Pseudophryne corroboree (corroboree frog): 135064012
Help
Entry
135064012 CDS
T11513
Symbol
FBN2
Name
(RefSeq) fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
pcob Pseudophryne corroboree (corroboree frog)
Pathway
pcob04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcob00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
135064012 (FBN2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pcob00536
]
135064012 (FBN2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pcob00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
135064012 (FBN2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
TB
hEGF
EGF_3
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
EGF_FBN_1st
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
135064012
NCBI-ProteinID:
XP_063820322
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(266486752..266871489)
Genome browser
AA seq
2867 aa
AA seq
DB search
MMSGPERRGVLLLSCFLIVFGYSAAQQFFNSESRHGTQDAKDGTNGGVVSRTRRRGSQYA
LHGPNVCGSRFHSYCCPGWKTLPAGNQCIVPICRNSCDDGFCSRPNMCTCSNGQVSPACV
SKTVPQCSIRCMNGGTCVEDQCRCHKGYIGAHCGQPVCENGCQNGGRCIGPNRCACVYGF
TGPQCERDYRTGPCFTQISNQMCQGQVTGIVCTKTLCCATIGRAWGHPCEMCPPQPQPCR
RGFIPNIRSGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTDGSYECRCPVGHKQSETSQKCEDIDEC
SNIPGICNGGECSNTIGSYYCICPRGYLTSVDGLHCIDQRSGICFSSLVNGHCAQELTGR
FTKMQCCCEAGRCWALGSIPELCPVRGSDEYRRQCIDGVPFGGPRPGIPEGFDPSLFGPG
PGPGGNGFPPIVGGTGIDGPGIGGGVATLNQTIDICKQYPNLCLNGRCIPNLNSYRCECN
MGYKQDTHTECNDVDECTSSPCTNGDCVNTPGSYFCKCHSGFQRTPTKQACIDIDECIQN
GILCKHGRCVNTMGSFQCICNAGFELTADGKNCADHDECATTNMCLNGMCINEDGSFKCI
CKPGFVLAASGRYCTDVDECLTPGICMNGHCINTEGSFRCDCPPGLAVGVDGRVCVDTHM
RSTCYGAIKKGLCVRPFPGAVTKSECCCANPDYGFGEPCQPCPPRNSAEFHGLCSGGIGI
TVDGRDINECALDPDICSNGICENLRGGFRCNCNSGYESDSSGRSCVDIDECLLNRLLCD
NGLCRNTPGSYSCTCPKGYIFKTSTETCEDINECESNPCVNGVCRNIVGSFHCECSPGSK
LDSTSRICIDSLKGTCWLNIQDDRCEVNINGATLKSECCASLGAAWGSPCERCEIDTACP
RGFARVKGVSCEDVNECKVFPGVCPNGLCINTQGSFLCDCPGGFTLDGTGRVCLDLRMEQ
CFLKWDEDECVQPIPGRFRLDACCCAVGAAWGSECEECPQPGSNEYNLLCPRGPGFTNRA
DVLSGRPFYKDINECKAFYGICTNGKCRNTIGSFKCKCNNGFALDMEERNCTDIDECRIS
PDLCGSGTCVNTPGSFECECFEGFESGFMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGECVNTEGSFL
CNCPLGHELTPSGDACVDVNECSLSDSLCRNGKCVNMIGTYQCSCNPGYISTPDRLGCID
IDECQITNGGCDTHCENSEGSYTCSCLDGYALLPDSRTCGDIDECEDSPDICDGGQCTNI
PGEYRCLCYDGFMASVDMKTCIDVNECDINSNICMFGECENTKGSFVCHCQVGYSVKKGT
TGCTDVDECEIGAHNCDLHATCLNVPGSFKCSCKEGWIGNGITCNDHDECSNGTHRCSIS
AHCLNTPGSYRCACIEGYTGDGFRCSDIDECAENINLCENGQCLNVPSSYRCDCEMGFTT
APDGKSCQDINECYFENICVFGTCRNLPGMFQCVCDDGYELDRTGGNCTDVDECADPINC
VNGFCVNSPGSYECNCPPDFQLNPTGVGCVDTRVGNCYLNHGPRGDGTISCSTEIGVGVS
RSSCCCSLGKAWGNPCEICPPVNSSEYNTLCPGGEGFRPNPITILLEDIDECQELPGLCQ
GGNCINTFGSFQCECPPGYYLSDETRICEDIDECFTNPGVCGPGTCYNTLGNFTCICPLE
YMQVNGGHTCMDMRKSYCYRTYNGTMCDNELPFNITKKMCCCTYNIGKAWSKPCEPCPVP
GSVNFKNLCGSIPGFTFDIHTGKAVDIDECKEIPGICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYN
DLLLICEDIDECSNGDYFCQRNADCLNSPGSYRCECSAGFKLLPNGACIDRNECLEIPNV
CSHGTCEDTQGSYRCICNNGFKVSRDRTMCMDIDECERQPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPG
FELTHNNDCMDIDECVSYYGQRCRNGRCFNEIGSFICLCDEGYELTVDGKNCIDINECVA
YPGSCSPGSCQNLEGSFRCICPVGYAVQADNCLDIDECNEDPNICLFGTCANSPGSFQCI
CPPGFVLSDNGRRCFDTRQSFCFTKFENGKCSVPKAYNSTKATCCCSKMPGEGWGDPCEL
CPKEGEVTFQHLCPFGHGTIPGIGDTREDVNECIENPGICANGHCINTDGSFRCECPMGY
NLDYTGVNCVDTDECSIGNPCGNGTCTNVIGTFECSCEEGFEPGPMMNCEDINECALNPL
LCAFRCINTYGAYECTCPVGYVLREDQRMCKDLDECLEGLHDCESRGMLCKNLIGTFMCI
CPPGMTKRPDGEGCTDENECHSKPGICENGRCVNSIGSYRCECNEGFQSVSGTECLDTRQ
GFCFSEVLQTMCQMSSSNRNHVTKSECCCNGGRGWGNQCEICPLPGTTQFKKLCPHGPGY
TTDGKDVDECRVMPNLCRNGQCVNNIGSFRCFCNFGYTPDIEGTSCVDLDECSQSPKPCN
FICKNTEGGYQCSCPRGYILQEDGKTCKDLDECQTKQHNCQFLCVNNIGSFSCKCPPGFT
QHHTACIDTNECSLQPNLCGTKGVCQNSPGSFTCDCQRGFSLDTTGVNCDDVDECDGHHR
CQHGCQNIVGGYRCSCPQGYVQHYQWNQCVDENECAAQNTCGTASCYNTLGSFKCACPPG
FTFDQLSTSCHDVNECTSKNPCNYGCSNTDGGYLCGCPSGYFRVGQGHCVSGMGFNRGQY
LATAREDNEENELSPETCYECKVNGYPKKTGRAKRSSNNTQTIMNEHISLKSLAMDVPLK
IMLNSSELNTKKHIVEIIPAIQPLNNHVRYVISQGNDTVFHINQRDGLSYLHTARKKILP
GTYTLDITSIPIYRKSDFTKLEKKHDENYLLGELGETLRMRLQIDIS
NT seq
8604 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgtcggggccagaaaggaggggggtgctcctgctcagctgctttcttatagtcttt
ggatattcagcggcacagcagttcttcaactccgagtccaggcatggaacgcaggatgca
aaggacggaaccaatgggggtgttgtgagcaggacccgcaggagaggatcacagtatgcc
ctgcacgggccaaacgtctgtggatctagatttcattcatactgttgccctgggtggaaa
acactccctgcaggaaaccaatgcattgtcccaatttgtagaaacagttgcgatgatgga
ttctgttcccgtccaaacatgtgtacttgttctaatggacaggtttccccagcctgtgtc
tctaaaaccgtccctcaatgtagcatacgatgcatgaatggaggaacgtgtgttgaagat
cagtgtcgttgtcataaaggttacattggagcacactgtggacaacctgtctgtgaaaat
ggctgccagaatggagggcgttgtatcggacccaatcgatgcgcctgtgtatatggattt
actggtcctcaatgtgaaagagactatagaacaggaccctgcttcactcaaatcagcaat
cagatgtgtcagggtcaggtgactggtattgtctgcacaaaaactctctgctgtgcaacc
attggacgtgcctggggacacccttgtgagatgtgcccacctcaaccacaaccctgccgc
cgtggcttcatccccaatatacgcagtggggcttgccaagatgttgatgaatgccaagca
atcccaggcctatgccaaggaggaaactgcattaacacagatggatcttacgagtgcagg
tgtcctgttggtcacaagcagagtgaaacatcacagaaatgtgaagacattgacgaatgt
agcaatattcctggtatttgtaatggaggagaatgttccaacacaattggtagctattat
tgcatctgtccacgtggatatctcacatctgttgatggcttgcactgcattgatcagaga
tctggtatatgcttctccagccttgtaaatggacattgtgcacaagagcttacaggaaga
tttacaaaaatgcagtgctgttgtgaagctggtcgttgctgggctctaggctccataccc
gagttgtgtccagtcagaggctctgatgaatacagaagacagtgtattgatggtgttcca
tttgggggtccaagaccagggataccagaaggatttgatcccagtctgtttggacctgga
cctggacctggtgggaatggttttcctcccattgtaggaggtacaggaatagatggacca
ggaattggtggaggtgttgcaacattaaatcagacaatcgacatttgcaaacaatacccg
aatctttgtctaaatggacggtgtattcccaaccttaacagctacagatgtgagtgcaac
atgggatacaaacaagatactcacacagaatgtaatgatgttgatgagtgcacatcaagc
ccatgtactaatggtgattgtgtaaatacacctggatcctatttctgtaagtgccattct
ggcttccagagaactcccaccaaacaagcttgtattgatattgatgagtgcattcaaaat
ggcattctctgcaaacatggccgatgtgtaaacaccatgggaagcttccagtgtatctgt
aatgccggctttgagctgactgctgatggaaagaactgtgcagatcatgatgaatgtgct
acaacaaatatgtgtttaaatggtatgtgtataaatgaggatggcagcttcaagtgcatc
tgtaaaccgggatttgttctggctgccagtggacgttattgtaccgacgttgatgagtgt
cttactccgggcatctgtatgaatggtcattgtatcaacacagaggggtctttccgctgc
gattgcccaccaggtttggctgttggggtagatggacgtgtatgtgttgacactcacatg
cgtagcacttgttatggcgctatcaagaaaggtctctgtgtccgtccatttccgggagct
gtgaccaaatctgagtgctgctgtgccaacccagactacgggttcggagaaccgtgccaa
ccgtgtccaccacgtaactctgctgaatttcatgggctctgcagcggaggaattggcatc
actgttgatggaagagacatcaatgaatgtgctctggatcctgacatctgttccaatgga
atttgtgaaaacttacgaggaggcttccgttgtaattgcaacagcggctatgaatcagat
tcttcaggaagaagttgtgtggacattgatgaatgcttactgaatagattgctgtgtgac
aatggcctctgcagaaacactcctgggagttacagttgcacatgtcccaaaggctacata
ttcaagaccagtactgagacctgtgaagacataaatgaatgtgaaagtaacccatgtgtt
aatggagtgtgtagaaatattgttggttcctttcactgcgagtgttctcctggcagtaag
ctggattccacctctcgcatttgcatagatagtctcaagggaacatgttggctcaatatt
caggatgatcgctgtgaggtcaatattaatggagcaactctaaagtccgaatgctgcgct
agtctgggagctgcgtggggaagtccttgtgaaagatgcgaaatagatacagcctgtccc
cgtggatttgcaagagtcaaaggggtctcatgtgaagatgtcaatgagtgtaaagtgttt
ccaggtgtatgtcccaacgggctgtgcatcaatactcagggatctttcctctgcgattgt
cctggtgggttcacattggatggaacaggcagagtttgcctagatttacgtatggagcag
tgtttcctaaaatgggatgaagatgaatgtgtccagcctattcctggccggttccgtctg
gatgcctgctgctgtgctgtaggagcagcctggggctcagagtgtgaggagtgtccacag
cctggttctaacgaatataatctgttgtgtcccagaggtccaggctttaccaatagagca
gatgttttatcggggagacctttctacaaagatataaatgaatgtaaagctttctatggg
atatgtactaacgggaaatgcagaaatacaattggtagcttcaagtgtaaatgtaacaat
ggatttgctttggacatggaagaaagaaattgcacagacattgatgagtgccgtatctct
cctgatctgtgcggaagtggaacttgtgtcaatactcccggcagctttgaatgcgagtgc
ttcgaaggcttcgaaagtggcttcatgatgatgaagaactgcatggacatagacgaatgt
gaacggaaccctttgctttgcaggggtggagaatgtgtgaacactgagggcagttttcta
tgcaactgtccccttggacatgaactcacgccatcaggagatgcctgtgtagatgtgaat
gagtgctctctcagtgacagtctatgcaggaatggaaagtgtgtgaacatgattggcaca
taccaatgctcctgtaacccagggtatatatctaccccagatagactgggctgcatagat
attgacgagtgtcagataactaatggtggatgtgacacccactgtgaaaactcagaaggc
agctatacatgcagctgcctggatgggtatgctttactgccagactcaaggacctgtgga
gatatcgatgagtgtgaagacagcccagatatttgtgatggaggacaatgtaccaacatc
ccaggagagtaccgctgcctctgctatgatggatttatggcgagtgtggacatgaaaaca
tgcatagatgtgaatgaatgtgacattaattcaaacatctgcatgtttggtgaatgtgag
aacaccaaaggatcatttgtgtgtcactgtcaggttgggtattcagtgaaaaagggaaca
actggatgtacagatgtggacgagtgtgaaattggcgcacacaactgtgatctgcatgct
acatgtctcaatgtaccaggcagttttaaatgttcctgtaaggaaggctggattggaaat
ggtatcacatgtaatgaccatgatgaatgctccaatggaactcacagatgcagcatttca
gcccattgcttaaacactcctggatcgtaccggtgtgcctgcattgaaggttatactggc
gatggatttagatgctcagatattgatgagtgtgcagaaaatatcaacctgtgtgagaac
ggacaatgtctaaatgtccctagctcatatagatgtgattgtgagatgggcttcactaca
gctccggacggcaagtcctgtcaggatatcaatgagtgttattttgagaatatttgtgta
tttgggacctgtcggaatcttccaggaatgttccaatgtgtctgtgatgatggttatgag
ttggaccgcactggaggaaattgcactgatgtggatgaatgtgcagatccaatcaattgt
gttaatggcttttgtgtcaattcccctgggagctatgaatgtaattgtccacctgacttc
cagcttaacccaaccggtgtcggctgtgtagatacgcgagtgggaaattgttatctgaac
catggacctcgcggtgatggaaccatctcctgtagtacagagattggtgttggcgtcagc
cgctcatcatgctgctgctctctaggaaaggcatgggggaacccatgtgaaatatgccca
cctgttaacagctctgaatataatacattgtgtcctgggggagaaggattcagacccaac
cccatcaccatccttttagaagatattgatgagtgccaagagttaccaggtctgtgccaa
ggtggtaactgcattaatacatttggaagcttccagtgtgagtgtccaccaggctactac
ctcagtgacgaaacgcgcatatgtgaagatatcgatgaatgtttcacaaatccaggggtc
tgtggaccaggaacatgctacaataccttgggaaactttacatgcatatgccctctggag
tatatgcaggtcaacggtggacatacttgcatggatatgagaaagagctactgctaccgg
acttacaatgggactatgtgtgacaatgaactgccctttaacatcacaaaaaagatgtgc
tgctgcacgtataatattggcaaagcctggagtaagccttgtgaaccgtgtccagttccc
ggatcagttaatttcaaaaatctctgtggatcgatccctggcttcacctttgatatacat
accggaaaagctgttgacattgacgaatgtaaagagatccctggaatctgtgcaaatgga
gtttgcatcaatcaaattggcagtttccgctgtgaatgtccaacaggattcagctacaat
gatttacttttgatttgtgaagacatcgatgaatgcagcaatggagactatttctgccag
agaaatgcagattgcttaaacagtcctggcagctaccgctgtgaatgttctgctggattc
aagctcttgcccaatggggcttgcattgatcggaacgaatgtctggaaattcctaatgtt
tgcagtcatggcacatgtgaggacactcagggcagttaccgctgcatatgcaacaatggg
ttcaaggtgtcccgagatcgcactatgtgcatggatattgatgaatgtgagcgtcagcca
tgtggaaacggaacctgtaaaaacacagtgggatcctataactgtctctgctatcctggg
tttgagctcactcataataatgactgtatggatattgatgaatgtgtctcctattatggc
cagcggtgcaggaatggacgttgcttcaatgaaattggatcattcatctgtttatgtgat
gaaggttatgaacttactgttgatggaaagaattgtattgacataaacgagtgcgttgct
tatcctggctcatgttctcctgggtcctgtcagaacttggaaggctcgttccggtgtata
tgtcctgtgggatatgccgtccaagctgataactgtctagatattgatgaatgtaatgaa
gaccccaatatctgtctttttggaacctgtgcgaactcaccaggaagctttcagtgtatt
tgcccaccagggtttgttttatcagataacgggagaagatgctttgatactcgtcaaagc
ttctgttttaccaaatttgaaaatgggaaatgttcagtccccaaagcgtataacagcact
aaagcaacatgttgctgcagcaaaatgcctggggagggctggggagatccctgtgaactc
tgcccaaaggaaggagaagtgacttttcaacatttatgtccgtttggacatggtactatt
ccaggtatcggagacactagagaagatgtcaatgaatgcattgaaaacccaggtatttgt
gcaaatggacattgtattaatacagacggatcttttcgatgcgagtgtcccatgggttac
aatctagattatacaggagtcaattgtgtagatactgatgaatgctccattggaaatcct
tgtgggaatggaacatgtactaatgtcattggtacttttgagtgctcctgtgaagaagga
tttgaaccaggcccaatgatgaactgtgaagatatcaatgaatgtgcgctaaatccacta
ttatgtgcatttaggtgcattaacacttatggtgcatatgaatgtacatgtcctgtgggc
tatgttcttagagaggatcagaggatgtgtaaagatcttgatgagtgtttagaggggctc
catgattgtgaatccagagggatgctttgtaaaaaccttattggtacctttatgtgcatt
tgtcctcctggaatgacaaaacggcctgatggagagggatgtacagatgaaaatgaatgt
cacagcaaaccgggtatctgtgaaaatggtcgttgtgtcaattccattggaagctatcgg
tgtgagtgtaatgaaggatttcagtctgtttcaggaactgaatgcctagacacacgccag
ggattctgcttctcagaagttctgcaaacaatgtgtcagatgtcgtccagcaatcgcaat
catgtgactaaatctgaatgttgctgcaatggaggtagaggctggggcaaccagtgtgag
atctgcccactgccgggtaccactcaatttaagaaactttgtccacacggaccaggatac
acaactgatgggaaagacgtagatgaatgtagagtgatgccaaacctctgtcgcaatgga
caatgtgtcaacaatattggctcttttagatgtttttgtaattttggctacacgcctgac
atcgagggaacatcatgtgttgatcttgatgagtgctctcagtcccccaagccgtgtaat
tttatctgtaagaacacagaaggcggataccagtgctcatgtccacggggttatattctg
caagaagacgggaaaacctgcaaagatcttgatgaatgtcaaaccaaacagcacaactgc
cagttcctctgtgtcaacaatattggaagtttcagttgtaaatgtcctccgggctttacc
cagcatcacactgcttgcattgatactaatgaatgcagtttacagcctaacttatgtggt
actaaaggagtatgccaaaattcaccaggcagcttcacttgtgattgccaaagaggattc
tctttggatacaactggagtaaactgtgatgatgttgatgagtgcgatggacatcacaga
tgccagcatgggtgccagaatatagttggcgggtaccgttgtagctgtccacagggctac
gttcagcattaccagtggaaccagtgtgtcgatgaaaatgaatgtgccgcacaaaacacg
tgtggcactgcatcatgttacaacacacttggcagtttcaaatgtgcttgtccacctgga
tttacattcgaccagttatcaacttcctgccatgatgtgaatgagtgtacatcaaagaat
ccgtgcaattatggttgctccaacactgatggaggctatctctgtggatgtccttcagga
tacttcagagtaggacaagggcattgtgtctccggcatgggttttaatagaggacagtat
ttggctactgccagagaagataacgaggaaaatgaactgtcaccagaaacatgctatgaa
tgtaaagtcaacggttacccaaagaaaaccggaagggcaaaaagaagttctaacaacaca
caaactataatgaatgaacatataagtctgaagagtctcgctatggatgtaccactgaag
ataatgcttaacagctctgagttaaacacaaagaaacatatagtggaaattatcccggca
attcaaccacttaataatcatgtacgctatgttatctcccaaggcaatgatactgtcttt
cacatcaaccaacgtgatggactcagttacctccacacagctcggaagaaaatcctaccc
ggaacttatactctagacataaccagtattcccatttataggaaaagtgacttcactaaa
ctggaaaagaaacatgatgaaaactacctcctaggagagctcggagagactcttagaatg
agactgcagatagacatctcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
