KEGG   Candidatus Protochlamydia amoebophila: PC_RS03555
Entry
PC_RS03555        CDS       T00172                                 
Name
(GenBank) unnamed protein product
Organism
pcu  Candidatus Protochlamydia amoebophila
SSDB
Motif
Pfam: RHS_repeat DUF6531 DUF1392
Other DBs
NCBI-ProteinID: CAF23463
UniProt: Q6MD86
LinkDB
Position
complement(927202..932709)
AA seq 1835 aa
MRWIIYILLNFILCLQTLTANNNDSIPAIESVATTEGLPSSLVGGMVCAISGQLVDQSVD
VVVPGPEPLIFSRSYCSLSTQERFGISWWSNHRDMLYYSHGVYQQKEVNYCQLFSTSGST
LTYYHSLILDGDKKKCQFKMIRPKGLTNGAGNEISGRTNVNNYQVTTYPDDEQFSVKTGA
GVVKHIQRYKTPLGDINYLQSSETKPNGIRLEYVHSKDVFGRLHIIKCLNAKTQRIFSTI
RFDQVGKRLHLQTSDNQVVKYSFTRQTVKNYSNDTILYVKDVEKPRFPHESYEYVKRDSS
DFLLMSKKKIADKQFLDISYYKNKHLYQFNNALPAICIEDKNDYRIDRVRQLKAPVGPDD
KAITTHRFVYDIKQDDNELQEGKTDVYDAYSHKTTYCFTKEHRLEQIRKYQGTSDYHLFS
KEGFVWGKEGSSNEGNLICKYLKDGQGNTHQARYFKYDERGNIKKKELWGCLTGMPTPQL
QLDKHHIPINNGCEKEKKVCTYSEDGLNHLLTETDSNGVVTVYHYYPRSDLLAAKLIVVD
EIVQKREFYTYDQNHVIIKKVIDDGKGLLEYDLTGLTKRFITHFYPRQHTLVHLPERVDH
MYLDLQSKQEVLLNKVIYHYTLEGYLAKEDTYDNQGDFCYSKSWEYDGHGNCTKEINPLG
EVSSKKYDDYNNLIFQEEPGSQFSLHNTYDYSNRLVLQEEKHTDGNYFATKHRYNYLNQC
IATTDPYGQETTFEFDDLGRQIATHLPEIENEAGEIVSPVIHREYNLIGLPTCVTDAKGL
QTKIQYNIRGQPILAHYPDGSSEQYLYLLDGTLIQKTERSGIRTHYEKDYQGRILTESTY
AAEGNLLCAQHWSYNAFHPLTYIDKEGIVTHYHYDFAGRLVSQIKEDQMTEYFYDSLGRE
IETKEWIDESNYRRTIKVYDWLNRIIEDRLEDAQNQLYQCNQYTYNAKGNKIVVKAGEQV
TKTTYDAHQNVIKITNALGQTTHTAYNPYYLNHYNQRVLQATTTDALGYQTILTYDNANR
LVSEKRKTPFGIEISHQQFYYDLNGNQAKRIDHVMVDGKTTHSIETLFSYNENNQLIMLA
EAAYTPEQKITHYLYNQRSQKISTTKPNGAILSHTYDSFGYLKTLKSSDGSIDYDYEYTL
NGLVKKVVDYVTESSTERLYDQMGRMIQEKLGNGLILAYQYDRLGRAILITLPDQTTIEY
QFSAVDLKAVHRLVNEKYSYTHKDLEHNLQGAPIKSQPPGENGLVHYQYDSLDRCVGVAS
PFFKQTISSEGYDEVGNLLSYETDGKVSSYTYDDFYQLQSEKGHANHKYQCDSLSNRLLK
DDQEHTYNSLNQLLKRGDETYLYDPNGNLIEKQTASEKTIYTYDALDRLQSVTSKQKTIS
YSYDPFNRRLSKKGVKEEMYFHQGQEEIGAIVKGKITELKVLGKGEKYPPVAIELNDQVY
VPIRDLFGQISGLQSLQGQLIETYRYSAFGEIQILNAKGKEIKESQVGNPWRYANKRFDP
ETGFVAFGLRYYDPNLGRWVTADPSGFEDGPNLYAYVHHSPLIYFDQFGLFTFSGLLDTT
FDYTMALCDYGAFGIPGFVASNVYQYLNNDPLNNVVNHKFCESEKDYEFFHSDSEIPDAI
YYNRSAVYNLNDFKNPSTNMPYNLKMTQGKLLMFMNGVNNSLQDHLSSLGHLGLLANHNV
LGVYSASQGMFSDFYHYKQALINNVAYESVRILHRSWNEFFKDTPEGKILMVCHSRAAVY
VRNALMDYPPELRKQIQVLAVAPGGYIADGLCGKVKHLTSDKDLIPWLDYHKISRCGDTV
VNLKAHPEYFIMDHSFQSPTYAPEIKKFANKFFHE
NT seq 5508 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcgttggataatatatatactgttgaactttattctttgcctgcaaacgctgacagca
aacaacaatgattctattccagccattgaatcagttgcaacgacagaagggctcccttca
agtcttgtaggtggaatggtttgcgccattagcggacagttggtcgaccaaagtgtggac
gttgtggttccaggacctgaacccttaatttttagtcgttcttactgtagtttaagtacc
caagaaagatttggcataagttggtggtccaatcatcgcgatatgctctattattcgcat
ggagtataccagcaaaaagaggtaaattattgccaacttttttcaacaagtgggtccacc
ctaacttattatcattctcttatcttagatggtgacaaaaaaaaatgccaatttaaaatg
attcgtcctaaagggctgactaacggagcaggaaatgaaattagtggacgaacaaatgtc
aataattaccaagtgacaacttatcctgatgatgaacaattttcagtcaaaacaggagcg
ggagttgttaaacatattcagcgctataagaccccgttaggagacattaattaccttcag
tcgagtgaaaccaaaccaaatggcattcgtttagaatatgtccattccaaggatgtattc
ggaagactccatattattaagtgtttaaacgctaaaacacaacgaatatttagtacgatt
cgatttgatcaagttggtaagcgtcttcatcttcaaaccagcgacaaccaagtggtcaaa
tatagttttactcgacaaacagttaaaaattattctaatgacactattttatatgtaaaa
gacgttgaaaaacctagatttcctcacgaaagctatgaatatgtcaaaagagattcatct
gatttcctcctgatgtcaaaaaagaaaattgctgataagcaatttttagatattagctac
tacaaaaacaagcatctctatcaatttaataacgctcttcctgccatttgtattgaagat
aaaaatgattatcgcatcgaccgtgtgcgacaattaaaagcacccgttgggccagatgat
aaagctattacaactcatcgctttgtatacgatatcaaacaggatgataacgagcttcaa
gaagggaaaacagatgtttatgatgcctactctcataaaacaacttattgcttcacaaaa
gaacaccgcctagaacaaattcgaaaatatcaaggcacttccgattatcacttatttagt
aaagaaggttttgtatgggggaaagagggttcctcgaatgaaggaaatctcatttgtaaa
tatctcaaagatggtcaaggaaatacgcatcaagcgagatattttaaatacgatgagcga
ggaaacattaaaaaaaaggaattatggggatgtttgacaggaatgccaacccctcaactt
cagcttgataaacatcatattcctattaataatggttgtgaaaaagaaaaaaaagtttgt
acgtattcagaagacgggttaaatcatcttttgacagagacagatagtaatggcgttgtt
accgtctatcattattatccaagaagtgatcttttagccgctaagctcattgtcgttgat
gaaatcgtacaaaaaagagagttttatacttatgaccaaaatcatgtcatcattaaaaaa
gtgattgatgatgggaaaggattattagaatacgatttaacaggtttaacaaaacgcttt
attacccacttttacccaaggcagcatacacttgtacatttgccagaacgagtagatcat
atgtatttggatttgcaatccaaacaagaagtgttgcttaacaaagttatttatcattat
accctggaaggttatcttgcaaaagaagacacttatgataaccaaggcgatttttgttat
tcaaaaagttgggaatatgacggccatggcaactgcaccaaggagattaatcctttgggt
gaagtctcttctaaaaaatatgatgactataataatctcatcttccaagaagagccgggt
tctcaattttctttacataatacttacgactattccaatcgtctcgttttgcaagaagaa
aagcatacggatggtaactattttgcgaccaagcaccgctataattatttaaaccaatgt
atcgccacaactgatccttatggacaagaaaccacatttgaatttgacgatcttggtcgt
caaattgccacacatttacccgagatagaaaatgaagctggagaaattgtttctcccgtt
attcatagagaatataatcttatcggtcttccaacttgtgtaacagatgctaaagggttg
caaaccaaaattcaatataacattcgtggtcagcctattcttgcccactatcccgatgga
tcatccgaacaatatctttatttgctagatggaactctcattcaaaaaactgaacgctct
ggcatacgcacgcactatgaaaaagattatcaaggaagaattctaaccgaatctacttat
gctgcagaaggaaaccttctttgtgcacagcattggtcgtataatgctttccaccccttg
acctatatagataaagaaggaatcgtcactcattatcattatgattttgcgggtcgccta
gtctctcaaattaaagaagatcaaatgacagagtacttttacgatagtttgggacgagaa
attgaaactaaagaatggattgatgaatcaaattatcgacgtaccattaaagtctatgat
tggctcaatcgtattattgaagataggctagaagatgctcaaaatcagctctatcaatgc
aatcaatatacttacaatgcgaaaggaaataaaattgttgttaaggcaggtgaacaagtc
acaaaaacaacttatgatgcccatcaaaatgtgataaaaattaccaatgcacttggtcaa
acgacgcacacagcttataatccttactacttaaaccattataatcaacgcgtcttgcaa
gccaccacaacagatgccctaggttatcagacaattcttacctatgacaacgcgaatcga
ttagttagtgagaagcgaaaaactccttttggaatagagatttctcatcaacaattttat
tacgatttgaatggcaatcaagcaaaacgcattgaccatgtgatggtggatggaaaaaca
acgcattccatcgaaacccttttcagctataacgaaaataatcaattaatcatgcttgca
gaagcggcttatacacccgaacaaaaaatcactcattacctctataatcaacgaagtcaa
aaaatttctaccacaaaacccaatggagccattttatctcacacctacgattcatttggc
tatttaaaaacattaaaatcttctgatggatctattgattacgattatgagtatacatta
aatggactggtaaaaaaagtcgtcgactatgttacagaaagctctactgagcgtttgtat
gatcaaatgggacgaatgatccaagaaaaactcggaaatggattaattcttgcttatcaa
tacgatcgccttggcagagctattcttatcaccctacctgatcaaacaacaattgaatat
cagttcagcgcagtcgatttaaaagctgttcatcgtttagtaaacgaaaagtactcttat
acgcataaagatttagaacacaatctacaaggtgcaccaattaaatcccaaccgccagga
gaaaatggccttgttcattatcaatatgattctttagatcgatgtgtcggcgttgcctcc
ccttttttcaaacaaacaatttcaagtgaagggtatgatgaggtcggcaatctgctcagc
tatgaaacggatggcaaagtttcttcttatacttatgatgatttctatcaattacaaagt
gaaaaaggacatgctaatcataaataccaatgtgattccctatcgaatcgcttacttaaa
gatgatcaagaacacacatacaattccctcaatcaacttttaaaaagaggagatgaaacc
tatctctatgatcccaatggaaatttaattgagaaacaaacggcctcagaaaaaaccatt
tacacctacgatgcccttgaccgtctccaatcagtaacatccaaacaaaaaacaatttct
tactcttacgatccttttaatcgacgcctgagtaaaaaaggtgtcaaagaagagatgtac
tttcatcaaggacaggaagaaattggagctatcgttaaaggaaaaatcactgaattaaaa
gttcttgggaaaggtgaaaagtatccccctgttgcgattgaactaaatgatcaagtctat
gtccccattcgtgatctattcggtcaaattagcgggttacagtctttacaagggcaacta
attgaaacttatcgttattctgcttttggagaaattcaaatccttaatgcgaaaggaaaa
gaaattaaagaatctcaggttggaaatccttggcgttatgctaacaaacgatttgatccc
gagacaggatttgtcgcatttggtcttcggtattatgatcccaacctcggtcgctgggtc
acagctgatccttccggctttgaagacggtcctaacctttacgcctatgtgcatcatagc
cctctgatctactttgatcaatttggactattcaccttttcaggtttattagataccact
tttgattacacaatggctttgtgcgactatggtgcatttggaattcctggctttgttgcg
agtaatgtgtatcagtacctaaataacgacccattaaacaatgttgtgaatcataaattt
tgtgaatctgaaaaagattatgaatttttccattcagattctgaaattcctgatgctatt
tattataatcgatccgcagtatataatttaaatgactttaaaaatccttcaaccaatatg
ccctataacttaaagatgactcaaggtaaactcttaatgtttatgaatggtgtgaataat
agccttcaagatcaccttagtagccttggccaccttggtttacttgctaaccataatgta
cttggggtatactctgcttcccaagggatgtttagtgatttttaccattataaacaagct
ttaataaacaatgttgcttatgaatctgtgcggatactacatagatcttggaatgaattt
ttcaaagatactcctgaaggaaagattttaatggtttgccatagccgagctgctgtttat
gttcgaaatgctttaatggactatccgccagaattgagaaaacagattcaagtccttgct
gtcgctccaggaggatacatagcggatggcttatgtggcaaagtaaagcatctaacgagt
gataaagatcttattccttggttagattatcataaaatttcgagatgtggagacacagta
gtgaatttgaaagcccatccagaatatttcattatggatcattcattccaaagcccaact
tatgcacctgaaataaaaaaattcgcaaataaattttttcatgaataa

DBGET integrated database retrieval system