Phoenix dactylifera (date palm): 103700889
Help
Entry
103700889 CDS
T03274
Name
(RefSeq) phytochrome C
Organism
pda
Phoenix dactylifera (date palm)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PHY
PAS
PAS_2
GAF
HisKA
PAS_9
HATPase_c
PAS_4
PAS_8
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103700889
NCBI-ProteinID:
XP_008781008
UniProt:
A0A8B7MSJ8
LinkDB
All DBs
Position
16:complement(8123129..8132726)
Genome browser
AA seq
1126 aa
AA seq
DB search
MSSRSNRATCSRSSSARSKHSARVVSQTSLDAKLHAEFEDSDRPFNYSMSIGAANRSGGT
ESCGIPSSTVSSYLQQMQRGKFIQPFGCLLAIDDQMFTIIAYSENAPEMLDLTPHAVPSI
EQREALTIGTDVRTLFRSPSSVALQKAASFGEVYLLNPILVHCRSSGKPFYAIMHRVEVG
LVIDLEPVNPADVAVTAAGALKSYKLAAKAISRLQSLPSGNISLLCDVLVREVSELTGYD
RVMAYKFHEDEHGEVIAECRRSDLEPYLGLHYPATDIPQASRFLFMKNKVRMICDCSAPP
VKVIQDKKLAQPLSLCGSTLRSPHGCHAQYMANMGSIASLVMSVTINDDDDETGSEQQQK
GRKLWGLVVCHHTSPRFVPFPLRYACEFLLQVFGIQLNKEVELAAQAREKHILRTQTLLC
DMLLRDAPVGIFTRSPNVMDLVKCDGAALYYRNQFWLLGTTPTGAQIRDLVAWLQEYHDG
STGLSTDSLTEAGYPGVADLGDAICGMAAIKITSKDFIFWFRSHTAKEIKWGGAKNEPDT
RDGQKMHPRSSFKAFLEVMKQRSVPWEDIEMDSIHSLQLILRGSLQDEIVNDESKTIVNA
PLDDSKKIPGVDELHMVTNEMVRLIETATVPIFAVDASGNINGWNTKAAELTGLSVNEAI
GMPLIDVIEDDSVGLAKNVLCLALQGKEEQNVEIKLKTFRYRESTGPIILVVNACCSHDM
KDNIVGVCFVAQDMTGHKMVMDKYTRIQGDYTAIVRNPSELIPPIFIIDENGCCFEWNSA
MQKLSGLKREDVIDKMLVGEVFSLQSFGCRVKDHDTLTKLRIVLNGVIAGQDAEKLLFGF
FDINGKYVEALLSANKRTNSEGRITGVLCFLHVASPELQHALQVQKMSEQAATNSLRELA
YLRQEIRNPLNGIVFTRNLIESTNLNEEQKQLLKRGALCQEQMTKVLDDMDLESIEQCYM
ELNTVEFNLGEALDTVMMQGMSLSSERQVPLVHDWPAEMSSMYLYGDNLRLQQVLSDFLL
TALQFTPPTVGSILFQVIPRREIIGTGVQIIHLEFRIFHPAPGIPEALVQEMFHHSQCIS
REGLGLYISQKLVKIMTGTVQYLREAERASFIILVEFPLVHDAGGR
NT seq
3381 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgtccaggtcgaacagagctacctgttcgcggagcagctcagcacggtccaagcac
agtgctcgtgtggtttctcagacctccttagatgcaaagctccatgctgagttcgaggac
tccgatcggccatttaattactctatgtcgatcggtgctgccaatcggtcgggcggcact
gagagctgtggcatcccctcctccacagtctcttcttaccttcaacagatgcagcgggga
aagttcatccagccctttgggtgcttgcttgccattgatgaccagatgttcaccataatt
gcatatagtgaaaacgcccctgagatgctggacctgacacctcatgctgtccccagcatc
gagcagcgggaagccttaacaatcggtaccgacgtccgaactctcttccgatctccgagc
tctgttgccttgcaaaaggctgcaagctttggagaggtttatcttcttaacccaatacta
gtacattgcagaagctcggggaagcctttttatgcaataatgcaccgagttgaagtggga
ttggttatagacttggagcctgtgaaccctgctgatgtggcagtgactgcagctggagca
ctaaaatcctacaaactagcggcaaaagcaatttctagactgcaatctttgcccagtggg
aatatctctctcttatgcgatgtcttggttcgagaagtaagcgagctgacgggctatgac
agggtgatggcttataaattccacgaagatgagcatggtgaagttatagctgagtgtagg
agatcagatttggagccttaccttggattgcattaccctgctactgatattcctcaggct
tcgaggtttctattcatgaagaataaagttaggatgatatgtgattgttctgctccacca
gtgaaagtaatccaggataagaaattggctcagcctctcagtttgtgcgggtctacatta
agatctcctcatgggtgtcatgctcagtacatggctaatatgggttcgattgcttctctc
gtaatgtcggtcacaatcaatgatgatgatgatgaaacaggcagcgaacagcagcagaag
gggaggaaactctggggattggtggtttgccatcacactagcccaaggtttgttcctttt
ccactcagatatgcctgtgaatttttgttgcaagtatttggcatacagcttaacaaagag
gtagagttagcagctcaagcaagggagaagcatatccttcgaacgcaaactcttctatgt
gatatgctcctccgagatgcccctgttggaatttttacacggtcacctaatgttatggat
cttgttaaatgtgatggtgcggccctctattaccgaaaccagttttggctgttgggaaca
acacctactggagcgcagataagggatcttgttgcatggcttcaagagtaccatgatggc
tctacaggcttaagtactgacagcttaacagaagcaggttatccaggtgttgctgaccta
ggagatgcaatatgtggcatggctgcaattaaaattacttccaaggattttatcttttgg
ttccggtcacacacagcaaaagagatcaagtggggtggtgccaaaaatgaacctgacact
agagatggacagaaaatgcatccaagatcttcattcaaggccttcttggaggtgatgaag
caaagaagtgttccttgggaagatattgaaatggactcaatccactccttgcagctcata
ttgcgtggatcgctgcaagatgagattgtgaatgatgagtccaagaccatagtaaatgca
ccattagatgattcaaagaagataccgggtgtggatgaactgcatatggttaccaatgaa
atggttcgtcttattgaaacagcaacagtgccaatttttgctgttgatgcctcagggaac
ataaatggctggaatactaaggcagcagaattgaccggattgtctgtgaatgaagctatt
ggtatgcctctaattgatgttattgaggacgattcagttggactggcaaaaaatgtgcta
tgcttggctttgcaaggaaaagaggagcaaaatgttgaaatcaagcttaaaacatttaga
tatcgagaaagcaccgggcctataatcttggtggttaatgcatgctgtagccatgacatg
aaggacaatattgtgggagtctgctttgttgcacaagacatgacagggcacaaaatggta
atggataagtatacccgcattcaaggtgactacactgccatagtgagaaatccaagtgaa
ctcatccctccaatttttataattgatgagaatggttgctgttttgaatggaattcagca
atgcagaagttatctggtttaaagagggaggatgtaatcgataagatgcttgttggggag
gtgttcagccttcaaagttttggctgtagggtgaaggatcatgacacattaaccaagctc
agaatagtgctgaatggtgtgattgcaggccaagatgcggagaaattattatttgggttc
tttgacatcaacggcaagtatgttgaagcattactttctgccaataagaggacaaattca
gagggtaggatcacaggggtcttatgctttctgcatgtcgccagcccggaactccaacat
gctctgcaggtgcaaaaaatgtctgagcaggctgcaacgaacagtctaagggaattagct
taccttcgccaagaaataaggaaccctttaaatgggattgtatttactcgcaatttgata
gagtctactaatttaaatgaggagcagaagcaacttcttaagagaggtgccctgtgtcaa
gagcagatgacgaaggtcttggatgacatggatttagaaagcattgagcaatgctacatg
gagctcaacacagtagaatttaaccttggggaagctctggatacggtcatgatgcaggga
atgtctctgagcagcgagcgacaggtgccgcttgttcatgattggcctgcagaaatgtcc
tccatgtacttatatggtgacaatctgaggcttcagcaggtcctgtcggacttcttgttg
actgcacttcagttcacaccccctactgtaggatcaattttgttccaagtcattccaaga
agggaaattataggaacaggagtgcagatcattcaccttgaattcaggatttttcatcca
gcaccaggaatcccagaggctttggtacaggagatgttccaccatagccaatgcatatcg
agagaaggccttggcctatacatcagccagaaacttgtgaaaataatgactgggacggta
cagtatcttagggaagctgagagagcatctttcataattctagtggagtttcccttggtt
cacgacgcaggtgggagatga
DBGET
integrated database retrieval system