Entry |
|
Name |
(RefSeq) pumilio homolog 1-like
|
KO |
K17943 | pumilio RNA-binding family |
|
Organism |
pcox Pyrus communis (pear)
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
8:21713878..21721112
|
AA seq |
1052 aa
MLSELGRRPALGGNEGSFGDEFENEIGMLLREQRRQDADDRESELNIYRSGSAPPTVEGS
LNAVGGLFAGVGGGSAGAAFSEFPGGKNGNGFASEEELRSDPAYIQYYYSNVNLNPRLPP
PLLSKEDWRSAQRMKGGGNSVLGGIGDRRKVNRGDEASGRSMFSMPPGFNSRKQESDAES
DKVHGSAEWGVDGLIGLPGLGLGNKQKSLAEIFQDDLGRAAPVSGHPSRPASRNAFDENA
ESVGSAESDLAHLRRDLMTSDTLRSSANGLGSSAAQSMGPPSSYSYAAALGASLSRSTTP
DPQVVARAPSPCLTPIGGGRVGASEKRGFSSPSSFNAISSGMNESGDLVGTFSSMNLSAN
GVKDNESHLPSQIKQDVDDHQNYLFGLQGGENHARQLAYLKKSESGHMHMSSAPHSAKAS
YADLGKSNGGGPDSSDRHVELKKSAVSSGNLYSKGSPTSNLNGGGGLHHQYQQVDHANSS
FSNYGLSGYSMNPALASMVASQLGTGNLPPLFESAMGSPGMDSRVLGGRMASGPNLAAAS
NESHNLAGLGSPIAGSGLQAPFVDPMYLQYLRTSEYAAAQLAALNDPSVDRNYLGNSYMN
LIELQKAYLGALLSPQKSQYGVPMGGKSGGSNHHGYYGNPAFGVGMSYPGSPPVIPNSPV
GPGSPMRHNELNMCYPSGMRNLAPWHLDGGCNIDESFASSLLEEFKSNKAKSFELSEIGG
HVVEFSADQYGSRFIQQKLETATTEEKNMVYQEIMPQALALMTDVFGNYVIQKFFEHGLP
PQRRELANKLFSHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVDLDQKIKMVEELDGHVMRCVRDQNGN
HVIQKCIECVPEKAIHFIVSTFFDQVVTLSTHPYGCRVIQRVLEHCEDENTQSKVMDEIL
GAVSMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPHERSAIIKELAGKIVQMSQQKFASNVVEKCLTFGG
PAERELLVNEMLGTTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQRELILSRIKVHLNAL
KKYTYGKHIVARVEKLVAAGERRAAQSAQHPA |
NT seq |
3159 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgttgtcggaattaggaaggaggcctgcgctcggaggaaacgagggttcctttggggat
gaatttgagaacgagatagggatgctgctgagggaacagcgtaggcaagacgccgatgat
cgcgaaagtgagctgaatatatatagaagcggatcagcacctcccactgtggagggttct
ttgaatgcggttggtgggttgtttgctggtgtcggtggtggcagtgctggtgccgccttt
tcggagtttcctggaggtaaaaatggaaatgggtttgcgtccgaagaggagcttaggtct
gatcctgcttatattcaatactattactcgaatgtgaacctgaatccgcggcttcctcct
cctttgctgtcgaaggaggattggaggtctgcacaaaggatgaaaggaggagggaattcg
gtgttgggtgggataggagacaggaggaaagtgaataggggtgatgaggctagcggtaga
tcgatgttttcaatgccgccaggtttcaactcaaggaaacaagagagtgacgccgagtcg
gacaaagtgcatggctcagcagagtggggtgttgatggactgattggtttgccaggtttg
ggacttggtaacaaacaaaagagccttgccgaaatctttcaggatgacttgggtcgtgca
gctcctgtttctgggcatccttctcgtccagcaagccgtaatgcatttgatgaaaatgca
gagtctgttggttctgctgaatctgatctagctcatttgcgacgcgacttgatgacttct
gatactctacgatcaagtgcaaatggtctgggatcttctgcagcccaaagtatgggccca
ccttcttcatactcgtatgctgcagctctgggtgcttccttatctagaagcaccactcct
gatccccaagttgtcgctagggctcctagtccttgccttacacctattggaggaggaagg
gttggtgcttcagaaaagagaggatttagtagtccaagctccttcaatgctatctcgtct
ggtatgaatgagtctggggatctggtgggcacgttttccagcatgaacttgtctgccaat
ggtgtaaaagataacgagagccatttgccatcacagattaagcaagatgtagatgatcac
cagaattatctctttggtcttcaaggtggcgagaatcatgccaggcaactagcatacctg
aagaagtctgaatctgggcatatgcacatgtcctctgccccacactcagcaaaagcttca
tatgcagatttgggtaagagcaatggtggtgggccagattcctctgataggcatgttgaa
ctgaaaaagtctgctgtttcttctggtaacttatactcaaaaggatctcccacatccaat
cttaatggcggaggtggcttgcatcatcagtatcagcaagtggatcatgcaaactcatca
ttttctaactatggtttaagtgggtactctatgaatccagcattggcgtccatggtggct
agccaacttggcactggtaatcttccacccttgtttgaatcagctatgggatcccctgga
atggattcaagagtgcttggaggacgtatggcttccggaccaaacctagcagccgcttca
aatgaatcacataatctcgctggattagggagtccgattgcagggagtggtcttcaggct
ccttttgttgatcctatgtatcttcagtacttgaggacatctgagtatgctgctgcacag
cttgctgctcttaatgatccatctgtggataggaactacttgggtaattcatacatgaat
ttaattgaacttcaaaaggcatatcttggagccttgctgtcaccacagaagtcacagtat
ggtgttccgatggggggaaagtctggtggttctaatcatcatgggtattatggaaatcct
gcatttggtgtaggcatgtcttatcctggaagtcctcctgttattcccaactctccagtt
ggaccaggtagtcctatgaggcacaacgaactcaatatgtgttatccctctgggatgagg
aatttagctccctggcacctggatggtgggtgtaacatagatgaaagttttgcttcttca
ctcttagaagagttcaagagcaacaaagccaagtcttttgaactttcagaaattggtgga
catgttgtggagttcagtgcggatcagtatggaagtcgttttattcaacaaaaacttgaa
actgccactacagaagagaaaaacatggtttatcaagaaatcatgcctcaagctcttgct
ctaatgactgatgtgtttggtaattatgtgattcaaaagttttttgagcatggacttcca
cctcagagaagggaattggccaacaagctgtttagtcatgtactgacacttagccttcaa
atgtatggttgtcgggtgatccagaaggcaatagaagttgttgatctggaccaaaagatc
aaaatggttgaagaacttgatggtcatgtaatgcgctgcgtacgtgatcagaatgggaac
catgtcatccagaagtgtattgaatgtgtccctgaaaaggccattcattttattgtctca
acattttttgatcaagttgtgaccctttcaacccatccatatgggtgtcgtgtgatacag
agagttcttgagcactgcgaagatgagaatacacagagtaaagttatggatgagattcta
ggagctgttagcatgttggcacaagatcagtatggcaattatgttgttcagcatgtcctg
gagcatggaaaaccgcatgagcgctctgctatcataaaagaattagctgggaagatagtc
caaatgagtcagcagaagttcgcctccaatgtagtagagaagtgtttaacttttggcggt
cctgctgaacgtgaattgctagtgaatgagatgcttggtactactgatgaaaatgagcct
cttcaggcaatgatgaaggatcaatttgcaaattatgttgtacaaaaagtgttggagact
tgtgacgaccagcaacgtgaactgatcctttcccgaattaaagttcatttgaatgcatta
aagaaatacacttacggaaagcatattgttgctcgtgtagaaaaacttgttgctgctggg
gaaaggagagccgctcagtctgctcagcaccctgcttag |