Clostridioides difficile 630Derm: CD630DERM_21940
Help
Entry
CD630DERM_21940 CDS
T03785
Name
(GenBank) putative ROK protein
KO
K15545
transcriptional regulator of PTS gene
Organism
pdf
Clostridioides difficile 630Derm
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pdf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
pdf03000
]
CD630DERM_21940
Transcription factors [BR:
pdf03000
]
Prokaryotic type
Other transcription factors
Others
CD630DERM_21940
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ROK
HTH_24
MarR
HTH_Mga
HTH_Crp_2
MarR_2
HTH_IclR
HVO_A0261_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CEJ98798
LinkDB
All DBs
Position
1:2498349..2499563
Genome browser
AA seq
404 aa
AA seq
DB search
MMSNKQGSNIKDVKIKNKLIILKLLSTNTPMSRVDLAKSTGLTKMTLSNLVTELINENMI
REIESSTLNAHSSGRKPILLDISNISPCICGILIRRNICKVIISDLKGNIVKQLSETYPK
CLSNDVLKDIIKRMFTKIMKINKRDIIGIGISSIGPVDDINGTILNPPDFGNVSNLNIVD
FIKEMSDLPIFLINDANSGALAEKMYGLGKNISNYIYLHIMNGIGAGLVLENKLHTGNLG
QSGEIGHTSINFSGPLCSCGNNGCLDYYTSVSNLIKRIESLSHIYPNSPLINCKDFSLVK
LIDEANNKDSLAMFLLDEFCTYVSYALVNTLTLIDCSSIIIGYDFNIPGTFIENTLLKKL
TASASFSKYKKISVRHSNFGANAPLIGSIAIVSYNFFNGSINFY
NT seq
1215 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgagtaacaaacaaggttctaacatcaaagatgtaaaaattaaaaataagttaata
atattgaaattactttctacaaatacacctatgtccagagttgatttagctaagtctaca
ggacttactaaaatgactttatcaaatctagttactgaacttattaatgaaaatatgatt
agggaaatagagtcatcaactttaaatgcacattcatcaggtcgtaaacccattttatta
gatatttctaatatatcgccttgtatttgtggaatcctaataagaagaaatatatgtaag
gtaattatttcagatttaaaaggtaatattgtaaaacaactttctgaaacttaccctaaa
tgtctatcaaatgatgttttaaaagatataataaaaagaatgtttactaaaataatgaaa
atcaacaagagagatataattggaattggtatttcttcaataggtccagtagatgatata
aatggtaccatactaaatcccccagattttggaaatgtatcaaacctaaatatagtagat
tttataaaagaaatgtctgatttgccaatatttttgataaatgatgctaattcgggtgca
ttagcagaaaaaatgtatggtttaggtaaaaatatatcaaattatatatacctacacata
atgaatggtattggagctggtctagttctagaaaataaacttcatactggcaacctagga
caaagtggagaaataggacatacatcaattaattttagtggaccattgtgcagttgtggt
aacaatggatgtttagattattatacaagtgtcagtaatctaattaaaagaattgaatca
ttgagccatatttatcctaactccccattaattaactgtaaagatttttctttagtcaag
ttaatagatgaggcaaataataaagatagtcttgccatgtttttgcttgatgaattttgt
acatacgtatcatatgcattagttaatacacttacattgattgattgtagttctataata
ataggctatgactttaatatacctggtacatttatagaaaatacattattaaaaaaattg
actgcttcagcaagtttttctaaatataaaaaaataagtgtaaggcattcaaattttgga
gcaaatgcaccattaattggctctatagccattgtaagttataatttttttaatggtagt
ataaatttttattaa
DBGET
integrated database retrieval system