Pedobacter cryoconitis: AY601_2817
Help
Entry
AY601_2817 CDS
T04341
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pcm
Pedobacter cryoconitis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pcm02000
]
AY601_2817
Transporters [BR:
pcm02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AY601_2817
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
PEGA
Big_1
DUF7382
CooC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMP99699
UniProt:
A0A127VEH3
LinkDB
All DBs
Position
complement(3362448..3364913)
Genome browser
AA seq
821 aa
AA seq
DB search
MIKLLSIPFLFLICSLYFTIPAHGQQTSQTVKGTVIDDKGDPLPGSTIIVQGTSLTAIAD
VKGRYSVSLDPGNYTLRVSFLGYVSSHYKIKVVTGANITQNISLSADNSSLQQVEITGRK
ERTYKTKSTFIGNKTETDIKDLPQSVSYASKELMADQGAIRTGDVVKNFSGVSQFTFYDD
LTIRGFRVNGQSNTQLVNGLRTSTGFWKQPLTNYLERVEVLKGPSSALYGNASPGGVVNR
VTKKPLNETRRQLSMSLGSFNTLRGLADFTGPASKDSTLLYRINLGYEDAGSFRDLQFDK
NIVIAPSLSFVASEKTQINFDMVYNSSRSRLDRGQSVIGNDLYSTPQSLALSTANDFLNE
QTYIVTLSANHRFNENLSFNLAYSKTGYQEDLYEHRSANAFAKDKLGKDIPNLVNMQVFQ
RKRKRYIDNLSGYFNYNVKTGSVEHKIVVGYDYGSEKMPAGASQLTASGYRNATNTGTIA
SYVAKDSLKYLRDPKGNPVPNIPSFDLTNSINSQRMQDDSKAFFAPTTLAPTYYYLNAGY
VQDQIKLGRFQALLGIRYEYYTDFINYATSTEGKTHSSAWLPRLGLIYSATKNINVYGSY
VMGYNPQTAANLANPNAGGPFAPVTSNMIEFGAKSSWFDNRLAITTSIYQIEQRNTLYNA
NDLINPDLLRPVGKERARGFEFDITGRILPNWSILASYAYNDAKIVESLVPAELGLQKPN
APKNTANIWTRYNFISGQLSGFGFGLGSNYVGKRNLSINLSQTIPEYLLINAAAYYRVNK
VQIQVNANNITGKKYWVGGYDYIRLFPGAPSNYLLTLTYDF
NT seq
2466 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaacttttatctattccatttctatttttaatctgctcactttatttcactatt
ccagcgcatggacaacagacttcgcaaacggtaaaagggactgtaatcgatgacaaaggc
gatccgctgcctggttctactattattgttcaaggtacttcattaactgcaattgccgat
gtgaaggggcgttactccgttagtcttgatcctggaaactatactttacgtgtaagtttc
ctcggatatgtatcttcccactataagataaaggttgttacaggtgcaaacattacacaa
aatatatccctctcagccgataactcatccttacagcaagttgagataacagggcgtaaa
gaaagaacttacaaaaccaagtcgacctttatcggcaacaaaactgaaactgatattaag
gatctcccacaatctgtatcttacgcaagtaaagagttaatggccgatcagggggcaata
cgcacaggtgatgtcgttaaaaacttcagcggcgtaagtcagttcacattttatgatgat
ttgaccattagaggattccgtgttaacggccaaagtaacacgcagttggttaatgggctg
cgtacaagcaccggcttttggaaacaaccactgacgaactaccttgaacgtgttgaggta
ttaaaaggtccttcatcagcactatatggtaatgccagccctggaggtgtggttaacagg
gtaactaaaaagccactgaatgaaacccgccgtcagcttagtatgtcattaggcagcttc
aatacattacgtggtttggctgactttaccgggcctgccagtaaagatagtacgctgcta
tacagaataaaccttggttacgaggatgcaggatctttccgggatctgcagtttgacaaa
aatattgtaattgccccatctttatcattcgtggcatctgaaaaaacacagatcaatttt
gatatggtatataacagctctcgttcgaggctcgacagggggcagtctgttattggtaac
gatctttattctactccgcaatccctcgcgttaagtacggccaatgacttcctgaacgaa
caaacttatattgttacgctttcagccaatcaccgttttaatgaaaatttaagctttaac
ctggcctattcaaaaaccggttatcaggaagatctttatgagcaccgtagtgcaaacgct
tttgccaaagataagttgggtaaagatatacctaacctggttaatatgcaggtgttccaa
cgcaaacgcaaacggtatattgacaatttaagcggatactttaattacaatgttaaaacc
ggtagtgttgaacataaaattgttgttggttacgactatggtagtgaaaaaatgcctgcc
ggtgcctcacaacttactgcttctggttatagaaatgcgaccaatacaggcactatcgcc
agctacgttgcaaaggacagtttgaagtatctgcgcgaccctaaaggtaatcctgtacct
aacatcccatctttcgacttgactaattcgatcaattcacaacgaatgcaagatgatagt
aaggcattttttgcaccaacaactcttgcgccaacatactactatctgaatgcaggatat
gtacaggatcaaattaaattaggccgttttcaagcattgcttggtatacgttatgagtat
tataccgactttataaattatgcgacttcgacggaaggaaaaacgcactccagcgcctgg
ttaccccgtcttggattaatatatagcgcaacaaaaaatataaatgtatatggtagctat
gtgatgggctacaacccgcaaaccgcggctaaccttgctaatcccaatgcgggtggaccg
tttgccccggttaccagcaacatgatagaatttggtgctaaaagtagctggtttgacaac
cgtttagctattaccacctcaatttatcaaattgaacaaagaaatacgctttataatgcc
aatgacctcattaatcctgacctgttaagaccggttggtaaagaacgtgcccgtggtttt
gagtttgatattacgggtcgtatcttgccaaactggagcatattggcatcttacgcctat
aacgatgctaaaattgtagagagccttgtgcctgctgaacttggcttgcaaaagcctaat
gcaccaaaaaatacagccaatatctggacaaggtataactttataagtggacagttaagc
ggctttggttttggcttaggatcaaactacgttggcaaacgtaatttatctatcaatctt
tcccaaacgattcctgagtatctgttgattaatgctgccgcttattatcgtgttaataaa
gtgcagatccaggttaatgccaacaacatcacaggtaaaaaatattgggtaggggggtat
gattatatcaggctgttcccaggtgcaccctcaaactatttgttaacattaacatacgac
ttttaa
DBGET
integrated database retrieval system