Pyrus communis (pear): 137722246
Help
Entry
137722246 CDS
T10779
Name
(RefSeq) phytochrome A-2-like
KO
K12120
phytochrome A
Organism
pcox Pyrus communis (pear)
Pathway
pcox04712
Circadian rhythm - plant
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
137722246
NCBI-ProteinID:
XP_068317304
LinkDB
All DBs
Position
17:17774043..17779662
Genome browser
AA seq
1125 aa
AA seq
DB search
MSSSRPSNSSSNSGRSRHSARVIAQTTVDAKLHADYEESGSSFDYSSSVRAGSSVGGDQQ
PRSDKVTTAYLHHIQKGKTIQPFGCLLALDEKTFKVIAYSVNAPEMLTTVSHAVPSVGDS
PVLGVGTDIRTIFTAPSASALHKALGFGEVSLLNPILVHCKTSGKPFYAITHRVTGSLII
DFEPVKPYEVPMTAAGALQSYKLAAKAIARLQSLPSGSMERLCDTMVQEVFELTGYDRVM
AYKFHDDDHGEVVSELTKPGLEPYLGLHYPSTDIPQASRFLFMKNKVRMIVDCCAKHVKV
FQDEKLPLDLTLCGSTLRAPHSCHLEYMKNMNSIASLVMAVVVNEGDDEVTDPDSVPPQK
KKRLWGLVVCHNTSPRFVPFPLRYACEFLTQVFAIHVNKEIELEEQMVEKNILRTQTLLC
DMLLRDAPLGIMSQSPNIMDLVKCDGAALLYKNKVWRLGMTPSDFQLHDIASWLSEYHMD
STGLSTDSLYDAGFPGALALGDVVCGMAAVWLTSKDMLFWFRSNTAAEIRWGGAKHETGE
KDDGCKMHPRSSFKAFLEVVKRRSLPWKDYEMDAIHSLQLILRNAFKDAGTTLEANTKAI
NVRLSDLKLEGMQELEAVTSEMVRLIETATVPILAVDVHGLVNGWNTKIGELTGLPVDKA
IGKHLLSLVEDSSTDTVKKMLNSALHGKEEQNIQFEIKTHGSRADLGPISLVVNACASRD
IRENVVGVCFVAQDITGQKNVMDRFTRIEGDYKAIVQNPNPLIPPIFGTDEFGWCSEWNS
AMTKLTGWKREEVMDKMLLGEVFGIHMACCPLKSQESFVNLGVVLNHAMTSQVSEKVPFG
FCARNGKYIECLLCVTKKLDSEGSVTGVFCFLQLASPELQQALHVQRLSEQTAVKRSKEL
SYIRRQIRNPLAGIIFSRKMMEDTELGEEQQLLLHTSAQCQNQLNKILDDSDLDTIIDGY
LNLEMVEFTLHDVLNAAVSQVMMKSNAKSIRVVQDAPEEIMTQTLYGDSLRLQQVVADFL
AVSISFVPTGGQLTIEANLTEDQLGQSVHLVHLELRITHAGGGIPEALLNQMFGNDGDIS
EEGISLLVSSKLVKLMSGDVRYLREEGKSTFMISVELAAAYKMKP
NT seq
3378 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttcttcaagacctagcaactcgtccagcaattcagggcggtctagacacagtgct
agagttatcgctcagacaactgttgatgcaaagctgcatgcagattatgaggagtcaggt
agttcctttgactactcgagctcagtgcgcgctggcagttcagttggcggggatcaacaa
cctaggtctgacaaagtgaccactgcttatctccatcacatacagaaaggcaagacgatc
caaccgtttggatgcttgctagccttagatgagaagactttcaaggtcattgcttatagt
gtgaatgcccctgaaatgctgactacggtcagtcatgcagtcccaagtgtcggggactcc
cctgttcttggcgtaggaacagatattagaacaattttcactgcacctagtgcctctgca
ctgcataaggccctaggatttggagaggtttctctcttaaatcccatcttagtccattgc
aagacctctggcaagcctttctatgcaataacccatcgagtaacgggcagtttgatcatt
gactttgagccggtgaagccttatgaagtccctatgactgctgccggggccctgcaatcg
tacaagcttgcggccaaagcaattgccagattgcagtctttgcctagtgggagcatggag
aggctttgtgatacaatggtacaagaggtttttgaactcactggttatgacagggtgatg
gcctataaatttcatgatgatgatcatggagaagtggtctctgagcttacgaagcctggc
ctggagccatatctaggtttgcattatccatccactgacatcccacaggcttcacggttc
ctatttatgaagaataaggtccgcatgattgtcgattgttgtgcgaaacatgtgaaggtt
tttcaagatgagaagcttccgctggatctcacattgtgcggttcaaccctgagagcccca
cacagttgtcatttagaatacatgaagaatatgaattccattgcatctcttgttatggca
gtagttgttaatgagggggatgacgaggttaccgatcctgattctgttccacctcaaaaa
aaaaagagactttggggtttggtagtatgccataatacaagtccaagatttgttcctttc
cctctcaggtatgcctgtgagtttttaactcaagtgtttgccatccatgtcaataaggaa
atagagttggaagaacagatggttgagaagaacatcttgcgcactcaaacactgttgtgt
gatatgctgttacgagatgcacccttgggtattatgtcacagagccctaatattatggat
ctggtgaaatgtgatggagctgccctattgtacaagaacaaggtatggagacttggaatg
actccgagtgacttccagcttcatgacatagcttcttggctctctgagtaccatatggat
tctacgggtttgagtacagatagcttgtatgatgcaggattccccggggctcttgctctt
ggtgatgtagtatgtggaatggcagctgtgtggttaacttccaaggacatgctcttttgg
tttcgatccaacactgctgctgaaattcgatggggtggtgcaaaacatgaaaccggtgag
aaagatgatggttgcaaaatgcaccctagatcatcattcaaggctttccttgaagttgtc
aaaaggaggagcttgccttggaaggactatgaaatggatgcaattcattctttgcagctt
attctgaggaatgcattcaaagatgccggaaccaccttggaagcaaacaccaaagcaatc
aatgtaaggcttagtgacctaaaacttgaagggatgcaagaactggaagctgtgacgagt
gagatggtccgtttgattgaaacagcgacggttcccattttggctgttgatgttcatggg
ctggttaatgggtggaatacaaaaattggcgagctaactggtctacctgttgataaagca
atcggtaagcatttgctctcactcgtggaagattcttcgactgatacggtgaaaaagatg
ttgaactctgcattgcatggcaaagaggaacaaaacatccaattcgagataaaaacacat
ggttctagggctgaccttggtcccatcagcttagttgtgaatgcttgtgcaagcagagac
attcgggaaaatgttgtgggggtgtgttttgtggcacaagatatcactggtcagaagaat
gtgatggacagattcacccggattgagggtgattacaaagcaattgtacaaaaccctaac
cccttgattcccccaatatttggtacagatgaatttggctggtgttctgagtggaattca
gcaatgacgaagttaacaggatggaaacgagaggaggtaatggataaaatgcttctggga
gaggtttttgggatccacatggcatgttgtcctctcaaaagccaggaatcttttgtaaat
cttggtgttgtcctgaaccatgccatgacaagtcaggtgtccgaaaaggttccctttggt
ttctgtgctcgcaatggaaagtacatagaatgcctgctgtgtgtgactaagaaattggac
agcgaaggctcggtcactggggtcttttgcttcttgcagcttgctagcccagagctgcaa
caagcacttcacgtccagcgcttatcagaacaaactgcagtgaagagatcgaaagaattg
tcttatattagaaggcagatccggaatcctttagccggaataatattttctcggaaaatg
atggaggatactgagttgggagaagaacaacaactgcttctgcatacgagcgcccagtgc
cagaaccagctcaacaaaatactagatgactcggatcttgataccatcattgacggctac
ttgaacctggaaatggttgagttcacattgcatgacgtactgaatgccgctgtcagtcaa
gtcatgatgaagagcaatgccaagagcatccgtgttgtccaagatgcaccggaagagatc
atgactcagactttatatggggatagtcttaggcttcaacaagtcgtagctgatttctta
gccgtatcaattagttttgtgccaactggaggccagcttactatcgaagctaatttgacc
gaagatcagttgggacagtctgttcatcttgtgcatttggagctcaggatcacacacgcc
ggtggtgggattccagaagcattgctgaaccagatgtttggaaatgacggagacatatct
gaggagggcattagcctgctcgtcagcagcaaactggtgaagcttatgagcggagacgta
cgttatcttagggaagaaggcaagtcaaccttcatgatatccgtggaactcgcggctgca
tacaagatgaagccctaa
DBGET
integrated database retrieval system