Pyrus communis (pear): 137742207
Help
Entry
137742207 CDS
T10779
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
pcox Pyrus communis (pear)
Pathway
pcox03015
mRNA surveillance pathway
pcox03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcox00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
137742207
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
137742207
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
pcox03041
]
137742207
Spliceosome [BR:
pcox03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
137742207
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
137742207
NCBI-ProteinID:
XP_068338101
LinkDB
All DBs
Position
8:23636481..23640065
Genome browser
AA seq
465 aa
AA seq
DB search
MAGIYGQGGDGAPPTYGSSGGGGYGGSGGYGGGSGGYGGGGGGGSYGGSGGGGYGGKGGD
GGGYGGGRGGGGGGRGGGYQGDRGGGGRGGDRGGGGRGGRGGSGRDGDWLCPNPGCGNSN
FARRVECNKCGTPSPSGAGGDRGSGGGYNRGGSGGGYGGGNRGGRGGNYDGGRSGNYEGG
KSSSYDGGRGSSYDSRGGGGSRGGSYGGSQGRDDGGYGQVPPSAPPSYGAAGGNYAPSYN
ASYGTDAVPPPTSYTGGPGSYPPSYGGPAGGYGGDGLGDARGGGRGGPPAKYDGGYSAGG
RGGYGSAATEAPAKVKQCDQNCDDTCDNARIYISNLPPDVTVDELQQLFGGIGQVGRIKQ
KRGYKDQWPYNIKIYTDESGKNKGDACLAYEDPSAAHSAGGFYNDYDLRGYKISVGMAER
SAPRPSFEQGGGGGRGGYGGGDRRNSYRDGGADRHQHGGNRSRPY
NT seq
1398 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctggaatctacggtcaagggggcgatggtgcccctccgacatacggatctagcggc
ggcggtggctatgggggttctggcggatatggaggcggttctggtggttatggaggtggt
ggtggaggcgggagctatggtggaagcggtggtggtggatacggaggtaagggcggcgat
ggaggtggttacggtggtggacggggcggtggcggtggtggccgaggtggaggatatcaa
ggcgaccgtggtggtggaggcagaggtggcgaccgtggtggtggcggcagaggcggccgc
ggtggcagtggaagagatggtgattggctgtgtcctaatccaggctgtggcaattcaaac
tttgcaagaagagttgagtgtaataagtgtggcacgccctctccttcgggtgccggtggt
gatcgtggcagtggtggtggttataacagaggaggaagtggtgggggctacggtggtggt
aaccgtggtggtaggggtggtaattatgatgggggtcgaagtggtaactatgaaggaggt
aaaagtagcagttatgatggaggcagaggcagtagttatgacagtagaggcggtggtggt
agtagaggtggttcttatggtggtagtcaaggaagagatgatggtgggtatggtcaggtt
cctccaagtgctccaccgtcctatggtgcagctggaggcaattacgcaccatcttacaat
gctagttatggaacagatgcagttccgcctcctacaagctatactggtggacctggatca
tatcccccatcttatggtggtcctgcaggtggttatggtggtgatggtctaggtgatgca
aggggtggtgggcgtgggggccctccagctaaatatgatggtggatacagtgctggtggt
cgtggtggatatggcagtgctgctacggaagccccagctaaggtgaagcagtgcgaccag
aattgtgatgatacttgtgacaatgctagaatctacatatcaaacttaccaccagatgtt
accgttgacgaacttcagcagctctttggaggcattggacaagtgggacgaatcaagcag
aaacgtggctataaggatcaatggccatataatatcaaaatatacacagacgagtctgga
aaaaacaaaggtgacgcatgtttagcctatgaagatccctctgctgcacattcagccggt
ggattttacaatgattatgacttaaggggctataagatcagtgttggaatggcggagaga
tcagctccaaggccttcgtttgaacaaggtggtggtggcggtagaggtggatatggtggc
ggtgacaggcgcaacagttatagagatggtggagctgatagacatcagcacggcggaaac
cgttcgcgtccttactga
DBGET
integrated database retrieval system