Pedobacter cryoconitis: AY601_3350
Help
Entry
AY601_3350 CDS
T04341
Name
(GenBank) Amino acid transporter
KO
K03294
basic amino acid/polyamine antiporter, APA family
Organism
pcm
Pedobacter cryoconitis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcm00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99977 Transport
AY601_3350
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AA_permease_2
AA_permease
DUF4748
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMQ00218
UniProt:
A0A127VG66
LinkDB
All DBs
Position
complement(3991522..3992934)
Genome browser
AA seq
470 aa
AA seq
DB search
MNKEIEDSSFKRELGLLDGTMLVVGSMIGSGIFIVSADIARQVGSAGWLILIWVLTGLVT
VVAAVSYGELSAMFPKAGGQYVYLKEAYNKLIAFLYGWSFFAVIQTGTIAAVGVAFSKFA
AYLYEPLSDTNILYSLGSFHLNAAQLVSIVTIVLLTYINSRGVRDSKILQTFLTIIKIFS
LLGLIAGGFLIAANTQVWNANWADAWNTRAFDAQNGSWVSIGGTALLSGIAAAMVGSLFS
SDAWVGVTFIAGEIKKPERNVGLSLFFGTFIVSVIYISANLMYISVMPLNEIAFAKSDRV
AVAAAQYIFGDVGTVTIAVMIMISTFACNNGLIMAGARVYYTMAKDGLFFKKAALLNKSS
VPGWALWFQCIWASFLCLTGKYGDLLDYVVIIVMIFYILTIYGIFILRRKRPDLVRPYRA
FGYPVLPALYMVVAAAICVALLITKFSTCGWGVLIMLAGIPVYFFSKPKG
NT seq
1413 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaagaaattgaggatagctcttttaagagagagcttggtcttttagacggaact
atgcttgttgtaggttccatgatcggatcggggatatttattgtaagtgctgatattgcc
aggcaagtgggctccgcaggctggctcatcctgatctgggtgttaacaggattggtaact
gtagttgctgcggtaagttatggggagctgagtgcgatgttcccaaaagcgggtggtcag
tatgtttatttgaaagaggcgtataataagctgatcgcgtttttgtatgggtggagcttt
tttgcagtcatccagacaggaacaattgctgcggtgggggtggctttttctaagttcgct
gcttatttgtatgagcctttgagtgatactaatattttatatagtttagggtcttttcat
ctgaatgcggctcagctggtttcgattgtgaccattgtgttgctgacttatatcaatagc
aggggggtgagggatagtaagatactccagactttcctgaccattattaagattttttct
ttacttggtttaattgctggtggttttttaattgcggcaaatacgcaggtgtggaatgcg
aattgggctgatgcatggaatacgagagcttttgatgcacaaaatggttcgtgggtgtct
attggtggtactgctttgctctctggaattgctgcggcgatggtgggttctcttttttcg
agtgatgcgtgggttggggtaacgtttattgctggtgagattaaaaagcctgagcgtaat
gtggggctgagtttgttttttgggactttcattgtgagtgtgatttatatttcagcgaat
ttgatgtatatctctgtgatgcctttaaatgagattgcttttgcgaagtctgatcgtgtg
gctgttgcggcggcacaatatatttttggtgatgtgggtacggttactattgctgtaatg
atcatgatttcaacttttgcttgtaataatgggttgatcatggctggggcaagggtttat
tatacgatggcgaaggatgggttgttttttaagaaggcggctttgttgaacaagtctagt
gtaccgggatgggccttgtggttccagtgtatttgggcttcttttctttgtttgacgggt
aagtatggtgatttgctggattatgtggtgatcattgtcatgattttttatattctgact
atttatgggatttttattttaagaaggaagcggcctgatttggtacgtccgtatagggcg
ttcggttatccggtgttgccggctttgtatatggtggtggctgcggcaatttgtgtggcg
ctgttgattacgaagtttagtacgtgtgggtggggggtgttgatcatgctcgcaggtata
ccggtttatttcttttctaagccgaagggataa
DBGET
integrated database retrieval system