctaggttcgacatttggcttaaccaatgatggtattgatcctgga gtaggattttatgtagacggagtttaccaggcgcgtccggcagctacttctactgatttt cttgacattgaacaaatagaaatactgcgtggcccgcaaggaacattatttggtaaaaac acaactgcaggtgcatttaacatcactactgccaagccatctcaaacaccaagcggaaaa gttgaattgagttttggaaactataattttatgcaggccaaaacatcggtaaccggaggt gttggaaaaaatcttgcagccagactatccatctcaggaactcaaagagatggcacaatt ttcaataccaaagaagaacgcagatatagcggacagaacaatcttggttttaaaggtcag ttctattatacaccttcagataagctgcaaatcttgtttagtggggatgcaagcatccag catcctgcaggttacccgctggtaattgcaggagtcactgcaacagaaagaagtccttac cgccaatatgctaaaattgtttctgacttaggctaccaacaacctgtagcagatcctaaa tccagaacaatcaatacgaatacgccttggaaacatgaccagtcaattggtggtttatct gtaaatgtagattataagataggtaatggaacgcttacttcaactacagcctggagattt tggaattggaatcctacaaacgacagggatttctctgaattatctgcattgactaaatct cagggaacatcccgccatgatcaatattcgcaagaagtaagatatgctggtaatctgtct gaaaaagtaagtggtgtaattggtgtatatttccttggtcagaatttaaaaggactaggt caaacagaagaagtaggtaaagatcagtggagatttgtacaaacaagtaatactggtgca caggcattatattcaacaccaggtttgttagatggctacggtatcaaaactaattcaact attaaatcattgagtgctgctgtattcgcacaggttgattgggaaattgtgaatcacctg catgttttacctggattaagatatacttatgataaaaaagatgtagactatgacaggaca acttatggaggcctgcaaacatcagaccctgctttacttgcattaaaaacagcggtttat gccaatcagcggtttaataccaacgtagataacaataatttgtctggtaatatcacagtt tcataccgccctaccactaaattaaacgcttatggaactttttctaccgcttataaacca gttggtgttaacgtaggcggcttgccaactaccgcgaccggagaggcagatttgtctgtg gccgttgtaaaaccagaatatgttcaacattatgagttaggtcttaaaaccaaacctgtt aaaggggcgatagtcaatgtcagtgcctttaatacagacatcaaagattaccaaacgaat gtacaatcacctcaattaggggtaaacagaggctatcttgccaatgcagaaaaagttagg gtgaaaggtttggaagttgatggaatttatcaaataggaagattcttaaccttaaatgct gctcttgcttatcttgatggcaaatacgtgaaatttacaaacgctcccctgccattagag gaaaccggacatacagaacttgtgaacggtgtagctacgcaggcagcatttaaagatgct tcaggaggcaagttaccaggaatatctaaatggaatgtttctggtggagcagagttcagc aatccaggtaaactggctactacaacaggcagatattttattgctgccgatgcgagttac cgttcagaatattcatcaaatccgacaccttcaagggtcttaaatgttgaaggctattcg ttattgaatggtagattagggtttaagtcagataaattctctgcatttatttgggcgaga aatattgcgaataaaaattattatgaacaattacaggcagctgcaggtaactctggctta tatgctggagttcttggtgatccaagaacttatggggtaacattacgttataatttataa

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