KEGG   Pasteurella dagmatis: 4362423_00327
Entry
4362423_00327     CDS       T05467                                 
Symbol
cas3
Name
(GenBank) CRISPR-associated helicase Cas3
  KO
K07012  CRISPR-associated endonuclease/helicase Cas3 [EC:3.1.-.- 5.6.2.4]
Organism
pdag  Pasteurella dagmatis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pdag00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:pdag02048]
    4362423_00327 (cas3)
Enzymes [BR:pdag01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     4362423_00327 (cas3)
Prokaryotic defense system [BR:pdag02048]
 CRISPR-Cas system
  Type I CRISPR-Cas system
   Type I signiture cas proteins
    4362423_00327 (cas3)
SSDB
Motif
Pfam: Cas3_I-F_Cas2 Cas3-like_C_2 DEAD Cas3_HD ResIII Helicase_C_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: SNV55163
LinkDB
Position
1:292642..295968
AA seq 1108 aa
MNILLVSQCQKNALTETRRILDQFAERCGDRIWQTVITQAGLETLYKMLRQTARKNTAVA
CYWMHRKNGNELLWVVGDKSQFNTQGRVPTNRTMRNILRAEDEVNWKDAYSLQILTALSA
LLHDLGKSNIAFQNKLDKHKNVPKVADCYRHEWISARLFEAMIAGCKTDQEWLRRLANWS
EFEQKNPKWFEQIIQDKPNAKTFSGFEQLPSIARTLIWLITSHHRLPFTDTFSRSLDYTR
NVRLYCQRTFQMFFKEYRPQERWVFNSSDHPTPELFWKFDHIATQSKAWQKQMTRWANKA
LNHPPLFALNEIEDPFLLLLSRLCLMTGDHYYSAQDKNDKLGDAAFPLLANTYRGSGEVK
QRLDEHLIGVCQSAVRFARLLPKFSTELPRIKQHKPFAKLAKDRFVWQNKAVNMAKILQK
SSETQGFFGVNMASTGCGKTLANAKMMYALSDAKQGARLTIALGLRVLTLQTGTALQARL
DLSERDLAVLVGGSAVKKLYELQQENALELAENGSESVENWFDEMAVYGASFIESAVEND
EISSFLTKDPKAKKLFYAPIVTCTLDHLVSASESVRGGHHIVPILRLLTSDLILDEPDDF
SQEDLPALSRLVHLAGLFGSRVLLSSATLTPDFITGLFNAYQAGRKVYNQQKGISADLPI
CCAWVDEFQQVQAKVENPDIFMQQHREFVTKRAGCLEKSPVRRKAEILTLPILKPIENQL
FNYELLAQHLLQSAVKLHQFHGETDSKSQKKVSIGLIRFSNIKPMIPVAQALLEMQETSE
FEDYCFHLCCYHSKQLLLLRSNLEEKLDRILDRHHPEQFFKQPEVALALNRHNAKNHVFI
VLGSPVTEVGRDHDYDWAIVDPSSMRSIIQLAGRVWRHRADKVLENPNIYLLPTHWRGLG
VANYNSGKVIYTHPGFESEMYKLTTHKLEQLIPLEDLSHIQATPRIVKSEQLQATTKLAD
LEHKVIGDLLNNTRANHVNLYWDNRYTNRLLANLPMMTRFRKSVKELDIVCWPNDDTDWG
FRFLSAENAYKNEESYLPNIQYQKLECAKAGIVKPWLMQSLASALDQLAEKLGTENIRSV
ATTYASSALPQYDSNKLDWYYNEFLGFW
NT seq 3327 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatattttgctagttagtcaatgtcagaaaaatgcgttaacagaaactcgccgtatt
ttagatcagtttgcagagcgttgtggcgatcgaatatggcaaaccgtgatcacgcaagca
ggcttagaaactttgtataaaatgttacgccaaactgcacgcaaaaatacggcagtcgcg
tgttattggatgcaccgtaaaaatggtaatgaattgttgtgggtagttggggataaaagc
caatttaacactcaggggcgtgtacccactaatcgtacgatgcgtaatattttgcgtgct
gaagatgaagtaaattggaaagatgcctattctttgcaaattttgaccgcactttctgcg
ttattacatgatttaggtaaatcaaatattgctttccaaaataaattagataagcataag
aatgtcccaaaagtggctgactgttatcgtcatgagtggatttcagcacgcttatttgaa
gcgatgattgctggctgtaaaacagatcaagagtggcttcgtcgtttagcaaattggagc
gaatttgaacagaagaacccaaaatggtttgagcaaattattcaagataaacccaatgca
aagacgttttctggttttgaacagttaccatcgatagctcgcacattaatttggttaatt
acctcacatcaccgattaccttttactgatactttttctcgatcgctcgactatacaaga
aatgtgcgtttgtattgtcagagaactttccaaatgttctttaaagaataccgaccacag
gaacgctgggtgtttaattcttcagatcatccaacgcctgaactcttttggaaatttgac
catattgcgacacaaagcaaggcgtggcaaaagcaaatgacgagatgggcaaataaagca
ttaaatcatccaccgttatttgccttgaatgagattgaagatccttttttattgttgtta
tcacgcttatgtttaatgacaggagatcactattattctgcacaagataaaaatgacaaa
ttaggagatgctgcctttcctttattggcaaatacttatcgcgggtcaggggaagttaag
cagcgattagatgagcatttgattggtgtgtgccaaagtgcggtacgttttgcacgatta
ttgccaaaattcagcacagaattacctcgcattaagcagcataagccatttgcaaaactg
gctaaagatcgttttgtatggcaaaacaaagcggtaaatatggcaaaaatattgcaaaaa
agcagcgaaacacaaggcttttttggggtgaatatggcaagtactggctgtggtaaaacc
cttgctaatgccaaaatgatgtacgcattaagtgatgctaaacaaggtgcgagattaaca
attgcgttaggtttacgagtattaacgttacaaacaggcactgcattgcaagcacgttta
gatttatccgaacgtgatttggctgttttagtgggaggaagtgcggtcaaaaaattatat
gaattacaacaagaaaacgcattagaactggcggaaaatggcagtgaaagtgttgaaaat
tggtttgatgaaatggcagtttacggtgcttctttcattgaaagtgcggtcgaaaatgat
gaaatttcgagtttcttaacaaaagatccgaaagcgaaaaagttattttatgctccaata
gtgacttgtacacttgaccatttagtttcagcttcagaaagtgttcgaggcggtcaccac
attgtgccaatattgcgtttattgacctctgatttgattttggatgagcctgatgatttt
tctcaagaagatttgcctgcgcttagtcgtttggtgcatttggctggattgtttggtagt
cgagtgttactttcttcggcaacattgaccccagattttattacagggctgttcaatgct
tatcaagctgggcggaaggtttataatcagcaaaaaggcatttcagcagatttaccgatt
tgttgtgcttgggttgatgaatttcaacaagtgcaagcaaaggtagagaatccagatata
tttatgcaacaacatcgtgagtttgttactaagcgagctggatgtcttgagaaaagccct
gtgcgccgtaaagctgaaattttaacgttaccgattttaaaacccattgaaaatcaactg
ttcaactatgaattgttagcgcagcatttattacaaagtgcggttaaattgcatcaattt
cacggagaaactgactctaaaagtcaaaaaaaggtcagtataggtttaattcggttttca
aacattaaaccgatgattccagttgcacaagcgttgttagaaatgcaagaaacaagtgaa
tttgaagactattgttttcatttatgttgttaccattctaaacaattgttgttgttacgt
tctaatctcgaagaaaaattggatcgtattttagatcgccatcatccagaacagtttttc
aaacaacctgaagttgcattagcattgaatagacataacgctaaaaatcatgtattcatc
gtgctaggtagcccagttactgaagtcgggcgtgatcacgattatgattgggcgattgtt
gatccctcttctatgcgttctattattcagcttgctgggcgtgtttggcgacatcgagca
gataaagtgcttgaaaatccaaatatttatttactaccaacgcattggcgtggacttggt
gttgcaaattacaattcaggtaaagtgatatatactcacccaggttttgaaagtgaaatg
tataaattaactacgcataaattggagcaattaattcctttggaagatttatcacatatt
caagcgacaccaagaattgtgaagtctgagcaattacaagctacaacaaaattagcagat
ttagagcataaagtgattggtgatttgttaaataatacaagagctaatcatgtaaattta
tattgggataatcgttataccaatcgtttattggctaatttaccgatgatgacacgcttt
cgtaagagtgtaaaagaattggatattgtgtgttggcctaatgatgatactgactggggt
tttcgctttttaagcgcagaaaatgcttataaaaatgaagaaagctatttgccgaatatt
caatatcagaagttagaatgtgctaaagcggggattgtgaaaccttggcttatgcagtct
ttggcttctgcgttggatcagcttgcagaaaaactaggcacagaaaatattcgttctgtt
gcaacgacttatgcgagcagtgccttaccgcaatatgattcaaataaattagattggtac
tataatgaatttttaggattttggtaa

DBGET integrated database retrieval system