Pseudophryne corroboree (corroboree frog): 134914642
Help
Entry
134914642 CDS
T11513
Name
(RefSeq) fibrillin-2-like
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
pcob Pseudophryne corroboree (corroboree frog)
Pathway
pcob04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcob00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
134914642
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pcob00536
]
134914642
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pcob00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
134914642
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
TB
hEGF
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_Teneurin
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
134914642
NCBI-ProteinID:
XP_063776133
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(873686378..873939620)
Genome browser
AA seq
2876 aa
AA seq
DB search
MGVIWLAKFMLGCTALWYVEQAQGQLEFSDQQAYEERTAQRVRRRGQDTLRGPNVCGSRF
HSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNTCGDGFCSRPNMCTCSNGQLSPNCGAGAVMNCNVRC
MNGGTCSDDSCSCQKGYTGTHCGQPVCENGCQNGGRCIGPNRCACVYGFTGPQCERDYRT
GPCFTQISNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATIGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIPNIRTGA
CQDVDECQAIPGLCHGGNCINTVGSYECKCPAGHKQSETSQKCEDIDECSTIPNVCDGGE
CTNTAGSYVCICPRGFTSSIDGSRCIDQRTGSCFSALIGGRCSGELHGQYTKGQCCCDAG
RCWAIGQIPEMCPVRGSDEYRRLCIEGQPLGPSYPGTYPVGPGGIGPGGIGPGGIGPGGN
GHGGVGPGGFGPFVVGPNGQGTLPGLPSVGTEIGTATLNQTGDICKHFTNLCQNGRCIPT
PSSYRCECNMGYKQDSRLECIDVDECSSSPCIHGDCVNTQGSYHCRCHDGFQSNPTKQAC
IDIDECIMNGVMCRNGRCVNTEGSFQCICNAGFETTPDGKNCVDHDECATTNMCLNGMCI
NEDGSFKCICKPGFVLAPNGRYCVDVDECQTPGICMNGRCINTEGSFRCECLGGLTIGVD
GRVCVDTHMRSTCYGAIKKGTCARPFPGAVTKSECCCASPDHGFGEPCQPCPAKNSAEFQ
ALCSSGIGITADGRDINECALNSEICPNGICENLRGSYRCICNVGYESDTSGKNCVDVDE
CAVNRLLCDNGLCRNTPGSYTCTCPKGYVFKPESETCEDVNECASNPCVNGVCRNNAGSF
VCECSFGSKLDPTGTICVDSMKGTCWLNIQDGRCEVNINGATLKSECCATLGAAWGSPCE
RCEIDSACPRGYSRKKGVACEDVNECEVFPGVCPNGRCVNTAGSFKCECPEGLTLDGTGR
NCVDIRVEQCYMKWDEDECTAPLPGKYRIDMCCCSVGAAWGVDCEECPKPGSEEYKTTCP
RGPGFANRGDILSGRPFYKDVNECKVFNSLCSHGTCRNSIGSFRCICDSGFALDAEERNC
TDIDECRISPDLCGHGTCVNTPGSFECECFDGYESGFMMMKNCMDIDECERDPLLCRGGT
CINTDGSFECICPLGHELTTEGNACVDINECSLSDNLCRNGRCVNMIGTYQCSCDSGFKP
TPDRQGCIDIDECTIMNGGCDTQCTNSEGSYECSCSEGYALMPDQRSCADIDECEDNPDI
CDGGQCTNIPGEYRCLCFDGFMASLDMKTCIDVNECDLNPHICLHGECENTKGSFICHCQ
LGYFVKKGNTGCTDIDECEVGAHNCDVHASCVNVPGSFKCKCRTGWVGDGLKCVDLDECS
TEDHNCNVNANCVNTPGSYRCTCNEGFNGDGFTCSDVDECADNVNLCENGHCLNAPGGYR
CECEMGFTPTEDSKACQDIDECTFQNICVFGTCQNLPGMFRCVCDDGYELDRSGGNCTDV
NECADPVNCINGLCVNTPGSYLCNCPQDFELNPTGVGCVDTRVGNCYLETLTRGDAGLAC
SAEIGVGVTRASCCCSLGRAWGNPCESCPLANSTEYKTLCPGGEGFRPNPITVILEDIDE
CQELPGLCQGGNCVNTFGSFQCECPLGYYLNEDTRICEDIDECSAHIGICGPGTCYNTLG
NYTCVCPPEYMQINGGNNCMDMRKSVCYRNYNDTCENELSINMTKKMCCCSYNIGKAWNK
PCEPCPVTASPEYQILCGNQAPGFIIDIRTGKPMDIDECSEIPAICTNGVCINQIGSFRC
ECPMGFSYNNILLICEDIDECSSGENLCQINADCINIPGSYRCECSSGYKLSPSGACVGR
NECNEIPNVCSHGTCMDTTGSYICICHNGFKASGDQTMCMDIDECDRQPCGNGTCKNTVG
SYNCLCFPGFELTHNNDCMDIDECSSLVGQVCRNGQCINNVGSFQCLCHEGYEITPDGKN
CVDINECISLPGTCSPGTCHNLEGSFRCICPPGYAVQNDNCIDINECDDEPNICLFGTCT
NTPGSFQCVCPPGFVLSDNGRRCFDTRQSFCFTRFDNGKCSVPKAFNTTKARCCCSMMPG
EGWGDPCELCPQEGNLAFPELCPYGHGAIPNIGDTREDVNECSENPGICVNGICINTDGS
FRCECPFGYNLDFTGVNCVDTDECSIGNPCGNGTCTNVVGGFECACDDGFEPGPMMTCED
INECTNPLLCAFRCINTYGSYECTCPSGYTLREDRRMCKDLDECAEGLHDCESRGMMCKN
LIGTFMCICPPGMQRRPDGEGCMDENECRKPGICPNGRCVNTIGSYRCDCNDGFQVSGSG
TECIDTRQGSCFTEVLQTMCQLSSTNRNMVTKSECCCNLGRGWGNQCELCPLPGTAPYKK
MCPHGPGFTTDGRDIDECKVLPNLCKNGQCINTIGSFRCHCNLGYTTDITGTTCVDLDEC
AQSPKPCNFICKNTEGSYQCSCPRGYIMQEDGKTCKDLDECSTKQHNCQFLCVNTIGSFN
CKCPPGFTQHQSSCIDNNECSAQPSLCGARGMCQNNPGSFACECQKGFSLDNSGSNCEDV
DECDGSHRCQHGCQNVLGGYRCGCPQGYVQHYQWNQCVDENECSSQSTCGSASCYNTLGS
FKCICPSGFDFDQPFGGCQDVDECSSSGGNPCSYGCSNTDGGYQCGCPGGYFRAGQGHCV
SGMGFGKGSYLPAPAEEDEENILSPENCYECKINGYPKRGRQRRSTNETSEHENHISMAS
VDIDAPLKMSLNISELINKQHIMELLPALVPLENHVRYIISHGNEEGIFRIHQKDSLSFL
HLGRKKVTQGTYNLEIVSMPLYRKKELQKLEDEKDSNYLSGEIGQALKMKLRIHLY
NT seq
8631 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggggtaatatggctggctaaattcatgctgggatgtacagcactatggtatgtggag
caagctcagggacagctggagttcagtgaccagcaagcctatgaagaaaggacagcacaa
agagtcagaaggagaggacaggacacgttgagaggaccaaatgtttgtggatctcggttt
cactcgtactgttgtccagggtggaaaacattaccgggcggaaaccagtgtattgttcca
atctgccggaacacctgtggagatggattttgttcaagaccaaatatgtgtacatgttca
aatggacagctgtctccaaactgtggggctggagcagttatgaattgtaatgtgcgttgc
atgaatggagggacctgtagtgacgattcatgttcctgtcagaagggatacactgggact
cactgtggacaaccggtctgtgaaaacgggtgtcagaatggaggacgctgcattggaccc
aacagatgcgcctgtgtttacggctttactggaccacaatgtgaaagagattaccggacc
ggaccatgcttcacgcaaataagcaaccagatgtgtcagggacagcttagtggtattgta
tgcacaaagaccttgtgctgcgccaccattggtcgtgcctggggtcacccctgtgaaatg
tgccctgcccaaccacacccatgtcgtagaggattcattccaaatatccgaaccggagcc
tgtcaagatgttgatgaatgtcaagctatacctggactgtgccatggtggcaattgcatc
aacacagtgggatcctatgagtgtaaatgtccagctggccacaaacagagcgagacctcc
cagaagtgtgaagatattgatgaatgcagtacaattcctaacgtgtgtgatggaggggaa
tgcacgaatacagctgggagctacgtttgcatatgtcctagaggattcacttcaagtatt
gatggatctcgctgcattgatcagaggactggcagctgcttttctgctttaattgggggc
cgatgctctggggaacttcatggccaatacacaaaaggccaatgctgctgtgacgctggg
cgatgctgggccattgggcaaatccctgagatgtgtccagtcaggggctctgatgaatac
cgaagactttgcattgaaggtcaacctctaggcccttcataccctggaacctatcctgtt
ggccctgggggcattggacctggaggaattggacctggaggaattggacctggtggaaat
ggccatggaggagttggacctggtggatttggcccctttgttgttggacctaatggacaa
ggaacactaccaggcttgcctagtgtgggcaccgaaattggaactgcaacattaaaccag
actggagacatttgcaaacactttactaacctgtgccaaaatgggcgttgtatccctaca
ccgtccagttatcgatgtgaatgtaacatgggttataagcaagacagccgactggaatgt
atagatgtggatgagtgctcgagcagtccatgtattcatggagactgtgtgaacacacaa
ggttcttaccactgtaggtgccacgacggattccagagcaaccccaccaaacaagcatgc
attgacattgatgaatgtatcatgaacggagtaatgtgccggaacgggcgttgtgtaaac
acggagggtagtttccagtgtatctgtaatgcaggctttgagactaccccagatggaaag
aattgcgtagatcacgatgagtgtgcgaccacaaacatgtgcttgaacgggatgtgcatc
aatgaagacggcagctttaagtgcatctgtaaaccaggctttgtattggcaccaaatgga
cgctactgtgttgatgtggacgaatgccagacaccaggaatctgtatgaacggacgctgc
ataaacacagagggttcattccgctgtgagtgcttaggtgggctgaccatcggcgttgat
ggacgagtttgcgtggacacccacatgcgtagtacctgctatggagccattaaaaagggc
acatgtgcccgccccttccctggtgctgttaccaaatctgaatgctgttgtgcaagccct
gaccatggatttggagagccctgccagccttgccctgccaaaaactctgctgaattccag
gctctttgtagcagcggcattggaataactgcagatggcagagacattaatgaatgtgcc
ttgaactctgaaatctgtcccaatggcatctgtgagaacttacgtggcagctaccgctgt
atttgcaatgttggttatgaatcagacacaagtggaaaaaactgcgtggatgttgatgag
tgtgccgtgaaccgcttgctttgtgacaatggcttgtgccgtaatacccctgggagctac
acctgcacctgccccaagggttatgtctttaagccagagtcagagacctgtgaagatgta
aatgaatgtgcctccaatccctgcgttaatggtgtctgcaggaacaatgctggctccttt
gtgtgtgagtgctcatttggaagcaaactggatcctaccgggactatttgtgtggacagc
atgaaaggaacttgttggttaaacatccaagatggccgatgtgaggtgaacatcaatgga
gccactctgaagtctgaatgctgtgcaactttaggagctgcatggggaagcccttgcgag
cgctgcgagattgattcagcatgtcctagaggttactccaggaagaaaggcgttgcatgt
gaagatgtcaatgagtgtgaggtcttccctggagtatgtcccaatggacgctgtgtgaat
actgctgggtctttcaaatgcgagtgtccagaaggcctgactctggatggaactggcaga
aactgtgttgatatacgtgttgagcagtgctacatgaaatgggatgaggatgaatgcaca
gctcctttgcctgggaaatacagaattgatatgtgctgctgctctgtgggtgctgcctgg
ggcgttgactgtgaggagtgccctaaacctgggagtgaggaatataagaccacctgtcca
agaggtccgggctttgctaacagaggcgatattctttctggtcggccgttctacaaagat
gtgaatgaatgtaaagtgttcaacagcttgtgtagtcatggaacatgccgaaacagcatc
ggaagcttcaggtgcatctgtgacagcggttttgctctggatgctgaggaaaggaactgt
acagatatagatgaatgcagaatttctcctgacctatgtggacatgggacgtgcgtcaat
actcctgggagcttcgagtgtgaatgttttgatggttacgagagtggcttcatgatgatg
aagaactgcatggatattgatgagtgtgagagagacccactgctgtgtagaggaggcacc
tgtattaacactgacggcagctttgaatgtatatgtcctcttggtcatgagctgactacg
gaaggcaacgcctgtgtggatattaatgagtgttcgttgagcgacaacctctgcaggaac
gggcggtgtgttaacatgattggaacttaccagtgttcttgtgattctggcttcaagcct
actcctgatcggcagggctgcatagatattgatgagtgcacaatcatgaatggaggatgc
gacacccagtgcactaactcagaaggcagctatgaatgcagctgtagtgaggggtatgcg
cttatgccagaccagcgatcctgtgcagatattgatgaatgtgaggacaacccagacatc
tgtgacggaggacaatgtacaaatatccctggagaatatcgctgcttgtgcttcgatggc
ttcatggcctctctagatatgaagacatgtatagatgtcaatgagtgtgacctgaacccc
cacatctgcctacatggggagtgtgagaacaccaaaggctccttcatctgccactgtcag
ttgggttactttgtgaagaagggtaatacaggatgcacagatatcgatgaatgtgaagta
ggggcacataactgtgatgtccatgcatcctgcgttaatgttcctggaagttttaaatgc
aaatgccgaactggctgggtcggagatggactgaaatgtgttgatcttgatgagtgctcc
actgaagaccataactgcaatgtgaacgctaattgtgttaacacccctggctcataccgg
tgcacatgtaatgagggattcaatggggatggctttacttgctcagatgttgatgagtgc
gcagacaatgttaacctttgtgagaatggtcactgcttaaacgcccccggaggttaccgc
tgcgaatgtgagatgggatttactcctacagaagacagcaaggcttgtcaagatatcgat
gaatgtacgttccagaatatctgtgtctttggaacttgccagaatctgcctggaatgttc
cgctgtgtctgtgatgatggctatgagctggatagaagtggaggaaactgcactgatgta
aacgagtgtgcagacccagtgaactgtatcaatgggctgtgtgttaacacaccaggaagc
tatttgtgtaactgcccgcaggactttgagctgaatcctactggcgtgggctgtgttgat
acacgagttgggaactgctacttggaaactctgacaagaggagatgctggccttgcttgt
agcgctgagattggagttggcgttacaagggcatcctgctgctgctctttgggacgtgct
tggggcaacccctgtgaaagctgccccctggccaactccaccgaatataagaccctgtgt
ccgggaggagagggattcagaccaaaccccataacagttatattagaagatattgatgag
tgccaggaactacccggtctctgccaaggtggaaactgtgtgaacacctttgggagtttc
caatgtgagtgcccccttggctactatctgaatgaggacacccgcatctgtgaagatatt
gatgaatgttctgctcacattggcatctgtggtcctggtacttgctataatacattaggg
aactacacctgtgtttgcccaccagagtatatgcaaatcaacggaggaaacaactgcatg
gacatgaggaagagcgtgtgttatcgcaactacaatgacacatgtgagaatgaactatca
atcaacatgacaaagaaaatgtgttgctgctcttacaacattggcaaagcttggaacaag
ccgtgtgagccatgtcccgtgacggctagccctgaataccaaattctctgtggaaatcaa
gcacctggttttattattgacatccgaactggcaagcctatggatattgatgaatgcagt
gaaatcccagccatttgcaccaatggagtctgcatcaaccagattggaagcttccgttgt
gaatgtccaatgggattcagctacaacaacattctcctcatctgtgaagacattgatgag
tgcagcagcggagagaacctgtgccagattaatgctgactgtattaatatcccgggctca
tatcgctgcgaatgctccagtggatacaagctgtctccaagcggtgcctgtgttggccgt
aatgaatgcaatgagatccccaatgtctgcagccatggaacatgtatggacacaaccgga
agctacatctgcatctgccacaatgggttcaaagcaagtggagaccaaaccatgtgcatg
gatatcgatgagtgcgatcgtcagccttgtggcaatggtacctgcaagaacactgttgga
tcatataactgtctctgcttccctggcttcgaactcacccacaacaatgattgcatggac
atagatgagtgctcttccctggttgggcaagtgtgcagaaatggccagtgcatcaacaat
gtgggctccttccaatgtctttgccatgaaggctatgagatcactcctgatggaaagaat
tgtgtggatattaatgagtgcattagcctgcccgggacctgctctcctggaacatgccat
aacctggaaggatccttccgctgcatctgtcccccaggttatgcagtgcagaatgacaac
tgcatagatattaatgaatgtgatgatgaaccgaacatttgcctatttggaacctgcact
aacacccccggcagcttccagtgcgtgtgcccacccggctttgtcctgtcggataatggt
cgccgttgctttgatactcgtcaaagcttctgctttactcgatttgataatggaaaatgc
tccgttcctaaagccttcaacactacaaaagcgagatgttgctgcagcatgatgcccggc
gagggttggggagatccgtgtgagctgtgcccacaggaaggaaacttggcttttcctgag
ctctgtccatatggtcatggagccattcctaacattggagacaccagagaagatgtcaat
gaatgttctgagaatcctggaatttgtgtcaatggaatctgcattaatactgatggctct
ttccgatgtgaatgtccatttggctataatttagacttcacaggagttaactgtgttgat
acggatgagtgctccatcggaaacccatgtggcaatggaacgtgcactaatgtggttgga
ggttttgaatgtgcctgtgatgacggttttgaaccaggaccaatgatgacttgtgaagat
atcaatgagtgtacaaaccctcttctgtgtgctttccgctgcataaacacttacggatca
tatgaatgcacttgtccatctggatacaccttgagagaggaccgcaggatgtgcaaagat
ctggatgagtgtgcagaaggtctgcatgactgtgaatcccgcggtatgatgtgcaagaat
ctcattggtacattcatgtgtatctgcccaccaggcatgcagagacgaccagatggggaa
ggatgtatggatgaaaatgaatgtcgcaagccaggcatctgccccaatgggcgctgtgtg
aacactataggaagctataggtgtgactgcaatgatggattccaggtcagcggctctgga
acagaatgcatagatacccgtcagggatcttgtttcactgaagtgctacagacaatgtgc
cagctttcatctactaatcgcaacatggtgacaaagtctgagtgctgctgtaacctaggt
cgaggctggggtaaccagtgtgaactctgtccccttcctggaactgcaccttacaagaag
atgtgcccacacggtcctggcttcaccactgatgggagagatattgatgaatgcaaagtt
ctacccaacctgtgcaaaaatgggcaatgtatcaacaccatcgggtcattccgttgtcac
tgtaatttgggctacaccacagacatcacagggaccacgtgtgtcgatctggatgaatgt
gctcagtctcccaaaccttgtaactttatatgtaagaatacagagggcagctaccagtgc
tcatgtcccaggggctacattatgcaagaggatggaaagacgtgtaaagacctggatgaa
tgttcgaccaaacagcacaactgccaattcctctgtgttaacactatcggaagcttcaac
tgcaagtgtccacctggatttactcagcaccaatcctcttgcatcgataacaatgagtgc
agtgcccagcccagcctctgcggtgcccgtggcatgtgccagaacaaccctggaagcttc
gcctgtgaatgccagaaaggtttctccctggacaactctggcagcaactgtgaagatgtg
gatgagtgtgatggcagccaccgctgccaacacggctgccagaatgtccttggaggatat
cgctgcggctgcccacaaggctacgtgcagcattaccaatggaaccagtgtgtggatgag
aatgagtgttccagccaatctacctgtggctctgcttcttgctacaacactttgggaagc
ttcaagtgcatctgcccatcaggctttgattttgaccagccttttggtggctgccaggat
gtagatgagtgctcatcatctggtggaaacccttgtagttatggctgctccaacactgat
ggtggttaccaatgtggatgtccagggggttatttccgtgccggccaagggcactgcgta
tcaggcatgggatttggcaaaggttcctatctcccagctcctgctgaagaggatgaggaa
aacatcctatccccagagaactgctatgaatgcaagatcaatggttatccaaagagagga
aggcagcgtcgcagcacaaatgaaacttctgagcacgagaatcatatcagcatggctagc
gttgacatcgatgctccacttaaaatgagcctaaacatttctgagctgataaacaagcaa
catatcatggagctattgccagccttggtgccattggaaaatcatgtacgttacatcatc
tctcatggcaatgaagagggcatcttccgcattcaccaaaaggacagcctgagtttcctc
caccttggccgtaagaaggtgactcaaggtacatacaacctggagattgtcagcatgccg
ctatatcgcaagaaggaactgcagaaattagaggatgagaaggactccaactacctcagt
ggtgaaataggccaagcgcttaagatgaaacttcggatccatctgtattaa
DBGET
integrated database retrieval system
