Pasteurella dagmatis: 4362423_01225
Help
Entry
4362423_01225 CDS
T05467
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor, beta-barrel domain protein
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pdag
Pasteurella dagmatis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pdag00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pdag02000
]
4362423_01225
Transporters [BR:
pdag02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
4362423_01225
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SNV71155
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(1292873..1295263)
Genome browser
AA seq
796 aa
AA seq
DB search
MKKISYLSLCVISGLYSQIAVAQNNLTNTGNHIELDAIHVDALNDSRQGAPLTGRLITSE
KTISEYSLKQRGSNIGDALSNELGIHASQFGGGASAPVIRGQEGKRIKLLNSGTETLDMS
SMSPDHAVTVDSLLAKKIEILRGVNTLLYSSGNAAGAVNVVDNKIPTTEIVGVEGEVGLR
TGSVDNERLVNAAFDVGLSKHFALHLEGLYKKAGDYRTPSYQYQGSTQHKLANSFVDNRS
GSIGLSWVGDKGYLGASYSQRKDKYGLPAHSHLYDEYYMHVLLSDAHWRKPYLKHYPFLM
EETDIDYNNPGIDCIKKSWHSHGHLCNHGHAHHANEPNSHDHQHADPHIVLNSQRWDIRG
EWKNPVKGLDKVRFSVAQVDYRHDEKSGAISDNSFKNKGYSARLEFIHQPIANVSGLIGV
SHTYQDSYALDNHTLEYRKQNLLSDHTTDQQSLFLMERVEFGKWQFDIGGRMERQRIAMK
YHFNVPAREQVPQELTQPHKSKGYSYAFSANYQVNDRHQLNIIFSHQERLPNAQELYAHG
KHLATNSFEAGNKNLKKERSNNIELGWDYSGEKLGIKLSGYYQQFSNYIYAAILNDKSTC
TWRANGRCSRSLSSDYPLHLYRYNQAEANIYGLEAEASYQISSTYDVSIFGDYVRGKLKN
LPVLPIGYEQAYDQNYNPIGLKPTGWEKQPDGNAPRMPAMRLGIKLNGHFDNGVSFNTQL
YRVFKQNKVARLEKPTPGHTMWNAGVSYDGRIGNNEYTLFLNANNLLNVKVYNHASFLSY
IPQNGRGINVGMNFKF
NT seq
2391 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaatttcgtatttatcattgtgtgttatttcgggactttatagccaaatagcc
gtagcacaaaataatttaaccaatacaggaaaccatattgaacttgatgcgatacatgtg
gatgcacttaatgatagtagacaaggcgcgccactgacaggtcgtctcataacaagtgaa
aaaactatctcggagtatagccttaaacaacgtgggagtaatattggtgatgcgttgtca
aatgaacttggtattcacgctagccaatttggaggtggtgcatcagctcctgtaattcgc
ggacaagaaggtaaacgtattaaactgcttaatagtggtactgaaacgttggatatgtca
tctatgtctcctgatcatgcggtcactgtggacagtctattagctaaaaaaattgaaatt
ttacgtggtgtcaatacgttactgtatagttccggtaatgctgcgggtgctgtcaacgtg
gtagataataaaattcctactaccgaaattgttggtgttgaaggggaagttggcctaaga
acgggcagcgtggacaatgaacgtttggtgaatgcagcatttgatgtgggattatcaaaa
cattttgcgttacaccttgaaggtttgtacaaaaaagcgggtgattatcgtacgccttct
tatcagtatcaggggagtactcagcataaattagctaatagttttgttgataatcgaagt
ggtagtattgggctttcttgggtgggagataaaggttatttaggtgcttcatatagccaa
cgtaaagataaatatggcttacctgcacattctcatctatacgatgaatactatatgcat
gtgttattgtcagatgcacattggcgtaagccttatttaaaacattatccatttttaatg
gaagaaacggatattgattataataacccgggtattgattgtataaaaaaatcatggcat
agccatgggcacttatgtaatcacggtcatgcacaccatgcaaatgaaccaaatagccac
gatcatcagcatgctgatccgcatattgtgttaaattctcaacgttgggatatacgtggt
gaatggaaaaatcctgtgaaaggcttagataaagtccgtttttctgttgcacaagtagat
tatcgtcatgatgaaaaatcaggggcaatttcggataactcttttaaaaataaaggttat
tccgcacgtcttgagtttattcatcagccgattgctaatgttagtgggttaattggggtg
agccatacatatcaagatagctatgctttagataatcatacacttgaatatcgtaagcaa
aatcttctttctgatcataccacagatcagcaaagcctatttttgatggagcgtgttgaa
ttcggtaaatggcaatttgatatcggtggtagaatggaacgtcagcgtattgcgatgaaa
tatcactttaatgtgcctgcaagagagcaagtgcctcaagagcttactcaaccgcataag
tcaaaaggttattcttatgcgttttcagcaaattatcaagttaatgatagacatcagctg
aatatcattttttcacatcaagagcgtttaccaaacgcacaagagctatatgctcacgga
aaacatttagcgacaaattcttttgaagctggaaataaaaatctgaaaaaagagcgttca
aataatattgaattaggttgggattattctggggaaaaattagggattaagttaagtggt
tattaccaacagttttccaattatatttatgctgccattttaaacgataagtcaacttgt
acttggcgagcaaatggacgttgttcacgctcgttaagtagtgattatccattacattta
tatcgctataatcaagcagaagcaaatatttatggattagaagcagaagctagttatcaa
atctcatcaacatatgatgtatcaatttttggtgattatgtgcgaggtaaattaaaaaat
ctaccagtgctcccaattggttatgagcaagcatatgatcaaaattataatcctattggc
ttaaaaccaacgggctgggaaaaacaacctgatggcaatgcccctcgtatgccggcaatg
cgtttggggataaaactaaatggtcattttgataatggtgtgagttttaatacacagctc
tatcgtgttttcaaacaaaataaagttgcacgtttagaaaagccaacaccgggtcatacg
atgtggaatgccggagtgagctatgatggacgaattggcaacaatgaatatacattattc
ttgaatgccaacaacttgctaaatgtgaaagtctataatcatgcttcatttttatcttat
attccacagaatggacgtggtattaatgtggggatgaattttaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system