Candidatus Protochlamydia amoebophila: PC_RS01090
Help
Entry
PC_RS01090 CDS
T00172
Name
(GenBank) unnamed protein product
Organism
pcu
Candidatus Protochlamydia amoebophila
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S9
BD-FAE
DLH
Peptidase_S15
Hydrolase_4
Abhydrolase_6
Abhydrolase_1
Esterase
Abhydrolase_3
AXE1
Abhydrolase_11
BAAT_C
PD40
DPPIV_N
XPC-binding
WD40_WDHD1_1st
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAF22949
UniProt:
Q6MEQ0
LinkDB
All DBs
Position
319680..321629
Genome browser
AA seq
649 aa
AA seq
DB search
MRVWKLIILVGLFGWSMTNATISSQESTTLIPRHLLFGNPEKTNPRLSPNGQYLAYLAPD
AQNVLNVWLKNLKTAEKDRQVTTDKKRGIRSFLWQFDGDHILYEQDKDGDENWHLYQTHI
QSNLTRDLTPYEGVKAEIVQYDPKFPQDLLVQLNLRNPQLFDVYRLDLQTRNLQLDTENQ
ANVIRWVADHNLCIRIAQSYNDDGSMLIRTREGKDQSWKEFLKLDASEINGEVYGFTADN
QSIYLISSLQGNTAGLLLVDLTTGKQNLIVDDPVYDLSTLMTHPTTYALEAVGFDKEKFE
WKALDNAVKIDFSLLSTKLNTPFKIINSDLANQKWVVASLSDQRPVRYYLYERQSKFLTF
LFSAQSSLENFTLSAMSPISLSARDGMKLYGYLTLPSGKEPRNLPMILLVHGGPWARDSW
GLNPTVQWLTNRGYAVVQLNYRGSSGYGKHYLNAGNREWSKKMHTDLLDAKQWMIDQGYV
DPHKVAIYGGSYGGYATLVGLAFTPDEFCCGVDIVGPSNLVTLLQTLPPYWAPLKAKMEL
RLGNLDTDAEFLKACSPLFKVDQIKKPLLIAQGANDPRVKQSESDQIVKAMREKNLPVEY
LLFPDEGHGFARPENRLKFAAAAEDFLVKYLGGRSEPASSAEDWKTLRK
NT seq
1950 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagagtttggaaattaattattttagtgggtttgtttggttggagtatgacaaatgca
acaatttcatctcaggagtcgaccactttaattccaagacatcttctatttggaaatcct
gagaaaacaaatcctcgattatctccaaatggtcaatatttggcttatctagcgcctgat
gcacaaaacgttttaaatgtttggctaaaaaatttaaaaacagcagaaaaagacagacaa
gttacgacagataaaaaaagaggaatccgctcatttttatggcaatttgacggggaccat
attttgtacgagcaagataaagatggggatgaaaattggcatctttatcaaacgcatatt
caatctaatcttacaagagatttgactccatacgaaggcgtgaaagctgaaattgtgcaa
tacgatcctaaattcccccaagatttgttagtacaattgaacctgcgcaatcctcaactc
tttgacgtatatcgtctcgatttgcaaacgagaaatttacagcttgatacggaaaatcag
gcaaatgtcattagatgggtggcagatcacaatctttgtattcggattgctcaatcctat
aatgatgatggatcaatgctaattagaacaagagagggtaaagatcaatcttggaaagaa
tttttgaaacttgatgctagtgaaattaacggggaagtttacggttttacagctgataat
caatcaatttatttaatctctagtttgcagggaaatacggcaggtcttttattagttgat
ctgacgacaggaaaacaaaatttaattgtggatgatcccgtatacgatttatccactttg
atgactcacccaacaacttatgctcttgaagcagtaggatttgataaggaaaagtttgaa
tggaaagctttagacaatgccgtcaaaattgatttttctttattatcaacgaaattaaat
actcctttcaagattattaactcagatctagccaatcaaaagtgggttgttgcttctttg
tctgatcagcgccctgttcgttattatctatatgaaaggcaatctaaatttttaaccttt
ctttttagtgctcaaagttccttggagaatttcactctaagtgccatgtcacctatctcc
ttatcggcaagagatggaatgaagctttacggttacctgactttaccgtctggaaaagaa
cctagaaacttgccaatgattttacttgttcatggaggtccttgggcaagggattcttgg
ggattaaatccaactgttcagtggttaactaatcgcggttatgctgtcgtgcaattgaat
tacagaggctcaagtggatacggcaaacattatttgaatgcgggaaatcgagagtggtct
aaaaaaatgcacactgatctactggatgcaaagcaatggatgattgaccaaggatatgtt
gatcctcataaagtagctatttatggaggtagttatggtgggtatgctacgctggtaggg
ctggcatttactcctgatgaattttgttgtggggttgatatcgtcggcccttctaacctc
gtaactcttttgcaaacactccctccctattgggctcctttaaaagcaaaaatggagctt
cgtttagggaatttagatacagacgccgaatttttaaaagcatgttcccctctttttaaa
gttgaccaaattaaaaaacctctcttaatcgcgcaaggtgccaatgatcctcgggtaaag
cagtcagagagtgatcaaattgttaaagcgatgcgagagaaaaacttacctgttgaatat
ttattatttcctgacgaaggccatggttttgcaaggccggaaaatcgattgaaatttgca
gctgcggcagaagattttctggtgaagtatttaggtggaagaagtgagcccgcctcttca
gccgaagattggaaaactcttagaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
