Paramisgurnus dabryanus (large-scale loach): 135718123
Help
Entry
135718123 CDS
T10799
Symbol
fbn2a
Name
(RefSeq) fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
pdab Paramisgurnus dabryanus (large-scale loach)
Pathway
pdab04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pdab00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
135718123 (fbn2a)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pdab00536
]
135718123 (fbn2a)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pdab00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
135718123 (fbn2a)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
hEGF
FXa_inhibition
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
135718123
NCBI-ProteinID:
XP_073672394
LinkDB
All DBs
Position
11:36229482..36339890
Genome browser
AA seq
2665 aa
AA seq
DB search
MPSKGDLWCFVGLLGILMGKISGIDGKVSGHMNGSERREKQEFLRGPNVCGSRLNTYCCP
GWKKLPVGNLCVVPICQNSCGDGFCSRPNMCTCPNGQIASTCATKSLQSCSIRCLNGGLC
KDDRCQCLKGYTGTFCGQPVCEKKCQNGGRCVEPNRCACVYGFTGPQCERDYRTAPCFIQ
VLNRKCAGQSSAFVCSKTLCCGTVGRAWGHSCELCPLLSSPCSRGFTPNTRTGVCQDVDE
CKYIPDLCKGGRCINTAGSYQCRCTLGYHHDMTSLMCQDVDECSSVDHGVCDGGYCINTP
GSYSCVCPSGYLLSTDRTRCLDPHAGICFTSVVHGRCVQELSGRFSRTQCCCDHGRCWSH
EKCPVPGSDEYFRMCLVGSALTGYNEEDTDTNLHSLDNEQNTPQVHEIPQVLHHEQRPEQ
HFFSMNETVNRCRLFPNLCLNGHCVPVGSNYRCDCNIGYRENHRGECSDVDECASDPCSN
GNCVNTLGSYHCTCHVGYIRAPDKHICIDNDECLQNAVLCKNGRCVNTEGSFQCICNAGF
NLSPDERSCVDHDECASANMCLNGMCINEDGSFKCLCKPGFTLNPSGQYCTDMDECQTPG
VCINGRCVNTEGSFRCDCSAGLTVGLDGRTCVDTHVRSSCYGAIKRGLCFRPLQRAVTKS
QCCCASPEFAFGEPCRPCPARNSAEFQALCAAGVGFSADGTDINECILDPDVCSNGRCEN
LRGSFRCVCNTGYESDPNGKSCLDIDECVVNSRLCDNGLCRNVPGSYSCSCPSGFTFRHD
TETCEDVNECVRSPCVNGVCKNSAGSFTCQCSLGSKLDSTGLICVDTMKGSCWLTLQDGH
CEVNVNADTLRSECCATLGSAWGSPCEPCQTDPVCEKGFARPKGSICEDVNECEVFPGVC
RDGYCINTRGSFECRCSDGLVLDVTGRLCVDIRSESCYMTYDEDVCTQPVPGRFRMDVCC
CTVGLAWGKVCELCPQPGTNWYSALCPRGPGFANKGEVLTNRPVYKDINECKVFSSICTF
GKCRNTVGSFRCRCDSGFALDMNERNCTDIDECIISPDVCAHGTCVNTLGSFQCECFPGY
ESGFMMMKNCVDIDECERDPSLCSGGVCENTDGGFQCLCPAGLHLSGDGSVCEDVNECES
NPTLCHNGRCVNIMGTYQCTCSSGYQTTPDRKDCTDIDECTIENGGCELYCSNTEGSYLC
SCSQGYVLTPDQRTCADVNECEEDVDICEGGQCVNVPGEYHCLCYEGFMASVDMKTCVDV
NECEVKPNICVFGECENIKGSFVCHCEMGYSVKKGTSGCTDVDECEMNAHDCDTHASCVN
TKGHYYCSCIDGWSGDGLRCADIDECMERSDVCSPDAECVNTVGSYFCQCSHGFTGDGFT
CSDMDECADDVDLCENGQCLNVPGGYRCECEIGFTHTPNSRTCRDIDECSFKNICVCGTC
QNIPGMFRCICDDGYELDSTGGNCTDVDECVDPLRCVNGHCKNTAGSYQCICPTHFQLNP
TGVGCVDTRAESCFLDAASHRRSGLMCDSEVGFGVSRSSCCCSLGRAWGKPCDLCPRLNT
SDYNSLCPGGEGFRPNPISIILEDIDECLELPGLCQGGDCINTFGSFHCDCPSGFSLNPD
TRFCEDIDECLFRPEVCGPGTCYNTLGNYTCVCPQDYIQVNGGNSCMDMRKSLCYREYKS
STCKHQLTFNTTQRLCCCAYNVGKAWSKPCQSCPIPGTGSFRSLCGGVTGFKIDIETGKP
KDIDECREIPGICAHGLCINHIGSFRCECPTGFNYNDLLITCEDIDECSSLGRVCQRYAD
CINSPGSYQCECSDGYILSPNGACTDRNECVETPGVCHHGDCVDLPGGYECVCHNGFMAT
PNGRMCTDVDECLQQPCGNGTCKNSVGSFNCICHPGFQLTHNTYCTDIDECEVFHGELCR
HGQCVNNMGSFKCHCKDGYELTSDDKNCRDINECQKSPGTCAPGSCLNLDGSFKCVCPEG
FITHNHLCVDVNECLEDSSVCLYGSCFNTLGSFECVCKPGFLLSEDKRHCYDTRESFCFT
NFEKGRCSVPQAFNSSKAKCCCSIMTKEGWGDPCELCPKEQDAGFLDLCPFGHGIIPGVG
DTRIDINECVENPEVCVNGHCINTDGSFRCECPAGYTLDYTGTSCDDMDECSLGNPCGNG
TCSNVFGGFECLCEEGFEPGPMMSCEDVNECAQNPLLCAFRCINTFGSYECGCPSGYTLR
EDRRMCQDVDECTEDLHDCDSREMKCKNLIGTFMCVCPVGMIRRTNDEVCQDENECLTQP
GVCENGRCVNTVGSYTCECNTGFKPDTTATQCLDYRQGFCFTDVLHKMCQMSSRSLTPVS
RSQCCCDGGQGWGNQCELCPLPDTSSYKRLCPYGAGYTTDGADIDECKVIPDVCVNGRCM
NMMGSYRCLCKPGFISSTAGTACVDVDECGMSPKPCNFICQNTEGSYMCSCPRGYTLQDD
SRTCRDVDECTNKPHSCQFTCVNTIGGFTCKCPPGLTQHHTTCRDINECTSDTGVCGPKG
VCKNTAGGFNCECPKGFFLDSTGLNCQDIDECVGDHTCKFGCQNIAGSFRCRCPPGYTQH
QQWNQCVDENECSSQSHCGSVSCFNTLGSFRCVCPAGFSFDPVSLSCEDMNECDSHSNPC
RYGCTNTEGGFMCECPAGYHRAGHG
NT seq
7998 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccatctaaaggggatttgtggtgttttgttggtcttctgggaattttgatgggtaaa
atctcagggattgatggaaaagtgtctggtcatatgaatggatctgagagacgagaaaaa
caagagttcttgagaggtcctaatgtttgtggatctcgattaaacacttactgttgtcca
ggctggaagaagctgccggtggggaatctctgtgtcgtgcctatttgccagaacagctgt
ggtgatggtttctgttcccgacccaacatgtgtacctgtcccaacggtcagatcgcctca
acctgtgccaccaaatcactccagagttgctccatcaggtgtctgaacggaggattgtgt
aaagatgaccgctgtcagtgtttaaagggatacacgggaaccttctgtggacaaccggtc
tgtgagaagaagtgtcaaaatggtggacgctgtgttgagccaaaccgctgtgcatgtgtg
tatggatttactggaccacaatgtgagagagattaccgaacagccccgtgctttatccaa
gtgcttaacaggaagtgtgcgggtcagagcagtgcttttgtgtgcagtaagactctgtgc
tgtggcactgtgggccgggcgtggggtcattcatgtgagctgtgcccacttctcagctcg
ccctgcagcagaggattcaccccaaacacacgcacaggagtttgccaagatgttgatgaa
tgtaagtatatacctgatctgtgtaaaggaggcagatgtataaatacagcaggatcgtat
cagtgcagatgtacactgggatatcatcatgatatgacttcactcatgtgtcaggatgtg
gatgaatgttccagtgttgatcatggtgtatgtgatggaggatactgcattaatactcca
ggcagttactcatgtgtgtgtccttctggatatcttctgtctacagaccggacacgctgc
cttgatccacatgcaggcatctgcttcacgtctgtggttcatggacgttgtgttcaggag
ctgagtggacgcttcagtcgaacccaatgctgctgtgaccacggccgctgctggagtcat
gagaaatgtcctgtaccaggatcagatgaatacttcagaatgtgtctggtggggtctgct
ctcacgggatataatgaagaagatactgatacgaatcttcattcgttggacaatgaacaa
aacacacctcaggttcatgagattcctcaagttctccatcatgaacagagaccagagcaa
catttcttcagtatgaatgagacagtgaacagatgccgtctttttcctaacctgtgtctg
aatggacactgtgtacctgtgggttcaaactaccgctgtgactgtaacattggatacaga
gaaaaccacaggggagaatgttcagatgtggatgagtgtgcatctgatccctgtagtaat
ggaaactgtgtgaacacactgggctcttatcattgcacctgtcacgtcggctacatcaga
gctccagacaaacacatctgcattgacaatgatgagtgtcttcagaatgcagtgctttgt
aagaacggacgctgtgtgaacacagaagggagttttcaatgcatctgtaatgcaggattc
aatctctcacctgatgagagaagctgtgtggaccatgatgaatgtgccagcgcaaacatg
tgtctgaatggcatgtgcatcaatgaagacggcagctttaagtgtttgtgtaagcctggg
tttaccctaaatcctagtggacaatactgtacagatatggatgagtgtcagactccaggt
gtgtgtataaacggacgctgtgtgaacactgaaggctctttcaggtgtgattgttctgca
ggtcttactgtaggactagatggacgcacatgtgtagacacacacgtgcgcagcagctgt
tatggagctattaaaagaggtttgtgttttcgacccttgcagcgagctgttactaaatcc
cagtgttgttgtgccagccctgaatttgccttcggtgagccgtgccgtccctgccctgcc
agaaactcagctgagtttcaagcattgtgtgcggctggtgttggattttctgctgatgga
acagatattaatgagtgtattctggatcctgatgtctgctctaatggacggtgtgaaaat
ctcagaggaagctttcgctgtgtttgtaacacaggatatgaaagcgatccgaatggaaag
agctgtctggatattgatgaatgtgttgtgaacagtcgtctgtgtgataacggtctttgc
cgaaatgttcctggcagttatagctgctcttgtccctctgggttcaccttcagacatgat
acagagacgtgtgaggatgtgaatgagtgtgtgaggtctccatgtgttaatggcgtttgt
aagaacagtgctggatctttcacctgtcagtgctcactgggaagtaaactggactcaaca
ggactcatatgtgtcgacactatgaagggctcttgctggttaactctccaggacggtcat
tgtgaagtcaatgttaatgcagacacgctgagatctgaatgttgtgctacactgggatcg
gcctggggcagtccatgtgaaccatgccaaacggatcctgtatgtgaaaaaggatttgct
cgaccaaaaggttccatatgtgaagatgtgaatgagtgtgaagtgtttcccggtgtgtgt
cgtgatggttattgtataaacacccgaggatcttttgagtgtcggtgttctgatggtttg
gtgttagatgttacgggacgtctctgtgtggacattcgttcagagtcctgttacatgaca
tatgatgaagacgtgtgtacacagccggtccctggacgttttcgtatggatgtgtgttgt
tgtacggtgggtttggcctggggtaaagtctgtgagttatgtccacagcccggcacaaat
tggtatagcgctctgtgtccgagaggaccgggatttgctaacaaaggggaagtgctcacc
aacagacctgtctataaagacatcaatgagtgtaaagtgttcagcagcatctgtactttt
ggaaaatgccggaataccgtgggaagcttccgatgtcgttgtgacagtgggtttgcgctg
gatatgaatgaacgaaactgcacggatattgatgagtgtattatttcccctgatgtgtgc
gctcatgggacgtgtgtgaacacactgggcagttttcaatgtgaatgttttcctggctat
gagagtggatttatgatgatgaagaactgcgtagatattgatgaatgtgagcgagaccct
tcactctgcagtggaggtgtttgtgaaaacactgatggtggctttcagtgtttgtgtcca
gctggtcttcatctgtctggagacggcagcgtctgtgaagatgtgaatgagtgtgagtcc
aatccaacactgtgtcataatgggagatgtgtaaatataatgggaacgtaccagtgtacc
tgtagctccggttaccaaacaacacctgacagaaaagattgcacagatatagatgagtgt
actatagagaacggaggatgtgagctgtactgcagtaatacagagggaagttatctctgc
agctgcagtcagggttacgtactgaccccagatcagcgcacatgtgcagatgtgaatgaa
tgtgaagaagatgttgatatctgtgaaggtggtcagtgtgttaatgttcctggagaatat
cactgtctgtgttatgaaggatttatggcatctgtggacatgaagacgtgtgtcgatgtg
aatgagtgtgaagtcaagcctaacatctgtgtgtttggggagtgtgagaacatcaagggc
tctttcgtctgtcattgtgagatgggttactcggtaaagaaaggaacctcgggttgcact
gatgttgatgagtgtgagatgaacgctcatgactgtgatacacacgcttcatgtgttaac
actaaaggacattactactgctcctgtatagacggatggtcaggtgatgggctcagatgc
gctgatatagatgagtgcatggagagatcagacgtctgcagtccagatgctgaatgtgtg
aacactgttggctcgtacttctgtcagtgttcacatggtttcactggagatggatttacc
tgctcagatatggacgagtgtgcagatgatgtagatctttgtgaaaatggtcagtgtctg
aatgttcctggtggatatcgctgtgaatgtgagatcggctttacacacactcctaacagc
agaacatgtcgagatatagacgagtgctcttttaaaaacatctgtgtgtgcggcacatgt
cagaatatcccgggaatgtttcgctgtatctgtgatgatggatatgagctggacagcaca
ggtggaaactgcacagatgtggatgagtgtgtggatcctctcagatgtgttaatggtcat
tgtaagaacacagccggttcatatcagtgtatctgtcccactcactttcagcttaacccc
actggagtcggctgtgttgacacacgagctgagagctgttttctggatgcggcatctcat
agacgcagcgggttgatgtgcgatagtgaggtgggatttggagtcagccgttcgtcgtgt
tgttgttctttgggacgagcgtgggggaaaccctgtgatctctgtcctcgactcaacacc
tcggattataactcactttgtcctggaggagaaggattcagaccaaaccccatcagtatc
atcctggaagacattgatgaatgtcttgagctgcccggtctgtgtcagggtggagactgt
atcaatacatttggcagttttcattgtgactgtccaagtggattctcccttaacccagac
actcgcttctgtgaggacattgatgagtgtttgttcaggcctgaggtttgtggtccaggc
acctgctacaatacattgggcaactacacatgtgtctgtccacaggactacatacaagtg
aatggaggaaacagctgcatggatatgagaaagagtttgtgctatcgtgaatataaatcc
tccacctgtaaacaccagcttacctttaacaccacacagagactctgctgctgtgcctac
aatgtgggcaaagcatggagtaaaccatgccagtcttgcccgattcctggcacaggtagc
tttcgaagtctttgtggtggtgtgactggtttcaagattgacattgaaacaggaaaacca
aaagatattgatgaatgtcgtgaaatccctggcatctgtgctcatggtttgtgtatcaat
catatcggcagtttccgctgtgaatgtcccacaggcttcaattacaatgacctgctgatc
acctgtgaagacattgatgaatgcagcagtctgggtcgtgtatgtcagagatatgcagac
tgcatcaacagtccaggcagttaccagtgtgaatgttctgatggatatatcctctcacca
aacggagcctgcactgatcgtaatgagtgtgtggaaacacccggtgtgtgtcatcatgga
gattgtgtggaccttccaggaggatatgaatgtgtttgtcacaacggcttcatggcaaca
ccaaacggcaggatgtgtacagatgtggatgagtgtctacaacagccgtgtggaaacggc
acatgtaaaaactctgtggggtcatttaactgtatctgccatcctggatttcagctcacc
cataatacctactgtacagatattgatgagtgtgaagtgtttcatggagagctgtgcaga
cacggtcagtgtgttaataatatgggatccttcaagtgtcactgtaaagacggttatgaa
cttacttctgatgacaagaactgtagagatattaatgagtgtcaaaagagtccagggaca
tgtgctccaggatcatgtctgaatctggatggatctttcaaatgtgtctgtcctgaaggt
tttattacccacaaccatctgtgtgtagatgtaaacgagtgtttagaggactcgtctgtt
tgtctgtatggctcttgctttaacactttaggaagttttgaatgtgtttgtaaacctgga
tttttgctgtcagaagataaacgtcactgttacgacactagagagagtttctgtttcaca
aactttgagaagggcagatgttcagtaccgcaagcctttaacagcagcaaagctaagtgc
tgctgcagcatcatgactaaagagggctggggtgacccatgtgagctctgtcctaaagaa
caggatgctggatttctggacctgtgtccgtttggtcatggcatcattcctggggtcggt
gacacacgtattgacataaatgagtgtgtggagaaccctgaggtgtgtgtgaatggtcac
tgtattaacacggatggatctttccgctgtgaatgtcctgcgggatacacactcgactac
acaggaacaagctgtgacgatatggatgaatgttcgttgggaaacccgtgtggaaacggc
acatgctcaaatgtgtttggaggattcgagtgtctctgtgaggaaggatttgagcctgga
ccaatgatgagctgtgaagatgtgaatgaatgcgctcagaatcctttgctctgtgcgttt
cgctgcattaatacttttggctcgtacgaatgcggctgtccatccggatacacactgaga
gaagacagacgcatgtgtcaagatgtagatgagtgtacagaagatcttcatgactgtgac
tccagagaaatgaagtgtaaaaatttaatcggcaccttcatgtgtgtttgtcctgtggga
atgatccgcagaacgaatgatgaggtgtgtcaagatgaaaatgaatgtcttactcaaccc
ggggtctgtgaaaatggcagatgtgttaacactgtcggcagctacacgtgtgagtgcaac
actgggttcaaacctgacactactgcgactcaatgcctcgactacaggcaagggttttgt
ttcactgacgttctccacaagatgtgtcagatgtcatccaggtctctcacacctgtcagc
agatctcagtgttgttgtgatggaggtcagggatggggaaaccagtgtgaactctgtcct
ctgcctgataccagcagctataagagactctgtccgtatggagcgggctatactacagac
ggagcagatattgatgaatgtaaagtcattcctgatgtttgtgtgaatggcagatgtatg
aacatgatgggctcatacagatgtctctgtaaaccaggattcatctcatctactgcaggg
actgcgtgtgttgatgtggatgaatgcgggatgtccccaaaaccctgtaacttcatatgt
cagaacacagaaggcagctacatgtgttcatgtccacgcggttatacgcttcaggacgac
agcaggacgtgtcgagatgtggatgagtgtacgaacaaaccacacagctgtcagtttaca
tgtgtcaacaccatcggtggatttacctgtaaatgtccaccaggattaacacaacaccac
acaacctgtagagatataaatgagtgtacgtctgataccggtgtatgtggcccaaaaggc
gtctgcaagaatacagcgggcggcttcaactgtgagtgtccaaagggtttctttctggac
tccaccggcctcaactgtcaagatatagatgagtgtgtcggggatcacacgtgtaagttt
ggttgtcagaatattgccggtagtttccgctgcagatgtccaccgggttacacacaacac
cagcagtggaatcagtgtgtggatgaaaatgaatgctcgagccagagtcactgcggctca
gtgtcctgtttcaatacattgggcagttttagatgcgtctgtcccgctggattcagtttt
gatcctgtgtctctcagctgtgaggatatgaatgagtgcgattcccactcaaacccctgc
agatatggctgtacaaacactgaaggtggattcatgtgtgaatgccccgcgggttaccac
agagcaggacacgggtga
DBGET
integrated database retrieval system
