KEGG   Pyrus communis (pear): 137733734
Entry
137733734         CDS       T10779                                 
Name
(RefSeq) uncharacterized protein isoform X1
  KO
K12604  CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Organism
pcox  Pyrus communis (pear)
Pathway
pcox03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pcox00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    137733734
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:pcox03019]
    137733734
Messenger RNA biogenesis [BR:pcox03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     137733734
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Ccr4-NOT complex
     137733734
SSDB
Motif
Pfam: Not1 CNOT1_CAF1_bind CNOT1_TTP_bind ARM_Cnot1 DUF3819 CNOT1_HEAT NOT1_connector
Other DBs
NCBI-GeneID: 137733734
NCBI-ProteinID: XP_068328999
LinkDB
Position
5:8788748..8807439
AA seq 2420 aa
MLNFTPTTASQIRFLLQSLNDATSDSVLRELSQFTEYGLEGSILLLQTCLDHLTNYRTDL
KNAALERVLASIFKYLLDRPNFSTVFCECLRNTEINEGILENFSNALHLSVSEKIGIALA
LSDSENLDTRICGKNFCMDQIQKLCESPIAMNSSEQIQNIVIFLQRSEGLSKHVDSFMQM
LSLLQLKDDSFSVLTPLLSDELRDANFLSNVGLLHESGENDFDAILAEMAKEISMGDVMK
ELGYGCTVDSSQCKEILSLFLPLTEITISKILGMIASTHVGLEDNQNAFSTFRLAVGNST
LSDLPMLNTWNIDVLVDTIKQLAPGTNWIQVIENLDHEGFFIPNQEAFSFFMSVYQHVCQ
ELFPLHVICGSVWKNTEGQLSFLKHAVSAPPEVFTFAHSVRQLAYIDAVHGHKLQLGHAN
HAWLSLDLLDVLCLLAERGHALAVRSMLEYPLKHCPEVLLLGMAHTNTAYNLLQYEVSYT
VFPMMVKNAMGIGMINHLWHINTSLVLRGFVDAHNCDPDSIARILDICQELKILSSVLEM
IPSSLSIRLAALASKKELVDLEKWLSNNLNLYKDTFFEECIKFLKEIQFGGSQDFSTRPF
QHSGAVSNIYVDTATIFTKVLKAHVGLVASSQLTEEMERLSVTIMDSIPRLPNGGTTESS
TDGYADDIEAEANSYFHQMFSGQLTIDSMVQMLARFKESSVKREQSIFECMIANLFEEYR
FFPKYPERQLKLAAVLFGSVIKHQLVTHLTLGIALRGVLDALRKPADSKMFVFGTKALEQ
FVDRLIEWPQYCNHILQISHLRSTHSELVAFIEQALARISSSHSDSDGSNHASAAHHHGP
SQATPGNVELNGSTILHNGQQHSSPLQLQQRHESSLDDRHKASNSSNDIKPPLSSAVQPP
VGPVGDTPRIQKSQSALSAPAMLSSPSPGFVRPTRGVTSTRFGSALNIETLVAAAEKRDT
LIEAPASEIQDKISFIINNISVANVEAKSKEFAEIIKEQYYPWFAQYMVMKRASIEPNFH
DLYLKFLDKVNSKGLNKEIVQATYENCKVLLGSELIKSSAEERSLLKNLGSWLGKLTIGR
NQVLRAREIDPKSLIIEAYEKGLMIAVIPFTSKILEPCQSSLAYQPPNPWTMGILGLLAE
IYSMPNLKMNLKFDIEVLFKNLGVDLKEITPSSLLKDRNREVEGNPDFSNKDIGASQPQM
VAEVKLNQVELPVDVGPSNSASHTHISQYATPVHVSPGTLIEDEKVFPDQIPAQGLLPAT
PSQSPFSLPTPISNIATHVVINPKLSALGLHLHFQRVVPIAMDRAIKEIVTGIVQRSVSI
ATQTTKELVLKDYAMESDETRILLAAHLMVASLAGSLAHVTCKEPLRSSISTQLRNSLQG
LNIPNDHLEHAVQLVTNDNLDLGCAIIEQSATDKAVQTIDGEIAQQLSLRRKREGAGTTF
FDANMYTQGGSVPESLRPKPGHLSISQQRVYEDFVRLPWQNQSSQNSHVLPASTAATSAS
AGLNSTFGSASAQINTGFSAGPGSKFDAVSRPLDEAIESNPALHPSASSINVGAGDGVSQ
HGSENDSVIGSFPPAASALELQSVESSDTIQESGISSQPQPSPTVTERLASNISEPSLNT
RDALDKYQIVSQKLEALVTNDARELEIQGVIGEVPEIILRCVSRDEAALAVAQKVFKGLY
ENASNHTHVSAHIAMLTAIRDVCKLVVKELTSWVIYSDEERKFNKDITVGLIHSELLNLA
EYNVQMAKLIDGGRNKPATEFSISLLQSLVIEESKVISELHNLVDALAKLAAKPGSPESL
QQLVEMVKNPAYILGAPSAINVGKEDKARISKDKKASVHSPVSREDFSNVESVEPDPAGF
REQVSMLFAEWYRICELPGANDAACAHFILQLHQNGLLKGDDMTDRFFRVLTELSVAHCL
SSEMTIPSSLQTPQQVQNLSFLAIDIYAKLVFLILKVIIPLYVCFMLFMIPGPNLTMDYL
LEQGSSKLFLLSKILLVTVRFIQKDAEEKKTSFNPRPYFRLFVNWLLDLGSLDPVIDGAN
FQILTAFANAFHALQPLKVPTFSFAWLELVSHRSFMPKMLVGNGQKGWPYVQRLLVHLFQ
FMEPFLRNAELGVPVHFMYKGTLRVLLVLLHDFPEFLCDYHFTFCDVIPPSCIQMRNIIL
SAFPRNMRLPDPSTPNLKIDLLAEISQSPRILSEVDAALKVKQMKADVDEYLKTRQQGSS
FLTELKQKLLLLPSEAASAGTRYNVPLINSLVLYVGMQAIQQLQARTPHAQSTQTVPLTV
YLVGAALDIFQTLIVDLDTEGRYLFLNAIANQLRYPNTHTHYFSFIVLYLFAESNQHEII
QEQITRVLLERLIVNRPHPWGLLITFIELIKNPRYQFWNRAFIRCAPEIEKLFESVSRSC
GGPKPVDESMVSGWVSESAH
NT seq 7263 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctcaattttacgccgaccaccgccagccagattcgcttcctactccagagcctcaac
gatgccacctccgactccgttctccgagagctctctcagtttactgaatatggacttgag
ggaagcattttgctgctacagacctgtctggatcatctcactaattacagaacagactta
aagaacgcagcattggaacgagttcttgcctcaattttcaaatatctccttgacagacct
aatttcagtacggtgttttgtgagtgcctaagaaatacagagattaatgaaggaattctt
gagaatttctctaatgcattacacctatctgtatcggagaaaattggcattgctcttgcg
ctgtcagattctgaaaacctagacaccaggatatgtggcaagaacttctgtatggatcag
atccagaaattgtgtgaaagtcctattgctatgaattcgtctgagcaaattcagaacatt
gttatattcctccagcggtctgagggcctttccaagcatgtggattcctttatgcagatg
ttatctttactgcaactgaaagatgacagtttttctgttttaactccattgctttcagat
gagctccgtgatgccaattttttgagcaatgtgggtttgttgcatgaaagcggagaaaat
gattttgatgctattttagctgaaatggcgaaggaaatcagcatgggagatgtaatgaag
gaattaggttatggatgcacagttgattcatctcagtgcaaagagattttatctcttttc
ttaccactcactgagattactatttcaaaaatacttggcatgattgcctctactcatgtt
ggtctcgaggacaatcagaatgcattttcaacattccggttggcggttggtaacagcact
ttatctgatctgcctatgttgaacacctggaatattgatgtccttgtagatacaatcaag
caacttgctcccggtactaactggatacaagttattgaaaatttggatcatgagggattc
ttcattcctaatcaggaggcattctcttttttcatgtctgtatatcagcatgtctgtcag
gagctgttccccctccatgttatctgcgggtctgtttggaagaacaccgagggtcagcta
tccttccttaaacatgctgtgtcagcaccacctgaagtgtttacctttgcccactctgtt
aggcagctggcctatattgatgcagtgcatggccataagcttcaacttggacatgcaaat
catgcatggttgagtcttgaccttttggatgtactgtgtctactagctgagaggggtcat
gctcttgctgtccgatcaatgcttgagtatcctcttaaacactgtcctgaagtcctgctt
cttgggatggcgcatacaaatactgcttataacctgctgcaatatgaagtgtcttatact
gttttccccatgatggtaaaaaatgccatgggcattggcatgattaaccacctctggcat
attaacacctcattggtgttgaggggatttgtggatgctcacaattgtgatccagatagc
atagctagaattttggatatctgtcaagagctaaagattctgtcatctgtcctagagatg
atcccttcctctttaagtatcagattggcagcccttgcttctaaaaaagagcttgtagac
cttgagaagtggttgagtaataatttgaatttgtataaggatactttctttgaggagtgc
ataaagttcttgaaggagattcaatttggtggttcacaggatttttccaccagacctttc
cagcattctggtgccgtgtctaatatttatgtggacactgctactatcttcacgaaggtt
cttaaagctcatgttggcttggttgcctctagccaacttactgaggagatggaaaggttg
tctgtaacaattatggattcgattccaaggctcccgaatggtggcacgacagagtcttca
actgatggatatgcagatgatattgaagctgaagcaaactcttacttccatcaaatgttt
tctggtcaattgacaattgattcaatggtccaaatgcttgcccgattcaaggaatcttct
gtaaaaagggaacagtcaatttttgagtgtatgattgcaaatctgtttgaagagtataga
ttcttccccaagtatcctgaaagacagctcaaacttgctgcagttctgtttggctctgtc
atcaagcaccagctcgtaactcatctgactcttgggattgctctgcgtggtgttttagat
gcattgcgcaaacctgcggattcaaaaatgtttgtgttcggaacaaaggccttggagcag
tttgtggatcgtctgattgagtggccgcagtattgcaatcacattcttcaaatatcccat
ctgcggagtactcattcagagcttgtggctttcattgaacaggctcttgccagaatttct
tcaagccattcagactcggatggaagtaaccatgcttctgctgctcatcaccatggtccc
agtcaagctaccccaggaaatgtggagttaaatggttctaccatcttacataacgggcaa
caacattcttctccactccagcttcaacagagacatgaaagttctcttgatgaccgtcat
aaagcctcgaattcatcaaacgacataaagccacctttatcttctgctgtgcaacctcct
gttggtcctgtaggcgatactcctcgtattcagaagtcacaaagtgcactcagtgctccg
gcaatgttgtcttctccttcccctggtttcgttcgtcctacgcgaggagttacttctacc
aggtttggctctgctttgaatattgaaacattagttgctgctgccgagaaaagagatact
cttattgaggctccagcatcagagattcaggacaagatatcatttataattaataatatt
tcagttgccaatgttgaagctaagtcaaaggagtttgctgaaataatcaaagagcagtac
tatccttggtttgcacagtatatggttatgaaaagggcaagcattgagccgaattttcat
gatttgtacctgaaatttctggacaaagttaattccaagggtttgaataaggagattgtt
caagccacttatgagaactgcaaggttcttcttggatctgagcttataaagtcaagcgca
gaagagcgttcgttgctaaaaaatttaggtagctggcttgggaagcttacaattggaagg
aatcaagtcttaagggctcgggaaatagatcccaaatctttgattatagaggcatatgag
aaagggttgatgattgcagttataccctttacttcaaagattctggagccatgccaaagt
agcttggcatatcagccaccaaatccttggacaatgggtattcttggattacttgctgag
atatattcaatgccaaacttgaaaatgaacctgaagtttgacatcgaggttctatttaag
aaccttggtgtggatttgaaggagattaccccaagttctctactcaaggaccggaacaga
gaagttgaagggaatcctgatttctctaacaaagatattggagcatcccaaccacagatg
gttgccgaagtgaaactaaatcaagttgaactaccagttgatgttggtccatctaattct
gcaagccatacacatatatctcagtatgcgacccctgttcatgtttcaccgggaacctta
atcgaggatgaaaaggtgtttcctgatcagattcctgctcaaggactgttaccagctact
ccatcccagtcaccattctctcttcccacaccaatatctaatattgcaactcacgtggtt
atcaacccgaaactcagtgctttgggattgcacttgcattttcagagggtggttccaatt
gcaatggacagagctatcaaagagatagtaactggtatcgttcagcgcagtgtttctata
gctactcagacaactaaagagcttgtcttaaaggattatgccatggaatccgatgagaca
agaatattactggcagctcacttgatggttgcaagtttggcaggaagtctagctcatgta
acttgcaaggaacccttgcgtagttcaatatcaacccagctgcggaattcccttcaggga
ttaaatattccaaatgatcatctggaacatgctgtacaacttgttactaatgacaatctg
gatcttggctgtgcaatcattgaacagtctgctactgataaggcagtacaaacaattgat
ggagaaatagctcaacaactttcattaagaaggaagagggaaggtgcaggtacaacgttt
tttgatgctaacatgtatacacaaggaggcagtgtgcccgagtcccttcgcccaaaacct
ggtcatttgtccatttctcaacaacgagtttatgaggactttgtgcggcttccctggcaa
aaccagtctagccagaattcgcatgttctccctgctagtactgcagctacatctgcaagt
gcaggtctaaatagcacatttggttcagcctcggctcaaattaacacaggcttctcagca
ggccccggaagcaaatttgatgcagtttctcgtccactggatgaggcgattgaatccaat
ccggctctgcatccaagtgcatcctctattaatgtcggagcgggtgatggtgtttcccag
catggttctgagaatgattctgtcattggttcatttcctcctgctgcttctgccctagag
ctgcaatcagtagagtcatctgatactatacaggagtctggaatttcttcacagccacaa
ccgtcacctactgtaactgaacgtctggcaagcaacatatcagaaccttctctcaatacg
agggatgcattggataaataccagattgtttcacagaagcttgaagctttggtaaccaac
gatgctagagagttagaaattcagggagtaattggtgaagttcctgagattatactcagg
tgtgttagtcgagatgaggctgccttggctgtggctcaaaaggttttcaagggtttatac
gaaaatgcatcgaaccatactcatgtcagtgctcatattgcaatgctgacagctattcgc
gatgtttgcaagcttgttgttaaggagctcactagttgggttatttattcggatgaggag
cggaagtttaacaaggatattactgttggcctcattcacagtgaattgctaaatcttgca
gagtacaatgttcaaatggcaaaacttattgatgggggcagaaataagcctgcaactgag
ttttcaatttcccttctccaatctttggtgattgaagaatctaaagttatatcagaactt
cataatcttgttgacgcattggcaaagctcgctgcaaagcctggatctcctgagtcgcta
cagcagctggttgaaatggtaaagaatcctgcttatattcttggtgcgccgtctgctatt
aatgtaggaaaagaggacaaagccagaatatctaaagataaaaaggcttctgttcactct
ccggtgagcagggaagactttagtaatgtggagtctgttgaaccagatcctgctggattc
cgtgagcaggtgtctatgctgtttgcagagtggtaccggatttgcgaacttcctggtgca
aacgatgcagcttgtgcccattttatcttgcagttgcatcaaaatggtctgctgaagggg
gatgatatgacagaccggtttttccgtgtcctcacagagctatctgttgcacattgccta
tcttctgagatgacaattccaagctcactgcaaacgcctcaacaagtgcagaatctctcc
ttccttgctattgatatttatgctaaacttgtcttcttaattttgaaggtaattattcct
ttgtatgtatgttttatgctctttatgattcctggacctaatttaactatggattatctg
ttggagcagggatcaagtaaactatttctcttgtctaagatattgttagtcacagtgaga
ttcattcaaaaggatgcagaggagaagaaaacatctttcaatccaagaccgtattttaga
ttgtttgtcaactggcttctagaccttggttctttggatcctgtgattgatggtgctaac
tttcagatattgacagcatttgcaaatgcatttcatgctttgcagccccttaaggttcct
acgttcagctttgcatggcttgagttggtgagtcataggagtttcatgccaaaaatgctt
gttggaaatggtcagaagggttggccctatgtccaacgtttgctggtacatttgtttcaa
tttatggagccatttttgaggaatgctgaacttggagttccggttcatttcatgtataaa
ggcacacttagggtgcttctagtgctacttcatgattttccggagttcctttgtgattat
cattttactttctgtgatgtaatccctccaagctgcattcaaatgcgaaatatcatcctc
agtgcatttccccgtaatatgaggctaccagatccatctactcccaacttaaagattgat
ttgcttgcagaaatcagtcagtctccacgtattctttccgaggttgatgcagctctaaaa
gtgaagcagatgaaagctgatgtggatgagtatctcaagacaaggcaacagggttcttca
tttctgactgaactgaagcaaaagttgctccttttaccaagcgaagctgcctcagctggt
actcgttacaatgtacccctgatcaactcccttgtgctttatgttgggatgcaggctatc
cagcagcttcaggctagaacacctcatgcgcaatctacccaaactgttccattgactgtc
tatttggtgggtgctgctttggatatttttcagactctgatagtggacctagatactgaa
gggcgctaccttttcctaaatgcgatcgcaaaccaactgcgttatccaaacacccatacc
cattacttttctttcattgttttgtacttgtttgctgaatcaaaccagcatgaaattatc
caggagcaaatcacaagggtattgttggaacggctgattgtcaaccggcctcatccatgg
ggtcttctaattaccttcattgagcttatcaagaatccgagataccagttctggaaccga
gctttcatcagatgtgcgccagagattgaaaaactctttgaatctgtctcaaggtcttgc
gggggaccaaaaccagtggacgaaagtatggtctcaggttgggtatcggagagcgcccac
taa

DBGET integrated database retrieval system