Pocillopora damicornis (lace coral): 113677230
Help
Entry
113677230 CDS
T05773
Name
(RefSeq) stabilin-2-like
KO
K19013
stabilin-2
Organism
pdam
Pocillopora damicornis (lace coral)
Pathway
pdam04148
Efferocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pdam00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04148 Efferocytosis
113677230
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pdam00536
]
113677230
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pdam00536
]
Hyaluronan
Cell surface receptors
113677230
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Fasciclin
EGF_3
EGF_STAB1-2
FXa_inhibition
EGF_Teneurin
EGF_Tenascin
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113677230
NCBI-ProteinID:
XP_027049798
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2242 aa
AA seq
DB search
MATMLPSTSTIGTFFAVCVILLPSLVVSKRCDKQIDSFVRSNCMECSVNAFFQRPCPSGY
QQVTSGEGEQSCAYSVFFGFNFGSMRVPGCQHNCSRKITQKECCAGFWGQDCQACPGTPA
CSGRGSCNDTVGGDGTCTCQDGFKGFACELCRDSNKFGSYCNETCLCKHGTCDSGLNGTG
HCKPGTCVLGYAGSNCDNTLPRCDRNLSCGVNANCFRIESIDTCVCNPGYKNVSGVCKAI
NPCQDGTHGCHSNADCLYLRPGRNNCTCAAGYTGDGIVCIAIDPCQRNNGGCPSRSTQCN
YIHPGKSSCSCLFGFENYTSGAGCALIDLCKNGSGCDMNANCTMEAPGVKRCNCKSGYRG
NGTTCYGNILQRVKDLNLRGPIGLKGQLTTAIDLLTGSFMHLALSGAGPFTLFLMVNSAF
SNLTQEELSELSANTDMASHFVSRHLVAADLDSMLLKKYKKVTTLQGIDASISEYQNVMY
LKLDNQSVNASVLFRDLLAGNGMIHVIDKIMWHVGDYQETSSKSLLQVLWAQSRFSIFAS
LLQSSGIAAELSGLGASLTILVPANSAFDKIDNSTMRFLTSTDVGMRKLKSLLRNHILTG
KMAVLDLVYSGKVVSVQGESLEVKVTPSGRIVVDKDSVITESSVLVSDGILHVTDNLIIP
DDIEPLLPRNCNGQKFSNGICYRCEAVKAMPRTGCPIGYAPSPTTSVCYYRLSFRGIPIG
IFRGCRATTCSAPERECCAGFYGPSCHPCPGPFDNACNGNLNGKCVDKISGNGTCICQPN
FKGTACEHCQESKSFGPFCNQTCTCLHGTCDSGYPQGNGTCKAGSCSPGFHGDNCDQHDV
PCPGSVSRRCHAHATCRRQGNMDSCQCNFGYEGSGIQCSEIDPCSKPDRGGCHHEATCTK
TGPGTNNCTCDDGFRGDGTVCVAIDPCLEENAGGCHSNAECQYVGPGQSTCICKSGYTGN
GSTCFEVNPCLVNNGGCSLDARCLRTGPGNYSCHCISGFIGNGYTCLGSIVMIIRQKNSK
LENFIRQGNMLHYISDPRKNITMFAPSVSAISQLSDDDRKYWTNSTERLQYLIRYHLVEQ
VYNLETLKNVPSLNTTNSLMLNVTTQGQKVFIGGMAQIIQANITAENGIVHIIDQVLLPS
RLSYENELPLTSDLLKSIPEFSDFTNISQNMNLFLSLDACESCTVFAPTNSALKKYALVD
TQTLTPDVLKYHIVNQYLTEETIRNGEEFPSLLGNGRDYLVKITNPRKGMLQVNGIDVVV
KGHKARRAIVYGINGVLKPVKRNCDVVTKSSRLGYCTYCDVFVPTCPAGWTKIGLVLNTC
WVRILIFRLRGCQALCEKTSVIKRCCDGFWGQDCQLCPGNVTNPCSGHGACDDGKTGSGH
CQCDANFTGTACEKCILGKYGSNCTGECKCTNGVCNDGINGDGGCFCHHGWKGPICNTSA
NFDNCLPTKCSRNATCRGQSGSGRCECDFGYTGNGTYCAESNACAVNNGGCHQNATCVKN
ITLPGLRSCKCNAGFTGDGFVCLEIDPCQRNNGGCHINATCFSTAPGQRNCFCKKDFSGD
GVSYCFGVNPCDVGNGGCSDRAICQQVGPHQRTCKCRKFYVGDGITCIGDISEALKLDPQ
LSGVDMLLRKNGLDKLLASHGHFNLLAPVNAALGSLQPRSRKRRSVPSSAEEELNLLKYL
IIGCSTIPTDTSDDYAANFTTLLGVTISVKTEGNVTSIIDQYGNISRVVGVYESSNGVIM
KLDNLPTPPKSMDSTVQESYLDVANRLGYKEFVKLVKLAGLQNILDIPVNRAVLMFWPTD
DAIKAVPDDLRARLTDPSHLARFVKYHVVTQIHSDFSTQSFLRSGAGLELRTFGGTSLFV
SCKGGKGDLYVNGESKIVARDIHFGGGVAFGVDSALFPFGFGGNCDEIMDTKITGQCGNC
FVPVSCPQETTLVGVTNHNCTYNGDLVGCQPICLQRQRLKRCCKNFYGPDCVACPGGVQL
PCSRRGLCIDGLTGSGQCVCDASYNGTACEQCVNSNESCPAPSVDCEVDNGGCHVFATCT
KTAPNRLTCSCKSGYQGDGYYCQMIDSCASDNGGCGENATCLFTAPERRRCVCKAGFYEV
GSSCRAHRPMSPCAINHGGCSVHADCTDNGQEASCACRPGFTGDGFSCGGTILQVSRFFC
LFNPFHPSPLLLQPLSFVPCLMVVKETQSATEFYKAFYQLITSSAQATTLYQGLASLSKS
FTVFVPVSSAVHYKVTVISMFL
NT seq
6729 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgacgatgctgccgagcacctcaacgatcgggacatttttcgctgtgtgcgtgatc
ttgttgccgtcgcttgtagtatctaaaagatgcgacaagcagatcgatagttttgtgcgg
agcaactgcatggaatgttcggtaaatgccttttttcaacgtccctgtccgtccggttat
cagcaagttaccagcggtgaaggcgaacagagctgtgcttattccgttttttttggattt
aacttcggctccatgcgtgtccctggatgtcagcataattgctcaaggaagattacacag
aaagaatgttgtgccggcttttggggacaggactgccaagcatgtcctggtacacctgca
tgcagtgggcgtggctcttgtaatgacacagtgggtggtgatggaacatgcacttgtcag
gatggttttaagggatttgcatgtgagctgtgtagggattcaaacaaatttggtagttac
tgcaatgaaacctgtctatgcaaacatgggacatgtgatagtggattgaatggcacagga
cactgcaagccaggcacttgtgtcttaggatatgctgggtcaaactgtgataatactttg
ccaagatgtgacagaaacctttcctgtggagttaatgccaactgcttcagaattgaaagt
attgatacttgtgtatgtaacccaggatataagaatgtcagtggtgtttgcaaagcaatc
aatccttgccaggatggtacccatggctgccatagtaatgcagattgcctctacctaagg
ccagggaggaacaactgcacctgtgctgctggttatacaggagatggaatagtttgcatt
gctattgatccttgccagaggaacaatggtggctgtccatcacgatcaactcagtgcaat
tacatacatcctggaaagagtagctgtagctgcctttttggatttgaaaactacaccagt
ggggctggctgtgcactcattgatctgtgtaaaaatggcagtggatgcgacatgaatgca
aactgtacaatggaggcaccaggagtgaagagatgcaattgtaagagtgggtacagagga
aatggcaccacatgttatggtaatattctccagagggtaaaagacctgaaccttagaggc
ccaattggactcaaaggacaattaaccacagcaattgatttgctgacaggttcattcatg
cacttggctctttctggagcagggccatttactcttttcttaatggtgaacagcgcattt
tcaaatctcactcaagaagagcttagtgagctatccgcaaacacagacatggcctcacat
tttgtcagtcggcacttagtggctgctgatttagactctatgttgttgaaaaagtacaag
aaagtcacaacactacaggggattgatgcaagcatctcagagtaccagaatgttatgtac
ttaaaactggacaatcagtcagtaaatgcatcagtgctattccgtgatttgttagcgggc
aatggcatgattcatgttattgacaagattatgtggcatgtcggagactatcaagagacg
agctctaaatcattgcttcaggtcctttgggcacaaagtagattttccatttttgcctca
cttttacagtcgtctggaattgctgcagagttgagtggtctgggagcttccctcactatt
ttggtgccagcaaattctgcttttgataagattgacaacagtaccatgagatttttgacc
agcacagatgtgggaatgagaaaattgaagtcacttttaagaaaccacattcttacagga
aagatggcagtgttagacttggtatacagtggcaaagttgtatcagtacagggagaatca
ttggaagtcaaagtaactccctcgggtcgtattgttgtggataaagattccgtcataaca
gaatcaagtgttcttgtcagtgatggtatacttcatgtaacagataaccttatcatccct
gacgacattgagcctctgttaccaagaaattgtaatggacagaaattcagtaatggaatt
tgttatcgctgtgaagctgttaaagccatgccaaggacaggttgccctataggatatgct
ccatcacccacaacatctgtgtgctactatcgactgagtttccgaggaattcctattgga
attttccgcggctgtagggccaccacatgttcagcaccagaacgagaatgttgtgctggg
ttttatggtccatcttgccatccttgtcctgggccttttgataatgcttgtaatggaaat
ttaaatggaaagtgtgttgataaaatcagtggcaatggaacttgcatatgtcaacccaac
ttcaagggaacagcatgtgaacattgtcaggagagcaaaagctttggaccgttctgcaat
caaacttgcacatgtttgcatggcacatgtgacagtggctatcctcaagggaatggaaca
tgtaaggctggatcttgttctcctggttttcatggtgacaactgtgaccaacatgatgtc
ccatgtcctgggtcagtgagtcgtcgttgtcatgcgcatgccacttgccgacgacaagga
aatatggacagctgtcagtgcaactttggctatgaaggttctggtatacagtgctctgaa
attgatccttgttctaaacctgatcgtggaggctgtcaccatgaggcaacttgcacgaaa
actgggccaggtaccaacaactgtacatgtgatgatggtttccgtggtgatggaacagta
tgtgttgctatagatccttgtttagaggaaaatgctggaggttgccacagtaatgccgag
tgtcagtatgtcggtcctggacagagcacctgtatctgcaagtcaggctacacaggaaat
ggttcaacatgttttgaagttaatccttgtctagtcaacaatggagggtgctctcttgat
gcaaggtgtttgcgaactggtcctgggaattacagttgtcattgcatcagtggattcatt
gggaatggttatacttgtctaggatctattgttatgatcattagacagaaaaattcaaag
ctggagaattttatcaggcaaggaaacatgctgcactatatatcagacccaaggaagaac
atcactatgtttgctccatcagtgtcagcaatttcacagttatctgatgatgatagaaaa
tattggactaatagcacagagagacttcaatatctaataaggtatcatttggtggagcaa
gtgtataatctagagacactgaaaaatgtgccatcactgaacaccacgaatagcctcatg
ttaaatgttactactcaaggtcaaaaggtatttattggtggaatggctcaaattattcaa
gctaacattactgcagaaaatggaattgtacatatcattgaccaggtccttttgccgtct
cgtctgtcgtacgaaaatgagcttccactgacgtcggatcttcttaaaagtattccagag
ttttccgatttcaccaatatctcacagaacatgaacctgtttctctccctggatgcctgt
gagtcgtgtactgtatttgctccaaccaactccgctctcaaaaaatatgcccttgtagac
acgcagacgctgacgccagatgtccttaagtatcatattgtgaaccaatatctcacagaa
gaaacaattcgtaatggagaagaattcccatctttgcttgggaatgggagggattacctt
gtgaaaatcactaatcctaggaaaggaatgctgcaagtcaatggaattgatgttgtcgtc
aaaggtcacaaagctagaagagcaatagtgtatggcataaatggtgtacttaaaccagtt
aagaggaactgtgatgttgttacgaaatcgtcacgtctcggatactgtacatattgcgac
gtatttgtcccaacatgtccagcgggctggaccaaaattggccttgtgctgaatacatgt
tgggttcgaatattaatcttcaggctcagaggctgccaagcactatgtgaaaaaacttct
gtaatcaagagatgctgtgatggattctggggtcaagactgccaattatgtcctggaaat
gttaccaacccgtgctctggtcatggcgcctgtgatgatggcaaaactggaagtggtcac
tgtcagtgtgatgcaaacttcactggtacagcatgtgagaaatgtattcttggaaaatat
ggaagtaactgtacaggtgaatgcaaatgcactaatggagtttgtaatgatggtattaat
ggcgatggaggatgtttctgtcaccatggttggaaaggacctatttgcaatacctctgca
aattttgacaactgccttccaaccaaatgtagtcgaaatgccacatgccgcggacagagt
ggtagtggtagatgtgaatgtgattttggttacacaggcaatggaacctactgcgcagaa
agtaatgcatgcgctgtcaacaatggtggctgtcatcaaaatgccacatgtgttaagaat
ataactctgcctggccttagatcttgcaaatgtaatgcaggattcactggagatgggttt
gtctgcttggaaatagatccatgtcagcgtaataatggtggctgccacatcaatgcaact
tgcttcagcacagctcccgggcagagaaactgtttttgtaaaaaggatttctcaggagac
ggtgttagctattgttttggtgttaatccatgtgatgtgggcaatggagggtgtagtgac
agagctatttgtcaacaagttggaccgcaccaaaggacgtgcaagtgcaggaagttttac
gttggtgatggtatcacatgtattggtgatatatcagaggctctaaagcttgatccccaa
ctgtcaggtgtggacatgctactcaggaaaaatggtctggacaaactgctagcttctcat
ggacattttaaccttctcgctccagtaaatgctgctttaggcagtttacaaccacggtct
cgcaagcgtcgtagtgttccgtcatcagctgaggaagagttgaatttactgaaatatctt
ataattggctgttcaacgattcctaccgacaccagtgatgattatgcagctaactttact
actttgcttggagtaactatttcagtaaaaacagaggggaacgttacatcgatcatcgat
caatatggcaacatatccagagtagttggagtgtacgagtcatcaaatggcgtgataatg
aaactggataatttaccaaccccacccaagtctatggatagcacagtacaggaatcttat
cttgacgtggctaatagacttggatacaaggagtttgttaaactggtcaagttagcagga
ttgcagaacatcctagatattccggtgaacagagctgttcttatgttttggccaactgat
gatgctataaaagctgtgcctgacgacttaagggcacgactcactgatccttcacatctg
gctcgatttgtaaaataccacgttgtcacccaaattcactctgattttagtactcagtcc
ttcttgagaagtggtgcagggttagaattgcgaacatttggaggaactagtttatttgta
tcttgcaaaggaggaaagggcgatctttacgtaaatggtgaaagcaagattgttgcaaga
gacatacacttcggtggtggtgtggctttcggagtggattcagctctttttccttttgga
tttggaggcaactgtgatgagatcatggacactaaaattacgggtcagtgtggaaattgt
tttgtccctgtgagctgtccacaagagactacccttgttggcgtaacgaatcataactgc
acctacaatggtgatttggtaggatgtcagcccatctgtttacagcgtcaacggctgaag
agatgctgtaagaacttttatggaccagattgcgtggcttgcccaggtggtgttcaattg
ccatgtagcaggcgtggcttgtgtattgacgggctgacagggagtggccagtgtgtgtgt
gatgcgtcttataacggcacagcttgtgaacaatgtgtgaatagcaatgagtcctgtcca
gcaccttcagtggactgcgaggtagacaatggtggctgtcacgtgtttgccacctgcact
aaaactgccccgaatcgtttgacgtgctcgtgtaaatccggttaccaaggagatggatat
tactgccaaatgattgactcgtgtgcaagtgacaacggcgggtgtggtgagaacgcaacc
tgcttgtttacagcaccagaacgaaggcgctgtgtatgtaaagcaggcttttacgaagta
ggctccagttgtcgtgctcaccggccaatgtcgccctgtgccataaaccatggcggctgc
tctgttcatgctgactgtactgataacggccaggaggccagctgtgcctgccgtccgggt
ttcactggagacggcttttcttgtggaggaaccattctacaggtaagtagatttttttgt
ctttttaaccctttccacccctcccccctcctccttcagcccttgtcttttgtgccttgc
ctgatggttgtcaaagaaactcagagtgccactgaattctacaaggcgttctaccaactg
atcacttccagcgcacaagcgacgactttataccaaggcctggcatcgttatcaaaatcc
ttcacagtgtttgtgcctgtcagtagtgcggttcactacaaggtgacagtcatctcaatg
tttctttag
DBGET
integrated database retrieval system