Pedobacter cryoconitis: AY601_2991
Help
Entry
AY601_2991 CDS
T04341
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
pcm
Pedobacter cryoconitis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reg_prop
HATPase_c
Response_reg
Y_Y_Y
HTH_18
SGL
Beta-prop_LRRK2
HisKA
HTH_AraC
HTH_24
K319L-like_PKD
TetR_N
VPS11_N
HTH_8
PKD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMP99865
UniProt:
A0A127VEW3
LinkDB
All DBs
Position
complement(3592760..3596911)
Genome browser
AA seq
1383 aa
AA seq
DB search
MLNRVIFKRAYCLFLSAICILQAGYAQQQKINFTSLNSKDGLSSNTVNAILKDRYGLMWF
ATEDGLNKFDGTNFTVYKHKSDDSTGLQANDIRTLHEDKSGNLWVGSAGGSLSLYDRKKN
SFINFPANTAAGLSSDIVRSICSDYTGKIWVATFNGLDVVDPVSKKVRKFSIRSKNQQVF
PDKIISCLYEDRKRRMWIGTNNGLYLYNRKTTSFIFFQHSATNAASISDNYIAGIVEDRL
GNLWIGTKNGLSMLLPDGKGFQNLRHKPGDSQSLSSNTITSVVANATNQLWIGTDEGLNI
LDITTGEITKYMPDSRNTYSLTGKFINCMYIDKQGTYWVGPFRGGINKYDNNLNLFHLKQ
SNIFDQRGLNGSVVTSFAGYTPDEIFVGTDGGGLNLFNRKTELFRHINMPLANGSSSAGI
SIMVMEMTRSKKLYIGTYSKGLFVMDTGTEKIQQFKAGNRADELNSNDIFCVKEDSKGKI
WVGTNGGGVNILNSAHKVVFRYCENAKGANEAKYPINNFIRFIEEDDHGDMWIGSYGSGI
AVFNPLSQKFTQYDKASGKLPNNLTLCMLKDRAGDIWVGTFSGGLSLFDRKTKQFITFSE
KSGLNNATVYAIVEDLKGQIWVSTNKGISSFDRKTKKFTNYGIYNGVQNNNFVLGAGFSA
ADGEIFFGGAEGFNYFNPQYFKKNKNVPSVMFTDLRINNNSVKASDDGPIKDHISVAKEI
NLDYKQNFTLGYVSVNYTAPEQNKYSYRLEGFDKDWIEAGTSKSVSYTNLDPGDYVFHVK
ASNNNGLWNTAGTVINIHVKPPFWRTIYAYLFYVIVSIGSLLYSRHRGIQKLKKKFAEVQ
ERMKADQERKETERLNDLDKLKIKFLTNLSHEFRTPLSLIMGPVDKLLLEEKGAVDSSPL
VMIKRNARRLLNLVNQILDFRKMEEHELRLNSSDAELVPFIKEVLESFNDLSERKHIQLV
FKSQIREFYTSFDQDKIERVLFNLLSNAFKFTPAGGTITLEVEKSDRTITEEPGIIIKVS
DTGIGISADDKEKIFERFFQTDTAGTILNQGSGIGLSITKEFVKMHGGSITVQSEYGAGS
CFIIYLPFLPVEPIDEIRIDFSGAVKAESKPEVLKLQETLVDPVELTSILLVEDNEDFRF
YLKDSLKSFYKIYEASNGQEGWQKILAHHPQIIVSDINMPLMTGIELCCKVKSDKRTNHI
PIILLTALTGEDEQIRGLKTGANDYLTKPFNFEILNNKIKNLLFLNRTLKDTYTKQIKVQ
APELLIELHSDKLLNKVVLYIEENLTNPKLSVEDLSKHVGMSRGTLYYKILELTGLSPVE
YIRSVKLDKAIVLLEKSDLNVSQIAYMVGFATPTYFAKAFKAKFSIQPSEFKNLKRKAEV
VGH
NT seq
4152 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaaccgggtcatttttaaaagagcttactgcttatttctaagcgctatctgtata
ctacaagctggatatgcacaacagcagaaaataaatttcacctcgctgaattcaaaagac
ggactttcttccaatacagttaatgctattttaaaagaccggtatgggttaatgtggttt
gccaccgaagatggtctcaataaatttgacggaacgaattttacggtatataaacataaa
tctgatgattctaccgggcttcaggccaatgatatcaggacactgcatgaagacaaatca
ggtaatttatgggtgggcagtgcaggaggttcgcttagtttatatgacaggaaaaaaaac
tcttttataaatttccctgccaataccgctgctggcctgagcagtgatattgtccgcagc
atttgcagcgattataccgggaaaatatgggttgcaacttttaacggtcttgatgtagtt
gatccagtaagtaaaaaggtcagaaaattttctatccgttctaaaaatcagcaggtattc
cctgataaaataatcagttgtctttatgaagaccgtaaacgcaggatgtggatcggaacg
aataacggcctttacctgtataaccggaaaacgacttcatttatattttttcagcattcg
gcgacaaatgctgccagtatcagcgataactatatagccggaattgttgaagatcgtctc
gggaatttgtggataggtacgaaaaacggactcagcatgcttcttcctgatgggaaagga
tttcaaaatttaagacacaaacccggagatagtcagtcactgtccagtaatactataacc
agtgtagtagccaatgctacgaaccagttgtggattggtacagacgaaggcttaaatatt
ctggacattactaccggagaaattacaaagtatatgccggattcaagaaacacttacagt
ttgacaggcaagtttataaactgcatgtatatagacaaacagggcacctattgggttggc
ccttttcgcggaggcatcaataagtatgacaataatctgaatctgtttcacttaaaacaa
agtaatattttcgaccagcggggattaaacggttcagtggtgacttcctttgcaggatat
actcctgatgaaatctttgtgggaacagatggcggagggcttaatttgttcaaccgcaaa
acagaacttttccggcacatcaatatgcctttggcaaatggatcctcttcagctggcatc
tcgattatggtgatggaaatgaccagatctaaaaagctgtatatcggcacttattcaaaa
gggctgttcgtcatggacacaggaacagaaaaaattcagcagtttaaagcagggaaccgc
gcagatgagttaaattccaatgatatattctgtgtcaaagaagatagcaaagggaaaata
tgggttggtacaaatggcggtggagtcaatattttgaattcagcccataaagtagttttt
agatattgtgaaaacgcaaaaggggcaaacgaagccaaatatccgataaataatttcatc
agatttattgaggaagatgatcatggtgatatgtggataggttcctatggttcaggaatt
gccgtatttaatccccttagccagaagtttacccagtatgataaagcttctggtaaatta
ccaaataatctgacattatgtatgctaaaagaccgtgccggggatatctgggtagggaca
tttagcggaggcctgagccttttcgatcgtaaaacaaaacaatttattacgttttctgaa
aaaagcgggctgaataatgcaaccgtttatgcgatagttgaagacctgaaagggcaaatt
tgggtgagtacaaataaagggatcagtagttttgaccggaaaactaagaagtttaccaat
tatggcatttataacggtgtccagaacaataatttcgtgctcggagctggcttcagtgct
gctgatggagagattttttttggtggtgccgaaggtttcaactactttaatccgcaatac
tttaaaaaaaacaaaaatgtcccgtccgtcatgtttactgatttaaggataaataataat
tccgtaaaagcatcagatgacgggcctattaaggatcatatttctgtagctaaagagatt
aatctggattataaacaaaattttacacttggttatgtgagtgtaaactataccgctccg
gaacaaaataaatattcctatcggctggaaggatttgataaggactggattgaagcagga
acttctaaatccgtatcctataccaatcttgatccgggtgattatgtctttcatgtgaaa
gctagcaataacaacggactatggaataccgcaggaacggtaatcaacatacatgtaaag
cctccgttctggcgtacaatatatgcttatctcttttatgtaattgtcagcattggatca
ctgttatatagcaggcacagagggattcagaagttgaagaagaagtttgccgaagttcag
gaacgcatgaaagcagaccaggaaagaaaggaaaccgaacgtttaaatgatttggataaa
cttaagataaagttcctgacaaatttaagtcatgagttccggactccgctttcattaatt
atggggcccgttgataaattattactggaagagaaaggcgccgttgatagcagcccgctg
gtcatgattaagcgaaatgcaaggagactgttaaatttagtaaatcaaatccttgatttc
agaaagatggaagaacatgagctgaggttaaattcatctgatgcagagcttgtccctttc
attaaagaagttttggaatcgtttaatgatctgagtgagcgcaaacatatccaactggta
tttaagagtcagatcagagagttttacacttcctttgatcaggataaaattgagcgcgta
ttatttaacttattgtcaaatgcctttaaatttaccccggcaggtggaacgataacttta
gaggtggagaaaagtgaccggactattactgaagaaccgggtataatcattaaagtgtca
gatacaggtattggcattagtgctgatgataaagagaaaatatttgagcggttttttcag
acggatacagccggtactattctcaatcagggcagtgggattggtttgtcaatcacgaaa
gaatttgttaaaatgcatggtggcagtataactgttcaaagtgaatatggggcaggaagt
tgttttattatttatcttccatttttaccagttgaaccaatagatgaaatcaggatagat
ttttcaggtgctgttaaggctgaatcgaaacccgaagtgcttaagctccaggaaacactt
gttgatccggttgaattaacttccatcttattggtagaagataatgaggatttcagattt
tatctgaaagatagtttaaaatccttctataagatttatgaggcatcaaacggacaggaa
ggctggcaaaaaatactggcgcatcatccgcaaattattgtaagtgatatcaatatgcct
ttaatgaccggaattgagttgtgctgtaaggtgaaatcagataagcgtaccaatcatatt
ccaattatattgttgactgctttaactggagaagacgagcagatcagaggattgaagacc
ggtgctaatgattatctgactaagccatttaattttgagatccttaataataaaattaaa
aatctgttgttcttaaacaggactttgaaagatacttataccaaacagatcaaggttcag
gcgccagaattgcttattgaattgcatagcgacaaattattaaataaggtcgtattgtat
attgaagaaaacctcaccaacccgaaactctcggtggaggatttaagtaaacatgtcggg
atgagcagaggcacactgtactataaaatactggaattaacaggactctcaccagttgaa
tatatccggtctgttaagcttgataaagccattgttttgctcgaaaagagtgaccttaat
gtttcacaaattgcttacatggttggttttgccacacctacttattttgcaaaagctttt
aaagctaagttcagcattcagccttctgaatttaaaaatttaaaacggaaagcagaagtc
gtgggacattag
DBGET
integrated database retrieval system