Pocillopora damicornis (lace coral): 113678685
Help
Entry
113678685 CDS
T05773
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: pumilio homolog 2-like
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
pdam
Pocillopora damicornis (lace coral)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PUF
PUF_NOP9
DUF6922
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113678685
NCBI-ProteinID:
XP_027051386
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1205 aa
AA seq
DB search
MGMFLSDKPXDGHAKNGLSFVGLSHPIRPMSFPCVLGMNEVGWEDGAYHSNGMTPKLVGR
TSNGGSKTNNSGFEIDVGGKSNGEVASYLFQRQGVATSFSKTVSENDKGNFSGQRWSSVG
EGMSEQSNSKDGELDDKFQSLSLNNNEKKADTPIEEIASTAKKLWDVQDSGEENQGGMTS
GIFFGEQWRETAWGPSVPHMAQSEHAVSQPIMVQRPAKGGNFNNPSESQSVLSPRSADGV
GLSMVEYVLASSPGGQELDAQIMKAGFGTSPSSDVLSDKGTKSNGESKGSKGGSPFEEGA
GDEVKHALQEEQGHDSPTPTAKQSTEDDKTSASFSRTPGSRQPSPTSGPQHQDAQQTTQT
QLPTQQPVGQNKAKPFKQSDAMEDIVTPVALIDPLESVPLEQLSFAPQREPVVGTPTSPS
DFVMVSGASLQSHNAPSQHGQSLHLTQHQLALAMAAQQQQQQQQQQQQQQLGLQSGLQST
GIGHPNPYFITAPPSQDPYGNPSLAAVSGGAHQVVHPQYAAYSVQPWGVYSAAGASGTGG
YLQQQQQQQQQQHAQLLRSNSGGMTGRPMQGQVEIIGTPPSHQQQAMAAASSGTNYQLVA
PAGAAPLGLGTTAYYDQSGNLVLGNTQNVNNMATAQMAASQMGALRMVSPVVVNAQNAGA
NSVTGGRLGNASSMGGASTLGLFGQQQQQPQLNSSALGMLGGVVGGSSGVGAVGTIPGGG
TRRDSMNATEYGKRAGITQYYTTPGAVSSLASLSISAQPSYNTPQELPTPPLLSQGQSGF
GGQSAYGGQSGFTVGSPLSNGLSRYMQLAAAPRDTPTKYQGSLGGLGGMQYGSSALGVGS
FRGSRGKETGRSRLLEDFRNNRYPNIQLRDLANHIVEFSQDQHGSRFIQQKLERASPTEK
QMVFHEILPAAYSLMTDVFGNYVIQKFFEFGSPEQKHHLANCIRGHVLPLALQMYGCRVI
QKALECISPDVQNDLVRELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVDPSSLQFIIGAFQAQVY
ALSTHPYGCRVIQRILEHCMPEQTSPILNELHQHTERLVQDQYGNYVIQHVLEHGTPEDK
SKIVHELRGNILNFSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAMLIDEVCSSSDNALYTMMKDQFA
NYVIQKMIDVAEPPQRKLLMHRIRPHVATLRKYTYGKHILAKLEKYYMTMKPTPDFLPLT
NGPLL
NT seq
3618 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggaatgttcttatctgacaagccangcgacggccatgccaagaatggcctttctttc
gtaggcctttcgcatccgatccgtccaatgagttttccatgtgttcttggcatgaacgaa
gttggatgggaagatggagcgtaccacagcaatggtatgactccaaaacttgtaggacgc
accagtaatggtggatcgaagacgaacaacagtggcttcgaaatcgatgtaggtggcaaa
tcgaacggtgaagtggcaagttaccttttccagcgtcaaggagtcgcaacaagcttttct
aaaacagtttcagaaaacgacaaaggcaatttttctggccagcgatggtcatctgttggt
gaaggaatgtcagagcagtcaaattccaaggatggggaactggatgacaagttccagagt
ttgtctttgaacaacaatgaaaagaaagctgacacaccaatagaggagattgcctctact
gcaaaaaaactttgggatgttcaagactctggtgaggagaatcaaggggggatgacatct
ggcatttttttcggtgaacagtggagggagacagcctgggggccgtcagtacctcatatg
gcacaatcagagcatgctgtgtctcagccaattatggtgcaacgtccagccaaaggagga
aatttcaacaacccttcagaatcacagagtgttttgtcacccagatcagctgatggagtt
gggcttagcatggttgaatatgttctggcatcatcacctggtggtcaagagttagatgct
caaataatgaaagctggatttggaacatctccatcgtctgatgttttgtctgataaagga
actaaatcaaatggagagagcaaaggaagcaagggcggatctccctttgaggaaggtgct
ggagatgaagttaagcatgcccttcaggaggagcaaggtcatgattccccaacacctacc
gcaaagcagagcacagaggatgacaagacatctgcctcctttagccgaactcctggcagt
agacaaccatctcctacttcaggccctcaacatcaagatgctcagcagaccacccaaaca
cagctgcccacacagcaaccagtgggtcagaacaaagccaaacccttcaaacagtctgat
gctatggaagatattgtcacgcctgtggcattaatagatcctctggaaagtgtaccactg
gagcaactttcatttgcaccccagagagagcctgtggtgggtactcctacaagtccatca
gattttgttatggtctctggagcatctttacaaagccataatgctccctctcagcatggt
cagtcacttcacttgacacaacatcagttggcattagcaatggctgctcaacaacagcaa
caacagcaacagcaacaacaacagcaacaacttggattgcagtctggcttgcaatccact
ggtattggccatccaaacccatacttcatcacagcaccaccatcccaagatccatatggt
aatccttcacttgctgcagtcagtggcggtgcccatcaggtggtccatcctcaatatgca
gcttatagtgttcaaccatggggtgtgtattctgcagctggagcatcaggtacaggagga
taccttcaacagcaacaacagcaacaacaacaacagcatgctcagctgctccgctctaac
tcgggtgggatgactggacggcctatgcagggacaggtggagattattgggactccgcca
tcacaccagcaacaggcaatggctgctgcatcttctggaactaactaccagctagtagct
ccagctggggcagcccctttgggactaggaactactgcttactatgatcagtctgggaac
ttggtgctagggaatacacaaaatgttaacaatatggcaacagcacaaatggcagctagt
cagatgggagccctcagaatggtatcaccagtagtggtaaatgcccagaatgcaggtgcc
aattctgtcactggaggacgactgggaaatgccagctcaatgggtggtgcgtcaacatta
gggctgtttggacaacagcagcaacagccacaattgaatagcagtgctctgggtatgctg
ggaggtgttgtgggaggctcgtctggagttggggctgttggtaccattccaggtggagga
actagaagagattctatgaatgctactgaatatggcaaacgggcaggaatcacccagtac
tatacaaccccgggtgctgtaagcagccttgcaagtttgtcaatctcagcacaaccatct
tacaatactccccaggagctgccaacacctcctcttctttcacagggacagtcagggttt
ggtggtcagtcagcatatggcggacagtcaggcttcactgtaggaagccccttatccaat
ggactctctcgttacatgcaacttgcagctgctcccagagatactcctacaaaatatcag
ggatcacttggtggactaggtggaatgcaatatggcagctcagctttaggtgttggtagc
tttagaggatcaagaggtaaagaaacagggagaagtaggcttttagaagacttccgtaat
aatcgctatcccaacatccagctgcgtgacttggcaaatcacattgtggaattctcacag
gaccaacatggttcaagatttatccagcaaaaattagaacgtgcttctcctactgaaaag
cagatggtttttcatgaaatcctcccagctgcttacagcttgatgactgatgtgtttgga
aactatgttatacagaagttctttgagtttgggagtcctgaacagaagcatcaccttgcc
aactgcattcggggacatgtgctgcctcttgccttacaaatgtatggatgtcgcgtcata
cagaaagcattggagtgtatttctccagatgttcagaatgatctggtcagagaactggat
ggacatgtgctgaagtgtgtcaaggatcaaaatgggaaccatgtagtacagaagtgtatt
gagtgtgttgacccatcttctcttcagttcattattggagctttccaggcacaggtgtat
gccttgtcaactcatccttatggatgtcgtgtgatccaacgtatccttgagcactgcatg
ccagagcagacatcaccaatactgaatgagttacatcagcatacagagagactggttcaa
gatcaatatggtaactatgtgatccaacatgtcttggaacatggcacacctgaggacaag
agcaagattgtgcatgaactcagaggcaacatactgaattttagccagcacaaatttgcc
agcaatgtggttgagaagtgtgttactcatgcttcacgtacagaaagagctatgctcatt
gatgaagtttgcagcagcagtgataatgccttgtacactatgatgaaggatcagtttgca
aactatgttattcagaagatgattgatgtggcagaaccacctcaacgcaagctgctgatg
cacaggattcggccccatgtggcaacattgcgcaagtacacttatggaaaacacatttta
gccaagttagagaagtactacatgacaatgaaaccaacaccagatttcctccctttgaca
aatggtcctttgctttag
DBGET
integrated database retrieval system
