Pedobacter cryoconitis: AY601_4265
Help
Entry
AY601_4265 CDS
T04341
Name
(GenBank) Histidine kinase
Organism
pcm
Pedobacter cryoconitis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Response_reg
CHASE3
HATPase_c
GAF_2
HisKA
GAF
HAMP
OKR_DC_1_N
GAF_3
PDE8A_N
GAS
Cons_hypoth95
UPF0242
MFD_D3
DUF2393
RNase_Y_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMQ01114
UniProt:
A0A127VIF8
LinkDB
All DBs
Position
4982543..4986136
Genome browser
AA seq
1197 aa
AA seq
DB search
MIKKTLKKNLRFGLGLSLLLLFISSFASYISISNLIKNSDLVSHSNAVIRHTDSVLSVLK
DAETGQRGFLLTGDEVFLEPYNGAKAGAVLLLDTLQRQTTDNDAQQANIGKLREIIEGRL
GILDKTIAIKRKGGAVSIGDLLTGKSYMDKARDVIKTMQGEEQSLLARRTASQSKLADFT
PILIILAAILAILITIFFYRRVSTDFDARIRLQEELEATNKEVDRRIQAIQGIAAQISSG
NYQIRLDEASEDGLGRLAVSLNSMAESLQYSFSLLADKEWLQSGIANLNDKMVGEKNVET
LANDILDNIIQHTSAQVAAFYLLENDRELHLAGSYALLADRQKRTLKDGEGLVGQVLRSG
KQILLNDIPDGELTISYAAGNTKPKNIVAVPIIRDNIIVGVMEFGSLNTFSQLQLDFFNN
IATNIGVAVHVAQNRKKLQEFLEETQAQAEELQAQHSELEGLNAELEAQTQKIQTSEEEL
RVQQEELLQSNQELEERTTLLEEKNQMIHEHNVEIQQKSEQLEQSTKYKSEFLANMSHEL
RTPLNSILLLSKLMSDNEELDPEYIEYAEVIQSSGQGLLGLIDEILDLSKIEAGKMKLEL
ADISLNEVASDMRSLFNPIAKNKNLEFKIEQESALPMLHTDKMRLEQILKNLLSNAIKFT
AKGSVILNIHSDQANNAMIFKVTDTGIGIPAAKQGLVFEAFQQADGSTRRKFGGTGLGLS
ISRELAKLLGGEIELTSAENTGSTFTLILPIDGIAAELEEEIHAIYDYSDVEVVETTGTV
LPERYTVDHIPQEIEDDRATIVKGDKVILIIEDDTSFAKALLTFTRKRNYKGIVAVRGDI
GIELANHFNPLAILLDIQLPVKDGWQVMEELKANPKTRPIPVHIMSSLEVKKESLLKGAV
DFINKPVALEHMQQIFQKLEHALSRHPKKVLIVEENQQHAKALSYFLSNHAIQTEVVNNV
AESVDALQRKEVDCVILDMGIPDKNAYLTLETIKKSEGLENLPIIIFTGKNLSQGEERRI
KQYADSIVVKTAHSYQRILDEAGLFLHLVEEKSIESRNKKSTETLGGLYEVLHNKTVLIA
DDDVRNIFSLTKALEQHKMKVLAATDGKEALQLLKENPSIDLVLMDMMMPEMDGYESTKE
IRKISAFKHLPILAVTAKAMMGDREKCIAAGASDYISKPVDVDQLISLLRVWLYDKN
NT seq
3594 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcaaaaaaacattaaaaaaaaacctgcgctttggactggggttatctttattattg
ctttttatcagttcgtttgcttcctatataagtattagtaacctgattaaaaattcagat
ctggtttctcatagcaatgctgtaatcaggcatacggatagtgttttatccgttttaaaa
gacgcggagaccggacaacggggatttctgctcacaggagatgaagtttttcttgaacct
tataacggagctaaagctggagcggttcttttactggatactctacagcgtcaaactact
gataatgatgcacaacaggctaatatcggtaaattaagagaaattattgaaggccgtttg
ggtatccttgataaaactatagccattaaaaggaagggtggggctgtaagcattggtgac
ctgcttaccggcaaatcttatatggataaagccagggatgtaattaaaactatgcagggt
gaagaacagagtttactggccaggcgtactgcaagtcagagtaaactggctgattttacg
ccaatcttaatcattttggcagcaatactggctattttaattaccatcttcttttaccgc
agagtttcgacagatttcgatgcaagaataagattacaagaagagctggaagcaacgaat
aaagaagttgatcgccggattcaggcgattcagggaatagctgctcagatttccagtgga
aattatcagatcagactggatgaagcctcggaagatggtttaggaagattggcagtctct
ctgaactcaatggcagaatctttacaatactctttctctttactggccgacaaagaatgg
ttgcaatctggtattgcaaacctgaacgataaaatggttggcgagaaaaacgtagaaacg
ctggctaacgatattttagataatattattcagcataccagtgcacaagtagcagcattt
tatcttttagaaaatgaccgggagctgcatttggctggaagttatgccttgctggcagat
cggcagaaaagaacgctgaaagacggggaaggactggttggtcaggtattaagatctggt
aaacagattttgctgaatgatattcctgatggagagctgaccattagttatgcagctgga
aatacaaaacctaaaaatattgttgcagtacctataatcagggataatattattgtgggt
gtaatggaatttggctctttgaatactttcagccaattgcagcttgattttttcaataac
atcgcgactaatattggggtagctgttcatgtggcacaaaaccgtaaaaaattacaagaa
ttcctggaagaaacgcaggcacaggcagaagaattacaagcgcagcacagtgaactggaa
ggcctgaatgctgaattagaagcacaaactcaaaaaatacaaacttcagaagaagaactt
cgggtacaacaggaagagcttttacaaagtaaccaggaactggaagaaaggacgactttg
ctggaagagaaaaatcagatgatccatgaacataatgtggagattcagcaaaaatctgag
cagctggaacaaagcacaaagtataagtcagagttccttgcaaatatgtctcatgaatta
aggacaccgctgaattcaattttgctgttgtctaaattaatgtctgataatgaagaactg
gatccggaatatattgaatatgctgaggttattcagagttcggggcaaggcttactaggt
ttgattgacgaaatcctggatctctctaaaatcgaagcagggaagatgaaattggaactg
gcagatatcagcttaaatgaagtggcttcagatatgcgttctttatttaacccgatagcg
aaaaacaagaacctggagtttaagatcgagcaggagagtgcactaccaatgcttcatacc
gataaaatgcgtctggaacagattttaaagaatctattgtccaatgcgattaagtttacg
gccaagggaagtgtaatcttgaatattcatagcgatcaggcaaataatgcaatgatcttt
aaggtaacggatacgggaattggtattcctgcagctaaacaaggactagtttttgaagcc
tttcaacaggccgatggatctaccaggaggaaatttggtggaacaggacttggactttca
atcagcagagaactggctaagttattaggtggtgaaattgaattgacaagtgcagaaaat
acgggtagtacgttcaccctgattttacctatagacggtattgcagccgaactcgaagaa
gaaattcatgcaatttacgattacagtgacgttgaggttgttgaaacaacaggaacagta
ttacctgaacgctatacagtagaccatattccgcaggaaattgaagatgaccgtgcaact
attgtcaaaggtgataaggttatcctgattattgaagatgatacttcttttgctaaagca
ttgttaacctttacccgcaaaagaaattataaagggatcgttgctgtaagaggtgatatt
ggtatagaactggctaatcactttaatcccttagcgatcttgctggatatacagctaccc
gtaaaagatggatggcaggtaatggaagaattgaaagcaaatccgaaaacaagacctatt
cctgtacatattatgtcttctctggaagttaaaaaggaaagtttgttaaaaggagctgtt
gactttatcaacaaacctgtcgcattggagcatatgcagcagattttccaaaagctggaa
catgctttaagccgtcatcctaaaaaggtattgattgtagaagaaaatcagcagcacgca
aaagcactaagctactttttaagtaaccatgccatacaaactgaggtcgtgaataacgtt
gcagaaagtgttgacgcattgcagcgcaaagaagtggactgcgtaatcctggatatgggt
attcctgataaaaatgcctacctgactttagaaacgattaaaaaaagcgaaggattagaa
aatcttcctattattatttttacggggaaaaacctgtctcagggcgaagaacggagaatt
aagcagtatgcagattctattgtggtgaaaacggcgcactcttatcagcgtattctggat
gaagcaggtctttttctgcatttggtagaagagaaatctatagaaagcaggaacaagaaa
tcaactgaaactctgggggggttgtatgaagtactgcacaataagacagtattgattgct
gatgacgatgtcaggaacatcttttccctcactaaagcattggaacagcataagatgaaa
gtattagcagcaactgatggaaaagaggcgctacagttacttaaagagaatccatcgata
gatcttgtgcttatggatatgatgatgccagaaatggacggatatgaaagtaccaaagaa
atccgtaaaataagcgcgtttaaacatttacctattttagctgttacagcgaaagcaatg
atgggagatagagagaaatgtatcgctgcaggtgcatctgactatatttccaagccagtc
gatgtagaccagctgatttcgttactgcgtgtatggctttatgataaaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system