Clostridioides difficile 630: CDIF630_02496
Help
Entry
CDIF630_02496 CDS
T03885
Name
(GenBank) transporter, major facilitator superfamily (MFS)
KO
K03305
proton-dependent oligopeptide transporter, POT family
Organism
pdc
Clostridioides difficile 630
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pdc00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99977 Transport
CDIF630_02496
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PTR2
MFS_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJP12005
UniProt:
Q185D6
LinkDB
All DBs
Position
complement(2605512..2606903)
Genome browser
AA seq
463 aa
AA seq
DB search
MSSTESVSKKSGHPKSFWLICMTILWERFSYYGLTALLVLFFTASVAQGGLGLSTQEATS
MFGLFTGLIYLTPLVGGWLADKVLGQQKCISIGALLIAIGDFVLFASSTSIAMVWVGLSI
IILGNGFFKSSCSNIVGDIYPKTDVSRKDAAYSLFYMAVNVGAFIAPIICGLLSDNVFAV
RGASGDIVSYGYKMAFLICGIGMMLGMIIFTLLAPKLLNEVGKYPVTKGNKGEKIEYGPL
TKLEKNRIIAMVILFLFVVLFWTAYYQTQSSFMIYVRDNVNRTLFGFEMPVAWLTSLNAI
LCVALCPVLATLWVKLSHTKRGDFSIPVKMGLGMIIMGVGFIVMVFATLANGPDGMVKAS
ILFIVLTYIFTTVGELFLSPIGLAMFNKLAPAKYATLSMGAWYLTSFFASLLSGKIAGFT
ATLGFLQIFGGIATVLIIFGLILLGIRNVLTRLMAMDLLTKEK
NT seq
1392 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaagtacagaaagcgtatctaaaaaaagtggtcatccgaagagtttttggcttatt
tgcatgacaattttgtgggaaagatttagttattatggtttaacagctttattggtatta
ttttttacagcaagtgtagctcaaggtggtttaggtctttctactcaagaagcaacatcc
atgtttggcttatttacaggtcttatatatcttacaccattagtcggtggctggttagca
gataaagttttaggtcaacaaaaatgtatttctataggtgcacttttaatagcaatagga
gatttcgtactatttgcttcatctacatctattgccatggtttgggtaggtctatcaata
attattttaggaaatggtttttttaaatcaagttgctcaaatatagttggggatatatat
cctaaaactgatgtgtcaagaaaagatgcagcatacagtttattctatatggcagtaaat
gtaggagcatttatagctccaataatatgtggattgctttctgataatgtatttgcagta
agaggagcaagtggagatatagtatcttatggatataagatggcatttttaatttgtggt
ataggcatgatgttaggtatgattatatttacacttcttgcaccaaaattattaaatgaa
gtcggaaaatatcctgtgactaaaggtaataaaggtgaaaaaattgagtatggaccactt
actaagttggagaaaaataggataatagcaatggttattttatttttatttgtggtctta
ttctggacagcatactatcaaacacaaagttcttttatgatttatgtaagggataatgta
aatagaactctatttggatttgaaatgccagtagcatggcttacatcactaaatgctata
ttatgtgtggctttatgcccagtattagctaccctatgggttaaattatctcataccaaa
agaggtgatttctctattccagttaaaatgggattaggaatgataataatgggtgttggg
tttatagttatggtatttgctacattagctaatggtccagatggaatggtaaaggctagt
atattgtttatagtattgacttatatatttacaacagtaggtgaattattcttatctcct
ataggacttgcaatgttcaataaattagctccagctaagtatgctacgttgtctatggga
gcctggtatctaacaagtttttttgcaagtttattatcaggaaagattgctggttttaca
gccacacttggttttttacagatatttggaggaatagcaacagttttaataatatttggt
ttaatattattgggaataagaaatgtattaacaagattaatggctatggatttactaaca
aaagaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system